Hexa-nucleotide Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1
Total Repeats: 1071
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1001 | NC_011312 | CACGAC | 2 | 12 | 3103674 | 3103685 | 33.33 % | 0 % | 16.67 % | 50 % | 209696265 |
1002 | NC_011312 | CTTCAG | 2 | 12 | 3108998 | 3109009 | 16.67 % | 33.33 % | 16.67 % | 33.33 % | 209696267 |
1003 | NC_011312 | CATCAG | 2 | 12 | 3109500 | 3109511 | 33.33 % | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 209696268 |
1004 | NC_011312 | ATATAA | 2 | 12 | 3115421 | 3115432 | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 0 % | 209696274 |
1005 | NC_011312 | TCTAAA | 2 | 12 | 3117796 | 3117807 | 50 % | 33.33 % | 0 % | 16.67 % | 209696276 |
1006 | NC_011312 | ATTGCT | 2 | 12 | 3128397 | 3128408 | 16.67 % | 50 % | 16.67 % | 16.67 % | 209696282 |
1007 | NC_011312 | GGTGCA | 2 | 12 | 3128415 | 3128426 | 16.67 % | 16.67 % | 50 % | 16.67 % | 209696282 |
1008 | NC_011312 | TTTGCT | 2 | 12 | 3128457 | 3128468 | 0 % | 66.67 % | 16.67 % | 16.67 % | 209696282 |
1009 | NC_011312 | TCTAAA | 2 | 12 | 3128520 | 3128531 | 50 % | 33.33 % | 0 % | 16.67 % | 209696282 |
1010 | NC_011312 | TGGTAA | 2 | 12 | 3133323 | 3133334 | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 209696286 |
1011 | NC_011312 | CATTAG | 2 | 12 | 3133340 | 3133351 | 33.33 % | 33.33 % | 16.67 % | 16.67 % | 209696286 |
1012 | NC_011312 | TCTAAC | 2 | 12 | 3138567 | 3138578 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 209696291 |
1013 | NC_011312 | TCATCT | 3 | 18 | 3138886 | 3138903 | 16.67 % | 50 % | 0 % | 33.33 % | 209696291 |
1014 | NC_011312 | AATTGA | 2 | 12 | 3140075 | 3140086 | 50 % | 33.33 % | 16.67 % | 0 % | 209696293 |
1015 | NC_011312 | AAAGAA | 2 | 12 | 3141192 | 3141203 | 83.33 % | 0 % | 16.67 % | 0 % | 209696293 |
1016 | NC_011312 | ATAACA | 2 | 12 | 3143159 | 3143170 | 66.67 % | 16.67 % | 0 % | 16.67 % | 209696294 |
1017 | NC_011312 | GGCTTT | 2 | 12 | 3144938 | 3144949 | 0 % | 50 % | 33.33 % | 16.67 % | 209696297 |
1018 | NC_011312 | CACCAA | 2 | 12 | 3148765 | 3148776 | 50 % | 0 % | 0 % | 50 % | 209696302 |
1019 | NC_011312 | CTCGTT | 2 | 12 | 3150178 | 3150189 | 0 % | 50 % | 16.67 % | 33.33 % | 209696303 |
1020 | NC_011312 | GCTTAA | 2 | 12 | 3155855 | 3155866 | 33.33 % | 33.33 % | 16.67 % | 16.67 % | 209696308 |
1021 | NC_011312 | ATGTCA | 2 | 12 | 3162907 | 3162918 | 33.33 % | 33.33 % | 16.67 % | 16.67 % | 209696318 |
1022 | NC_011312 | GGTATT | 2 | 12 | 3163298 | 3163309 | 16.67 % | 50 % | 33.33 % | 0 % | 209696319 |
1023 | NC_011312 | ATAACG | 2 | 12 | 3163564 | 3163575 | 50 % | 16.67 % | 16.67 % | 16.67 % | 209696319 |
1024 | NC_011312 | ATCTTT | 2 | 12 | 3168146 | 3168157 | 16.67 % | 66.67 % | 0 % | 16.67 % | 209696322 |
1025 | NC_011312 | CTTCAA | 2 | 12 | 3170362 | 3170373 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 209696325 |
1026 | NC_011312 | CAGGTA | 2 | 12 | 3172150 | 3172161 | 33.33 % | 16.67 % | 33.33 % | 16.67 % | 209696326 |
1027 | NC_011312 | ACCAAC | 2 | 12 | 3172601 | 3172612 | 50 % | 0 % | 0 % | 50 % | 209696326 |
1028 | NC_011312 | TTTCTT | 2 | 12 | 3176029 | 3176040 | 0 % | 83.33 % | 0 % | 16.67 % | 209696328 |
1029 | NC_011312 | CAAGTC | 2 | 12 | 3176879 | 3176890 | 33.33 % | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 209696329 |
1030 | NC_011312 | AATGAA | 2 | 12 | 3183801 | 3183812 | 66.67 % | 16.67 % | 16.67 % | 0 % | 209696335 |
1031 | NC_011312 | TAAAAA | 2 | 12 | 3184157 | 3184168 | 83.33 % | 16.67 % | 0 % | 0 % | 209696335 |
1032 | NC_011312 | ACCAGA | 2 | 12 | 3184775 | 3184786 | 50 % | 0 % | 16.67 % | 33.33 % | 209696336 |
1033 | NC_011312 | GATGTT | 2 | 12 | 3185948 | 3185959 | 16.67 % | 50 % | 33.33 % | 0 % | 209696336 |
1034 | NC_011312 | CCAGAA | 2 | 12 | 3187117 | 3187128 | 50 % | 0 % | 16.67 % | 33.33 % | 209696337 |
1035 | NC_011312 | AGAACA | 2 | 12 | 3194907 | 3194918 | 66.67 % | 0 % | 16.67 % | 16.67 % | 209696346 |
1036 | NC_011312 | TGGCGG | 2 | 12 | 3205502 | 3205513 | 0 % | 16.67 % | 66.67 % | 16.67 % | 209696355 |
1037 | NC_011312 | CTTGAA | 2 | 12 | 3209704 | 3209715 | 33.33 % | 33.33 % | 16.67 % | 16.67 % | 209696358 |
1038 | NC_011312 | TGCTGA | 2 | 12 | 3210917 | 3210928 | 16.67 % | 33.33 % | 33.33 % | 16.67 % | 209696359 |
1039 | NC_011312 | GTAATG | 2 | 12 | 3211896 | 3211907 | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 209696359 |
1040 | NC_011312 | AAGCAA | 2 | 12 | 3219935 | 3219946 | 66.67 % | 0 % | 16.67 % | 16.67 % | 209696367 |
1041 | NC_011312 | TTAGAA | 2 | 12 | 3223413 | 3223424 | 50 % | 33.33 % | 16.67 % | 0 % | 209696369 |
1042 | NC_011312 | AGAGAA | 2 | 12 | 3226652 | 3226663 | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 0 % | 209696373 |
1043 | NC_011312 | GAGCTA | 2 | 12 | 3230071 | 3230082 | 33.33 % | 16.67 % | 33.33 % | 16.67 % | 209696376 |
1044 | NC_011312 | ACTTAA | 2 | 12 | 3232875 | 3232886 | 50 % | 33.33 % | 0 % | 16.67 % | 209696378 |
1045 | NC_011312 | GGTTGA | 2 | 12 | 3237724 | 3237735 | 16.67 % | 33.33 % | 50 % | 0 % | 209696383 |
1046 | NC_011312 | AAATTT | 2 | 12 | 3238888 | 3238899 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 209696383 |
1047 | NC_011312 | GAAATG | 2 | 12 | 3242480 | 3242491 | 50 % | 16.67 % | 33.33 % | 0 % | 209696386 |
1048 | NC_011312 | TTAATG | 2 | 12 | 3244442 | 3244453 | 33.33 % | 50 % | 16.67 % | 0 % | 209696388 |
1049 | NC_011312 | AAAAAG | 2 | 12 | 3245216 | 3245227 | 83.33 % | 0 % | 16.67 % | 0 % | 209696389 |
1050 | NC_011312 | GAAAAC | 2 | 12 | 3245415 | 3245426 | 66.67 % | 0 % | 16.67 % | 16.67 % | 209696389 |
1051 | NC_011312 | GTTATC | 2 | 12 | 3247105 | 3247116 | 16.67 % | 50 % | 16.67 % | 16.67 % | 209696390 |
1052 | NC_011312 | ACTGAT | 2 | 12 | 3249845 | 3249856 | 33.33 % | 33.33 % | 16.67 % | 16.67 % | 209696394 |
1053 | NC_011312 | CATGGT | 2 | 12 | 3255604 | 3255615 | 16.67 % | 33.33 % | 33.33 % | 16.67 % | 209696398 |
1054 | NC_011312 | ATGGCC | 2 | 12 | 3260245 | 3260256 | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 33.33 % | 209696402 |
1055 | NC_011312 | TTTGAT | 2 | 12 | 3261834 | 3261845 | 16.67 % | 66.67 % | 16.67 % | 0 % | 209696404 |
1056 | NC_011312 | AGTTAA | 2 | 12 | 3264593 | 3264604 | 50 % | 33.33 % | 16.67 % | 0 % | 209696406 |
1057 | NC_011312 | CTATAT | 2 | 12 | 3265893 | 3265904 | 33.33 % | 50 % | 0 % | 16.67 % | 209696407 |
1058 | NC_011312 | GAAAAA | 2 | 12 | 3267964 | 3267975 | 83.33 % | 0 % | 16.67 % | 0 % | 209696409 |
1059 | NC_011312 | ATAGTG | 2 | 12 | 3275477 | 3275488 | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 209696414 |
1060 | NC_011312 | TTATAG | 2 | 12 | 3276825 | 3276836 | 33.33 % | 50 % | 16.67 % | 0 % | 209696415 |
1061 | NC_011312 | TACCAA | 2 | 12 | 3278330 | 3278341 | 50 % | 16.67 % | 0 % | 33.33 % | 209696417 |
1062 | NC_011312 | TGCGAT | 2 | 12 | 3283227 | 3283238 | 16.67 % | 33.33 % | 33.33 % | 16.67 % | 209696423 |
1063 | NC_011312 | TGATTT | 2 | 12 | 3295771 | 3295782 | 16.67 % | 66.67 % | 16.67 % | 0 % | 209696430 |
1064 | NC_011312 | TGGTAA | 2 | 12 | 3304122 | 3304133 | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 209696435 |
1065 | NC_011312 | TTTCAG | 2 | 12 | 3305194 | 3305205 | 16.67 % | 50 % | 16.67 % | 16.67 % | 209696436 |
1066 | NC_011312 | CTTCAA | 2 | 12 | 3312809 | 3312820 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 209696441 |
1067 | NC_011312 | CATTTT | 2 | 12 | 3312908 | 3312919 | 16.67 % | 66.67 % | 0 % | 16.67 % | 209696441 |
1068 | NC_011312 | AGGCTC | 2 | 12 | 3315814 | 3315825 | 16.67 % | 16.67 % | 33.33 % | 33.33 % | 209696444 |
1069 | NC_011312 | CAGAAG | 2 | 12 | 3317352 | 3317363 | 50 % | 0 % | 33.33 % | 16.67 % | 209696445 |
1070 | NC_011312 | GCAAGA | 2 | 12 | 3321784 | 3321795 | 50 % | 0 % | 33.33 % | 16.67 % | 209696452 |
1071 | NC_011312 | CGTTGA | 2 | 12 | 3323390 | 3323401 | 16.67 % | 33.33 % | 33.33 % | 16.67 % | 209696454 |