MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 1387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009440	GAAGG	2	10	1633101	1633110	40 %	0 %	60 %	0 %	146304457
1002	NC_009440	GGTTG	2	10	1633588	1633597	0 %	40 %	60 %	0 %	146304457
1003	NC_009440	TTCCA	2	10	1635340	1635349	20 %	40 %	0 %	40 %	146304458
1004	NC_009440	GTCCA	2	10	1636479	1636488	20 %	20 %	20 %	40 %	146304460
1005	NC_009440	GGGAG	2	10	1639009	1639018	20 %	0 %	80 %	0 %	146304462
1006	NC_009440	CTCTC	2	10	1639809	1639818	0 %	40 %	0 %	60 %	146304463
1007	NC_009440	AGGGA	2	10	1640034	1640043	40 %	0 %	60 %	0 %	146304463
1008	NC_009440	GGGAT	2	10	1641087	1641096	20 %	20 %	60 %	0 %	146304464
1009	NC_009440	TCGTG	2	10	1642130	1642139	0 %	40 %	40 %	20 %	146304465
1010	NC_009440	AGCGT	2	10	1645323	1645332	20 %	20 %	40 %	20 %	146304469
1011	NC_009440	CAGTG	2	10	1648413	1648422	20 %	20 %	40 %	20 %	146304473
1012	NC_009440	GAAGT	2	10	1652318	1652327	40 %	20 %	40 %	0 %	146304478
1013	NC_009440	TAGAA	2	10	1652359	1652368	60 %	20 %	20 %	0 %	146304478
1014	NC_009440	GATAA	2	10	1656487	1656496	60 %	20 %	20 %	0 %	146304480
1015	NC_009440	CTTCT	2	10	1658414	1658423	0 %	60 %	0 %	40 %	146304482
1016	NC_009440	ATGGG	2	10	1659300	1659309	20 %	20 %	60 %	0 %	146304482
1017	NC_009440	CTATT	2	10	1660983	1660992	20 %	60 %	0 %	20 %	146304484
1018	NC_009440	GTATA	2	10	1661651	1661660	40 %	40 %	20 %	0 %	146304485
1019	NC_009440	AGAAA	2	10	1664256	1664265	80 %	0 %	20 %	0 %	146304488
1020	NC_009440	AGGTA	2	10	1664719	1664728	40 %	20 %	40 %	0 %	146304489
1021	NC_009440	ATTTC	2	10	1668953	1668962	20 %	60 %	0 %	20 %	146304494
1022	NC_009440	GAAAT	2	10	1669779	1669788	60 %	20 %	20 %	0 %	146304496
1023	NC_009440	TTAGC	2	10	1671768	1671777	20 %	40 %	20 %	20 %	146304498
1024	NC_009440	CTGAG	2	10	1672241	1672250	20 %	20 %	40 %	20 %	146304498
1025	NC_009440	TTCCT	2	10	1673392	1673401	0 %	60 %	0 %	40 %	146304500
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1027	NC_009440	TGGCA	2	10	1673771	1673780	20 %	20 %	40 %	20 %	146304501
1028	NC_009440	CCTTC	2	10	1674249	1674258	0 %	40 %	0 %	60 %	146304501
1029	NC_009440	TCCAG	2	10	1676413	1676422	20 %	20 %	20 %	40 %	146304504
1030	NC_009440	CTATA	2	10	1677752	1677761	40 %	40 %	0 %	20 %	146304506
1031	NC_009440	GAAGG	2	10	1682246	1682255	40 %	0 %	60 %	0 %	146304511
1032	NC_009440	TTCGG	2	10	1682894	1682903	0 %	40 %	40 %	20 %	146304511
1033	NC_009440	ATCTT	2	10	1686484	1686493	20 %	60 %	0 %	20 %	146304513
1034	NC_009440	GATAT	2	10	1687851	1687860	40 %	40 %	20 %	0 %	146304515
1035	NC_009440	GTAAG	2	10	1688115	1688124	40 %	20 %	40 %	0 %	146304515
1036	NC_009440	AAGGG	2	10	1688248	1688257	40 %	0 %	60 %	0 %	146304515
1037	NC_009440	AGCTA	2	10	1688968	1688977	40 %	20 %	20 %	20 %	146304515
1038	NC_009440	TGAAA	2	10	1693123	1693132	60 %	20 %	20 %	0 %	146304519
1039	NC_009440	GGAGA	2	10	1693685	1693694	40 %	0 %	60 %	0 %	146304520
1040	NC_009440	CAGGT	2	10	1697387	1697396	20 %	20 %	40 %	20 %	146304523
1041	NC_009440	AGCTG	2	10	1698820	1698829	20 %	20 %	40 %	20 %	146304525
1042	NC_009440	GAGTC	2	10	1701346	1701355	20 %	20 %	40 %	20 %	146304528
1043	NC_009440	GGCTC	2	10	1703833	1703842	0 %	20 %	40 %	40 %	146304530
1044	NC_009440	AGGGA	2	10	1712887	1712896	40 %	0 %	60 %	0 %	146304534
1045	NC_009440	GGGAC	2	10	1713671	1713680	20 %	0 %	60 %	20 %	146304534
1046	NC_009440	GGAAA	2	10	1716306	1716315	60 %	0 %	40 %	0 %	146304537
1047	NC_009440	GGAAG	2	10	1716341	1716350	40 %	0 %	60 %	0 %	146304537
1048	NC_009440	TCCCT	2	10	1717571	1717580	0 %	40 %	0 %	60 %	146304537
1049	NC_009440	CAGGA	2	10	1718496	1718505	40 %	0 %	40 %	20 %	146304538
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1051	NC_009440	GGAAA	2	10	1720290	1720299	60 %	0 %	40 %	0 %	146304540
1052	NC_009440	GTTAA	2	10	1720326	1720335	40 %	40 %	20 %	0 %	146304540
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1054	NC_009440	AGCTG	2	10	1723597	1723606	20 %	20 %	40 %	20 %	146304543
1055	NC_009440	TTCCC	2	10	1725791	1725800	0 %	40 %	0 %	60 %	146304546
1056	NC_009440	TCAAG	2	10	1728356	1728365	40 %	20 %	20 %	20 %	146304550
1057	NC_009440	CCTCC	2	10	1729748	1729757	0 %	20 %	0 %	80 %	146304552
1058	NC_009440	CTTCA	2	10	1730411	1730420	20 %	40 %	0 %	40 %	146304552
1059	NC_009440	GCTTA	2	10	1730510	1730519	20 %	40 %	20 %	20 %	146304552
1060	NC_009440	CAGGT	2	10	1731761	1731770	20 %	20 %	40 %	20 %	146304554
1061	NC_009440	CAGTT	2	10	1731909	1731918	20 %	40 %	20 %	20 %	146304554
1062	NC_009440	TGAAT	2	10	1731981	1731990	40 %	40 %	20 %	0 %	146304554
1063	NC_009440	AGGGA	2	10	1732214	1732223	40 %	0 %	60 %	0 %	146304554
1064	NC_009440	GGTGA	2	10	1733901	1733910	20 %	20 %	60 %	0 %	146304556
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1068	NC_009440	GGCTG	2	10	1736609	1736618	0 %	20 %	60 %	20 %	146304560
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1072	NC_009440	GATTG	2	10	1745659	1745668	20 %	40 %	40 %	0 %	146304568
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1079	NC_009440	CTCTC	2	10	1756753	1756762	0 %	40 %	0 %	60 %	146304575
1080	NC_009440	ATAGA	2	10	1757729	1757738	60 %	20 %	20 %	0 %	146304575
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1085	NC_009440	AATCT	2	10	1763646	1763655	40 %	40 %	0 %	20 %	146304578
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1096	NC_009440	GTGGC	2	10	1772282	1772291	0 %	20 %	60 %	20 %	146304586
1097	NC_009440	GTTGG	2	10	1772602	1772611	0 %	40 %	60 %	0 %	146304586
1098	NC_009440	TCCCT	2	10	1772813	1772822	0 %	40 %	0 %	60 %	146304586
1099	NC_009440	TCCTG	2	10	1772824	1772833	0 %	40 %	20 %	40 %	146304586
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1107	NC_009440	GATCA	2	10	1788689	1788698	40 %	20 %	20 %	20 %	146304594
1108	NC_009440	TTGCC	2	10	1788983	1788992	0 %	40 %	20 %	40 %	146304594
1109	NC_009440	GCTAC	2	10	1790295	1790304	20 %	20 %	20 %	40 %	146304595
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1111	NC_009440	CGAGG	2	10	1798159	1798168	20 %	0 %	60 %	20 %	146304599
1112	NC_009440	ATGAG	2	10	1799009	1799018	40 %	20 %	40 %	0 %	146304600
1113	NC_009440	GTTGT	2	10	1801394	1801403	0 %	60 %	40 %	0 %	146304602
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1116	NC_009440	TCTTT	2	10	1806221	1806230	0 %	80 %	0 %	20 %	146304607
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1365	NC_009440	ACCTA	2	10	2156470	2156479	40 %	20 %	0 %	40 %	146305000
1366	NC_009440	TAAAC	2	10	2156887	2156896	60 %	20 %	0 %	20 %	146305001
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1371	NC_009440	AAGCT	2	10	2165409	2165418	40 %	20 %	20 %	20 %	146305009
1372	NC_009440	ATCTT	2	10	2166506	2166515	20 %	60 %	0 %	20 %	146305010
1373	NC_009440	TATCA	2	10	2166736	2166745	40 %	40 %	0 %	20 %	146305010
1374	NC_009440	TCAAC	2	10	2167125	2167134	40 %	20 %	0 %	40 %	146305010
1375	NC_009440	ATTCT	2	10	2169334	2169343	20 %	60 %	0 %	20 %	146305013
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