MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 9195

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011312	TTA	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011312	TAT	2	6	38	43	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011312	TAT	2	6	50	55	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011312	TCG	2	6	61	66	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011312	CAA	2	6	93	98	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011312	TAA	2	6	279	284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011312	CAT	2	6	302	307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011312	ATT	2	6	782	787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011312	ATT	2	6	2180	2185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011312	GCC	2	6	2244	2249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011312	TGC	2	6	3924	3929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011312	CAT	2	6	3955	3960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011312	TGA	2	6	4093	4098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011312	AAT	2	6	4486	4491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011312	TTA	2	6	4644	4649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011312	AGT	2	6	4656	4661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011312	CAA	2	6	4711	4716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011312	ATT	2	6	6236	6241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011312	TAA	2	6	7210	7215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011312	AAT	2	6	7219	7224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011312	AAG	2	6	13637	13642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011312	CAA	2	6	15265	15270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011312	GTT	2	6	15511	15516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011312	TCA	2	6	15517	15522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011312	GTT	2	6	15536	15541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011312	TTA	2	6	15565	15570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011312	TTA	2	6	15596	15601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011312	AAT	2	6	15627	15632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011312	TAA	2	6	15698	15703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011312	ATA	2	6	15943	15948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011312	TCA	2	6	16021	16026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011312	ATG	2	6	16033	16038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011312	TCT	3	9	16042	16050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011312	AGA	2	6	16135	16140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011312	ATA	2	6	16242	16247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011312	CCT	2	6	16266	16271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_011312	TTA	2	6	18847	18852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011312	TTA	2	6	19249	19254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011312	CCA	2	6	19452	19457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_011312	CTC	2	6	19509	19514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_011312	TCC	2	6	19525	19530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_011312	CAA	2	6	20935	20940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011312	ATA	2	6	20998	21003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011312	ATA	2	6	21008	21013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011312	ATA	2	6	21023	21028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011312	TAT	2	6	21146	21151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011312	TTG	2	6	21180	21185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011312	AGA	2	6	21530	21535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011312	AGC	2	6	21585	21590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011312	TCC	2	6	22181	22186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_011312	TGG	2	6	22226	22231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011312	GTC	2	6	22238	22243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011312	GTT	2	6	23634	23639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011312	CAA	2	6	25135	25140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011312	AAC	2	6	26048	26053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011312	TCA	2	6	26176	26181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011312	TAA	2	6	26255	26260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011312	AAT	2	6	26320	26325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011312	TCT	2	6	26404	26409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011312	AGT	2	6	26425	26430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011312	TAA	2	6	27236	27241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011312	GTT	2	6	27276	27281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011312	AAT	2	6	28362	28367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011312	ATT	2	6	29266	29271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011312	ATA	2	6	29331	29336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011312	ATA	2	6	29447	29452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011312	AGT	2	6	29472	29477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011312	ACT	2	6	29492	29497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011312	CTT	2	6	29502	29507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011312	GAA	2	6	29539	29544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011312	AAT	2	6	31823	31828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011312	TTA	2	6	31894	31899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011312	AAT	2	6	32092	32097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011312	AGA	2	6	32111	32116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011312	TCA	2	6	32157	32162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011312	GTA	2	6	32557	32562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011312	GAC	2	6	32587	32592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011312	TTA	2	6	32597	32602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011312	TTA	2	6	32614	32619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011312	CTG	2	6	32623	32628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011312	TAA	2	6	32630	32635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011312	ACA	2	6	32652	32657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011312	ATC	2	6	32670	32675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011312	GAA	2	6	32680	32685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011312	GTT	2	6	32756	32761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011312	ATT	2	6	32820	32825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011312	TAG	2	6	33153	33158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011312	GGC	2	6	35829	35834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011312	GAA	2	6	35909	35914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011312	TAT	2	6	35929	35934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011312	GTT	2	6	36323	36328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011312	AAT	2	6	36331	36336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011312	ACA	2	6	37059	37064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011312	TGT	2	6	37094	37099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011312	CAA	2	6	38492	38497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011312	AAG	2	6	38551	38556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011312	GAA	2	6	38697	38702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011312	TCT	2	6	38771	38776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011312	GCA	2	6	38787	38792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011312	GCA	2	6	38799	38804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011312	TGA	2	6	38843	38848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011312	AGC	2	6	38861	38866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011312	CAA	2	6	38881	38886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011312	AGA	2	6	38927	38932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011312	AAC	2	6	38937	38942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011312	TGA	2	6	39011	39016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011312	AGC	2	6	39173	39178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011312	TAT	2	6	39452	39457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011312	TTA	2	6	39529	39534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011312	TGA	2	6	39666	39671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011312	TAA	2	6	39813	39818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011312	ATT	2	6	40087	40092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011312	ATT	2	6	41228	41233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011312	CTT	2	6	41282	41287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011312	TTA	2	6	42640	42645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011312	TTG	2	6	42709	42714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011312	TAG	2	6	44278	44283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011312	CCA	2	6	44349	44354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_011312	CAT	2	6	44365	44370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011312	ATG	2	6	44379	44384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011312	GGT	2	6	44408	44413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011312	CTT	2	6	44419	44424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011312	TAA	2	6	44426	44431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011312	AAC	2	6	44438	44443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011312	CAT	2	6	44506	44511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011312	TTC	2	6	44522	44527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011312	CAC	2	6	44629	44634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_011312	ATT	2	6	44836	44841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011312	AAT	2	6	44850	44855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011312	TAT	2	6	46449	46454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011312	TCA	2	6	49074	49079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011312	AAT	2	6	49095	49100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011312	ATT	3	9	50538	50546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011312	TTG	2	6	50580	50585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011312	TGA	3	9	50629	50637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011312	ATT	2	6	51033	51038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011312	TAT	2	6	51128	51133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011312	ACT	2	6	51146	51151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011312	CGG	2	6	51236	51241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011312	TAT	2	6	51282	51287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011312	TTA	2	6	51412	51417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_011312	TAA	2	6	51491	51496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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