MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 2619

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011312	GTGAG	2	10	4390	4399	20 %	20 %	60 %	0 %	209693638
2	NC_011312	TTTAA	2	10	4669	4678	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011312	TTGCC	2	10	5261	5270	0 %	40 %	20 %	40 %	209693640
4	NC_011312	ATTTG	2	10	6861	6870	20 %	60 %	20 %	0 %	209693642
5	NC_011312	TTTGT	2	10	7114	7123	0 %	80 %	20 %	0 %	209693642
6	NC_011312	GTTAC	2	10	9505	9514	20 %	40 %	20 %	20 %	209693644
7	NC_011312	GAGTT	2	10	10508	10517	20 %	40 %	40 %	0 %	209693645
8	NC_011312	GAAGT	2	10	12121	12130	40 %	20 %	40 %	0 %	209693646
9	NC_011312	CGCTG	2	10	13032	13041	0 %	20 %	40 %	40 %	209693646
10	NC_011312	GAGTC	2	10	16073	16082	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011312	TTTTA	2	10	16206	16215	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011312	CAATA	2	10	16467	16476	60 %	20 %	0 %	20 %	209693648
13	NC_011312	CGCTT	2	10	17845	17854	0 %	40 %	20 %	40 %	209693650
14	NC_011312	TTCTT	2	10	18829	18838	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011312	CGCTT	2	10	19344	19353	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011312	AAGCG	2	10	19533	19542	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011312	TTTGA	2	10	21662	21671	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011312	TCTCT	2	10	22291	22300	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011312	TTCGC	2	10	22425	22434	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_011312	AAATG	2	10	22607	22616	60 %	20 %	20 %	0 %	209693654
21	NC_011312	TGTTT	2	10	26201	26210	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011312	TGATA	2	10	26302	26311	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011312	GAAAT	2	10	27379	27388	60 %	20 %	20 %	0 %	209693658
24	NC_011312	CAAAA	2	10	28281	28290	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011312	TGATA	2	10	28344	28353	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011312	ATTAC	2	10	29294	29303	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011312	CATTA	2	10	30785	30794	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011312	TTAAG	2	10	31792	31801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011312	TAACT	2	10	32544	32553	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011312	TTTCA	2	10	33510	33519	20 %	60 %	0 %	20 %	209693664
31	NC_011312	TTCAA	2	10	33606	33615	40 %	40 %	0 %	20 %	209693664
32	NC_011312	TCATT	2	10	33657	33666	20 %	60 %	0 %	20 %	209693664
33	NC_011312	TTTTA	2	10	33783	33792	20 %	80 %	0 %	0 %	209693664
34	NC_011312	AAGAA	2	10	34574	34583	80 %	0 %	20 %	0 %	209693664
35	NC_011312	ATGAA	2	10	34775	34784	60 %	20 %	20 %	0 %	209693664
36	NC_011312	TATTG	2	10	36229	36238	20 %	60 %	20 %	0 %	209693666
37	NC_011312	GAAAA	2	10	36610	36619	80 %	0 %	20 %	0 %	209693667
38	NC_011312	TAAGG	2	10	37109	37118	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011312	TCAGA	2	10	38757	38766	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011312	GCCTA	2	10	40385	40394	20 %	20 %	20 %	40 %	209693669
41	NC_011312	AAATG	2	10	42137	42146	60 %	20 %	20 %	0 %	209693670
42	NC_011312	TGAGC	2	10	44658	44667	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011312	GAAAG	2	10	45791	45800	60 %	0 %	40 %	0 %	209693672
44	NC_011312	ACAAT	2	10	46689	46698	60 %	20 %	0 %	20 %	209693673
45	NC_011312	GCCAT	2	10	48212	48221	20 %	20 %	20 %	40 %	209693675
46	NC_011312	CTTTG	2	10	50406	50415	0 %	60 %	20 %	20 %	209693676
47	NC_011312	AATTC	2	10	54690	54699	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_011312	ACGTA	2	10	55763	55772	40 %	20 %	20 %	20 %	209693682
49	NC_011312	AGTTT	2	10	57729	57738	20 %	60 %	20 %	0 %	209693683
50	NC_011312	ATGTA	2	10	58243	58252	40 %	40 %	20 %	0 %	209693684
51	NC_011312	ATTTG	2	10	58289	58298	20 %	60 %	20 %	0 %	209693684
52	NC_011312	ATTGG	2	10	59453	59462	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011312	CCTTA	2	10	61198	61207	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_011312	TTGAA	2	10	63211	63220	40 %	40 %	20 %	0 %	209693687
55	NC_011312	GCTTT	2	10	64854	64863	0 %	60 %	20 %	20 %	209693690
56	NC_011312	AATTA	2	10	65844	65853	60 %	40 %	0 %	0 %	209693691
57	NC_011312	ATAAA	2	10	69216	69225	80 %	20 %	0 %	0 %	209693692
58	NC_011312	GAGTC	2	10	72494	72503	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_011312	TTTTA	2	10	72627	72636	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011312	CAATA	2	10	72888	72897	60 %	20 %	0 %	20 %	209693694
61	NC_011312	AAAGT	2	10	74323	74332	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011312	TTCGT	2	10	76043	76052	0 %	60 %	20 %	20 %	209693696
63	NC_011312	CCTGC	2	10	76248	76257	0 %	20 %	20 %	60 %	209693696
64	NC_011312	AAAAT	2	10	77607	77616	80 %	20 %	0 %	0 %	209693697
65	NC_011312	ATCAT	2	10	79057	79066	40 %	40 %	0 %	20 %	209693699
66	NC_011312	ATTTA	2	10	79501	79510	40 %	60 %	0 %	0 %	209693700
67	NC_011312	TTTAG	2	10	80265	80274	20 %	60 %	20 %	0 %	209693700
68	NC_011312	CCCTG	2	10	82147	82156	0 %	20 %	20 %	60 %	209693703
69	NC_011312	AAGAA	2	10	82437	82446	80 %	0 %	20 %	0 %	209693703
70	NC_011312	CTATT	2	10	82532	82541	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011312	GAATA	2	10	84318	84327	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011312	AAGCA	2	10	85017	85026	60 %	0 %	20 %	20 %	209693707
73	NC_011312	GTGAC	2	10	85507	85516	20 %	20 %	40 %	20 %	209693707
74	NC_011312	TGTCT	2	10	85897	85906	0 %	60 %	20 %	20 %	209693708
75	NC_011312	CCCAT	2	10	86775	86784	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
76	NC_011312	CAAGT	2	10	92161	92170	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_011312	CAAGT	2	10	97737	97746	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_011312	CAAGT	2	10	103410	103419	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_011312	CAAGT	2	10	109183	109192	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_011312	TAAAA	2	10	115112	115121	80 %	20 %	0 %	0 %	209693710
81	NC_011312	ATGAA	2	10	117044	117053	60 %	20 %	20 %	0 %	209693711
82	NC_011312	GAATT	2	10	118850	118859	40 %	40 %	20 %	0 %	209693713
83	NC_011312	GCTTG	2	10	118962	118971	0 %	40 %	40 %	20 %	209693713
84	NC_011312	AAGCA	2	10	120755	120764	60 %	0 %	20 %	20 %	209693713
85	NC_011312	TTGGT	2	10	121741	121750	0 %	60 %	40 %	0 %	209693714
86	NC_011312	CTAAG	2	10	122073	122082	40 %	20 %	20 %	20 %	209693715
87	NC_011312	ATGAA	2	10	122542	122551	60 %	20 %	20 %	0 %	209693715
88	NC_011312	CATTC	2	10	122964	122973	20 %	40 %	0 %	40 %	209693716
89	NC_011312	CGTGG	2	10	123462	123471	0 %	20 %	60 %	20 %	209693716
90	NC_011312	TTATT	2	10	123489	123498	20 %	80 %	0 %	0 %	209693716
91	NC_011312	GCATT	2	10	124910	124919	20 %	40 %	20 %	20 %	209693717
92	NC_011312	CGAAA	2	10	125790	125799	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011312	TACGT	2	10	128752	128761	20 %	40 %	20 %	20 %	209693718
94	NC_011312	GTTAC	2	10	133130	133139	20 %	40 %	20 %	20 %	209693721
95	NC_011312	CTGTG	2	10	133485	133494	0 %	40 %	40 %	20 %	209693721
96	NC_011312	TACCA	2	10	137255	137264	40 %	20 %	0 %	40 %	209693724
97	NC_011312	CAGCT	2	10	138357	138366	20 %	20 %	20 %	40 %	209693726
98	NC_011312	TAAAA	2	10	140033	140042	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011312	AAAAG	2	10	144393	144402	80 %	0 %	20 %	0 %	209693731
100	NC_011312	TTTTA	2	10	145779	145788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011312	GCCTA	2	10	146168	146177	20 %	20 %	20 %	40 %	209693735
102	NC_011312	ATAAA	2	10	147641	147650	80 %	20 %	0 %	0 %	209693738
103	NC_011312	GACTC	2	10	147775	147784	20 %	20 %	20 %	40 %	209693738
104	NC_011312	CGTTG	2	10	150387	150396	0 %	40 %	40 %	20 %	209693739
105	NC_011312	CCTGT	2	10	150652	150661	0 %	40 %	20 %	40 %	209693739
106	NC_011312	AATCC	2	10	150895	150904	40 %	20 %	0 %	40 %	209693739
107	NC_011312	GTTGT	2	10	151669	151678	0 %	60 %	40 %	0 %	209693740
108	NC_011312	TGTTT	2	10	152012	152021	0 %	80 %	20 %	0 %	209693741
109	NC_011312	AACAG	2	10	152401	152410	60 %	0 %	20 %	20 %	209693741
110	NC_011312	AGTTA	2	10	152632	152641	40 %	40 %	20 %	0 %	209693741
111	NC_011312	ATTTA	2	10	153552	153561	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011312	AAATG	2	10	154067	154076	60 %	20 %	20 %	0 %	209693742
113	NC_011312	TTTAT	2	10	155316	155325	20 %	80 %	0 %	0 %	209693743
114	NC_011312	TTGGG	2	10	157139	157148	0 %	40 %	60 %	0 %	209693745
115	NC_011312	TCCAT	2	10	159034	159043	20 %	40 %	0 %	40 %	209693746
116	NC_011312	TGAAT	2	10	160010	160019	40 %	40 %	20 %	0 %	209693746
117	NC_011312	TGGGG	2	10	160448	160457	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011312	TAAAA	2	10	162427	162436	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011312	TTTTC	2	10	162522	162531	0 %	80 %	0 %	20 %	209693749
120	NC_011312	AAATT	2	10	163056	163065	60 %	40 %	0 %	0 %	209693749
121	NC_011312	TCGAC	2	10	164204	164213	20 %	20 %	20 %	40 %	209693751
122	NC_011312	AAATC	2	10	167998	168007	60 %	20 %	0 %	20 %	209693755
123	NC_011312	AATCT	2	10	170411	170420	40 %	40 %	0 %	20 %	209693756
124	NC_011312	TTGGC	2	10	179281	179290	0 %	40 %	40 %	20 %	209693761
125	NC_011312	ATAAA	2	10	182315	182324	80 %	20 %	0 %	0 %	209693766
126	NC_011312	GACTC	2	10	182449	182458	20 %	20 %	20 %	40 %	209693766
127	NC_011312	GAAGC	2	10	183818	183827	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_011312	GATAA	2	10	184176	184185	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011312	TAAAT	2	10	186903	186912	60 %	40 %	0 %	0 %	209693768
130	NC_011312	GTTTT	2	10	187113	187122	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011312	AGCTA	2	10	187127	187136	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011312	ATTTC	2	10	187209	187218	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_011312	AAAGT	2	10	192035	192044	60 %	20 %	20 %	0 %	209693773
134	NC_011312	AAAAT	2	10	192754	192763	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011312	GAGTC	2	10	194170	194179	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_011312	TTTTA	2	10	194303	194312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011312	CAATA	2	10	194564	194573	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011312	TAAAG	2	10	195298	195307	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011312	AAAAC	2	10	196384	196393	80 %	0 %	0 %	20 %	209693775
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271	NC_011312	AGCGT	2	10	349446	349455	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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