MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 9195

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011312	ATC	2	6	1171616	1171621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_011312	GTC	2	6	1171675	1171680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_011312	AGT	2	6	1172659	1172664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_011312	GCA	2	6	1174568	1174573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_011312	GTT	2	6	1177652	1177657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_011312	ATT	2	6	1177794	1177799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_011312	TAA	2	6	1177803	1177808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_011312	GAA	2	6	1179380	1179385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_011312	TTC	2	6	1179998	1180003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_011312	ATC	2	6	1182282	1182287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_011312	GTA	2	6	1182297	1182302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_011312	ATT	2	6	1182706	1182711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_011312	GGC	2	6	1182728	1182733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_011312	TAC	2	6	1184012	1184017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_011312	TCA	2	6	1185213	1185218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_011312	AAC	2	6	1185281	1185286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_011312	AGT	2	6	1185599	1185604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_011312	TGG	2	6	1185610	1185615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_011312	ATT	2	6	1187077	1187082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_011312	TTA	2	6	1188550	1188555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_011312	AGG	2	6	1188567	1188572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_011312	AAC	2	6	1189529	1189534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_011312	AGA	2	6	1190784	1190789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_011312	TTA	2	6	1190811	1190816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_011312	TAA	2	6	1190941	1190946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_011312	TTG	2	6	1193709	1193714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_011312	ATT	2	6	1193908	1193913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_011312	TGC	2	6	1193921	1193926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_011312	ATG	2	6	1193994	1193999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_011312	TTA	2	6	1201188	1201193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_011312	TAA	2	6	1201208	1201213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_011312	ATA	2	6	1201277	1201282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_011312	GCA	2	6	1201381	1201386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_011312	CCA	2	6	1201456	1201461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_011312	TGA	2	6	1201484	1201489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_011312	TAA	2	6	1201497	1201502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_011312	ATA	2	6	1201514	1201519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_011312	TAA	2	6	1201692	1201697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_011312	GTT	2	6	1201708	1201713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_011312	CCA	2	6	1202183	1202188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_011312	TTG	2	6	1202245	1202250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_011312	AGC	2	6	1202431	1202436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_011312	AAC	2	6	1202495	1202500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_011312	AGG	2	6	1202531	1202536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_011312	TAT	2	6	1202555	1202560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_011312	TCT	2	6	1202662	1202667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_011312	AGA	3	9	1202752	1202760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_011312	ATC	2	6	1202762	1202767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_011312	ATG	2	6	1202775	1202780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_011312	TTA	2	6	1202853	1202858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_011312	ATT	2	6	1203098	1203103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_011312	AAC	2	6	1203261	1203266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_011312	TGA	2	6	1203280	1203285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_011312	AAC	2	6	1203286	1203291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_011312	CGA	2	6	1203530	1203535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_011312	TTA	2	6	1203627	1203632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_011312	TGA	2	6	1203806	1203811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_011312	ACC	2	6	1204137	1204142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_011312	ACC	3	9	1204185	1204193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_011312	CCA	2	6	1204252	1204257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_011312	TGT	2	6	1204274	1204279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_011312	CTG	2	6	1204364	1204369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_011312	GCG	3	9	1204408	1204416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_011312	ATG	2	6	1204567	1204572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_011312	CCG	2	6	1204573	1204578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_011312	TCT	2	6	1204627	1204632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_011312	AAG	2	6	1204639	1204644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_011312	CTT	2	6	1204781	1204786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_011312	GTT	2	6	1204893	1204898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_011312	CAC	2	6	1204973	1204978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_011312	CTG	2	6	1205033	1205038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_011312	AGA	2	6	1205277	1205282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_011312	GAC	2	6	1205390	1205395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_011312	CAT	2	6	1205493	1205498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_011312	CAG	2	6	1205504	1205509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_011312	TGC	2	6	1205529	1205534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_011312	TGC	2	6	1205754	1205759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_011312	ATT	2	6	1205760	1205765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_011312	TCA	2	6	1205881	1205886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_011312	CCA	2	6	1205887	1205892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_011312	ACG	2	6	1205922	1205927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_011312	CTT	2	6	1205957	1205962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_011312	AGA	3	9	1206066	1206074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_011312	CAG	2	6	1206128	1206133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_011312	GTT	2	6	1206136	1206141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_011312	ACA	3	9	1206343	1206351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_011312	ATC	2	6	1206378	1206383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_011312	AAG	2	6	1206428	1206433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_011312	TGA	2	6	1206453	1206458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_011312	CCG	2	6	1206515	1206520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3091	NC_011312	ATT	2	6	1206672	1206677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_011312	ATT	2	6	1206705	1206710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_011312	ATT	2	6	1207242	1207247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_011312	AGA	2	6	1207249	1207254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_011312	AAT	2	6	1207350	1207355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_011312	TGT	2	6	1207367	1207372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_011312	GCT	2	6	1207435	1207440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_011312	GGA	2	6	1207480	1207485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_011312	TGT	2	6	1207505	1207510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_011312	TTA	2	6	1207529	1207534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_011312	ACA	2	6	1207594	1207599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_011312	GAA	2	6	1208656	1208661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_011312	TTA	2	6	1208694	1208699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_011312	TTA	2	6	1208927	1208932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_011312	TTG	2	6	1209703	1209708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_011312	TGA	2	6	1209833	1209838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_011312	GAA	2	6	1209885	1209890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_011312	TTG	2	6	1209909	1209914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_011312	ACT	2	6	1209919	1209924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_011312	TCT	2	6	1209998	1210003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_011312	ATA	2	6	1210041	1210046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_011312	CTT	2	6	1210109	1210114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_011312	ATA	2	6	1210158	1210163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_011312	TCA	2	6	1210303	1210308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_011312	CGT	2	6	1210370	1210375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_011312	GAC	2	6	1210383	1210388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_011312	TAT	2	6	1210448	1210453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_011312	CCA	2	6	1210467	1210472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_011312	TTG	2	6	1210473	1210478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_011312	TGA	2	6	1210569	1210574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_011312	TCT	2	6	1210642	1210647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_011312	TCG	2	6	1210655	1210660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_011312	TAA	3	9	1210677	1210685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_011312	TTC	2	6	1210797	1210802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_011312	TCA	2	6	1211082	1211087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_011312	GTT	2	6	1211092	1211097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3131	NC_011312	ATT	2	6	1211534	1211539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_011312	TAA	2	6	1211579	1211584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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