MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76

Total Repeats: 986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010939	TAATTT	2	12	3008	3019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190149272
2	NC_010939	TTTTCG	2	12	3704	3715	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	190149272
3	NC_010939	ACCGCC	2	12	4108	4119	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	190149273
4	NC_010939	ATGATC	2	12	4570	4581	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	190149273
5	NC_010939	GGTGCG	2	12	5331	5342	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	190149274
6	NC_010939	AAAGCG	2	12	8801	8812	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	190149277
7	NC_010939	TGGCGA	2	12	12731	12742	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	190149281
8	NC_010939	TACGGT	2	12	13159	13170	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149281
9	NC_010939	AAGGCG	2	12	13340	13351	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	190149281
10	NC_010939	CACCGA	2	12	13611	13622	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	190149281
11	NC_010939	ATTTAG	2	12	16577	16588	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	190149283
12	NC_010939	ATAAAG	2	12	18076	18087	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	190149285
13	NC_010939	ATGAAT	2	12	18514	18525	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	190149285
14	NC_010939	TATCGG	2	12	21883	21894	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149288
15	NC_010939	TTGCGG	2	12	22176	22187	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	190149288
16	NC_010939	CTTACA	2	12	22357	22368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190149288
17	NC_010939	TTCCGT	2	12	24845	24856	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	190149290
18	NC_010939	CAAGCA	2	12	25540	25551	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	190149291
19	NC_010939	TTCAGG	2	12	29550	29561	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149294
20	NC_010939	TAAACT	2	12	31859	31870	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	190149295
21	NC_010939	CCCATT	2	12	32210	32221	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	190149296
22	NC_010939	TTTCCA	2	12	36937	36948	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	190149299
23	NC_010939	GTATCG	2	12	38859	38870	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149302
24	NC_010939	TCATAT	2	12	52869	52880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	190149315
25	NC_010939	AGCAAA	2	12	53033	53044	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	190149315
26	NC_010939	ATTTGG	2	12	53201	53212	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	190149315
27	NC_010939	TCCGCA	2	12	54401	54412	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190149316
28	NC_010939	TTAGCA	2	12	55570	55581	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	190149318
29	NC_010939	GGCGTA	2	12	55633	55644	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	190149318
30	NC_010939	GGTTAC	2	12	55927	55938	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149318
31	NC_010939	TTTACG	2	12	57199	57210	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	190149320
32	NC_010939	ATCGGT	2	12	59178	59189	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149322
33	NC_010939	AACGGT	2	12	59222	59233	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	190149322
34	NC_010939	AACCGT	2	12	61206	61217	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190149324
35	NC_010939	GGTGAG	2	12	62048	62059	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	190149325
36	NC_010939	TTTTAT	2	12	63552	63563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	190149327
37	NC_010939	AGATAA	2	12	63857	63868	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010939	GTTTAC	2	12	65857	65868	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	190149329
39	NC_010939	CGAAGG	2	12	69782	69793	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010939	TGAAAT	2	12	73149	73160	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010939	GCGAAA	2	12	74325	74336	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_010939	CCTTAT	2	12	74428	74439	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010939	GAAAGC	2	12	75753	75764	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	190149332
44	NC_010939	AAAGCC	2	12	77523	77534	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	190149333
45	NC_010939	GCAAAA	2	12	78898	78909	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	190149334
46	NC_010939	ATTGCG	2	12	79758	79769	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149335
47	NC_010939	TGCCGG	2	12	79856	79867	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	190149335
48	NC_010939	TTACCG	2	12	86706	86717	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	190149345
49	NC_010939	TTTTTC	2	12	87104	87115	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	190149345
50	NC_010939	GGTTTT	2	12	87138	87149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190149345
51	NC_010939	TCGACT	2	12	87237	87248	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	190149345
52	NC_010939	TCCGGC	2	12	87252	87263	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190149345
53	NC_010939	GCGTTA	2	12	89607	89618	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149349
54	NC_010939	CTGCGA	2	12	90135	90146	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190149350
55	NC_010939	AAAGGC	2	12	92495	92506	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	190149353
56	NC_010939	CGGTTG	2	12	92553	92564	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	190149353
57	NC_010939	TGTTTT	2	12	94511	94522	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010939	TTTTTC	2	12	95376	95387	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	190149356
59	NC_010939	TCGCTT	2	12	95606	95617	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	190149356
60	NC_010939	ATCTTG	2	12	96902	96913	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	190149358
61	NC_010939	ACCGAT	2	12	101130	101141	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190149364
62	NC_010939	TAAATG	2	12	101331	101342	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	190149364
63	NC_010939	AAATCC	2	12	104610	104621	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	190149367
64	NC_010939	CAATAT	3	18	104746	104763	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	190149367
65	NC_010939	AGTAAA	2	12	110218	110229	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	190149372
66	NC_010939	CTATTG	2	12	110972	110983	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	190149372
67	NC_010939	CAATTG	2	12	111173	111184	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	190149372
68	NC_010939	GCAATC	2	12	111853	111864	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190149372
69	NC_010939	ATACTA	2	12	111887	111898	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	190149372
70	NC_010939	AGCGGT	2	12	114448	114459	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	190149372
71	NC_010939	AAACTA	2	12	116300	116311	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	190149372
72	NC_010939	TGTAAA	2	12	116965	116976	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	190149373
73	NC_010939	CAAATG	3	18	117288	117305	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	190149373
74	NC_010939	TGCGAT	2	12	117481	117492	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149373
75	NC_010939	GTGAAT	2	12	118838	118849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190149373
76	NC_010939	GATAAA	2	12	121631	121642	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	190149373
77	NC_010939	AATTGC	2	12	126362	126373	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	190149374
78	NC_010939	CGCAAT	2	12	127753	127764	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190149375
79	NC_010939	GTTTCC	2	12	130928	130939	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	190149375
80	NC_010939	TTGCCG	2	12	131127	131138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010939	ACCGAT	2	12	131791	131802	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190149376
82	NC_010939	TCCGGA	2	12	136268	136279	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190149381
83	NC_010939	ACGATT	2	12	137362	137373	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	190149382
84	NC_010939	CAGAAA	2	12	139665	139676	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	190149386
85	NC_010939	GCCGAA	2	12	140143	140154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190149387
86	NC_010939	AGCAAA	2	12	144916	144927	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	190149391
87	NC_010939	CGGCAA	2	12	144947	144958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190149391
88	NC_010939	CTGTTG	2	12	147248	147259	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	190149395
89	NC_010939	ATATGG	2	12	148289	148300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190149397
90	NC_010939	CGGTAA	2	12	155544	155555	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	190149405
91	NC_010939	TTACCG	2	12	156030	156041	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	190149406
92	NC_010939	CGTCAC	2	12	158540	158551	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190149407
93	NC_010939	AACCCG	2	12	160312	160323	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	190149410
94	NC_010939	GTAACA	2	12	163045	163056	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	190149412
95	NC_010939	GCATTA	2	12	163420	163431	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	190149412
96	NC_010939	GATTGC	2	12	165028	165039	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149413
97	NC_010939	TATCGA	2	12	171597	171608	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	190149419
98	NC_010939	GCGATT	2	12	173904	173915	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_010939	TGCGTA	2	12	177590	177601	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149424
100	NC_010939	CTTATT	2	12	177854	177865	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	190149424
101	NC_010939	TAATTT	2	12	179915	179926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010939	TAAGTG	2	12	180456	180467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190149427
103	NC_010939	TTATTT	2	12	190687	190698	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010939	GATTGC	2	12	191331	191342	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149437
105	NC_010939	AAAAAG	2	12	193329	193340	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	190149438
106	NC_010939	CGGAAG	2	12	194124	194135	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	190149438
107	NC_010939	AATTTA	2	12	194829	194840	50 %	50 %	0 %	0 %	190149439
108	NC_010939	TTTCTT	2	12	198684	198695	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	190149444
109	NC_010939	GCGGAA	2	12	199969	199980	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	190149445
110	NC_010939	ACCGTG	2	12	201130	201141	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190149446
111	NC_010939	TTTGCG	2	12	204269	204280	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	190149450
112	NC_010939	TCGCTT	2	12	204506	204517	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	190149450
113	NC_010939	ATCGTG	2	12	207326	207337	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149451
114	NC_010939	GAAAGT	2	12	207586	207597	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	190149452
115	NC_010939	ATTGAT	2	12	208229	208240	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	190149453
116	NC_010939	TTATTT	2	12	216150	216161	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010939	AGCTGA	2	12	216232	216243	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_010939	AATACG	2	12	218363	218374	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	190149462
119	NC_010939	AAAATA	2	12	218904	218915	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	190149462
120	NC_010939	CGAAAA	2	12	232204	232215	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	190149478
121	NC_010939	GGTAAA	2	12	234383	234394	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	190149479
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123	NC_010939	ACAAAA	2	12	251673	251684	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	190149491
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146	NC_010939	ATTGCG	2	12	317903	317914	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190149551
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149	NC_010939	ATATTC	2	12	320761	320772	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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183	NC_010939	AGCCTA	2	12	395181	395192	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190149620
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217	NC_010939	TTGTTT	2	12	504791	504802	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	190149711
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221	NC_010939	TATTTA	2	12	514034	514045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_010939	TTTCAT	2	12	514656	514667	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	190149721
223	NC_010939	TTCTTG	2	12	514939	514950	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	190149722
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229	NC_010939	GTCGGA	2	12	527083	527094	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
230	NC_010939	TGGCAA	2	12	532156	532167	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	190149745
231	NC_010939	ACCGGC	2	12	532793	532804	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	190149746
232	NC_010939	TGCTAA	2	12	534057	534068	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	190149749
233	NC_010939	GCAGTA	2	12	543190	543201	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	190149759
234	NC_010939	GGTAAC	2	12	544114	544125	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	190149760
235	NC_010939	GGGTGA	2	12	544485	544496	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	190149760
236	NC_010939	GGCGAT	2	12	547134	547145	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	190149765
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249	NC_010939	ATTAAA	2	12	573142	573153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_010939	CGTCAG	2	12	575834	575845	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190149788
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271	NC_010939	CGGTGC	2	12	629831	629842	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	190149833
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336	NC_010939	TTTATA	2	12	768367	768378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
337	NC_010939	ATTTTT	2	12	769510	769521	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	190149958
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347	NC_010939	AATCGC	2	12	784302	784313	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190149972
348	NC_010939	TTCGGT	2	12	787298	787309	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	190149976
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351	NC_010939	TTGATT	2	12	794089	794100	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	190149982
352	NC_010939	TTCCGG	2	12	794614	794625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190149982
353	NC_010939	CGGCTT	2	12	798004	798015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190149984
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365	NC_010939	CGTTGG	2	12	815875	815886	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	190149999
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421	NC_010939	CCGATA	2	12	963114	963125	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190150131
422	NC_010939	TTTAAA	2	12	966026	966037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_010939	CACTTG	2	12	1018902	1018913	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	190150176
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450	NC_010939	CTAAAT	2	12	1049972	1049983	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	190150204
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457	NC_010939	ATATTG	2	12	1065031	1065042	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	190150218
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459	NC_010939	TTGTGT	2	12	1066303	1066314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190150219
460	NC_010939	TCTGAT	2	12	1066547	1066558	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
461	NC_010939	CGATAA	2	12	1067621	1067632	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	190150221
462	NC_010939	GGTTTT	2	12	1067688	1067699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190150221
463	NC_010939	CGATGG	2	12	1073518	1073529	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	190150225
464	NC_010939	TACCGT	2	12	1073549	1073560	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	190150225
465	NC_010939	CGCTTC	2	12	1075822	1075833	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	190150227
466	NC_010939	CCCCAG	2	12	1077543	1077554	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	190150228
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483	NC_010939	TAAATA	2	12	1121423	1121434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_010939	TTTAAT	2	12	1145604	1145615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190150287
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491	NC_010939	GCTTGT	2	12	1154214	1154225	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
492	NC_010939	ATCGGT	2	12	1160172	1160183	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190150302
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