MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 chromosome

Total Repeats: 2321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009925	AGCTTC	2	12	4147113	4147124	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158337233
1502	NC_009925	CCCCAT	2	12	4147850	4147861	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	158337234
1503	NC_009925	ACCTAT	2	12	4148416	4148427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158337235
1504	NC_009925	CGATCA	2	12	4149302	4149313	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_009925	TTAATG	2	12	4150353	4150364	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158337237
1506	NC_009925	AGCTTC	2	12	4150649	4150660	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158337237
1507	NC_009925	GATAAT	2	12	4153309	4153320	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158337241
1508	NC_009925	TAGCTA	2	12	4154620	4154631	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1509	NC_009925	ATTGCC	2	12	4155945	4155956	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158337244
1510	NC_009925	CATCGT	2	12	4156943	4156954	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158337245
1511	NC_009925	CTGATA	2	12	4157359	4157370	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1512	NC_009925	GGAAGT	2	12	4158321	4158332	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158337246
1513	NC_009925	ATGAAG	2	12	4158749	4158760	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158337246
1514	NC_009925	CCTCGC	2	12	4159155	4159166	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158337246
1515	NC_009925	CCGCGC	3	18	4159167	4159184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158337246
1516	NC_009925	CGCCCG	2	12	4159212	4159223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158337246
1517	NC_009925	CCTCGC	2	12	4159233	4159244	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158337246
1518	NC_009925	CCGCGC	2	12	4159245	4159256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158337246
1519	NC_009925	CGACCT	2	12	4159266	4159277	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158337246
1520	NC_009925	GACATC	2	12	4164436	4164447	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158337251
1521	NC_009925	TGAATC	2	12	4166645	4166656	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158337252
1522	NC_009925	GCTTGG	2	12	4169195	4169206	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158337256
1523	NC_009925	TTGGGG	2	12	4169270	4169281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158337256
1524	NC_009925	CAATAT	2	12	4170041	4170052	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158337256
1525	NC_009925	TCAGGA	2	12	4171668	4171679	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158337258
1526	NC_009925	CCTCTA	2	12	4181213	4181224	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158337268
1527	NC_009925	TGCCAA	2	12	4181910	4181921	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158337269
1528	NC_009925	GGCAAT	2	12	4183203	4183214	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158337270
1529	NC_009925	CGTTGG	2	12	4192465	4192476	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158337281
1530	NC_009925	GCCTTT	2	12	4193047	4193058	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158337282
1531	NC_009925	CATGGT	2	12	4195840	4195851	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158337284
1532	NC_009925	TCGTTA	2	12	4198784	4198795	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158337288
1533	NC_009925	TGCCAA	2	12	4199259	4199270	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_009925	GCATGG	2	12	4201192	4201203	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158337293
1535	NC_009925	CTGGAG	2	12	4201408	4201419	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158337293
1536	NC_009925	CAATGG	2	12	4201601	4201612	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158337293
1537	NC_009925	CATGGT	2	12	4206105	4206116	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158337299
1538	NC_009925	AAATAT	2	12	4207585	4207596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_009925	TATTTG	2	12	4212195	4212206	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	158337308
1540	NC_009925	GCCATA	2	12	4216963	4216974	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158337313
1541	NC_009925	GGTCTT	2	12	4217561	4217572	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	158337313
1542	NC_009925	AGAAGG	2	12	4218880	4218891	50 %	0 %	50 %	0 %	158337315
1543	NC_009925	TCGACC	2	12	4221259	4221270	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158337318
1544	NC_009925	GGGTGA	2	12	4221995	4222006	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	158337319
1545	NC_009925	AATTTC	2	12	4224490	4224501	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	158337323
1546	NC_009925	GTTGAA	2	12	4224703	4224714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158337323
1547	NC_009925	GGTCTT	2	12	4226642	4226653	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	158337326
1548	NC_009925	TTGAGT	2	12	4227887	4227898	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	158337329
1549	NC_009925	ATTAGA	2	12	4229841	4229852	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_009925	GCAGCC	2	12	4234020	4234031	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158337334
1551	NC_009925	GGTGAT	2	12	4234962	4234973	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158337336
1552	NC_009925	ACGGCG	2	12	4238887	4238898	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158337338
1553	NC_009925	TGCCCA	2	12	4245175	4245186	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158337346
1554	NC_009925	AGAAGG	2	12	4252408	4252419	50 %	0 %	50 %	0 %	158337354
1555	NC_009925	GGGTGA	2	12	4252947	4252958	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	158337355
1556	NC_009925	GCCCTC	2	12	4255564	4255575	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158337358
1557	NC_009925	GGCATT	2	12	4257870	4257881	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158337361
1558	NC_009925	CGAAGC	2	12	4257995	4258006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158337361
1559	NC_009925	CCATTG	2	12	4260871	4260882	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158337365
1560	NC_009925	TCATTG	2	12	4261192	4261203	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158337365
1561	NC_009925	TAGCCC	2	12	4264049	4264060	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158337367
1562	NC_009925	AAGGAT	2	12	4274747	4274758	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	158337376
1563	NC_009925	AAATAA	2	12	4281721	4281732	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_009925	AGCTCT	2	12	4282731	4282742	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158337386
1565	NC_009925	ATATTT	2	12	4284082	4284093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_009925	TCAATC	2	12	4284764	4284775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_009925	ATATTG	2	12	4285614	4285625	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158337389
1568	NC_009925	GTCTTG	2	12	4286232	4286243	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	158337389
1569	NC_009925	CAGCTC	4	24	4286421	4286444	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158337389
1570	NC_009925	CCAGCC	2	12	4286450	4286461	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158337389
1571	NC_009925	CGACTC	2	12	4286481	4286492	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158337389
1572	NC_009925	CAACAC	2	12	4286493	4286504	50 %	0 %	0 %	50 %	158337389
1573	NC_009925	TGTCTT	2	12	4286980	4286991	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	158337389
1574	NC_009925	TCCCAT	2	12	4290080	4290091	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158337392
1575	NC_009925	CAAGAC	2	12	4290416	4290427	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158337392
1576	NC_009925	CATTGG	2	12	4291493	4291504	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158337393
1577	NC_009925	CGCTTC	2	12	4293504	4293515	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158337394
1578	NC_009925	AGAAGG	2	12	4297215	4297226	50 %	0 %	50 %	0 %	158337399
1579	NC_009925	GGGTGA	2	12	4297753	4297764	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	158337399
1580	NC_009925	AGCTGC	2	12	4300926	4300937	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158337403
1581	NC_009925	GGGTGG	2	12	4304653	4304664	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	158337405
1582	NC_009925	GATTTT	2	12	4305867	4305878	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	158337406
1583	NC_009925	TTATTT	2	12	4313161	4313172	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	158337415
1584	NC_009925	AACCAA	2	12	4317214	4317225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158337416
1585	NC_009925	TGCTTT	2	12	4320149	4320160	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	158337420
1586	NC_009925	CTTTTC	2	12	4320667	4320678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158337422
1587	NC_009925	AGTTGT	2	12	4331192	4331203	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_009925	CCAACC	2	12	4333057	4333068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158337432
1589	NC_009925	AAACTC	2	12	4334633	4334644	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158337433
1590	NC_009925	CCTCAA	2	12	4339343	4339354	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	158337435
1591	NC_009925	TCTGAT	2	12	4340081	4340092	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158337437
1592	NC_009925	CAAAGC	2	12	4342058	4342069	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158337439
1593	NC_009925	AAGAAC	2	12	4343583	4343594	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	158337440
1594	NC_009925	GAAGGT	2	12	4344114	4344125	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_009925	GATTGG	2	12	4348165	4348176	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158337443
1596	NC_009925	ACTCCT	2	12	4353266	4353277	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158337447
1597	NC_009925	GGTCGA	2	12	4354369	4354380	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158337448
1598	NC_009925	CTTCAG	2	12	4366801	4366812	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158337462
1599	NC_009925	CAATAT	2	12	4368551	4368562	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	158337462
1600	NC_009925	TGATCC	2	12	4372349	4372360	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158337464
1601	NC_009925	GGCTCA	2	12	4378600	4378611	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158337469
1602	NC_009925	ACCAAG	2	12	4379036	4379047	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	158337469
1603	NC_009925	TTGATC	2	12	4385974	4385985	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158337477
1604	NC_009925	TTGAAT	2	12	4386338	4386349	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158337478
1605	NC_009925	CCTGCC	2	12	4388854	4388865	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158337481
1606	NC_009925	CTTTAT	2	12	4393835	4393846	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	158337485
1607	NC_009925	CATGGG	2	12	4399669	4399680	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158337490
1608	NC_009925	TGGGTT	2	12	4402904	4402915	0 %	50 %	50 %	0 %	158337494
1609	NC_009925	CTCAAA	2	12	4403518	4403529	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158337494
1610	NC_009925	TCAACG	2	12	4406670	4406681	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158337497
1611	NC_009925	TCTGGC	2	12	4410623	4410634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158337501
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1721	NC_009925	CTGAAG	2	12	4654354	4654365	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158337736
1722	NC_009925	CAGGCC	2	12	4659032	4659043	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158337740
1723	NC_009925	ATTGGC	2	12	4663891	4663902	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158337746
1724	NC_009925	TCGCAA	2	12	4666028	4666039	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158337748
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1734	NC_009925	TGGATG	2	12	4720075	4720086	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158337801
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1819	NC_009925	GCCATT	2	12	4980137	4980148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158338055
1820	NC_009925	CAAAGG	2	12	4980548	4980559	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158338055
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1822	NC_009925	GCTCCT	2	12	4987416	4987427	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	158338062
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1825	NC_009925	CAATGT	2	12	5002648	5002659	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	158338078
1826	NC_009925	GATTTT	2	12	5003609	5003620	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	158338078
1827	NC_009925	CTATTC	2	12	5007111	5007122	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	158338079
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1829	NC_009925	TTGATA	2	12	5010678	5010689	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158338081
1830	NC_009925	CTCAAC	2	12	5011575	5011586	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
1831	NC_009925	CAGGCC	2	12	5012035	5012046	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1832	NC_009925	TGGCAA	2	12	5012755	5012766	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1833	NC_009925	AAAGCG	2	12	5013976	5013987	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1834	NC_009925	CGCTGG	2	12	5014731	5014742	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158338082
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1836	NC_009925	TTTGAC	2	12	5024224	5024235	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1837	NC_009925	AGCTCT	2	12	5025667	5025678	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158338090
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1841	NC_009925	TGGGGC	2	12	5035491	5035502	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	158338098
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1849	NC_009925	AGTTCT	2	12	5058921	5058932	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	158338123
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1859	NC_009925	TAGAGG	2	12	5101126	5101137	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1937	NC_009925	ACCCAA	2	12	5348060	5348071	50 %	0 %	0 %	50 %	158338381
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1939	NC_009925	ACGAAT	2	12	5359356	5359367	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158338395
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