MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 1691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011206	GCGCA	2	10	2535511	2535520	20 %	0 %	40 %	40 %	198284643
1502	NC_011206	CGTGT	2	10	2535649	2535658	0 %	40 %	40 %	20 %	198284643
1503	NC_011206	CGGGA	2	10	2535873	2535882	20 %	0 %	60 %	20 %	198284644
1504	NC_011206	GCGCG	2	10	2536293	2536302	0 %	0 %	60 %	40 %	198284645
1505	NC_011206	ATGTC	2	10	2538318	2538327	20 %	40 %	20 %	20 %	198284647
1506	NC_011206	GCATC	2	10	2543922	2543931	20 %	20 %	20 %	40 %	198284653
1507	NC_011206	GGATA	2	10	2547654	2547663	40 %	20 %	40 %	0 %	198284656
1508	NC_011206	ATGTA	2	10	2548071	2548080	40 %	40 %	20 %	0 %	198284656
1509	NC_011206	TGGCG	2	10	2548475	2548484	0 %	20 %	60 %	20 %	198284657
1510	NC_011206	GGGCC	2	10	2551592	2551601	0 %	0 %	60 %	40 %	198284659
1511	NC_011206	GACGC	2	10	2552650	2552659	20 %	0 %	40 %	40 %	198284661
1512	NC_011206	TGATG	2	10	2553524	2553533	20 %	40 %	40 %	0 %	198284661
1513	NC_011206	GCAGC	2	10	2554226	2554235	20 %	0 %	40 %	40 %	198284662
1514	NC_011206	CGCTG	2	10	2554262	2554271	0 %	20 %	40 %	40 %	198284662
1515	NC_011206	CCCCG	2	10	2554416	2554425	0 %	0 %	20 %	80 %	198284662
1516	NC_011206	GCACA	2	10	2555351	2555360	40 %	0 %	20 %	40 %	198284662
1517	NC_011206	GGTCA	2	10	2556254	2556263	20 %	20 %	40 %	20 %	198284662
1518	NC_011206	GCAAG	2	10	2556739	2556748	40 %	0 %	40 %	20 %	198284662
1519	NC_011206	TTTAT	2	10	2557875	2557884	20 %	80 %	0 %	0 %	198284663
1520	NC_011206	GGCGG	2	10	2558464	2558473	0 %	0 %	80 %	20 %	198284663
1521	NC_011206	AGAAA	2	10	2559883	2559892	80 %	0 %	20 %	0 %	198284664
1522	NC_011206	ATTGG	2	10	2560048	2560057	20 %	40 %	40 %	0 %	198284664
1523	NC_011206	GCTGG	2	10	2561743	2561752	0 %	20 %	60 %	20 %	198284666
1524	NC_011206	CGCGC	2	10	2562400	2562409	0 %	0 %	40 %	60 %	198284666
1525	NC_011206	GTAGA	2	10	2563677	2563686	40 %	20 %	40 %	0 %	198284667
1526	NC_011206	AGATC	2	10	2564525	2564534	40 %	20 %	20 %	20 %	198284668
1527	NC_011206	GCCCC	2	10	2564820	2564829	0 %	0 %	20 %	80 %	198284668
1528	NC_011206	TTCCC	2	10	2567726	2567735	0 %	40 %	0 %	60 %	198284670
1529	NC_011206	CCGCC	2	10	2569037	2569046	0 %	0 %	20 %	80 %	198284672
1530	NC_011206	GCTGG	2	10	2569091	2569100	0 %	20 %	60 %	20 %	198284672
1531	NC_011206	ATAAA	2	10	2573597	2573606	80 %	20 %	0 %	0 %	198284678
1532	NC_011206	CCCAC	2	10	2574439	2574448	20 %	0 %	0 %	80 %	198284679
1533	NC_011206	CCAGA	2	10	2576909	2576918	40 %	0 %	20 %	40 %	198284681
1534	NC_011206	GAATA	2	10	2579970	2579979	60 %	20 %	20 %	0 %	198284684
1535	NC_011206	ATGGC	2	10	2580497	2580506	20 %	20 %	40 %	20 %	198284685
1536	NC_011206	TTGGA	2	10	2581173	2581182	20 %	40 %	40 %	0 %	198284685
1537	NC_011206	CAGAG	2	10	2581859	2581868	40 %	0 %	40 %	20 %	198284685
1538	NC_011206	CGGAA	2	10	2584477	2584486	40 %	0 %	40 %	20 %	198284687
1539	NC_011206	GGATG	2	10	2590934	2590943	20 %	20 %	60 %	0 %	198284690
1540	NC_011206	CTGTG	2	10	2591168	2591177	0 %	40 %	40 %	20 %	198284691
1541	NC_011206	TTCCA	2	10	2593095	2593104	20 %	40 %	0 %	40 %	198284694
1542	NC_011206	GCCCT	2	10	2594214	2594223	0 %	20 %	20 %	60 %	198284696
1543	NC_011206	TCGTC	2	10	2597685	2597694	0 %	40 %	20 %	40 %	198284697
1544	NC_011206	CGACG	2	10	2597970	2597979	20 %	0 %	40 %	40 %	198284697
1545	NC_011206	GCGGA	2	10	2598994	2599003	20 %	0 %	60 %	20 %	198284697
1546	NC_011206	TGCGC	2	10	2600463	2600472	0 %	20 %	40 %	40 %	198284697
1547	NC_011206	GGATG	2	10	2600925	2600934	20 %	20 %	60 %	0 %	198284697
1548	NC_011206	GGGCC	2	10	2601361	2601370	0 %	0 %	60 %	40 %	198284697
1549	NC_011206	CTCCC	2	10	2603218	2603227	0 %	20 %	0 %	80 %	198284697
1550	NC_011206	ACCCC	2	10	2605410	2605419	20 %	0 %	0 %	80 %	198284699
1551	NC_011206	AGGGA	2	10	2606287	2606296	40 %	0 %	60 %	0 %	198284700
1552	NC_011206	GGCAA	2	10	2606497	2606506	40 %	0 %	40 %	20 %	198284700
1553	NC_011206	TGCCG	2	10	2607000	2607009	0 %	20 %	40 %	40 %	198284700
1554	NC_011206	TGCCA	2	10	2607664	2607673	20 %	20 %	20 %	40 %	198284701
1555	NC_011206	CGCGC	2	10	2607704	2607713	0 %	0 %	40 %	60 %	198284701
1556	NC_011206	GGGCA	2	10	2609871	2609880	20 %	0 %	60 %	20 %	198284703
1557	NC_011206	ATGGC	2	10	2610076	2610085	20 %	20 %	40 %	20 %	198284703
1558	NC_011206	GCAAC	2	10	2611525	2611534	40 %	0 %	20 %	40 %	198284704
1559	NC_011206	AGCGG	2	10	2619254	2619263	20 %	0 %	60 %	20 %	198284715
1560	NC_011206	GCGCT	2	10	2619458	2619467	0 %	20 %	40 %	40 %	198284715
1561	NC_011206	GCGCG	2	10	2620857	2620866	0 %	0 %	60 %	40 %	198284717
1562	NC_011206	CGATG	2	10	2620985	2620994	20 %	20 %	40 %	20 %	198284718
1563	NC_011206	AGGCA	2	10	2623025	2623034	40 %	0 %	40 %	20 %	198284721
1564	NC_011206	GCCCG	2	10	2623920	2623929	0 %	0 %	40 %	60 %	198284722
1565	NC_011206	GCCCC	2	10	2624387	2624396	0 %	0 %	20 %	80 %	198284723
1566	NC_011206	TCCTA	2	10	2626552	2626561	20 %	40 %	0 %	40 %	198284724
1567	NC_011206	TACAC	2	10	2628843	2628852	40 %	20 %	0 %	40 %	198284726
1568	NC_011206	ATCGT	2	10	2631224	2631233	20 %	40 %	20 %	20 %	198284729
1569	NC_011206	TACGG	2	10	2631987	2631996	20 %	20 %	40 %	20 %	198284730
1570	NC_011206	CAGCG	2	10	2633462	2633471	20 %	0 %	40 %	40 %	198284731
1571	NC_011206	GGTGG	2	10	2636413	2636422	0 %	20 %	80 %	0 %	198284735
1572	NC_011206	CCAGC	2	10	2637612	2637621	20 %	0 %	20 %	60 %	198284737
1573	NC_011206	GCAAC	2	10	2637976	2637985	40 %	0 %	20 %	40 %	198284738
1574	NC_011206	ATTTA	2	10	2638334	2638343	40 %	60 %	0 %	0 %	198284739
1575	NC_011206	GCGGT	2	10	2642357	2642366	0 %	20 %	60 %	20 %	198284743
1576	NC_011206	CGGAT	2	10	2645584	2645593	20 %	20 %	40 %	20 %	198284744
1577	NC_011206	CATCG	2	10	2647153	2647162	20 %	20 %	20 %	40 %	198284744
1578	NC_011206	GGGCC	2	10	2647623	2647632	0 %	0 %	60 %	40 %	198284745
1579	NC_011206	AGGAA	2	10	2653454	2653463	60 %	0 %	40 %	0 %	198284751
1580	NC_011206	GATGC	2	10	2653852	2653861	20 %	20 %	40 %	20 %	198284752
1581	NC_011206	GGAAT	2	10	2655176	2655185	40 %	20 %	40 %	0 %	198284753
1582	NC_011206	ACCGC	2	10	2660762	2660771	20 %	0 %	20 %	60 %	198284757
1583	NC_011206	CGGGG	2	10	2661189	2661198	0 %	0 %	80 %	20 %	198284758
1584	NC_011206	GGGCG	2	10	2661199	2661208	0 %	0 %	80 %	20 %	198284758
1585	NC_011206	CCGCT	2	10	2662146	2662155	0 %	20 %	20 %	60 %	198284759
1586	NC_011206	CGCGC	2	10	2675716	2675725	0 %	0 %	40 %	60 %	198284768
1587	NC_011206	GCCCA	2	10	2675947	2675956	20 %	0 %	20 %	60 %	198284768
1588	NC_011206	TGGTA	2	10	2676387	2676396	20 %	40 %	40 %	0 %	198284768
1589	NC_011206	TGGGG	2	10	2676432	2676441	0 %	20 %	80 %	0 %	198284768
1590	NC_011206	TTTCG	2	10	2677083	2677092	0 %	60 %	20 %	20 %	198284769
1591	NC_011206	ATTAT	2	10	2678613	2678622	40 %	60 %	0 %	0 %	198284770
1592	NC_011206	ACCGC	2	10	2689761	2689770	20 %	0 %	20 %	60 %	198284782
1593	NC_011206	GTTCT	2	10	2695320	2695329	0 %	60 %	20 %	20 %	198284786
1594	NC_011206	TGCCA	2	10	2696407	2696416	20 %	20 %	20 %	40 %	198284787
1595	NC_011206	TTCCG	2	10	2698014	2698023	0 %	40 %	20 %	40 %	198284788
1596	NC_011206	ACGTT	2	10	2698645	2698654	20 %	40 %	20 %	20 %	198284788
1597	NC_011206	GGCTG	2	10	2698813	2698822	0 %	20 %	60 %	20 %	198284788
1598	NC_011206	CAAAA	2	10	2702449	2702458	80 %	0 %	0 %	20 %	198284791
1599	NC_011206	TGAAA	2	10	2704151	2704160	60 %	20 %	20 %	0 %	198284794
1600	NC_011206	TGCCC	2	10	2705456	2705465	0 %	20 %	20 %	60 %	198284795
1601	NC_011206	GAGCG	2	10	2709231	2709240	20 %	0 %	60 %	20 %	198284799
1602	NC_011206	AGAAA	2	10	2715016	2715025	80 %	0 %	20 %	0 %	198284805
1603	NC_011206	CTCAA	2	10	2716154	2716163	40 %	20 %	0 %	40 %	198284806
1604	NC_011206	CGGTG	2	10	2718208	2718217	0 %	20 %	60 %	20 %	198284808
1605	NC_011206	GCGTC	2	10	2719099	2719108	0 %	20 %	40 %	40 %	198284809
1606	NC_011206	CCCTT	2	10	2725083	2725092	0 %	40 %	0 %	60 %	198284817
1607	NC_011206	GGTGC	2	10	2726089	2726098	0 %	20 %	60 %	20 %	198284818
1608	NC_011206	AGACC	2	10	2727832	2727841	40 %	0 %	20 %	40 %	198284820
1609	NC_011206	GCCAC	2	10	2728244	2728253	20 %	0 %	20 %	60 %	198284820
1610	NC_011206	GAAAC	2	10	2732915	2732924	60 %	0 %	20 %	20 %	198284826
1611	NC_011206	ACCGC	2	10	2732937	2732946	20 %	0 %	20 %	60 %	198284826
1612	NC_011206	ATCCG	2	10	2733530	2733539	20 %	20 %	20 %	40 %	198284827
1613	NC_011206	CTTGG	2	10	2735738	2735747	0 %	40 %	40 %	20 %	198284829
1614	NC_011206	CTTTT	2	10	2735940	2735949	0 %	80 %	0 %	20 %	198284829
1615	NC_011206	GCTCC	2	10	2737535	2737544	0 %	20 %	20 %	60 %	198284830
1616	NC_011206	ATGGG	2	10	2739775	2739784	20 %	20 %	60 %	0 %	198284832
1617	NC_011206	TTTCC	2	10	2743947	2743956	0 %	60 %	0 %	40 %	198284835
1618	NC_011206	GTGTC	2	10	2745629	2745638	0 %	40 %	40 %	20 %	198284838
1619	NC_011206	CAGCG	2	10	2746227	2746236	20 %	0 %	40 %	40 %	198284838
1620	NC_011206	ATTCC	2	10	2748776	2748785	20 %	40 %	0 %	40 %	198284842
1621	NC_011206	ACCGG	2	10	2750210	2750219	20 %	0 %	40 %	40 %	198284845
1622	NC_011206	GACGC	2	10	2753993	2754002	20 %	0 %	40 %	40 %	198284850
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1624	NC_011206	GACGG	2	10	2757159	2757168	20 %	0 %	60 %	20 %	198284853
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1628	NC_011206	GCGCG	2	10	2769763	2769772	0 %	0 %	60 %	40 %	198284864
1629	NC_011206	CCGCG	2	10	2771626	2771635	0 %	0 %	40 %	60 %	198284864
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1638	NC_011206	CAGAC	2	10	2784764	2784773	40 %	0 %	20 %	40 %	198284873
1639	NC_011206	GGCGC	2	10	2784787	2784796	0 %	0 %	60 %	40 %	198284873
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1647	NC_011206	GCGCC	2	10	2795112	2795121	0 %	0 %	40 %	60 %	198284881
1648	NC_011206	GCGCC	2	10	2795310	2795319	0 %	0 %	40 %	60 %	198284881
1649	NC_011206	TGCAC	2	10	2795874	2795883	20 %	20 %	20 %	40 %	198284881
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1653	NC_011206	GCCGC	2	10	2803899	2803908	0 %	0 %	40 %	60 %	198284892
1654	NC_011206	ACTGG	2	10	2805445	2805454	20 %	20 %	40 %	20 %	198284894
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1656	NC_011206	TGCGC	2	10	2807432	2807441	0 %	20 %	40 %	40 %	198284896
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1659	NC_011206	GAACA	2	10	2814810	2814819	60 %	0 %	20 %	20 %	198284903
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1662	NC_011206	AGATG	2	10	2821196	2821205	40 %	20 %	40 %	0 %	198284908
1663	NC_011206	GCGCT	2	10	2821369	2821378	0 %	20 %	40 %	40 %	198284908
1664	NC_011206	CCGTA	2	10	2821575	2821584	20 %	20 %	20 %	40 %	198284908
1665	NC_011206	CACCG	2	10	2822284	2822293	20 %	0 %	20 %	60 %	198284909
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1667	NC_011206	GCGCG	2	10	2833527	2833536	0 %	0 %	60 %	40 %	198284922
1668	NC_011206	GGAAA	2	10	2834525	2834534	60 %	0 %	40 %	0 %	198284923
1669	NC_011206	GGCGT	2	10	2843200	2843209	0 %	20 %	60 %	20 %	198284932
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1672	NC_011206	GGGGA	2	10	2846798	2846807	20 %	0 %	80 %	0 %	198284934
1673	NC_011206	GCCGC	2	10	2847175	2847184	0 %	0 %	40 %	60 %	198284934
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1677	NC_011206	CGGGC	2	10	2857578	2857587	0 %	0 %	60 %	40 %	198284943
1678	NC_011206	GGTGG	2	10	2857645	2857654	0 %	20 %	80 %	0 %	198284943
1679	NC_011206	GCCGT	2	10	2859420	2859429	0 %	20 %	40 %	40 %	198284945
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1686	NC_011206	GCTGG	2	10	2872144	2872153	0 %	20 %	60 %	20 %	198284960
1687	NC_011206	GCACC	2	10	2873328	2873337	20 %	0 %	20 %	60 %	198284961
1688	NC_011206	ACCGC	2	10	2874018	2874027	20 %	0 %	20 %	60 %	198284962
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1690	NC_011206	AGCCC	2	10	2881993	2882002	20 %	0 %	20 %	60 %	198284971
1691	NC_011206	TCGGA	2	10	2883655	2883664	20 %	20 %	40 %	20 %	198284973

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.