MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 2619

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011312	CAAAC	2	10	1919965	1919974	60 %	0 %	0 %	40 %	209695272
1502	NC_011312	TTGCA	2	10	1920600	1920609	20 %	40 %	20 %	20 %	209695272
1503	NC_011312	GTGAA	2	10	1921038	1921047	40 %	20 %	40 %	0 %	209695272
1504	NC_011312	TGCTT	2	10	1921374	1921383	0 %	60 %	20 %	20 %	209695273
1505	NC_011312	TGAAA	2	10	1922644	1922653	60 %	20 %	20 %	0 %	209695275
1506	NC_011312	AATAG	2	10	1926766	1926775	60 %	20 %	20 %	0 %	209695278
1507	NC_011312	ATAAA	2	10	1933693	1933702	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_011312	GACTC	2	10	1933827	1933836	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1509	NC_011312	AAATG	2	10	1937833	1937842	60 %	20 %	20 %	0 %	209695287
1510	NC_011312	TAAAA	2	10	1938928	1938937	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_011312	AGTAA	2	10	1939592	1939601	60 %	20 %	20 %	0 %	209695289
1512	NC_011312	ATTTT	2	10	1941827	1941836	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_011312	AATGA	2	10	1942106	1942115	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_011312	GAAGA	2	10	1942627	1942636	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_011312	TAAAA	2	10	1942677	1942686	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_011312	GTATT	2	10	1943959	1943968	20 %	60 %	20 %	0 %	209695291
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1523	NC_011312	GAAAA	2	10	1960509	1960518	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_011312	AGCTC	2	10	1962292	1962301	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1525	NC_011312	TTCAC	2	10	1962441	1962450	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1527	NC_011312	TTTTA	2	10	1966574	1966583	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1537	NC_011312	ATTTT	2	10	1979523	1979532	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1542	NC_011312	TTTAA	2	10	1985805	1985814	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_011312	CATGG	2	10	1986112	1986121	20 %	20 %	40 %	20 %	209695317
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1596	NC_011312	AAATT	2	10	2042361	2042370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1756	NC_011312	ACTTT	2	10	2224170	2224179	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1757	NC_011312	TCACA	2	10	2225394	2225403	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1758	NC_011312	TAAGA	2	10	2226817	2226826	60 %	20 %	20 %	0 %	209695521
1759	NC_011312	AATTA	2	10	2228604	2228613	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1767	NC_011312	GAGTC	2	10	2238472	2238481	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1768	NC_011312	TTTTA	2	10	2238605	2238614	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1769	NC_011312	CAATA	2	10	2238866	2238875	60 %	20 %	0 %	20 %	209695532
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1791	NC_011312	GTATT	2	10	2268414	2268423	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1792	NC_011312	GTGAA	2	10	2269560	2269569	40 %	20 %	40 %	0 %	209695561
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1797	NC_011312	AATAA	2	10	2273166	2273175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1798	NC_011312	TTCAC	2	10	2275069	2275078	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1812	NC_011312	ATGCA	2	10	2295097	2295106	40 %	20 %	20 %	20 %	209695581
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1988	NC_011312	TTTAC	2	10	2502275	2502284	20 %	60 %	0 %	20 %	209695755
1989	NC_011312	TAATG	2	10	2502607	2502616	40 %	40 %	20 %	0 %	209695755
1990	NC_011312	GTTCA	2	10	2505107	2505116	20 %	40 %	20 %	20 %	209695756
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1992	NC_011312	AATTA	2	10	2507411	2507420	60 %	40 %	0 %	0 %	209695758
1993	NC_011312	AAACC	2	10	2507701	2507710	60 %	0 %	0 %	40 %	209695758
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1995	NC_011312	GTTGC	2	10	2511123	2511132	0 %	40 %	40 %	20 %	209695762
1996	NC_011312	GCATT	2	10	2512118	2512127	20 %	40 %	20 %	20 %	209695763
1997	NC_011312	AACCA	2	10	2514780	2514789	60 %	0 %	0 %	40 %	209695767
1998	NC_011312	AATTA	2	10	2517723	2517732	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1999	NC_011312	AATAA	2	10	2518807	2518816	80 %	20 %	0 %	0 %	209695772
2000	NC_011312	TAAAT	2	10	2521073	2521082	60 %	40 %	0 %	0 %	209695774

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