MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Francisella philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25017 chromosome

Total Repeats: 871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010336	TACAAA	2	12	6401	6412	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626232
2	NC_010336	TATCAA	2	12	7402	7413	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167626233
3	NC_010336	CTACCA	2	12	7788	7799	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	167626233
4	NC_010336	ATTTTT	2	12	9327	9338	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	167626234
5	NC_010336	TAGCTA	2	12	12235	12246	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626237
6	NC_010336	CTTGGG	2	12	17585	17596	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	167626242
7	NC_010336	TTGGTG	2	12	18945	18956	0 %	50 %	50 %	0 %	167626244
8	NC_010336	TTTGAA	2	12	21219	21230	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167626246
9	NC_010336	ATGTCA	2	12	21703	21714	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626247
10	NC_010336	AAATAA	2	12	23192	23203	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	167626248
11	NC_010336	CTTTAT	2	12	28450	28461	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167626253
12	NC_010336	TGAGCT	2	12	28719	28730	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167626253
13	NC_010336	GAGATA	2	12	31292	31303	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167626256
14	NC_010336	GATTTA	2	12	31615	31626	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167626256
15	NC_010336	TATAGA	2	12	31923	31934	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167626256
16	NC_010336	CTTGAT	2	12	36462	36473	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167626260
17	NC_010336	ATCTAG	2	12	38024	38035	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626261
18	NC_010336	TCATCC	2	12	38949	38960	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	167626262
19	NC_010336	TCTAAA	2	12	39729	39740	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167626262
20	NC_010336	GTAATA	2	12	40339	40350	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167626263
21	NC_010336	TATTTT	2	12	42194	42205	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	167626266
22	NC_010336	TATTGG	2	12	45278	45289	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167626269
23	NC_010336	TGATTT	2	12	50293	50304	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167626273
24	NC_010336	TAATTT	2	12	50916	50927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626273
25	NC_010336	CTCTAT	2	12	52057	52068	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	167626275
26	NC_010336	TTCTGT	2	12	52555	52566	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167626276
27	NC_010336	AAATAA	2	12	53249	53260	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	167626278
28	NC_010336	CTTTCT	2	12	56779	56790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626282
29	NC_010336	ACTACA	2	12	61606	61617	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	167626288
30	NC_010336	TTACTT	2	12	64253	64264	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167626290
31	NC_010336	CAAAAT	2	12	65989	66000	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626291
32	NC_010336	TAAGTT	2	12	66223	66234	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167626292
33	NC_010336	TGTAAT	2	12	66710	66721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167626292
34	NC_010336	AACATA	2	12	70644	70655	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626296
35	NC_010336	CATAAA	2	12	74368	74379	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626299
36	NC_010336	TTATCC	2	12	75613	75624	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	167626300
37	NC_010336	AATATT	2	12	77505	77516	50 %	50 %	0 %	0 %	167626302
38	NC_010336	GTAAAT	2	12	81031	81042	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167626304
39	NC_010336	ATTTGT	2	12	89593	89604	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167626312
40	NC_010336	TATATT	2	12	95267	95278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626317
41	NC_010336	TAAACA	2	12	95290	95301	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626317
42	NC_010336	TTCAGC	2	12	95738	95749	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167626317
43	NC_010336	TTAGGA	2	12	96759	96770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626318
44	NC_010336	TATGTG	2	12	101164	101175	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167626322
45	NC_010336	ATGAGG	2	12	104126	104137	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	167626325
46	NC_010336	AAATAA	2	12	106193	106204	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	167626327
47	NC_010336	TTAGAT	2	12	111234	111245	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167626333
48	NC_010336	TACCAT	2	12	114300	114311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626336
49	NC_010336	TAGCAA	2	12	116600	116611	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167626339
50	NC_010336	GTTAAT	2	12	117424	117435	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167626339
51	NC_010336	CATTTA	2	12	123450	123461	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167626345
52	NC_010336	AATCAA	2	12	137146	137157	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626358
53	NC_010336	CAGCGT	2	12	141287	141298	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167626363
54	NC_010336	GCTTTA	2	12	142276	142287	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167626364
55	NC_010336	TTTTCT	2	12	147993	148004	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	167626371
56	NC_010336	TGCTTT	2	12	151296	151307	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167626374
57	NC_010336	CCATAC	2	12	151556	151567	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	167626374
58	NC_010336	TGCTTT	2	12	153614	153625	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167626375
59	NC_010336	CTTGAT	2	12	156165	156176	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167626377
60	NC_010336	ATCAAT	2	12	156269	156280	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167626377
61	NC_010336	ATCAGA	2	12	157160	157171	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167626377
62	NC_010336	TCTACA	2	12	158383	158394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626378
63	NC_010336	GAGCTT	2	12	163020	163031	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167626382
64	NC_010336	AGCTAT	2	12	163075	163086	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626382
65	NC_010336	CTTCAT	2	12	164077	164088	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	167626383
66	NC_010336	AAGACC	2	12	164600	164611	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	167626383
67	NC_010336	CAATGA	2	12	166759	166770	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167626385
68	NC_010336	TTGCTC	2	12	167190	167201	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	167626386
69	NC_010336	ATGTTT	2	12	170441	170452	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167626389
70	NC_010336	TTGCAT	2	12	170533	170544	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167626389
71	NC_010336	AATATA	2	12	171650	171661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626391
72	NC_010336	AGTGAT	2	12	174158	174169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626393
73	NC_010336	ATGCTG	2	12	177036	177047	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167626394
74	NC_010336	CTGAAA	2	12	177402	177413	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167626394
75	NC_010336	TGATTG	2	12	182398	182409	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167626400
76	NC_010336	TTAGCT	2	12	184192	184203	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167626401
77	NC_010336	GCTAAT	2	12	190673	190684	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626404
78	NC_010336	TAAAAC	2	12	192465	192476	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626406
79	NC_010336	ATTTTC	2	12	193879	193890	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167626408
80	NC_010336	TACCCT	2	12	195707	195718	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	167626409
81	NC_010336	ACGCCC	2	12	199250	199261	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	167626413
82	NC_010336	ATTACC	2	12	199367	199378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626413
83	NC_010336	GCAACT	2	12	200109	200120	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167626413
84	NC_010336	TAACCA	2	12	200812	200823	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	167626414
85	NC_010336	TAGTCA	2	12	200824	200835	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626414
86	NC_010336	CTTTCT	2	12	201832	201843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626415
87	NC_010336	TAACAA	2	12	209460	209471	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626422
88	NC_010336	TAAACT	2	12	214760	214771	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167626427
89	NC_010336	GCCTAC	2	12	215063	215074	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	167626427
90	NC_010336	ATCTGA	2	12	216947	216958	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626427
91	NC_010336	TAAACT	2	12	217432	217443	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167626428
92	NC_010336	TCCTAC	2	12	217675	217686	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	167626428
93	NC_010336	CCTACT	2	12	217694	217705	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	167626428
94	NC_010336	CTATTA	2	12	218169	218180	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167626428
95	NC_010336	ACTCTA	2	12	218553	218564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626428
96	NC_010336	CTTTCT	2	12	220413	220424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626429
97	NC_010336	TTATCA	2	12	225513	225524	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167626432
98	NC_010336	GTATCA	2	12	225537	225548	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626432
99	NC_010336	TGGTTT	2	12	225804	225815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626432
100	NC_010336	ATTAAA	2	12	229700	229711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626434
101	NC_010336	ATTATC	2	12	232446	232457	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167626436
102	NC_010336	AGCCAT	2	12	233213	233224	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167626438
103	NC_010336	CTTTTG	2	12	237335	237346	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167626441
104	NC_010336	AACCAC	2	12	242407	242418	50 %	0 %	0 %	50 %	167626448
105	NC_010336	TAGAAC	2	12	243501	243512	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167626449
106	NC_010336	CCAAAG	2	12	245821	245832	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	167626451
107	NC_010336	CACTAC	2	12	249271	249282	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	167626454
108	NC_010336	CATCTT	2	12	253523	253534	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	167626458
109	NC_010336	GAAAAA	2	12	255356	255367	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	167626459
110	NC_010336	AACATC	2	12	258672	258683	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	167626462
111	NC_010336	AGTAGA	2	12	260848	260859	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167626463
112	NC_010336	ATTTTA	2	12	268066	268077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626470
113	NC_010336	TTCTTA	2	12	269056	269067	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167626470
114	NC_010336	GTGCTT	2	12	270058	270069	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	167626471
115	NC_010336	TCAAAT	2	12	271537	271548	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167626473
116	NC_010336	ATCTTT	2	12	276205	276216	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167626478
117	NC_010336	AATCTC	2	12	276718	276729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626478
118	NC_010336	GCTCTA	2	12	276986	276997	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167626478
119	NC_010336	ATTTGT	2	12	278288	278299	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167626479
120	NC_010336	TAGAAT	2	12	279470	279481	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167626481
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125	NC_010336	GGTAGT	2	12	286896	286907	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	167626487
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231	NC_010336	AAAGCT	2	12	516561	516572	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167626686
232	NC_010336	TAAAGC	2	12	517148	517159	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167626687
233	NC_010336	TGTTGC	2	12	519230	519241	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	167626690
234	NC_010336	AGCTAT	2	12	519568	519579	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626690
235	NC_010336	TATTAG	2	12	520092	520103	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167626691
236	NC_010336	GAACTC	2	12	526446	526457	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167626698
237	NC_010336	CAATCT	2	12	535442	535453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626708
238	NC_010336	ACTTTT	2	12	537750	537761	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167626709
239	NC_010336	ATTAAT	2	12	539340	539351	50 %	50 %	0 %	0 %	167626713
240	NC_010336	TTAATA	2	12	547078	547089	50 %	50 %	0 %	0 %	167626724
241	NC_010336	CTTTAA	2	12	552029	552040	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167626729
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243	NC_010336	TAGAGA	2	12	553447	553458	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167626730
244	NC_010336	AGCTTC	2	12	554770	554781	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167626731
245	NC_010336	TTATAA	2	12	555750	555761	50 %	50 %	0 %	0 %	167626731
246	NC_010336	AATCTC	2	12	556331	556342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626732
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249	NC_010336	TTTTCT	2	12	559879	559890	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	167626735
250	NC_010336	GCTTGC	2	12	561816	561827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626736
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253	NC_010336	TTAGTA	2	12	565106	565117	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167626740
254	NC_010336	TTTATC	2	12	566475	566486	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167626741
255	NC_010336	CAATAT	2	12	566741	566752	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167626741
256	NC_010336	TTTTTA	2	12	570318	570329	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	167626744
257	NC_010336	CTGTAG	2	12	572769	572780	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167626746
258	NC_010336	CTGAAC	2	12	577542	577553	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167626750
259	NC_010336	TGGTAG	2	12	578770	578781	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	167626750
260	NC_010336	TATTTT	2	12	580723	580734	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	167626752
261	NC_010336	TAGGTG	2	12	582112	582123	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	167626754
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264	NC_010336	TTTTGT	2	12	585517	585528	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	167626757
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271	NC_010336	TAGCTA	2	12	591796	591807	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626764
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301	NC_010336	TGAAAT	2	12	637970	637981	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167626823
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334	NC_010336	GTTCTT	2	12	732378	732389	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167626915
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337	NC_010336	TTAGCT	2	12	734313	734324	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167626917
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339	NC_010336	TATAGC	2	12	737719	737730	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626919
340	NC_010336	AAACTA	2	12	743094	743105	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626922
341	NC_010336	TGCATC	2	12	748173	748184	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167626929
342	NC_010336	AGCTTG	2	12	748251	748262	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167626929
343	NC_010336	AAAACC	2	12	749083	749094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626930
344	NC_010336	CTTTCT	2	12	750004	750015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626931
345	NC_010336	TTTGCA	2	12	751366	751377	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167626933
346	NC_010336	GTTAGA	2	12	752691	752702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626933
347	NC_010336	ATTATG	2	12	757838	757849	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167626938
348	NC_010336	ACTATT	2	12	758697	758708	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167626940
349	NC_010336	GATTGA	2	12	758934	758945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626940
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457	NC_010336	AGCTAG	2	12	1038568	1038579	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167627187
458	NC_010336	TGATAG	2	12	1041038	1041049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167627188
459	NC_010336	TCTTTG	2	12	1059264	1059275	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167627206
460	NC_010336	TTTGTA	2	12	1059674	1059685	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167627206
461	NC_010336	AGCAAA	2	12	1060472	1060483	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	167627207
462	NC_010336	GCTTTG	2	12	1061143	1061154	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	167627207
463	NC_010336	AGATTT	2	12	1061893	1061904	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167627208
464	NC_010336	CTTTCT	2	12	1065142	1065153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167627213
465	NC_010336	TACTTT	2	12	1066886	1066897	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167627215
466	NC_010336	ACCAAT	2	12	1068321	1068332	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	167627217
467	NC_010336	TGAAGC	2	12	1071243	1071254	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167627220
468	NC_010336	ATTCGT	2	12	1072732	1072743	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627220
469	NC_010336	GATGTT	2	12	1073173	1073184	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167627220
470	NC_010336	ACCTGT	2	12	1079670	1079681	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167627227
471	NC_010336	TTTATC	2	12	1080450	1080461	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167627227
472	NC_010336	TAAAAA	2	12	1087759	1087770	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	167627232
473	NC_010336	TTGTAC	2	12	1088544	1088555	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627232
474	NC_010336	CTTATG	2	12	1092200	1092211	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627236
475	NC_010336	TTTGCA	2	12	1093070	1093081	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627236
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477	NC_010336	TAGTGC	2	12	1112168	1112179	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167627250
478	NC_010336	ATTTTT	2	12	1112825	1112836	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	167627251
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480	NC_010336	ATTTTG	2	12	1120353	1120364	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167627257
481	NC_010336	GTTTTA	2	12	1122149	1122160	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167627258
482	NC_010336	AATTTT	2	12	1123192	1123203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167627260
483	NC_010336	CAGGTA	2	12	1123787	1123798	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167627261
484	NC_010336	GACGAT	2	12	1127258	1127269	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167627263
485	NC_010336	TTGCTG	2	12	1129988	1129999	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	167627268
486	NC_010336	TGGTCT	2	12	1130112	1130123	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	167627268
487	NC_010336	TGAAGC	2	12	1130187	1130198	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167627268
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489	NC_010336	TATATG	2	12	1134120	1134131	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167627269
490	NC_010336	TACAGG	2	12	1138576	1138587	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167627270
491	NC_010336	TTTTAG	2	12	1139806	1139817	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167627272
492	NC_010336	TGCCTA	2	12	1145204	1145215	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167627277
493	NC_010336	GATTTG	2	12	1148430	1148441	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167627283
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495	NC_010336	ATTGAT	2	12	1150167	1150178	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167627285
496	NC_010336	TCAGCA	2	12	1158077	1158088	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167627291
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499	NC_010336	TGAGTA	2	12	1161929	1161940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167627293
500	NC_010336	ATTACC	2	12	1162234	1162245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167627293

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