MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 36066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009922	AGA	2	6	297	302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319060
2	NC_009922	GAA	2	6	319	324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319060
3	NC_009922	AGA	2	6	329	334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319060
4	NC_009922	AAT	2	6	385	390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319060
5	NC_009922	CTT	2	6	455	460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319060
6	NC_009922	GGT	2	6	511	516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319060
7	NC_009922	TTC	2	6	600	605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319060
8	NC_009922	TTA	2	6	626	631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319060
9	NC_009922	TAG	2	6	695	700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319060
10	NC_009922	TTC	2	6	745	750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319060
11	NC_009922	ATT	2	6	790	795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319060
12	NC_009922	TTG	2	6	1025	1030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319060
13	NC_009922	TTC	2	6	1035	1040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319060
14	NC_009922	GTT	2	6	1141	1146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319060
15	NC_009922	ATA	2	6	1157	1162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319060
16	NC_009922	AGA	2	6	1170	1175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319060
17	NC_009922	ACA	2	6	1300	1305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319060
18	NC_009922	GAC	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319060
19	NC_009922	TTC	2	6	1704	1709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319061
20	NC_009922	CAT	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319061
21	NC_009922	AGA	2	6	1827	1832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319061
22	NC_009922	TCG	2	6	1841	1846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319061
23	NC_009922	ATT	2	6	1857	1862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319061
24	NC_009922	ATT	2	6	1870	1875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319061
25	NC_009922	TGC	2	6	1941	1946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319061
26	NC_009922	AGA	3	9	2004	2012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319061
27	NC_009922	AGA	2	6	2124	2129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319061
28	NC_009922	TAA	2	6	2202	2207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319061
29	NC_009922	GAA	2	6	2263	2268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319061
30	NC_009922	CTT	2	6	2344	2349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319061
31	NC_009922	ATC	2	6	2377	2382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319061
32	NC_009922	TTA	2	6	2425	2430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319061
33	NC_009922	CTT	2	6	2447	2452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319061
34	NC_009922	AAT	2	6	2473	2478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319061
35	NC_009922	GAG	2	6	2548	2553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319061
36	NC_009922	TGA	2	6	2574	2579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319061
37	NC_009922	GAT	2	6	2632	2637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319061
38	NC_009922	TAT	2	6	2679	2684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319061
39	NC_009922	ATC	2	6	2736	2741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319061
40	NC_009922	GAT	2	6	3235	3240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319063
41	NC_009922	AAG	2	6	3612	3617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319063
42	NC_009922	TTA	2	6	3676	3681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319063
43	NC_009922	ATA	2	6	3696	3701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319063
44	NC_009922	TGC	3	9	3781	3789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319063
45	NC_009922	ATG	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319063
46	NC_009922	TGA	2	6	4027	4032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319063
47	NC_009922	ATT	2	6	4209	4214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319063
48	NC_009922	ACC	2	6	4253	4258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319063
49	NC_009922	ATG	2	6	4259	4264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319063
50	NC_009922	AGA	2	6	4288	4293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319063
51	NC_009922	AGG	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319064
52	NC_009922	AAG	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319064
53	NC_009922	TAT	2	6	4550	4555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319064
54	NC_009922	GAA	2	6	4569	4574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319064
55	NC_009922	TTA	2	6	4588	4593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319064
56	NC_009922	GAA	2	6	4612	4617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319064
57	NC_009922	AAC	2	6	4979	4984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319065
58	NC_009922	CAT	2	6	5001	5006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319065
59	NC_009922	GTT	2	6	5019	5024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319065
60	NC_009922	ATA	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319065
61	NC_009922	AGG	2	6	5048	5053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319065
62	NC_009922	AGA	2	6	5084	5089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319065
63	NC_009922	GGA	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319065
64	NC_009922	GGT	2	6	5205	5210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319065
65	NC_009922	GGA	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319065
66	NC_009922	TGG	2	6	5228	5233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319065
67	NC_009922	TGT	2	6	5255	5260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319065
68	NC_009922	ATT	2	6	5358	5363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319065
69	NC_009922	AAC	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319065
70	NC_009922	TAT	2	6	5392	5397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319065
71	NC_009922	GAA	2	6	5421	5426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319065
72	NC_009922	TAC	2	6	5544	5549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319065
73	NC_009922	GGT	2	6	5553	5558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319065
74	NC_009922	CTG	2	6	5854	5859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319065
75	NC_009922	TTG	2	6	5938	5943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319065
76	NC_009922	AGA	2	6	6072	6077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319065
77	NC_009922	TGA	2	6	6287	6292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319065
78	NC_009922	TTA	2	6	6373	6378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319065
79	NC_009922	TTA	3	9	6417	6425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319065
80	NC_009922	ACC	2	6	6485	6490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319065
81	NC_009922	AGA	2	6	6518	6523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319065
82	NC_009922	GAA	3	9	6537	6545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319065
83	NC_009922	GGA	2	6	6570	6575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319065
84	NC_009922	ACT	2	6	6874	6879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319066
85	NC_009922	TTG	2	6	6892	6897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319066
86	NC_009922	AGA	2	6	6942	6947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319066
87	NC_009922	TTG	2	6	7012	7017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319066
88	NC_009922	ATC	2	6	7036	7041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319066
89	NC_009922	CTG	2	6	7054	7059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319066
90	NC_009922	TAG	2	6	7111	7116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319066
91	NC_009922	TAA	2	6	7220	7225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319066
92	NC_009922	GTT	2	6	7386	7391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319066
93	NC_009922	CTG	2	6	7462	7467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319066
94	NC_009922	CAA	2	6	7468	7473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319066
95	NC_009922	AAG	2	6	7495	7500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319066
96	NC_009922	GAA	2	6	7551	7556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319066
97	NC_009922	CAG	2	6	7572	7577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319066
98	NC_009922	ATC	3	9	7578	7586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319066
99	NC_009922	AAG	2	6	7653	7658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319066
100	NC_009922	CAA	2	6	7754	7759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319066
101	NC_009922	ATT	2	6	7861	7866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319066
102	NC_009922	ATC	2	6	7870	7875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319066
103	NC_009922	ATT	2	6	7884	7889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319066
104	NC_009922	GAA	2	6	7894	7899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319066
105	NC_009922	AGA	2	6	7922	7927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319066
106	NC_009922	AGA	3	9	8123	8131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319066
107	NC_009922	GAA	3	9	8307	8315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319066
108	NC_009922	GTG	2	6	8316	8321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319066
109	NC_009922	CAG	2	6	8359	8364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319066
110	NC_009922	AGA	3	9	8420	8428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319066
111	NC_009922	TTG	2	6	8431	8436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319066
112	NC_009922	CTT	2	6	8449	8454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319066
113	NC_009922	AGA	2	6	8532	8537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319066
114	NC_009922	CTA	2	6	8647	8652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319066
115	NC_009922	TAT	2	6	8660	8665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319066
116	NC_009922	GAT	2	6	8736	8741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319066
117	NC_009922	ATC	2	6	8781	8786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319066
118	NC_009922	TCA	2	6	8938	8943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319066
119	NC_009922	TGA	2	6	9071	9076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319066
120	NC_009922	TTG	2	6	9087	9092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319066
121	NC_009922	AAT	2	6	9096	9101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319066
122	NC_009922	CAT	2	6	9197	9202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319066
123	NC_009922	GAA	2	6	9234	9239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319066
124	NC_009922	AGA	2	6	9242	9247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319066
125	NC_009922	GAA	2	6	9258	9263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319066
126	NC_009922	AAT	2	6	9492	9497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319067
127	NC_009922	TAA	2	6	9522	9527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319067
128	NC_009922	AGA	2	6	9615	9620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319067
129	NC_009922	ATT	3	9	9730	9738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319067
130	NC_009922	TTA	2	6	9766	9771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319067
131	NC_009922	ATG	2	6	9827	9832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319068
132	NC_009922	AGC	2	6	9901	9906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319068
133	NC_009922	AGA	2	6	10045	10050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319068
134	NC_009922	ATA	2	6	10098	10103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319068
135	NC_009922	AGA	2	6	10105	10110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319068
136	NC_009922	AGG	2	6	10135	10140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319068
137	NC_009922	GAT	2	6	10172	10177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319068
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139	NC_009922	CTT	2	6	10472	10477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319069
140	NC_009922	ATG	2	6	10505	10510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319069
141	NC_009922	ATC	2	6	10552	10557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319069
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153	NC_009922	ATT	2	6	16432	16437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319070
154	NC_009922	TTA	2	6	16475	16480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319070
155	NC_009922	ATC	2	6	16523	16528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319070
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157	NC_009922	TAG	2	6	16635	16640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319070
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159	NC_009922	TAA	2	6	16854	16859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319070
160	NC_009922	AAT	2	6	16907	16912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319071
161	NC_009922	TAA	4	12	16919	16930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319071
162	NC_009922	ATT	2	6	16998	17003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319071
163	NC_009922	CGG	2	6	17314	17319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319071
164	NC_009922	TAT	2	6	17443	17448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319071
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166	NC_009922	GGT	2	6	17540	17545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319071
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170	NC_009922	TAC	2	6	17801	17806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319071
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