MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Francisella philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25017 chromosome

Total Repeats: 871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010336	AGAAAA	2	12	1164196	1164207	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	167627295
502	NC_010336	TTATCT	2	12	1165664	1165675	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167627297
503	NC_010336	AATTTT	2	12	1167212	1167223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167627299
504	NC_010336	TGCACT	2	12	1168182	1168193	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167627300
505	NC_010336	CCAATA	2	12	1171375	1171386	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	167627302
506	NC_010336	TTCAAA	2	12	1178207	1178218	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167627312
507	NC_010336	GGTATG	2	12	1181898	1181909	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	167627317
508	NC_010336	GATAGA	2	12	1182363	1182374	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167627317
509	NC_010336	ATCAAT	2	12	1186372	1186383	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167627320
510	NC_010336	AAGTAA	2	12	1188350	1188361	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167627323
511	NC_010336	TCATTT	2	12	1194707	1194718	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167627329
512	NC_010336	AAGCCC	2	12	1194963	1194974	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	167627330
513	NC_010336	GCACCG	2	12	1196075	1196086	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	167627330
514	NC_010336	TGATAT	2	12	1200640	1200651	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167627334
515	NC_010336	ATTATA	2	12	1202506	1202517	50 %	50 %	0 %	0 %	167627335
516	NC_010336	CATTAG	2	12	1202721	1202732	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167627336
517	NC_010336	TTTATT	2	12	1205972	1205983	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	167627340
518	NC_010336	AAAGGT	2	12	1207412	1207423	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167627342
519	NC_010336	AAAGGT	2	12	1207646	1207657	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167627342
520	NC_010336	TAAAAA	2	12	1213899	1213910	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	167627349
521	NC_010336	ATTTAT	2	12	1219452	1219463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167627355
522	NC_010336	TTTATA	2	12	1223065	1223076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167627358
523	NC_010336	CAAAAG	2	12	1227063	1227074	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	167627362
524	NC_010336	ATTTTA	2	12	1228062	1228073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167627362
525	NC_010336	GATAAT	2	12	1228286	1228297	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167627362
526	NC_010336	AGTAAG	2	12	1228364	1228375	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167627362
527	NC_010336	CTATTA	2	12	1234446	1234457	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167627368
528	NC_010336	TTGCCT	2	12	1238214	1238225	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	167627371
529	NC_010336	ATTACA	2	12	1238522	1238533	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167627371
530	NC_010336	TTTTGG	2	12	1238609	1238620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167627371
531	NC_010336	TTGATC	2	12	1242922	1242933	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627371
532	NC_010336	CATTTT	2	12	1247924	1247935	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167627375
533	NC_010336	AAATAT	2	12	1250190	1250201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167627377
534	NC_010336	CTAAAA	2	12	1252024	1252035	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167627379
535	NC_010336	TAATCA	2	12	1255266	1255277	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167627381
536	NC_010336	GTCAAA	2	12	1258535	1258546	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167627384
537	NC_010336	ATATAG	2	12	1263541	1263552	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167627387
538	NC_010336	TTTAGA	2	12	1264063	1264074	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167627387
539	NC_010336	GGCGAA	2	12	1264150	1264161	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	167627387
540	NC_010336	GATTGT	2	12	1267747	1267758	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167627387
541	NC_010336	CTATGG	2	12	1277120	1277131	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167627397
542	NC_010336	GATTAG	2	12	1282555	1282566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167627402
543	NC_010336	AATTAA	2	12	1283246	1283257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167627403
544	NC_010336	TATGCT	2	12	1283452	1283463	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627403
545	NC_010336	TTTGAG	3	18	1283840	1283857	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167627403
546	NC_010336	GATATT	2	12	1286838	1286849	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167627406
547	NC_010336	CTGGTG	2	12	1290863	1290874	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	167627411
548	NC_010336	TGGTGA	2	12	1291227	1291238	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	167627411
549	NC_010336	ATGGTA	2	12	1291349	1291360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167627411
550	NC_010336	TGCTGG	2	12	1291389	1291400	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	167627411
551	NC_010336	CTTATG	2	12	1292534	1292545	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627411
552	NC_010336	TAGTGG	2	12	1294352	1294363	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	167627412
553	NC_010336	GCAAAA	2	12	1296210	1296221	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	167627413
554	NC_010336	CTTTCT	2	12	1299557	1299568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167627418
555	NC_010336	ATGAAG	2	12	1302219	1302230	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	167627420
556	NC_010336	GTTTTT	2	12	1313369	1313380	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	167627429
557	NC_010336	TTTACT	2	12	1313710	1313721	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167627430
558	NC_010336	GATTTT	2	12	1314751	1314762	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167627431
559	NC_010336	TTTAGA	2	12	1322350	1322361	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167627439
560	NC_010336	ATCATA	2	12	1322739	1322750	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167627439
561	NC_010336	AAAAGT	2	12	1323694	1323705	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167627439
562	NC_010336	TTTTAG	2	12	1327396	1327407	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167627444
563	NC_010336	TATGTT	2	12	1332643	1332654	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167627450
564	NC_010336	CAAATT	2	12	1334437	1334448	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	167627453
565	NC_010336	TGTTGC	2	12	1335614	1335625	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	167627454
566	NC_010336	CAGAAG	2	12	1336832	1336843	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	167627455
567	NC_010336	TATTTA	2	12	1343206	1343217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167627460
568	NC_010336	ATCTTG	2	12	1344487	1344498	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627462
569	NC_010336	TCATAC	2	12	1344624	1344635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167627462
570	NC_010336	GAGCAA	2	12	1345428	1345439	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	167627463
571	NC_010336	CTTGAG	2	12	1345476	1345487	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167627463
572	NC_010336	TCTTGC	2	12	1345784	1345795	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	167627463
573	NC_010336	TACAGC	2	12	1348342	1348353	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167627464
574	NC_010336	GCTAAA	2	12	1353066	1353077	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167627467
575	NC_010336	GATAAA	2	12	1356391	1356402	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167627468
576	NC_010336	AAAACA	2	12	1359044	1359055	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	167627469
577	NC_010336	ATGTTT	2	12	1362482	1362493	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167627472
578	NC_010336	TGGTAC	2	12	1363657	1363668	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167627473
579	NC_010336	GCTAAG	2	12	1366725	1366736	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167627476
580	NC_010336	ATTTTG	2	12	1375030	1375041	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167627485
581	NC_010336	GCTTAT	2	12	1377034	1377045	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627487
582	NC_010336	TAGTAT	2	12	1377569	1377580	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167627488
583	NC_010336	CATATT	2	12	1378283	1378294	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167627488
584	NC_010336	AAATAA	2	12	1381579	1381590	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	167627490
585	NC_010336	ATAAAA	2	12	1383649	1383660	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	167627493
586	NC_010336	ATTTTT	2	12	1398871	1398882	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	167627507
587	NC_010336	TTATTT	2	12	1399198	1399209	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	167627507
588	NC_010336	CAGGTA	2	12	1399324	1399335	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167627507
589	NC_010336	GGTTTA	2	12	1408609	1408620	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167627518
590	NC_010336	AACTGT	2	12	1410855	1410866	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167627521
591	NC_010336	GCTAGA	2	12	1416158	1416169	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167627528
592	NC_010336	TAATGA	2	12	1417754	1417765	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167627530
593	NC_010336	TTTTTA	2	12	1418491	1418502	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	167627531
594	NC_010336	CTTTCT	2	12	1419698	1419709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167627532
595	NC_010336	ATATTT	2	12	1420660	1420671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167627533
596	NC_010336	TAATTA	2	12	1424183	1424194	50 %	50 %	0 %	0 %	167627535
597	NC_010336	CTAAAA	2	12	1424869	1424880	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167627535
598	NC_010336	TAAATT	2	12	1425160	1425171	50 %	50 %	0 %	0 %	167627535
599	NC_010336	AGTAAT	2	12	1425257	1425268	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	167627535
600	NC_010336	TTTGTA	2	12	1431793	1431804	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	167627541
601	NC_010336	GCTTTT	2	12	1434129	1434140	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	167627543
602	NC_010336	TAGGTG	2	12	1435786	1435797	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	167627544
603	NC_010336	ATTTAG	2	12	1446518	1446529	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167627552
604	NC_010336	AAGCAA	2	12	1446598	1446609	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	167627552
605	NC_010336	ATTGCT	2	12	1446821	1446832	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627553
606	NC_010336	CTTAGT	2	12	1447691	1447702	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167627554
607	NC_010336	AGTTAG	2	12	1447968	1447979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167627554
608	NC_010336	CTGGTA	2	12	1451234	1451245	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167627557
609	NC_010336	TTGCCG	2	12	1459978	1459989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167627563
610	NC_010336	CAGTTG	2	12	1461376	1461387	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167627564
611	NC_010336	TTACAT	2	12	1463856	1463867	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	167627567
612	NC_010336	TTTATC	2	12	1464619	1464630	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167627567
613	NC_010336	CTATCT	2	12	1466282	1466293	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	167627569
614	NC_010336	ATCTCT	2	12	1469673	1469684	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	167627573
615	NC_010336	AGCATC	2	12	1469802	1469813	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167627573
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717	NC_010336	TAATAT	2	12	1700038	1700049	50 %	50 %	0 %	0 %	167627794
718	NC_010336	TAATAT	2	12	1700080	1700091	50 %	50 %	0 %	0 %	167627794
719	NC_010336	GGGCTA	2	12	1703020	1703031	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167627797
720	NC_010336	AGGTTT	2	12	1703199	1703210	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167627797
721	NC_010336	ATGCTC	2	12	1703339	1703350	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167627797
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835	NC_010336	ATGAAA	2	12	1954190	1954201	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167628053
836	NC_010336	AAAATG	2	12	1956921	1956932	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167628054
837	NC_010336	TTTAAA	2	12	1959320	1959331	50 %	50 %	0 %	0 %	167628055
838	NC_010336	CAAAGC	2	12	1959352	1959363	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	167628055
839	NC_010336	AAATTA	2	12	1967204	1967215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167628063
840	NC_010336	CTTTAT	2	12	1968995	1969006	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	167628064
841	NC_010336	GTTTAG	2	12	1969901	1969912	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	167628066
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847	NC_010336	ATCCTC	2	12	1987468	1987479	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	167628083
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864	NC_010336	ATAGCA	2	12	2028581	2028592	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167628121
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870	NC_010336	ATTTAA	2	12	2044492	2044503	50 %	50 %	0 %	0 %	167628134
871	NC_010336	AATCAA	2	12	2044613	2044624	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167628134

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