MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76

Total Repeats: 986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010939	GCTGAC	2	12	1193019	1193030	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190150323
502	NC_010939	TATCTT	2	12	1194324	1194335	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	190150324
503	NC_010939	CAAAAT	2	12	1194585	1194596	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	190150324
504	NC_010939	ATTTTG	2	12	1197090	1197101	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	190150327
505	NC_010939	AAAGAT	2	12	1201042	1201053	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	190150329
506	NC_010939	AAGCAA	2	12	1202795	1202806	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	190150331
507	NC_010939	ATCGGG	2	12	1203636	1203647	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	190150332
508	NC_010939	GTAAAC	2	12	1205668	1205679	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	190150334
509	NC_010939	AAACCT	2	12	1208087	1208098	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	190150336
510	NC_010939	CCAATT	2	12	1208166	1208177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190150336
511	NC_010939	GTTACC	2	12	1211641	1211652	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	190150338
512	NC_010939	CTTTTT	2	12	1217412	1217423	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	190150343
513	NC_010939	AAATCT	2	12	1217817	1217828	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	190150344
514	NC_010939	GCTTGC	2	12	1218557	1218568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190150345
515	NC_010939	TGCATT	2	12	1219625	1219636	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	190150346
516	NC_010939	TCTTAA	2	12	1222611	1222622	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
517	NC_010939	CAGTAA	2	12	1232020	1232031	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	190150357
518	NC_010939	CTTCAC	2	12	1233174	1233185	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	190150358
519	NC_010939	GCTTCC	2	12	1234243	1234254	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	190150359
520	NC_010939	TACGTT	2	12	1236940	1236951	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	190150361
521	NC_010939	TAAATC	2	12	1239300	1239311	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	190150362
522	NC_010939	CATAAT	2	12	1239450	1239461	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	190150362
523	NC_010939	GCTTCG	2	12	1241215	1241226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190150364
524	NC_010939	TCCGCT	2	12	1242004	1242015	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	190150365
525	NC_010939	GGCAAA	2	12	1242958	1242969	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	190150366
526	NC_010939	AATCTT	2	12	1246499	1246510	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	190150368
527	NC_010939	TTCCGC	2	12	1246576	1246587	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	190150369
528	NC_010939	CAATAA	2	12	1252777	1252788	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	190150374
529	NC_010939	TTTTGG	2	12	1253631	1253642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190150375
530	NC_010939	CTGAAA	2	12	1253702	1253713	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	190150375
531	NC_010939	TAAAAA	2	12	1254304	1254315	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	190150376
532	NC_010939	CTACCG	2	12	1254949	1254960	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190150377
533	NC_010939	GCAAAA	2	12	1255395	1255406	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	190150377
534	NC_010939	CAATCA	2	12	1257016	1257027	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	190150379
535	NC_010939	TTGATC	2	12	1257176	1257187	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	190150379
536	NC_010939	CTTTCG	2	12	1257601	1257612	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	190150379
537	NC_010939	ATATCA	2	12	1259599	1259610	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	190150380
538	NC_010939	ATTCCA	2	12	1259766	1259777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190150380
539	NC_010939	GCTTCG	2	12	1262302	1262313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190150381
540	NC_010939	TTTAAC	2	12	1263919	1263930	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	190150386
541	NC_010939	GCTGAC	2	12	1267198	1267209	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190150391
542	NC_010939	GAAAAC	2	12	1268432	1268443	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	190150393
543	NC_010939	GCAACG	2	12	1269388	1269399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190150394
544	NC_010939	GATTGT	2	12	1269861	1269872	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	190150394
545	NC_010939	AAAAAG	2	12	1270437	1270448	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	190150395
546	NC_010939	AGATTG	2	12	1270998	1271009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190150395
547	NC_010939	ATCGGT	2	12	1271258	1271269	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190150395
548	NC_010939	GGTATC	2	12	1273189	1273200	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190150398
549	NC_010939	ATTGCG	2	12	1274044	1274055	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190150398
550	NC_010939	TCAATA	2	12	1276517	1276528	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	190150401
551	NC_010939	TTGCCG	2	12	1279711	1279722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190150404
552	NC_010939	CCCTTG	2	12	1280652	1280663	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	190150404
553	NC_010939	ACAATC	2	12	1284191	1284202	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	190150408
554	NC_010939	ATACCG	2	12	1289124	1289135	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190150412
555	NC_010939	TAAAAA	2	12	1290784	1290795	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_010939	GAAAAA	2	12	1292685	1292696	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	190150414
557	NC_010939	ATATCA	2	12	1305714	1305725	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	190150427
558	NC_010939	TTTCTA	2	12	1308444	1308455	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	190150430
559	NC_010939	AAGCGG	2	12	1308914	1308925	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	190150430
560	NC_010939	CGTTAC	2	12	1311803	1311814	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	190150430
561	NC_010939	AAAGAA	2	12	1312342	1312353	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_010939	CCAGCT	2	12	1313903	1313914	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
563	NC_010939	CTAAAG	2	12	1315692	1315703	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
564	NC_010939	GGTAAT	2	12	1320362	1320373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190150436
565	NC_010939	CGTCAG	2	12	1322197	1322208	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190150438
566	NC_010939	TGCCGT	2	12	1328083	1328094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190150443
567	NC_010939	AGTAAA	2	12	1332030	1332041	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	190150449
568	NC_010939	TACGCT	2	12	1332569	1332580	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	190150449
569	NC_010939	TTTTTA	2	12	1332911	1332922	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	190150450
570	NC_010939	TAAATT	2	12	1334686	1334697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_010939	ACACCG	2	12	1335290	1335301	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	190150452
572	NC_010939	CCCATT	2	12	1337685	1337696	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	190150454
573	NC_010939	TAAAGG	2	12	1345817	1345828	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	190150462
574	NC_010939	TTCTCA	2	12	1346476	1346487	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	190150463
575	NC_010939	ATTAAA	2	12	1348857	1348868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_010939	TTTTAA	2	12	1349149	1349160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_010939	CTAAAG	2	12	1349172	1349183	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
578	NC_010939	CTTTTT	2	12	1353605	1353616	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	190150471
579	NC_010939	CCCAAG	2	12	1355694	1355705	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	190150474
580	NC_010939	ACAATT	2	12	1355863	1355874	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	190150474
581	NC_010939	TTTTAT	2	12	1358485	1358496	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	190150477
582	NC_010939	CCGTGA	2	12	1358503	1358514	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190150477
583	NC_010939	TTAATT	2	12	1361104	1361115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190150479
584	NC_010939	TTTAAC	2	12	1361850	1361861	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	190150480
585	NC_010939	ACTGCA	2	12	1362061	1362072	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190150480
586	NC_010939	TTGCGA	2	12	1362601	1362612	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190150481
587	NC_010939	CCGCTT	2	12	1362893	1362904	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	190150482
588	NC_010939	AATGCC	2	12	1366106	1366117	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190150483
589	NC_010939	GATAGT	2	12	1366374	1366385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190150483
590	NC_010939	CAAAAC	2	12	1366479	1366490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190150483
591	NC_010939	GCTAAA	2	12	1367845	1367856	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	190150484
592	NC_010939	ATACCG	2	12	1369049	1369060	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190150485
593	NC_010939	AAAGTT	2	12	1369891	1369902	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	190150486
594	NC_010939	GGTTTC	2	12	1371048	1371059	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	190150487
595	NC_010939	ACGAAT	2	12	1371162	1371173	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	190150487
596	NC_010939	TTGGAA	2	12	1375321	1375332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190150490
597	NC_010939	GATACT	2	12	1380110	1380121	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	190150496
598	NC_010939	TCGCTT	2	12	1383835	1383846	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	190150502
599	NC_010939	TAACCG	2	12	1385580	1385591	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190150503
600	NC_010939	TCTTAC	2	12	1387118	1387129	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	190150505
601	NC_010939	CGGTAT	2	12	1388561	1388572	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190150506
602	NC_010939	TACGAC	2	12	1391104	1391115	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190150507
603	NC_010939	AAATTT	2	12	1391378	1391389	50 %	50 %	0 %	0 %	190150507
604	NC_010939	GTTTGA	2	12	1395333	1395344	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	190150510
605	NC_010939	TTTTTA	2	12	1396294	1396305	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	190150511
606	NC_010939	GACCGA	2	12	1400293	1400304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190150516
607	NC_010939	TTTTAA	2	12	1403848	1403859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190150520
608	NC_010939	ATTTAC	2	12	1410129	1410140	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	190150528
609	NC_010939	AAAAAT	2	12	1412406	1412417	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	190150529
610	NC_010939	GTTTGG	2	12	1412487	1412498	0 %	50 %	50 %	0 %	190150529
611	NC_010939	GGTATC	2	12	1420045	1420056	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190150537
612	NC_010939	TTGCTT	2	12	1420371	1420382	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	190150537
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838	NC_010939	TTGTTC	2	12	2033955	2033966	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	190151095
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914	NC_010939	GTTCAC	2	12	2202578	2202589	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	190151266
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934	NC_010939	TCAATA	2	12	2238454	2238465	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	190151302
935	NC_010939	CTTCCA	2	12	2241679	2241690	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	190151306
936	NC_010939	CGACCA	2	12	2242251	2242262	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	190151307
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938	NC_010939	GAACAA	2	12	2244125	2244136	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	190151309
939	NC_010939	CGCTAC	2	12	2246837	2246848	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190151313
940	NC_010939	TTTTGC	2	12	2247379	2247390	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	190151313
941	NC_010939	AGCAAC	2	12	2249721	2249732	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	190151315
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943	NC_010939	GTTTTT	2	12	2252250	2252261	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
944	NC_010939	TTGATG	2	12	2255525	2255536	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	190151320
945	NC_010939	TTGAAA	2	12	2256714	2256725	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	190151322
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