MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Frankia sp. EAN1pec chromosome

Total Repeats: 6845

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_009921	GGTGCC	2	12	8497379	8497390	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158318702
6502	NC_009921	AGCCTG	2	12	8500037	8500048	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158318706
6503	NC_009921	AACGGG	2	12	8502891	8502902	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6504	NC_009921	GGCGAG	2	12	8503393	8503404	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6505	NC_009921	GCCCAC	2	12	8504090	8504101	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6506	NC_009921	CGGTCG	2	12	8508369	8508380	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_009921	GCCGGT	2	12	8509040	8509051	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_009921	GGGCTG	2	12	8509254	8509265	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6509	NC_009921	CCCGGG	2	12	8509417	8509428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6510	NC_009921	ACGGCG	2	12	8510809	8510820	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158318717
6511	NC_009921	CCCAGG	2	12	8510878	8510889	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158318717
6512	NC_009921	CGGCTG	2	12	8512771	8512782	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158318719
6513	NC_009921	ACCCGC	2	12	8513189	8513200	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158318719
6514	NC_009921	ACCGTG	2	12	8513302	8513313	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158318719
6515	NC_009921	CGCGGC	2	12	8513846	8513857	0 %	0 %	50 %	50 %	158318720
6516	NC_009921	CGCGGC	2	12	8515220	8515231	0 %	0 %	50 %	50 %	158318721
6517	NC_009921	AGGCCG	2	12	8516088	8516099	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158318722
6518	NC_009921	GTTGAC	2	12	8516939	8516950	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158318722
6519	NC_009921	CGTCGA	2	12	8517766	8517777	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158318722
6520	NC_009921	GCTCGC	2	12	8520608	8520619	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158318723
6521	NC_009921	GGCCGG	2	12	8522829	8522840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158318724
6522	NC_009921	CAAGGA	2	12	8524091	8524102	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158318725
6523	NC_009921	AGCTCC	2	12	8526843	8526854	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158318727
6524	NC_009921	GATCGA	2	12	8527147	8527158	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158318727
6525	NC_009921	GCCCGC	2	12	8528195	8528206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158318728
6526	NC_009921	CCGACG	2	12	8532153	8532164	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158318730
6527	NC_009921	ACTGGC	2	12	8534568	8534579	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158318731
6528	NC_009921	TGGTCG	2	12	8535489	8535500	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158318731
6529	NC_009921	GGCGCG	2	12	8536061	8536072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158318732
6530	NC_009921	CGACTT	2	12	8536411	8536422	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158318732
6531	NC_009921	GCGACG	2	12	8537791	8537802	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158318733
6532	NC_009921	GCCGAG	2	12	8538360	8538371	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158318733
6533	NC_009921	GGTCAC	4	24	8539726	8539749	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_009921	AGCCCG	2	12	8540730	8540741	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158318734
6535	NC_009921	CGTCGC	2	12	8541505	8541516	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158318734
6536	NC_009921	TGGCGC	2	12	8542237	8542248	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_009921	CTGGTC	2	12	8544221	8544232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158318735
6538	NC_009921	ATGCGG	2	12	8544923	8544934	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158318736
6539	NC_009921	GCCGTC	2	12	8545777	8545788	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158318736
6540	NC_009921	CGATCA	2	12	8547490	8547501	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158318738
6541	NC_009921	CGCCTA	2	12	8548481	8548492	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158318739
6542	NC_009921	GCCCTG	2	12	8548739	8548750	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158318740
6543	NC_009921	GCTGTC	2	12	8548879	8548890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158318740
6544	NC_009921	GCCGCG	2	12	8549078	8549089	0 %	0 %	50 %	50 %	158318740
6545	NC_009921	GCCCCG	2	12	8550838	8550849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158318741
6546	NC_009921	GGCCTG	2	12	8553026	8553037	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_009921	CCGGCA	2	12	8553773	8553784	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158318743
6548	NC_009921	CGGCGA	2	12	8557037	8557048	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158318746
6549	NC_009921	CGGCAA	2	12	8557160	8557171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158318746
6550	NC_009921	GAGTCC	2	12	8558031	8558042	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158318746
6551	NC_009921	GCGTTC	2	12	8558340	8558351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158318746
6552	NC_009921	CAGCCG	2	12	8560462	8560473	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158318748
6553	NC_009921	CATACA	2	12	8561427	8561438	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	158318748
6554	NC_009921	CCGGGG	2	12	8561544	8561555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158318748
6555	NC_009921	GCGGCA	2	12	8563447	8563458	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158318750
6556	NC_009921	GCGCCA	2	12	8563964	8563975	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158318750
6557	NC_009921	TGAGGT	2	12	8564662	8564673	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158318751
6558	NC_009921	TGGATG	2	12	8567440	8567451	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158318753
6559	NC_009921	GGCGAC	2	12	8567622	8567633	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158318753
6560	NC_009921	AGACCG	2	12	8568810	8568821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158318754
6561	NC_009921	TGCTCG	2	12	8573619	8573630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_009921	GCTGGC	2	12	8573876	8573887	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158318758
6563	NC_009921	TCGCGG	2	12	8575960	8575971	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158318760
6564	NC_009921	ACGATG	2	12	8576116	8576127	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158318760
6565	NC_009921	GGCCCT	2	12	8576258	8576269	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158318760
6566	NC_009921	ATCGGC	2	12	8576719	8576730	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158318760
6567	NC_009921	CCGCTC	2	12	8579037	8579048	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158318760
6568	NC_009921	AGCACC	2	12	8580736	8580747	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158318761
6569	NC_009921	CGTCGA	2	12	8581482	8581493	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158318762
6570	NC_009921	AGGATG	2	12	8581973	8581984	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	158318762
6571	NC_009921	CAGCGA	2	12	8582253	8582264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158318762
6572	NC_009921	CGGCGC	2	12	8582419	8582430	0 %	0 %	50 %	50 %	158318762
6573	NC_009921	CGAACG	2	12	8583321	8583332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158318762
6574	NC_009921	CGGCGC	2	12	8586939	8586950	0 %	0 %	50 %	50 %	158318765
6575	NC_009921	CGCCGG	2	12	8594889	8594900	0 %	0 %	50 %	50 %	158318772
6576	NC_009921	ACGTCG	2	12	8597460	8597471	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158318775
6577	NC_009921	CCGGGG	2	12	8599019	8599030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158318776
6578	NC_009921	TCAACT	2	12	8600024	8600035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158318776
6579	NC_009921	GTCACC	2	12	8602193	8602204	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158318777
6580	NC_009921	TCATCC	2	12	8605149	8605160	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158318779
6581	NC_009921	GTCTGC	2	12	8607661	8607672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158318782
6582	NC_009921	GCCGAG	2	12	8607807	8607818	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158318782
6583	NC_009921	AGGTCG	2	12	8609202	8609213	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158318783
6584	NC_009921	GACGGT	2	12	8611133	8611144	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6585	NC_009921	TCCGGT	2	12	8611386	8611397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6586	NC_009921	AAGATC	2	12	8613906	8613917	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6587	NC_009921	TTCACC	2	12	8615744	8615755	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	158318788
6588	NC_009921	CGGCGT	2	12	8617745	8617756	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158318790
6589	NC_009921	GGTCGA	3	18	8618466	8618483	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6590	NC_009921	CGAGCG	2	12	8618846	8618857	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158318791
6591	NC_009921	ATCGAG	2	12	8619423	8619434	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158318791
6592	NC_009921	GCGGTC	2	12	8620434	8620445	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158318791
6593	NC_009921	GCGGCA	2	12	8624165	8624176	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158318795
6594	NC_009921	GCGCCA	2	12	8624682	8624693	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158318795
6595	NC_009921	TGAGGT	2	12	8625380	8625391	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158318796
6596	NC_009921	CGCGGC	3	18	8627789	8627806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6597	NC_009921	CGCCTC	2	12	8628367	8628378	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158318797
6598	NC_009921	GAGGAA	2	12	8628670	8628681	50 %	0 %	50 %	0 %	158318797
6599	NC_009921	CGACCC	2	12	8628921	8628932	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158318797
6600	NC_009921	CCGCTC	2	12	8631389	8631400	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158318799
6601	NC_009921	GTCGAT	2	12	8638498	8638509	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158318807
6602	NC_009921	GATGGT	2	12	8639194	8639205	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158318807
6603	NC_009921	TTCGCT	2	12	8640463	8640474	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158318807
6604	NC_009921	CCAGCA	2	12	8641086	8641097	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158318807
6605	NC_009921	CGCCGA	2	12	8642394	8642405	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158318807
6606	NC_009921	GAGCAG	2	12	8648279	8648290	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6607	NC_009921	GCGACA	2	12	8650144	8650155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158318813
6608	NC_009921	TCGCCG	2	12	8651065	8651076	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158318813
6609	NC_009921	CGTGGC	2	12	8654180	8654191	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158318814
6610	NC_009921	GCCGGG	2	12	8655356	8655367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_009921	CGACCG	2	12	8656709	8656720	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158318815
6612	NC_009921	GCCCGG	2	12	8656946	8656957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6709	NC_009921	TCAGGG	2	12	8815704	8815715	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158318936
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6721	NC_009921	CTTCGG	2	12	8829501	8829512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158318948
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6723	NC_009921	GCGCTG	2	12	8832890	8832901	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158318951
6724	NC_009921	GCTGGC	2	12	8832943	8832954	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158318951
6725	NC_009921	GGCCCG	2	12	8836961	8836972	0 %	0 %	50 %	50 %	158318954
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6820	NC_009921	GGCCGC	2	12	8950040	8950051	0 %	0 %	50 %	50 %	158319037
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6822	NC_009921	ATCAGG	2	12	8950373	8950384	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158319038
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6824	NC_009921	ACCCGT	2	12	8950790	8950801	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158319038
6825	NC_009921	GCAGGT	2	12	8950808	8950819	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158319038
6826	NC_009921	GCGGGC	2	12	8951827	8951838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319038
6827	NC_009921	CCGACC	2	12	8953614	8953625	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158319040
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6829	NC_009921	CGCTGG	2	12	8958074	8958085	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158319041
6830	NC_009921	GCCAGC	2	12	8958430	8958441	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158319041
6831	NC_009921	CCACGA	2	12	8959615	8959626	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158319042
6832	NC_009921	GGTCGA	2	12	8961235	8961246	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6833	NC_009921	TCCGGT	2	12	8964619	8964630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319045
6834	NC_009921	GTGACC	2	12	8966114	8966125	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158319047
6835	NC_009921	GCGCGG	2	12	8968482	8968493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319049
6836	NC_009921	GGTCCA	2	12	8970302	8970313	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158319050
6837	NC_009921	GCGAGC	2	12	8971151	8971162	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158319051
6838	NC_009921	CGAAGA	2	12	8975384	8975395	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158319053
6839	NC_009921	CACCGC	2	12	8975841	8975852	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158319053
6840	NC_009921	CCGGCT	2	12	8976820	8976831	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158319053
6841	NC_009921	GAGCGC	2	12	8977254	8977265	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158319053
6842	NC_009921	CGGGAC	3	18	8978487	8978504	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6843	NC_009921	GAGCGG	2	12	8978904	8978915	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158319055
6844	NC_009921	GGGACG	2	12	8979047	8979058	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158319055
6845	NC_009921	TCGCGA	2	12	8980399	8980410	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158319056

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