MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 1071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011312	GTCAAA	2	12	1551140	1551151	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	209694955
502	NC_011312	TTTTCT	2	12	1554727	1554738	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	209694959
503	NC_011312	GGGATG	2	12	1557088	1557099	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	209694961
504	NC_011312	ATGACT	2	12	1563431	1563442	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	209694964
505	NC_011312	ATTTTG	2	12	1563596	1563607	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	209694964
506	NC_011312	GCAAGC	2	12	1570435	1570446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209694970
507	NC_011312	AGCACA	2	12	1570473	1570484	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209694970
508	NC_011312	CAGAAG	2	12	1571309	1571320	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	209694970
509	NC_011312	TCTTTC	2	12	1573842	1573853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209694972
510	NC_011312	CTTTAA	2	12	1582196	1582207	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	209694978
511	NC_011312	CTTCTG	2	12	1582362	1582373	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	209694978
512	NC_011312	TGGTTT	2	12	1585519	1585530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209694981
513	NC_011312	AGTAAA	2	12	1588068	1588079	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	209694986
514	NC_011312	CAGAAG	2	12	1590273	1590284	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	209694989
515	NC_011312	TTAAAG	2	12	1590439	1590450	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	209694989
516	NC_011312	GATAAT	2	12	1596179	1596190	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	209694996
517	NC_011312	TTGAAT	2	12	1599306	1599317	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	209694999
518	NC_011312	CAGAAG	2	12	1600523	1600534	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	209695001
519	NC_011312	TTAAAG	2	12	1600689	1600700	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	209695001
520	NC_011312	TGGAAG	2	12	1607406	1607417	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	209695008
521	NC_011312	AGAAAA	2	12	1609308	1609319	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	209695012
522	NC_011312	ACATTG	2	12	1609517	1609528	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	209695012
523	NC_011312	ATAGAA	2	12	1610877	1610888	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	209695014
524	NC_011312	AATTTT	2	12	1619344	1619355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209695024
525	NC_011312	GTAGGG	2	12	1620105	1620116	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	209695025
526	NC_011312	TTTGCA	2	12	1620919	1620930	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	209695026
527	NC_011312	TTTTCT	2	12	1623610	1623621	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	209695029
528	NC_011312	GATGTT	2	12	1636168	1636179	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	209695040
529	NC_011312	CGTATG	2	12	1636841	1636852	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209695041
530	NC_011312	TCGGAA	2	12	1637468	1637479	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209695042
531	NC_011312	ATTGTC	2	12	1639654	1639665	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	209695043
532	NC_011312	CTTTTC	3	18	1640619	1640636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209695044
533	NC_011312	AGAAAT	2	12	1644736	1644747	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	209695046
534	NC_011312	CTTGTA	2	12	1645080	1645091	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	209695046
535	NC_011312	CAAGAA	2	12	1645569	1645580	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	209695046
536	NC_011312	TAGATA	2	12	1646306	1646317	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	209695047
537	NC_011312	TAGATT	2	12	1649447	1649458	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	209695050
538	NC_011312	TTATCA	2	12	1649783	1649794	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	209695050
539	NC_011312	GTTAGC	2	12	1653037	1653048	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209695051
540	NC_011312	AGTTAC	2	12	1653119	1653130	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	209695051
541	NC_011312	GTATGT	2	12	1660126	1660137	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	209695053
542	NC_011312	TGCATT	2	12	1660151	1660162	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	209695053
543	NC_011312	GCGACT	2	12	1666505	1666516	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209695057
544	NC_011312	CACCAA	2	12	1667486	1667497	50 %	0 %	0 %	50 %	209695059
545	NC_011312	AGAACA	2	12	1669981	1669992	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	209695061
546	NC_011312	TAGATT	2	12	1670010	1670021	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	209695061
547	NC_011312	GGTGTA	2	12	1675335	1675346	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	209695066
548	NC_011312	CTCAAC	2	12	1678537	1678548	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	209695070
549	NC_011312	TATTGT	2	12	1680011	1680022	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	209695071
550	NC_011312	AACCAA	2	12	1680185	1680196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209695071
551	NC_011312	TGTTGC	2	12	1681440	1681451	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	209695072
552	NC_011312	TAAAAG	2	12	1683494	1683505	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	209695075
553	NC_011312	TTAATG	2	12	1693520	1693531	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	209695086
554	NC_011312	TTGCCT	2	12	1700682	1700693	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	209695094
555	NC_011312	AAATGA	2	12	1707630	1707641	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	209695102
556	NC_011312	TTTTCT	2	12	1712304	1712315	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	209695106
557	NC_011312	TTAGCC	2	12	1715481	1715492	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	209695110
558	NC_011312	TTTACC	2	12	1722625	1722636	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	209695116
559	NC_011312	AAGCCA	2	12	1722890	1722901	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209695116
560	NC_011312	AATCGC	2	12	1723720	1723731	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	209695116
561	NC_011312	CAGAAG	2	12	1724347	1724358	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	209695117
562	NC_011312	TTAAAG	2	12	1724513	1724524	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	209695117
563	NC_011312	TTAAAA	2	12	1726825	1726836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209695120
564	NC_011312	CAGAAG	2	12	1727692	1727703	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	209695121
565	NC_011312	TTAAAG	2	12	1727858	1727869	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	209695121
566	NC_011312	CATTTC	2	12	1730991	1731002	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	209695125
567	NC_011312	CAAGCT	3	18	1731770	1731787	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	209695127
568	NC_011312	GCTTAA	2	12	1733572	1733583	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	209695129
569	NC_011312	TGATTG	2	12	1733857	1733868	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	209695129
570	NC_011312	AATTAT	2	12	1734724	1734735	50 %	50 %	0 %	0 %	209695130
571	NC_011312	CAGAAG	2	12	1737036	1737047	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	209695131
572	NC_011312	TTAAAG	2	12	1737202	1737213	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	209695131
573	NC_011312	ATCAAC	2	12	1737935	1737946	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	209695133
574	NC_011312	TGGTTG	2	12	1738193	1738204	0 %	50 %	50 %	0 %	209695133
575	NC_011312	TAAAGA	2	12	1739294	1739305	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	209695134
576	NC_011312	AAAGCA	2	12	1741098	1741109	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	209695135
577	NC_011312	TTAGAT	2	12	1744329	1744340	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	209695139
578	NC_011312	AATACA	2	12	1745254	1745265	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	209695141
579	NC_011312	GATCAT	2	12	1746044	1746055	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	209695142
580	NC_011312	AAAATC	2	12	1746458	1746469	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	209695143
581	NC_011312	CTTGCC	2	12	1747539	1747550	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	209695145
582	NC_011312	TAGTTA	2	12	1751073	1751084	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	209695150
583	NC_011312	TTTTCT	2	12	1752204	1752215	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	209695151
584	NC_011312	GAAAAA	2	12	1781745	1781756	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	209695180
585	NC_011312	TTCTCT	2	12	1783953	1783964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209695181
586	NC_011312	GCAAGC	2	12	1785228	1785239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209695182
587	NC_011312	AACACC	2	12	1785699	1785710	50 %	0 %	0 %	50 %	209695183
588	NC_011312	TTGCAA	2	12	1785980	1785991	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	209695183
589	NC_011312	TTTTCT	2	12	1788680	1788691	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	209695185
590	NC_011312	TTCTTT	2	12	1789953	1789964	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	209695187
591	NC_011312	ATCAAC	2	12	1792515	1792526	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	209695189
592	NC_011312	CATCTT	2	12	1792834	1792845	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	209695190
593	NC_011312	TTGCCA	2	12	1793285	1793296	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	209695190
594	NC_011312	TTTTCA	2	12	1795321	1795332	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	209695192
595	NC_011312	TTTTCT	2	12	1803030	1803041	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	209695195
596	NC_011312	GAAAGC	2	12	1804613	1804624	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	209695197
597	NC_011312	ACCATC	2	12	1831539	1831550	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	209695207
598	NC_011312	TCTGAA	2	12	1835903	1835914	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	209695210
599	NC_011312	AGTTTG	2	12	1836032	1836043	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	209695210
600	NC_011312	AAAGTT	2	12	1839798	1839809	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	209695213
601	NC_011312	TGCTAC	2	12	1846044	1846055	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	209695217
602	NC_011312	CAGAAG	2	12	1850692	1850703	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	209695219
603	NC_011312	TTAAAG	2	12	1850858	1850869	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	209695219
604	NC_011312	TTTATA	2	12	1852102	1852113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209695221
605	NC_011312	TTTATA	2	12	1852863	1852874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209695222
606	NC_011312	CATAGG	2	12	1857864	1857875	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209695224
607	NC_011312	ATTACT	2	12	1864907	1864918	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	209695230
608	NC_011312	GAATAT	2	12	1865338	1865349	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	209695230
609	NC_011312	AAAAAT	2	12	1867087	1867098	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	209695231
610	NC_011312	TGAAGC	2	12	1869126	1869137	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209695234
611	NC_011312	GGTATT	2	12	1869199	1869210	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	209695234
612	NC_011312	CTGTTT	2	12	1871302	1871313	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	209695238
613	NC_011312	CTTTAC	2	12	1871673	1871684	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	209695239
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712	NC_011312	CATTGT	2	12	2202967	2202978	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	209695503
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719	NC_011312	TTATCT	2	12	2225672	2225683	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	209695520
720	NC_011312	GAAAAT	2	12	2226737	2226748	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	209695521
721	NC_011312	AACTGG	2	12	2232356	2232367	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209695527
722	NC_011312	CTAACG	2	12	2241802	2241813	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	209695535
723	NC_011312	TTTCGC	2	12	2250193	2250204	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	209695542
724	NC_011312	AACGTC	2	12	2253845	2253856	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	209695548
725	NC_011312	GTCCAT	2	12	2253978	2253989	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	209695549
726	NC_011312	ACGTTA	2	12	2256113	2256124	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	209695551
727	NC_011312	CAGAAC	2	12	2257837	2257848	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209695552
728	NC_011312	CAACAC	2	12	2259785	2259796	50 %	0 %	0 %	50 %	209695554
729	NC_011312	GTTTTA	2	12	2261351	2261362	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	209695556
730	NC_011312	GACTAA	2	12	2263228	2263239	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	209695557
731	NC_011312	TGTATT	2	12	2264581	2264592	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	209695557
732	NC_011312	AAATGA	2	12	2269179	2269190	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	209695561
733	NC_011312	TTATGG	2	12	2270809	2270820	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	209695562
734	NC_011312	TTGCAG	2	12	2271248	2271259	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209695563
735	NC_011312	TTTGAT	2	12	2275476	2275487	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	209695569
736	NC_011312	TGCCTC	2	12	2275974	2275985	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	209695570
737	NC_011312	AGAAAT	3	18	2282829	2282846	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	209695574
738	NC_011312	ACTTTT	2	12	2284215	2284226	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	209695575
739	NC_011312	CTAAAC	2	12	2291726	2291737	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	209695579
740	NC_011312	AATTAA	2	12	2294555	2294566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209695580
741	NC_011312	CGATAA	2	12	2296759	2296770	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	209695582
742	NC_011312	CATCTT	2	12	2313900	2313911	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	209695596
743	NC_011312	CAATAC	2	12	2315249	2315260	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	209695597
744	NC_011312	TGAAGC	2	12	2328396	2328407	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209695604
745	NC_011312	TATTGC	2	12	2329904	2329915	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	209695606
746	NC_011312	CATCGC	2	12	2333169	2333180	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209695609
747	NC_011312	CAGGCC	2	12	2335735	2335746	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209695613
748	NC_011312	TGTTTC	2	12	2350079	2350090	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	209695625
749	NC_011312	AAATTG	2	12	2351000	2351011	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	209695626
750	NC_011312	TTTCAG	2	12	2356688	2356699	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	209695630
751	NC_011312	GTGAAA	2	12	2366276	2366287	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	209695637
752	NC_011312	GTTGAT	2	12	2369238	2369249	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	209695642
753	NC_011312	TTAGCA	2	12	2370957	2370968	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	209695642
754	NC_011312	ATACCG	2	12	2383721	2383732	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	209695653
755	NC_011312	GAAAAT	2	12	2385618	2385629	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	209695655
756	NC_011312	TTGAAG	2	12	2387574	2387585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209695657
757	NC_011312	TGAGCG	2	12	2388667	2388678	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209695657
758	NC_011312	CTTTTT	2	12	2392259	2392270	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	209695662
759	NC_011312	CTATTC	2	12	2398047	2398058	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	209695665
760	NC_011312	ACGACC	2	12	2401164	2401175	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	209695668
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763	NC_011312	AAGCAA	2	12	2401997	2402008	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	209695668
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766	NC_011312	GAAGAG	2	12	2407971	2407982	50 %	0 %	50 %	0 %	209695672
767	NC_011312	ATAGCG	2	12	2408415	2408426	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209695674
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777	NC_011312	CCAACA	2	12	2444737	2444748	50 %	0 %	0 %	50 %	209695701
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782	NC_011312	CACGAA	2	12	2451773	2451784	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	209695708
783	NC_011312	TCTGGC	10	60	2457764	2457823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209695716
784	NC_011312	GGTGCA	2	12	2461618	2461629	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209695719
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787	NC_011312	TAGAAA	2	12	2470349	2470360	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	209695727
788	NC_011312	ACTGAC	2	12	2470441	2470452	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	209695727
789	NC_011312	ATTCAA	2	12	2473891	2473902	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	209695733
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806	NC_011312	CATTGC	2	12	2512001	2512012	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	209695763
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813	NC_011312	AACCAC	2	12	2536806	2536817	50 %	0 %	0 %	50 %	209695788
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823	NC_011312	TCCTGG	2	12	2568907	2568918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209695824
824	NC_011312	TGGTGA	2	12	2570382	2570393	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	209695826
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827	NC_011312	CGTCTT	2	12	2576432	2576443	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	209695832
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829	NC_011312	TGCTTC	2	12	2594351	2594362	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	209695847
830	NC_011312	TCTTTA	2	12	2594973	2594984	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	209695848
831	NC_011312	TGCCTG	2	12	2595761	2595772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209695849
832	NC_011312	CTTTTT	2	12	2596615	2596626	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	209695850
833	NC_011312	TGATAT	2	12	2599738	2599749	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	209695853
834	NC_011312	TCACGG	2	12	2607009	2607020	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209695859
835	NC_011312	CTTCAA	2	12	2614794	2614805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209695865
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937	NC_011312	TGCATC	2	12	2891545	2891556	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	209696080
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939	NC_011312	GAGCAA	2	12	2902020	2902031	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	209696087
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943	NC_011312	AAAGAT	2	12	2911538	2911549	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	209696097
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