MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Frankia sp. EAN1pec chromosome

Total Repeats: 6845

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009921	GGAGCG	2	12	7202715	7202726	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158317672
5502	NC_009921	TGGTCG	2	12	7202924	7202935	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158317672
5503	NC_009921	CGCCGA	2	12	7204722	7204733	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158317673
5504	NC_009921	CCGCAC	2	12	7207031	7207042	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_009921	GGGCGA	2	12	7207704	7207715	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158317676
5506	NC_009921	GGCGCC	2	12	7207915	7207926	0 %	0 %	50 %	50 %	158317676
5507	NC_009921	GGCCGG	2	12	7208064	7208075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158317676
5508	NC_009921	GCGGTC	2	12	7209502	7209513	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158317678
5509	NC_009921	GCCGGC	2	12	7209965	7209976	0 %	0 %	50 %	50 %	158317678
5510	NC_009921	GGCGCG	2	12	7211184	7211195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158317678
5511	NC_009921	GCTGGC	2	12	7212822	7212833	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158317679
5512	NC_009921	CGATCG	2	12	7213790	7213801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158317679
5513	NC_009921	GCCCAC	2	12	7214178	7214189	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158317679
5514	NC_009921	CTGGAC	2	12	7215484	7215495	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158317680
5515	NC_009921	CGGCAC	2	12	7215826	7215837	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5516	NC_009921	CGCCGG	2	12	7217199	7217210	0 %	0 %	50 %	50 %	158317682
5517	NC_009921	CGCCAG	2	12	7217716	7217727	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158317682
5518	NC_009921	GCCCCG	2	12	7218644	7218655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158317682
5519	NC_009921	CCCCGA	2	12	7219461	7219472	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158317682
5520	NC_009921	TGGCGG	2	12	7220802	7220813	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	158317682
5521	NC_009921	AGCGCG	2	12	7223678	7223689	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158317682
5522	NC_009921	GGCCGC	2	12	7223812	7223823	0 %	0 %	50 %	50 %	158317682
5523	NC_009921	CGAAGG	2	12	7227798	7227809	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158317682
5524	NC_009921	CGGCGC	2	12	7228110	7228121	0 %	0 %	50 %	50 %	158317682
5525	NC_009921	GCCGCG	2	12	7230272	7230283	0 %	0 %	50 %	50 %	158317682
5526	NC_009921	TTGCCG	2	12	7231802	7231813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158317682
5527	NC_009921	GTCCCG	2	12	7234219	7234230	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158317682
5528	NC_009921	GCCTGT	2	12	7234298	7234309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158317682
5529	NC_009921	GACTGT	2	12	7234310	7234321	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158317682
5530	NC_009921	CCGCGG	2	12	7236243	7236254	0 %	0 %	50 %	50 %	158317682
5531	NC_009921	ACCCGC	2	12	7237172	7237183	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158317682
5532	NC_009921	GCGTCG	2	12	7238021	7238032	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158317682
5533	NC_009921	GTCCGG	2	12	7238638	7238649	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158317683
5534	NC_009921	CCGTCG	2	12	7238819	7238830	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158317683
5535	NC_009921	CGGTGA	2	12	7239210	7239221	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158317683
5536	NC_009921	CCGATG	2	12	7239935	7239946	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158317683
5537	NC_009921	CCGGCG	2	12	7240152	7240163	0 %	0 %	50 %	50 %	158317683
5538	NC_009921	GCCCAG	2	12	7241586	7241597	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158317684
5539	NC_009921	CGGCGC	2	12	7242902	7242913	0 %	0 %	50 %	50 %	158317684
5540	NC_009921	GTCGAC	2	12	7243440	7243451	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158317684
5541	NC_009921	GGTCGG	2	12	7243946	7243957	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	158317684
5542	NC_009921	CACGAC	2	12	7247089	7247100	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158317686
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5544	NC_009921	CGCCAG	2	12	7248188	7248199	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158317687
5545	NC_009921	GACCAC	2	12	7248611	7248622	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158317687
5546	NC_009921	CATCGC	2	12	7250350	7250361	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_009921	GTCATC	2	12	7250365	7250376	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_009921	CAACCC	2	12	7253083	7253094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5549	NC_009921	GACCAG	2	12	7257327	7257338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158317693
5550	NC_009921	AGCCCG	2	12	7257463	7257474	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158317693
5551	NC_009921	GTCGAG	2	12	7258107	7258118	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158317694
5552	NC_009921	GCCCGG	2	12	7261708	7261719	0 %	0 %	50 %	50 %	158317700
5553	NC_009921	CCGCAA	2	12	7262173	7262184	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158317700
5554	NC_009921	AGCCGT	2	12	7262362	7262373	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158317701
5555	NC_009921	CTGGTC	2	12	7265009	7265020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158317704
5556	NC_009921	GACGGC	2	12	7265149	7265160	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158317704
5557	NC_009921	TCGACC	2	12	7265586	7265597	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158317704
5558	NC_009921	CGCACA	2	12	7267501	7267512	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158317706
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5560	NC_009921	CGGCAG	2	12	7269346	7269357	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158317707
5561	NC_009921	GGCCCG	2	12	7269996	7270007	0 %	0 %	50 %	50 %	158317708
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5564	NC_009921	GTCGGT	2	12	7278975	7278986	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158317716
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5566	NC_009921	ACGGCG	2	12	7283966	7283977	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158317719
5567	NC_009921	AGCGGG	2	12	7285017	7285028	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	158317720
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5569	NC_009921	CGCGTC	2	12	7285411	7285422	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_009921	GGCCGC	2	12	7286406	7286417	0 %	0 %	50 %	50 %	158317722
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5573	NC_009921	GCCGGC	2	12	7290861	7290872	0 %	0 %	50 %	50 %	158317724
5574	NC_009921	TCGCCG	2	12	7292376	7292387	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158317725
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5581	NC_009921	GTCGGC	2	12	7298876	7298887	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158317730
5582	NC_009921	CCCGGG	2	12	7300585	7300596	0 %	0 %	50 %	50 %	158317731
5583	NC_009921	CTCCGC	2	12	7300821	7300832	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158317731
5584	NC_009921	CCCGGC	3	18	7307666	7307683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5585	NC_009921	GCCGTT	2	12	7313005	7313016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_009921	GTGCAG	2	12	7313205	7313216	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158317738
5587	NC_009921	GGCCGT	2	12	7313587	7313598	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158317738
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5589	NC_009921	CCGGGT	2	12	7314082	7314093	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158317738
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5593	NC_009921	CGTGGC	2	12	7319784	7319795	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158317743
5594	NC_009921	CGGCCT	2	12	7319796	7319807	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158317743
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5596	NC_009921	GGAGAA	2	12	7324315	7324326	50 %	0 %	50 %	0 %	158317747
5597	NC_009921	CAGCGC	2	12	7324648	7324659	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158317747
5598	NC_009921	CGCGAC	2	12	7325390	7325401	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158317748
5599	NC_009921	CGGGCC	2	12	7326217	7326228	0 %	0 %	50 %	50 %	158317749
5600	NC_009921	GCCGCA	2	12	7328767	7328778	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158317751
5601	NC_009921	AGATCG	2	12	7328910	7328921	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158317751
5602	NC_009921	AGCCGA	2	12	7329750	7329761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158317752
5603	NC_009921	CCCGCT	2	12	7330359	7330370	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	158317752
5604	NC_009921	GGCGAA	2	12	7331822	7331833	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	158317753
5605	NC_009921	TCGGGC	2	12	7333226	7333237	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158317754
5606	NC_009921	CACGGT	2	12	7334870	7334881	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158317756
5607	NC_009921	CGGCCC	2	12	7334914	7334925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158317756
5608	NC_009921	GCGCGG	2	12	7334926	7334937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158317756
5609	NC_009921	CACGAC	2	12	7336012	7336023	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158317757
5610	NC_009921	CTTCAG	2	12	7336111	7336122	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158317757
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5612	NC_009921	CGGTGC	2	12	7337340	7337351	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158317757
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5829	NC_009921	GCCCTC	2	12	7616805	7616816	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5830	NC_009921	CAGCCT	2	12	7618477	7618488	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158318012
5831	NC_009921	TCGGTG	2	12	7618646	7618657	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	158318012
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5833	NC_009921	CACCCG	2	12	7623865	7623876	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5834	NC_009921	GGCCCC	2	12	7625034	7625045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158318017
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5948	NC_009921	GTCGGC	2	12	7801843	7801854	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	158318158
5949	NC_009921	CGGCAC	2	12	7801945	7801956	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158318158
5950	NC_009921	TCCAGG	2	12	7806110	7806121	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158318160
5951	NC_009921	TCGCGC	2	12	7807106	7807117	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	158318161
5952	NC_009921	CGGCAC	2	12	7807899	7807910	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5953	NC_009921	CAGCCG	2	12	7812180	7812191	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158318166
5954	NC_009921	GTCGAG	2	12	7812387	7812398	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	158318166
5955	NC_009921	CAGGAG	2	12	7813670	7813681	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5956	NC_009921	GTTCCG	2	12	7814469	7814480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5957	NC_009921	CGTCGG	8	48	7814803	7814850	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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5959	NC_009921	GCGGGA	2	12	7815242	7815253	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5960	NC_009921	GCCGAC	3	18	7816360	7816377	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158318168
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5965	NC_009921	ACCGCG	2	12	7817080	7817091	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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5974	NC_009921	GCCCGA	2	12	7835562	7835573	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158318179
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5976	NC_009921	GCATCT	2	12	7837568	7837579	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158318180
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5979	NC_009921	CGACGG	2	12	7840435	7840446	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5980	NC_009921	GGCCGT	2	12	7840454	7840465	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5981	NC_009921	CCGACC	3	18	7841349	7841366	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	158318182
5982	NC_009921	ACGATC	2	12	7842427	7842438	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5983	NC_009921	CCGACA	2	12	7842757	7842768	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	158318183
5984	NC_009921	CACCTG	2	12	7845144	7845155	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	158318186
5985	NC_009921	GAGCCT	2	12	7845551	7845562	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158318186
5986	NC_009921	CGGCGA	2	12	7847163	7847174	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	158318189
5987	NC_009921	CGCCGA	2	12	7847366	7847377	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	158318189
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5997	NC_009921	CGTTCG	2	12	7863094	7863105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158318203
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5999	NC_009921	AGGAAC	2	12	7865833	7865844	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	158318205
6000	NC_009921	GCGTCA	2	12	7865926	7865937	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	158318205

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