MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 36066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009922	GAT	2	6	106434	106439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319139
1002	NC_009922	ACC	2	6	106505	106510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319139
1003	NC_009922	ATC	2	6	106582	106587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319139
1004	NC_009922	AAG	2	6	106780	106785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319139
1005	NC_009922	TTC	2	6	106883	106888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319139
1006	NC_009922	GAA	2	6	106951	106956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319139
1007	NC_009922	GAA	2	6	106962	106967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319139
1008	NC_009922	GGA	2	6	107022	107027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319139
1009	NC_009922	TAC	2	6	107125	107130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319139
1010	NC_009922	AGG	2	6	107308	107313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319140
1011	NC_009922	AGA	2	6	107414	107419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319140
1012	NC_009922	AGA	2	6	107477	107482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319140
1013	NC_009922	AGA	2	6	107957	107962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319140
1014	NC_009922	TCT	2	6	107976	107981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319140
1015	NC_009922	TCA	2	6	107991	107996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319140
1016	NC_009922	ATA	2	6	107997	108002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319140
1017	NC_009922	TTC	2	6	108356	108361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319140
1018	NC_009922	TTG	2	6	108371	108376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319140
1019	NC_009922	CAG	2	6	108451	108456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319140
1020	NC_009922	GCT	2	6	108568	108573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319140
1021	NC_009922	ATA	2	6	108693	108698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319141
1022	NC_009922	GGT	2	6	108706	108711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319141
1023	NC_009922	TCT	2	6	108762	108767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319141
1024	NC_009922	AAG	2	6	108768	108773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319141
1025	NC_009922	ATA	2	6	108837	108842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319141
1026	NC_009922	CTT	2	6	109105	109110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319142
1027	NC_009922	TGA	2	6	109579	109584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319142
1028	NC_009922	TCT	2	6	109622	109627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319142
1029	NC_009922	GAT	2	6	109661	109666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319142
1030	NC_009922	GGA	2	6	109720	109725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319142
1031	NC_009922	TCA	2	6	109743	109748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319142
1032	NC_009922	TCC	2	6	109764	109769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158319142
1033	NC_009922	TTC	2	6	109783	109788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319142
1034	NC_009922	TCA	2	6	109851	109856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319142
1035	NC_009922	GGT	2	6	109914	109919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319142
1036	NC_009922	TCT	2	6	109974	109979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319142
1037	NC_009922	GTG	2	6	110227	110232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319143
1038	NC_009922	CGG	2	6	110255	110260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319143
1039	NC_009922	TGC	2	6	110294	110299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319143
1040	NC_009922	TTA	2	6	110302	110307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319143
1041	NC_009922	AGG	2	6	110308	110313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319143
1042	NC_009922	TGG	2	6	110344	110349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319143
1043	NC_009922	AAG	2	6	110434	110439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319143
1044	NC_009922	CTA	2	6	110446	110451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319143
1045	NC_009922	GCT	2	6	110496	110501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319143
1046	NC_009922	TAT	2	6	110507	110512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319143
1047	NC_009922	TTG	2	6	110530	110535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319143
1048	NC_009922	TGG	2	6	110540	110545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319143
1049	NC_009922	TAA	2	6	110660	110665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319143
1050	NC_009922	CTG	2	6	110683	110688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319143
1051	NC_009922	TGC	3	9	110738	110746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319143
1052	NC_009922	ATG	2	6	110956	110961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319143
1053	NC_009922	GCT	2	6	110967	110972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319143
1054	NC_009922	TGA	2	6	110980	110985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319143
1055	NC_009922	AGC	2	6	111042	111047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319143
1056	NC_009922	TAT	2	6	111065	111070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319143
1057	NC_009922	TGG	2	6	111227	111232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319143
1058	NC_009922	TGG	2	6	111344	111349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319143
1059	NC_009922	GAG	2	6	111503	111508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319144
1060	NC_009922	GTA	2	6	111629	111634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319144
1061	NC_009922	AAG	2	6	111639	111644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319144
1062	NC_009922	ATG	2	6	111656	111661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319144
1063	NC_009922	GCA	2	6	111766	111771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319144
1064	NC_009922	ATA	2	6	111993	111998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319144
1065	NC_009922	ATT	2	6	112189	112194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319144
1066	NC_009922	GAA	2	6	112217	112222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319144
1067	NC_009922	TAA	2	6	112276	112281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319144
1068	NC_009922	TGC	2	6	112414	112419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319144
1069	NC_009922	GAA	2	6	112447	112452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319144
1070	NC_009922	AGA	2	6	112528	112533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319144
1071	NC_009922	GTT	2	6	112540	112545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319144
1072	NC_009922	TGA	2	6	112557	112562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319144
1073	NC_009922	TGG	2	6	112692	112697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319144
1074	NC_009922	AAG	2	6	112701	112706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319144
1075	NC_009922	TTA	2	6	112856	112861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319144
1076	NC_009922	TAA	2	6	112873	112878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319144
1077	NC_009922	TAG	2	6	112906	112911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319144
1078	NC_009922	AGA	2	6	113348	113353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319145
1079	NC_009922	TGG	2	6	113495	113500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319145
1080	NC_009922	GGT	2	6	113670	113675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319145
1081	NC_009922	GAG	2	6	113730	113735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319145
1082	NC_009922	TAT	2	6	113842	113847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319145
1083	NC_009922	TGG	2	6	113873	113878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319145
1084	NC_009922	TGT	2	6	113966	113971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319145
1085	NC_009922	ATT	2	6	114093	114098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319145
1086	NC_009922	AAG	2	6	114101	114106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319145
1087	NC_009922	GCG	2	6	114108	114113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319145
1088	NC_009922	AGT	2	6	114173	114178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319145
1089	NC_009922	GAA	2	6	114186	114191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319145
1090	NC_009922	CAG	2	6	114247	114252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319145
1091	NC_009922	ATG	2	6	114322	114327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319145
1092	NC_009922	GTG	2	6	114328	114333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319145
1093	NC_009922	TTA	2	6	114430	114435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319145
1094	NC_009922	TCT	2	6	114463	114468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319145
1095	NC_009922	ATT	2	6	114663	114668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319145
1096	NC_009922	ATC	2	6	114735	114740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319145
1097	NC_009922	ATT	2	6	114833	114838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319146
1098	NC_009922	ATT	2	6	114847	114852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319146
1099	NC_009922	TTA	2	6	114857	114862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319146
1100	NC_009922	TAT	2	6	114880	114885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319146
1101	NC_009922	TTG	2	6	114975	114980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319146
1102	NC_009922	AGC	2	6	115120	115125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319146
1103	NC_009922	TGG	2	6	115144	115149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319146
1104	NC_009922	GTT	2	6	115163	115168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319146
1105	NC_009922	ATT	2	6	115198	115203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319146
1106	NC_009922	ACA	2	6	115331	115336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319146
1107	NC_009922	GCA	2	6	115343	115348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319146
1108	NC_009922	TTG	2	6	115362	115367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319146
1109	NC_009922	GTG	3	9	115383	115391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319146
1110	NC_009922	GAA	2	6	115484	115489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319146
1111	NC_009922	TAT	2	6	115569	115574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319146
1112	NC_009922	CAT	2	6	115594	115599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319146
1113	NC_009922	AGC	2	6	115609	115614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319146
1114	NC_009922	TAA	2	6	115662	115667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319146
1115	NC_009922	GGC	2	6	115684	115689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319146
1116	NC_009922	TGC	2	6	115720	115725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319146
1117	NC_009922	CGT	2	6	115741	115746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319146
1118	NC_009922	TGC	2	6	115765	115770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319146
1119	NC_009922	TGG	2	6	115864	115869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319146
1120	NC_009922	AGC	2	6	115939	115944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319146
1121	NC_009922	GTG	2	6	115971	115976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319146
1122	NC_009922	TAT	2	6	116107	116112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319146
1123	NC_009922	ATT	2	6	116260	116265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319147
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1128	NC_009922	TGA	2	6	116880	116885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319147
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1152	NC_009922	CTG	2	6	118464	118469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319149
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1230	NC_009922	GAA	2	6	124729	124734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319155
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1232	NC_009922	ATC	2	6	124779	124784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319155
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1240	NC_009922	ATC	2	6	125560	125565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319156
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1476	NC_009922	CTG	2	6	151363	151368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319182
1477	NC_009922	GAA	2	6	151392	151397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319182
1478	NC_009922	AAT	2	6	151423	151428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319182
1479	NC_009922	TTA	2	6	151600	151605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319182
1480	NC_009922	ATT	2	6	151663	151668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319182
1481	NC_009922	AAG	2	6	151685	151690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319182
1482	NC_009922	ATC	2	6	151702	151707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319182
1483	NC_009922	TTC	2	6	151743	151748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319182
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