MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 1691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011206	TGGGC	2	10	1695328	1695337	0 %	20 %	60 %	20 %	198283830
1002	NC_011206	AAGCA	2	10	1696932	1696941	60 %	0 %	20 %	20 %	198283832
1003	NC_011206	TCGCC	2	10	1699931	1699940	0 %	20 %	20 %	60 %	198283835
1004	NC_011206	CCGTC	2	10	1700404	1700413	0 %	20 %	20 %	60 %	198283835
1005	NC_011206	CGGCG	2	10	1701317	1701326	0 %	0 %	60 %	40 %	198283836
1006	NC_011206	TTCGC	2	10	1704627	1704636	0 %	40 %	20 %	40 %	198283838
1007	NC_011206	GCGCC	2	10	1706822	1706831	0 %	0 %	40 %	60 %	198283840
1008	NC_011206	TGCAG	2	10	1706849	1706858	20 %	20 %	40 %	20 %	198283840
1009	NC_011206	TGCCT	2	10	1709808	1709817	0 %	40 %	20 %	40 %	198283844
1010	NC_011206	TGGTT	2	10	1711036	1711045	0 %	60 %	40 %	0 %	198283845
1011	NC_011206	GTACC	2	10	1716822	1716831	20 %	20 %	20 %	40 %	198283847
1012	NC_011206	GGGCC	2	10	1718132	1718141	0 %	0 %	60 %	40 %	198283848
1013	NC_011206	CCGGT	2	10	1719416	1719425	0 %	20 %	40 %	40 %	198283850
1014	NC_011206	TTTAT	2	10	1723036	1723045	20 %	80 %	0 %	0 %	198283854
1015	NC_011206	CCCTG	2	10	1723197	1723206	0 %	20 %	20 %	60 %	198283854
1016	NC_011206	CCATG	2	10	1723448	1723457	20 %	20 %	20 %	40 %	198283854
1017	NC_011206	CCACC	2	10	1726169	1726178	20 %	0 %	0 %	80 %	198283857
1018	NC_011206	CCCGT	2	10	1732031	1732040	0 %	20 %	20 %	60 %	198283863
1019	NC_011206	CCTGG	2	10	1732809	1732818	0 %	20 %	40 %	40 %	198283863
1020	NC_011206	TTGAT	2	10	1733867	1733876	20 %	60 %	20 %	0 %	198283864
1021	NC_011206	ATTTT	2	10	1734615	1734624	20 %	80 %	0 %	0 %	198283865
1022	NC_011206	TTTAA	2	10	1734761	1734770	40 %	60 %	0 %	0 %	198283865
1023	NC_011206	ACTGC	2	10	1735749	1735758	20 %	20 %	20 %	40 %	198283866
1024	NC_011206	AGCGC	2	10	1737249	1737258	20 %	0 %	40 %	40 %	198283866
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1027	NC_011206	TTACA	2	10	1741694	1741703	40 %	40 %	0 %	20 %	198283868
1028	NC_011206	TCACA	2	10	1743735	1743744	40 %	20 %	0 %	40 %	198283872
1029	NC_011206	GCGTC	2	10	1744612	1744621	0 %	20 %	40 %	40 %	198283872
1030	NC_011206	CTGAT	2	10	1748497	1748506	20 %	40 %	20 %	20 %	198283876
1031	NC_011206	ACTGC	2	10	1749367	1749376	20 %	20 %	20 %	40 %	198283877
1032	NC_011206	CCAGC	2	10	1749754	1749763	20 %	0 %	20 %	60 %	198283877
1033	NC_011206	TTTCC	2	10	1750556	1750565	0 %	60 %	0 %	40 %	198283879
1034	NC_011206	TATGA	2	10	1753637	1753646	40 %	40 %	20 %	0 %	198283882
1035	NC_011206	ACCGC	2	10	1757034	1757043	20 %	0 %	20 %	60 %	198283884
1036	NC_011206	GTATG	2	10	1759032	1759041	20 %	40 %	40 %	0 %	198283886
1037	NC_011206	CGTGC	2	10	1760222	1760231	0 %	20 %	40 %	40 %	198283887
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1039	NC_011206	CGGTG	2	10	1762241	1762250	0 %	20 %	60 %	20 %	198283888
1040	NC_011206	TTCCG	2	10	1762818	1762827	0 %	40 %	20 %	40 %	198283889
1041	NC_011206	CTGCG	2	10	1763269	1763278	0 %	20 %	40 %	40 %	198283890
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1043	NC_011206	TGATC	2	10	1764321	1764330	20 %	40 %	20 %	20 %	198283890
1044	NC_011206	TCCGC	2	10	1764569	1764578	0 %	20 %	20 %	60 %	198283890
1045	NC_011206	AGCGC	2	10	1765220	1765229	20 %	0 %	40 %	40 %	198283891
1046	NC_011206	CGCCC	2	10	1766639	1766648	0 %	0 %	20 %	80 %	198283892
1047	NC_011206	ACGCA	2	10	1766945	1766954	40 %	0 %	20 %	40 %	198283892
1048	NC_011206	GTGCA	2	10	1767015	1767024	20 %	20 %	40 %	20 %	198283892
1049	NC_011206	CAGAC	2	10	1767404	1767413	40 %	0 %	20 %	40 %	198283893
1050	NC_011206	TGCGG	2	10	1768297	1768306	0 %	20 %	60 %	20 %	198283894
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1052	NC_011206	CATCG	2	10	1772721	1772730	20 %	20 %	20 %	40 %	198283898
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1054	NC_011206	CGGCG	2	10	1775830	1775839	0 %	0 %	60 %	40 %	198283903
1055	NC_011206	TGCCC	2	10	1776417	1776426	0 %	20 %	20 %	60 %	198283904
1056	NC_011206	CGGCC	2	10	1776645	1776654	0 %	0 %	40 %	60 %	198283904
1057	NC_011206	GCGGT	2	10	1776752	1776761	0 %	20 %	60 %	20 %	198283904
1058	NC_011206	TGCGC	2	10	1777686	1777695	0 %	20 %	40 %	40 %	198283904
1059	NC_011206	ACCGC	2	10	1777993	1778002	20 %	0 %	20 %	60 %	198283904
1060	NC_011206	GATCC	2	10	1778943	1778952	20 %	20 %	20 %	40 %	198283906
1061	NC_011206	CGCCC	2	10	1780590	1780599	0 %	0 %	20 %	80 %	198283909
1062	NC_011206	TCGGG	2	10	1783044	1783053	0 %	20 %	60 %	20 %	198283911
1063	NC_011206	TGCCG	2	10	1783659	1783668	0 %	20 %	40 %	40 %	198283912
1064	NC_011206	GCGCA	2	10	1783763	1783772	20 %	0 %	40 %	40 %	198283912
1065	NC_011206	CATGA	2	10	1788135	1788144	40 %	20 %	20 %	20 %	198283915
1066	NC_011206	GCTGG	2	10	1789936	1789945	0 %	20 %	60 %	20 %	198283917
1067	NC_011206	GGTGG	2	10	1791210	1791219	0 %	20 %	80 %	0 %	198283918
1068	NC_011206	TTTGT	2	10	1792503	1792512	0 %	80 %	20 %	0 %	198283920
1069	NC_011206	CGGCC	2	10	1793031	1793040	0 %	0 %	40 %	60 %	198283921
1070	NC_011206	CGCGG	2	10	1795145	1795154	0 %	0 %	60 %	40 %	198283923
1071	NC_011206	CCCGC	2	10	1797986	1797995	0 %	0 %	20 %	80 %	198283924
1072	NC_011206	GCGCG	2	10	1798106	1798115	0 %	0 %	60 %	40 %	198283924
1073	NC_011206	TGCCG	2	10	1799946	1799955	0 %	20 %	40 %	40 %	198283927
1074	NC_011206	GGCCA	2	10	1804944	1804953	20 %	0 %	40 %	40 %	198283932
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1076	NC_011206	GCATT	2	10	1805064	1805073	20 %	40 %	20 %	20 %	198283932
1077	NC_011206	CCCTG	2	10	1805700	1805709	0 %	20 %	20 %	60 %	198283933
1078	NC_011206	ACCGC	2	10	1806537	1806546	20 %	0 %	20 %	60 %	198283933
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1080	NC_011206	CAGCG	2	10	1808055	1808064	20 %	0 %	40 %	40 %	198283934
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1087	NC_011206	CTCGC	2	10	1822387	1822396	0 %	20 %	20 %	60 %	198283949
1088	NC_011206	ATCAC	2	10	1822805	1822814	40 %	20 %	0 %	40 %	198283949
1089	NC_011206	CTGCG	2	10	1826317	1826326	0 %	20 %	40 %	40 %	198283952
1090	NC_011206	ACGCC	2	10	1826596	1826605	20 %	0 %	20 %	60 %	198283952
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1092	NC_011206	GGGGT	2	10	1829390	1829399	0 %	20 %	80 %	0 %	198283955
1093	NC_011206	GCCCT	2	10	1832042	1832051	0 %	20 %	20 %	60 %	198283958
1094	NC_011206	ATGCT	2	10	1832364	1832373	20 %	40 %	20 %	20 %	198283958
1095	NC_011206	GAAAT	2	10	1834503	1834512	60 %	20 %	20 %	0 %	198283962
1096	NC_011206	AAGGA	2	10	1835898	1835907	60 %	0 %	40 %	0 %	198283963
1097	NC_011206	CCGGC	2	10	1842584	1842593	0 %	0 %	40 %	60 %	198283968
1098	NC_011206	CCACG	2	10	1842900	1842909	20 %	0 %	20 %	60 %	198283968
1099	NC_011206	TGACC	2	10	1843601	1843610	20 %	20 %	20 %	40 %	198283969
1100	NC_011206	ATTTC	2	10	1844299	1844308	20 %	60 %	0 %	20 %	198283969
1101	NC_011206	TGCGG	2	10	1846001	1846010	0 %	20 %	60 %	20 %	198283971
1102	NC_011206	TGCCC	2	10	1847501	1847510	0 %	20 %	20 %	60 %	198283973
1103	NC_011206	CGTGG	2	10	1847868	1847877	0 %	20 %	60 %	20 %	198283973
1104	NC_011206	CCGGG	2	10	1848433	1848442	0 %	0 %	60 %	40 %	198283974
1105	NC_011206	CACGC	2	10	1849618	1849627	20 %	0 %	20 %	60 %	198283975
1106	NC_011206	CCGCG	2	10	1853116	1853125	0 %	0 %	40 %	60 %	198283980
1107	NC_011206	GAGCC	2	10	1854141	1854150	20 %	0 %	40 %	40 %	198283981
1108	NC_011206	GGCGC	2	10	1854324	1854333	0 %	0 %	60 %	40 %	198283981
1109	NC_011206	GCGCC	2	10	1854589	1854598	0 %	0 %	40 %	60 %	198283981
1110	NC_011206	ACCGC	2	10	1855560	1855569	20 %	0 %	20 %	60 %	198283981
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1113	NC_011206	TCTGC	2	10	1862195	1862204	0 %	40 %	20 %	40 %	198283985
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1117	NC_011206	GCCTC	2	10	1868035	1868044	0 %	20 %	20 %	60 %	198283990
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1119	NC_011206	GGCGG	2	10	1872906	1872915	0 %	0 %	80 %	20 %	198283992
1120	NC_011206	TGCCC	2	10	1877523	1877532	0 %	20 %	20 %	60 %	198283997
1121	NC_011206	GATCG	2	10	1879397	1879406	20 %	20 %	40 %	20 %	198283999
1122	NC_011206	ACACA	2	10	1882243	1882252	60 %	0 %	0 %	40 %	198284003
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1124	NC_011206	GGCAC	2	10	1890669	1890678	20 %	0 %	40 %	40 %	198284007
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1366	NC_011206	CACCG	2	10	2276867	2276876	20 %	0 %	20 %	60 %	198284390
1367	NC_011206	GCAAC	2	10	2276926	2276935	40 %	0 %	20 %	40 %	198284390
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1371	NC_011206	CACGG	2	10	2281167	2281176	20 %	0 %	40 %	40 %	198284394
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1489	NC_011206	CCGCG	2	10	2515726	2515735	0 %	0 %	40 %	60 %	198284626
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1492	NC_011206	ACACC	2	10	2526655	2526664	40 %	0 %	0 %	60 %	198284632
1493	NC_011206	GCACC	2	10	2529505	2529514	20 %	0 %	20 %	60 %	198284636
1494	NC_011206	CAGCC	2	10	2529658	2529667	20 %	0 %	20 %	60 %	198284636
1495	NC_011206	CAGCG	2	10	2531357	2531366	20 %	0 %	40 %	40 %	198284636
1496	NC_011206	CGCGG	2	10	2531592	2531601	0 %	0 %	60 %	40 %	198284636
1497	NC_011206	TCGGC	2	10	2531758	2531767	0 %	20 %	40 %	40 %	198284636
1498	NC_011206	AGCGC	2	10	2532083	2532092	20 %	0 %	40 %	40 %	198284638
1499	NC_011206	CCATG	2	10	2532194	2532203	20 %	20 %	20 %	40 %	198284638
1500	NC_011206	GCGCC	2	10	2532934	2532943	0 %	0 %	40 %	60 %	198284639

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