MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 chromosome

Total Repeats: 2321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009925	ACCCTG	2	12	5543385	5543396	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158338583
2002	NC_009925	GGACTA	2	12	5546631	5546642	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158338587
2003	NC_009925	TGGCGT	2	12	5548065	5548076	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158338591
2004	NC_009925	CGACTT	2	12	5548917	5548928	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158338592
2005	NC_009925	TACCTT	2	12	5550796	5550807	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158338596
2006	NC_009925	AACCCT	2	12	5551663	5551674	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	158338596
2007	NC_009925	GCAAAC	2	12	5555395	5555406	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158338601
2008	NC_009925	ACCATT	2	12	5557093	5557104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158338603
2009	NC_009925	TTTGAT	2	12	5557619	5557630	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	158338604
2010	NC_009925	CATTGG	2	12	5558074	5558085	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158338604
2011	NC_009925	GTAAAG	2	12	5565240	5565251	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_009925	ATCATG	2	12	5568062	5568073	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158338617
2013	NC_009925	CCCAAG	2	12	5569193	5569204	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158338617
2014	NC_009925	CGTTGG	2	12	5570831	5570842	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158338618
2015	NC_009925	GACAAT	2	12	5571883	5571894	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158338621
2016	NC_009925	TCGCCC	2	12	5579389	5579400	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158338625
2017	NC_009925	CCCGTC	2	12	5579834	5579845	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158338625
2018	NC_009925	TAAATT	2	12	5582628	5582639	50 %	50 %	0 %	0 %	158338628
2019	NC_009925	GCCAAC	2	12	5583876	5583887	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158338630
2020	NC_009925	ATATTG	2	12	5584561	5584572	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_009925	TCTTGC	2	12	5586871	5586882	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158338634
2022	NC_009925	GCATCG	2	12	5588202	5588213	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158338635
2023	NC_009925	GACGAT	2	12	5592714	5592725	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158338640
2024	NC_009925	GCAAAA	2	12	5592797	5592808	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	158338640
2025	NC_009925	TAAAAG	2	12	5595514	5595525	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158338641
2026	NC_009925	AACATA	2	12	5601057	5601068	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	158338646
2027	NC_009925	TTCACC	2	12	5602155	5602166	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158338646
2028	NC_009925	CGTTTC	2	12	5603360	5603371	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158338646
2029	NC_009925	AATACC	2	12	5606327	5606338	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158338649
2030	NC_009925	GGCATG	2	12	5609063	5609074	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158338651
2031	NC_009925	GGCATC	2	12	5609132	5609143	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158338651
2032	NC_009925	AAGGCA	2	12	5613143	5613154	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158338658
2033	NC_009925	TCCTGA	2	12	5626606	5626617	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158338665
2034	NC_009925	AGTCCC	2	12	5626724	5626735	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158338665
2035	NC_009925	GCTAAA	2	12	5631534	5631545	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158338670
2036	NC_009925	ACTTGT	2	12	5639386	5639397	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2037	NC_009925	TTAAGG	2	12	5642091	5642102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158338675
2038	NC_009925	ATTGTG	2	12	5643434	5643445	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158338676
2039	NC_009925	TTTTTG	2	12	5643873	5643884	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	158338676
2040	NC_009925	TAGGAA	2	12	5647291	5647302	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158338680
2041	NC_009925	AACGGC	2	12	5649808	5649819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158338684
2042	NC_009925	GATAAG	2	12	5651814	5651825	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158338685
2043	NC_009925	ACGCCC	2	12	5652712	5652723	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158338686
2044	NC_009925	TTGGCC	2	12	5658690	5658701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158338691
2045	NC_009925	GCCAAT	2	12	5664242	5664253	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158338694
2046	NC_009925	TTCTCA	2	12	5667011	5667022	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2047	NC_009925	ATTCTC	2	12	5674454	5674465	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158338705
2048	NC_009925	ATCGGC	2	12	5675516	5675527	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158338705
2049	NC_009925	AAGCCC	2	12	5679814	5679825	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158338711
2050	NC_009925	CCCCAG	2	12	5679895	5679906	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158338711
2051	NC_009925	CAGACC	2	12	5683841	5683852	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158338715
2052	NC_009925	CAAATT	2	12	5686178	5686189	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158338717
2053	NC_009925	CCTTCA	2	12	5686204	5686215	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158338717
2054	NC_009925	CAAACC	2	12	5686386	5686397	50 %	0 %	0 %	50 %	158338717
2055	NC_009925	TTTCAA	2	12	5687027	5687038	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	158338718
2056	NC_009925	CAGAAC	2	12	5692420	5692431	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158338723
2057	NC_009925	AATCTC	2	12	5693220	5693231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158338724
2058	NC_009925	AAGGTG	2	12	5697318	5697329	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158338729
2059	NC_009925	AGGGGA	2	12	5704952	5704963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158338735
2060	NC_009925	GGGAGA	2	12	5705387	5705398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158338735
2061	NC_009925	GATATT	2	12	5705844	5705855	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158338735
2062	NC_009925	GCTCAA	2	12	5710121	5710132	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158338737
2063	NC_009925	GTGGCA	2	12	5711765	5711776	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158338739
2064	NC_009925	GTTTGG	2	12	5713029	5713040	0 %	50 %	50 %	0 %	158338739
2065	NC_009925	GCAGCC	2	12	5713360	5713371	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158338739
2066	NC_009925	TCCGGT	2	12	5715163	5715174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158338739
2067	NC_009925	TTGGCA	2	12	5718024	5718035	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2068	NC_009925	TAGTCC	2	12	5719169	5719180	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158338741
2069	NC_009925	ATCGAG	2	12	5725452	5725463	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158338750
2070	NC_009925	GGTGTT	2	12	5732226	5732237	0 %	50 %	50 %	0 %	158338756
2071	NC_009925	AAAGAT	2	12	5737044	5737055	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2072	NC_009925	TGAAGA	2	12	5740139	5740150	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2073	NC_009925	AGAAGG	2	12	5745795	5745806	50 %	0 %	50 %	0 %	158338769
2074	NC_009925	GGGTGA	2	12	5746333	5746344	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	158338769
2075	NC_009925	TTTGAT	2	12	5746490	5746501	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2076	NC_009925	GGTTTA	2	12	5750838	5750849	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158338776
2077	NC_009925	ATCTTC	2	12	5751272	5751283	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158338776
2078	NC_009925	GTTGAA	2	12	5751635	5751646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158338776
2079	NC_009925	TGATCC	2	12	5753112	5753123	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158338776
2080	NC_009925	AGTTCT	2	12	5755276	5755287	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158338777
2081	NC_009925	ATCCCT	2	12	5758471	5758482	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158338779
2082	NC_009925	CCAGGT	2	12	5761516	5761527	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158338781
2083	NC_009925	CAGGAT	2	12	5761850	5761861	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158338781
2084	NC_009925	CAGAAG	2	12	5772818	5772829	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158338789
2085	NC_009925	GGTTGG	2	12	5773008	5773019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158338789
2086	NC_009925	CTATCT	2	12	5774493	5774504	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158338790
2087	NC_009925	ATTGCC	2	12	5778770	5778781	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158338793
2088	NC_009925	AGTGAA	2	12	5781414	5781425	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2089	NC_009925	TTGGTA	2	12	5782088	5782099	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2090	NC_009925	TCCTTC	2	12	5782570	5782581	0 %	50 %	0 %	50 %	158338795
2091	NC_009925	GGTCAA	2	12	5785241	5785252	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158338799
2092	NC_009925	ATGGTT	2	12	5785840	5785851	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158338799
2093	NC_009925	CAAAAA	2	12	5785909	5785920	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	158338799
2094	NC_009925	AATCGG	2	12	5792886	5792897	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158338803
2095	NC_009925	CTTAGT	2	12	5794696	5794707	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158338805
2096	NC_009925	ATAAAG	2	12	5796827	5796838	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158338807
2097	NC_009925	CAATAA	2	12	5798974	5798985	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	158338809
2098	NC_009925	CAGCTC	2	12	5801951	5801962	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158338811
2099	NC_009925	TCAGAC	2	12	5803778	5803789	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2100	NC_009925	TAAAAA	2	12	5810165	5810176	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_009925	GATTGG	2	12	5815914	5815925	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158338824
2102	NC_009925	TCGGCC	2	12	5817430	5817441	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158338824
2103	NC_009925	ACTAAA	2	12	5819838	5819849	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	158338827
2104	NC_009925	CTTCTC	2	12	5820135	5820146	0 %	50 %	0 %	50 %	158338828
2105	NC_009925	CAACTC	2	12	5820168	5820179	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	158338828
2106	NC_009925	TTTGGA	2	12	5822523	5822534	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158338832
2107	NC_009925	ACTGGC	2	12	5823817	5823828	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158338832
2108	NC_009925	TCAAGC	2	12	5826835	5826846	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158338835
2109	NC_009925	GGGAAG	2	12	5827931	5827942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158338836
2110	NC_009925	AGCCTT	2	12	5830357	5830368	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158338839
2111	NC_009925	GAAAGC	2	12	5841165	5841176	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158338848
2112	NC_009925	AGTTTT	2	12	5842056	5842067	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	158338848
2113	NC_009925	TCCTAC	2	12	5849486	5849497	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158338854
2114	NC_009925	AATATA	2	12	5856824	5856835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158338861
2115	NC_009925	TCTGAA	2	12	5861442	5861453	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158338867
2116	NC_009925	TCGATA	2	12	5868303	5868314	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158338872
2117	NC_009925	GATCAG	2	12	5875361	5875372	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2118	NC_009925	ACTGGT	2	12	5878789	5878800	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158338883
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2122	NC_009925	CTAAAG	2	12	5884573	5884584	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158338889
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2127	NC_009925	TGGTAT	2	12	5900118	5900129	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158338905
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2177	NC_009925	CAATGG	2	12	6068818	6068829	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158339066
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2187	NC_009925	TTATAT	2	12	6103299	6103310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2190	NC_009925	GGGGTA	2	12	6112415	6112426	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	158339104
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2207	NC_009925	CAATTC	2	12	6173636	6173647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158339159
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2209	NC_009925	GCCAAC	2	12	6180182	6180193	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158339163
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2216	NC_009925	TGCCCT	2	12	6202669	6202680	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158339192
2217	NC_009925	GCTGCA	2	12	6205176	6205187	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158339194
2218	NC_009925	GCTGCA	2	12	6206994	6207005	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158339196
2219	NC_009925	AAGCGG	2	12	6210998	6211009	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158339205
2220	NC_009925	ATTTTG	2	12	6217209	6217220	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2221	NC_009925	TTAATA	2	12	6218751	6218762	50 %	50 %	0 %	0 %	158339212
2222	NC_009925	ATTGTG	2	12	6219328	6219339	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158339213
2223	NC_009925	GCCCTG	2	12	6221425	6221436	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158339213
2224	NC_009925	ACGTCA	2	12	6221504	6221515	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158339213
2225	NC_009925	TTCTAG	2	12	6225535	6225546	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158339218
2226	NC_009925	TTTACC	2	12	6229073	6229084	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158339222
2227	NC_009925	CCCTGA	2	12	6229744	6229755	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158339222
2228	NC_009925	GATTGC	2	12	6230168	6230179	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158339222
2229	NC_009925	TTTGCC	2	12	6232978	6232989	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158339226
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2233	NC_009925	TCGACC	2	12	6238763	6238774	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158339236
2234	NC_009925	TCAAGG	2	12	6242551	6242562	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2235	NC_009925	GATGCT	2	12	6243414	6243425	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158339245
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2238	NC_009925	TGCAGC	2	12	6253601	6253612	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158339256
2239	NC_009925	CTTTTA	2	12	6258760	6258771	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	158339266
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2242	NC_009925	GGGTTT	2	12	6265099	6265110	0 %	50 %	50 %	0 %	158339272
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2246	NC_009925	CGAACT	2	12	6278223	6278234	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158339286
2247	NC_009925	AGTATC	2	12	6284675	6284686	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158339292
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2281	NC_009925	TTCTAA	2	12	6369803	6369814	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2282	NC_009925	TCTCTA	2	12	6371666	6371677	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158339371
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2284	NC_009925	ACTGGG	2	12	6378794	6378805	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158339381
2285	NC_009925	GCTGAA	2	12	6380971	6380982	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158339385
2286	NC_009925	TCTCAG	2	12	6383860	6383871	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158339388
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2320	NC_009925	TAAATC	2	12	6494406	6494417	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158339474
2321	NC_009925	CCGGGG	2	12	6496268	6496279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158339475

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