MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 1387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009440	AGATG	2	10	807861	807870	40 %	20 %	40 %	0 %	146303654
502	NC_009440	CCCAG	2	10	808150	808159	20 %	0 %	20 %	60 %	146303654
503	NC_009440	GAAAT	2	10	808455	808464	60 %	20 %	20 %	0 %	146303654
504	NC_009440	GAGCG	2	10	808481	808490	20 %	0 %	60 %	20 %	146303654
505	NC_009440	AACAA	2	10	808861	808870	80 %	0 %	0 %	20 %	146303655
506	NC_009440	TTTAT	2	10	812143	812152	20 %	80 %	0 %	0 %	146303658
507	NC_009440	TGGAA	2	10	812199	812208	40 %	20 %	40 %	0 %	146303658
508	NC_009440	CGACT	2	10	812389	812398	20 %	20 %	20 %	40 %	146303659
509	NC_009440	CCTTA	2	10	814839	814848	20 %	40 %	0 %	40 %	146303660
510	NC_009440	CTTAC	2	10	817669	817678	20 %	40 %	0 %	40 %	146303662
511	NC_009440	CATGA	2	10	819700	819709	40 %	20 %	20 %	20 %	146303664
512	NC_009440	GGAAG	2	10	820688	820697	40 %	0 %	60 %	0 %	146303666
513	NC_009440	CTTAC	2	10	824403	824412	20 %	40 %	0 %	40 %	146303669
514	NC_009440	AGGGA	2	10	828531	828540	40 %	0 %	60 %	0 %	146303672
515	NC_009440	AGTCG	2	10	830609	830618	20 %	20 %	40 %	20 %	146303676
516	NC_009440	GGATT	2	10	830864	830873	20 %	40 %	40 %	0 %	146303676
517	NC_009440	TTCCT	2	10	834227	834236	0 %	60 %	0 %	40 %	146303682
518	NC_009440	TCTAC	2	10	834255	834264	20 %	40 %	0 %	40 %	146303682
519	NC_009440	ATCTC	2	10	835061	835070	20 %	40 %	0 %	40 %	146303683
520	NC_009440	TCAAG	2	10	835496	835505	40 %	20 %	20 %	20 %	146303684
521	NC_009440	GGAGT	2	10	835637	835646	20 %	20 %	60 %	0 %	146303684
522	NC_009440	CTATT	2	10	836076	836085	20 %	60 %	0 %	20 %	146303685
523	NC_009440	CAGTT	2	10	836598	836607	20 %	40 %	20 %	20 %	146303685
524	NC_009440	ATAAC	2	10	837404	837413	60 %	20 %	0 %	20 %	146303686
525	NC_009440	CCCCT	2	10	838211	838220	0 %	20 %	0 %	80 %	146303686
526	NC_009440	CTGAG	2	10	840252	840261	20 %	20 %	40 %	20 %	146303688
527	NC_009440	GGAAA	2	10	841040	841049	60 %	0 %	40 %	0 %	146303690
528	NC_009440	TTCTA	2	10	843743	843752	20 %	60 %	0 %	20 %	146303691
529	NC_009440	AGGGA	2	10	844139	844148	40 %	0 %	60 %	0 %	146303691
530	NC_009440	TCTGA	2	10	844708	844717	20 %	40 %	20 %	20 %	146303692
531	NC_009440	GAAGT	2	10	846820	846829	40 %	20 %	40 %	0 %	146303695
532	NC_009440	GGAAG	2	10	847429	847438	40 %	0 %	60 %	0 %	146303695
533	NC_009440	CACTA	2	10	847636	847645	40 %	20 %	0 %	40 %	146303695
534	NC_009440	GGGGA	2	10	848266	848275	20 %	0 %	80 %	0 %	146303695
535	NC_009440	GTAAA	2	10	848686	848695	60 %	20 %	20 %	0 %	146303695
536	NC_009440	GATGA	2	10	849178	849187	40 %	20 %	40 %	0 %	146303696
537	NC_009440	AAAGG	2	10	850521	850530	60 %	0 %	40 %	0 %	146303699
538	NC_009440	CATAC	2	10	853324	853333	40 %	20 %	0 %	40 %	146303703
539	NC_009440	CATTT	2	10	854089	854098	20 %	60 %	0 %	20 %	146303703
540	NC_009440	CAATC	2	10	854811	854820	40 %	20 %	0 %	40 %	146303703
541	NC_009440	GTCCT	2	10	858472	858481	0 %	40 %	20 %	40 %	146303710
542	NC_009440	GACAT	2	10	860350	860359	40 %	20 %	20 %	20 %	146303713
543	NC_009440	TTTCC	2	10	862577	862586	0 %	60 %	0 %	40 %	146303715
544	NC_009440	AATAA	2	10	862993	863002	80 %	20 %	0 %	0 %	146303715
545	NC_009440	TATGG	2	10	864690	864699	20 %	40 %	40 %	0 %	146303716
546	NC_009440	TAAAG	2	10	867356	867365	60 %	20 %	20 %	0 %	146303719
547	NC_009440	TTCCA	2	10	868678	868687	20 %	40 %	0 %	40 %	146303721
548	NC_009440	GAGGG	2	10	870000	870009	20 %	0 %	80 %	0 %	146303723
549	NC_009440	GGTAA	2	10	875723	875732	40 %	20 %	40 %	0 %	146303727
550	NC_009440	AAAGG	2	10	877279	877288	60 %	0 %	40 %	0 %	146303730
551	NC_009440	AAATA	2	10	877377	877386	80 %	20 %	0 %	0 %	146303730
552	NC_009440	TGTCC	2	10	884543	884552	0 %	40 %	20 %	40 %	146303737
553	NC_009440	TAGGC	2	10	884950	884959	20 %	20 %	40 %	20 %	146303737
554	NC_009440	GATAT	2	10	886449	886458	40 %	40 %	20 %	0 %	146303738
555	NC_009440	GGACT	2	10	889822	889831	20 %	20 %	40 %	20 %	146303741
556	NC_009440	GCCTC	2	10	891106	891115	0 %	20 %	20 %	60 %	146303742
557	NC_009440	CGAGG	2	10	891118	891127	20 %	0 %	60 %	20 %	146303742
558	NC_009440	AGTAA	2	10	894298	894307	60 %	20 %	20 %	0 %	146303745
559	NC_009440	TCAAG	2	10	895168	895177	40 %	20 %	20 %	20 %	146303745
560	NC_009440	TTACT	2	10	895394	895403	20 %	60 %	0 %	20 %	146303746
561	NC_009440	GGTAA	2	10	900533	900542	40 %	20 %	40 %	0 %	146303751
562	NC_009440	CAGGT	2	10	901837	901846	20 %	20 %	40 %	20 %	146303752
563	NC_009440	CCCTC	2	10	906191	906200	0 %	20 %	0 %	80 %	146303758
564	NC_009440	AGGAT	2	10	908461	908470	40 %	20 %	40 %	0 %	146303761
565	NC_009440	TGGCC	2	10	912154	912163	0 %	20 %	40 %	40 %	146303765
566	NC_009440	GAACC	2	10	912703	912712	40 %	0 %	20 %	40 %	146303765
567	NC_009440	CTTCC	2	10	913038	913047	0 %	40 %	0 %	60 %	146303765
568	NC_009440	AGATG	2	10	913219	913228	40 %	20 %	40 %	0 %	146303765
569	NC_009440	CGTAA	2	10	915027	915036	40 %	20 %	20 %	20 %	146303767
570	NC_009440	AGTAA	2	10	915893	915902	60 %	20 %	20 %	0 %	146303768
571	NC_009440	GGGAT	2	10	916364	916373	20 %	20 %	60 %	0 %	146303769
572	NC_009440	CGGAT	2	10	916548	916557	20 %	20 %	40 %	20 %	146303769
573	NC_009440	TGGGT	2	10	916783	916792	0 %	40 %	60 %	0 %	146303769
574	NC_009440	GAAGT	2	10	918031	918040	40 %	20 %	40 %	0 %	146303770
575	NC_009440	AGGGG	2	10	919487	919496	20 %	0 %	80 %	0 %	146303772
576	NC_009440	AGAGG	2	10	919760	919769	40 %	0 %	60 %	0 %	146303772
577	NC_009440	CCTGA	2	10	920746	920755	20 %	20 %	20 %	40 %	146303773
578	NC_009440	AGGAT	2	10	921739	921748	40 %	20 %	40 %	0 %	146303775
579	NC_009440	CTCTC	2	10	922011	922020	0 %	40 %	0 %	60 %	146303776
580	NC_009440	GAGAG	2	10	923007	923016	40 %	0 %	60 %	0 %	146303777
581	NC_009440	CTTCC	2	10	924229	924238	0 %	40 %	0 %	60 %	146303779
582	NC_009440	TATGG	2	10	927254	927263	20 %	40 %	40 %	0 %	146303783
583	NC_009440	GGCCA	2	10	928818	928827	20 %	0 %	40 %	40 %	146303784
584	NC_009440	GGGGA	2	10	929296	929305	20 %	0 %	80 %	0 %	146303785
585	NC_009440	ACCTT	2	10	932320	932329	20 %	40 %	0 %	40 %	146303788
586	NC_009440	ACGGG	2	10	935859	935868	20 %	0 %	60 %	20 %	146303791
587	NC_009440	AGAGG	2	10	936002	936011	40 %	0 %	60 %	0 %	146303791
588	NC_009440	TCCTT	2	10	937392	937401	0 %	60 %	0 %	40 %	146303792
589	NC_009440	TTCCT	2	10	939613	939622	0 %	60 %	0 %	40 %	146303794
590	NC_009440	CAACT	2	10	939786	939795	40 %	20 %	0 %	40 %	146303794
591	NC_009440	GAGCA	2	10	940535	940544	40 %	0 %	40 %	20 %	146303794
592	NC_009440	CTATC	2	10	943735	943744	20 %	40 %	0 %	40 %	146303797
593	NC_009440	TTTAT	2	10	945987	945996	20 %	80 %	0 %	0 %	146303798
594	NC_009440	CAGTT	2	10	947190	947199	20 %	40 %	20 %	20 %	146303799
595	NC_009440	ATCTT	2	10	949476	949485	20 %	60 %	0 %	20 %	146303800
596	NC_009440	AAATG	2	10	954188	954197	60 %	20 %	20 %	0 %	146303803
597	NC_009440	GATGA	2	10	955143	955152	40 %	20 %	40 %	0 %	146303804
598	NC_009440	TACTT	2	10	955747	955756	20 %	60 %	0 %	20 %	146303805
599	NC_009440	CGAGA	2	10	956736	956745	40 %	0 %	40 %	20 %	146303806
600	NC_009440	CAGGG	2	10	957143	957152	20 %	0 %	60 %	20 %	146303806
601	NC_009440	TTACC	2	10	958222	958231	20 %	40 %	0 %	40 %	146303807
602	NC_009440	CAACC	2	10	958409	958418	40 %	0 %	0 %	60 %	146303807
603	NC_009440	GGTTG	2	10	963822	963831	0 %	40 %	60 %	0 %	146303812
604	NC_009440	GCCCA	2	10	963894	963903	20 %	0 %	20 %	60 %	146303812
605	NC_009440	CTGGA	2	10	967750	967759	20 %	20 %	40 %	20 %	146303814
606	NC_009440	CCTGG	2	10	968044	968053	0 %	20 %	40 %	40 %	146303814
607	NC_009440	GAAGT	2	10	971444	971453	40 %	20 %	40 %	0 %	146303816
608	NC_009440	CACAC	2	10	972384	972393	40 %	0 %	0 %	60 %	146303817
609	NC_009440	TTCAA	2	10	974434	974443	40 %	40 %	0 %	20 %	146303819
610	NC_009440	TCCCT	2	10	975066	975075	0 %	40 %	0 %	60 %	146303819
611	NC_009440	CTCTG	2	10	976345	976354	0 %	40 %	20 %	40 %	146303820
612	NC_009440	TTCAA	2	10	976567	976576	40 %	40 %	0 %	20 %	146303820
613	NC_009440	AGGGA	2	10	977673	977682	40 %	0 %	60 %	0 %	146303822
614	NC_009440	AGGGA	2	10	977716	977725	40 %	0 %	60 %	0 %	146303822
615	NC_009440	CCTTG	2	10	978749	978758	0 %	40 %	20 %	40 %	146303823
616	NC_009440	GATCA	2	10	981165	981174	40 %	20 %	20 %	20 %	146303825
617	NC_009440	CTTAT	2	10	982438	982447	20 %	60 %	0 %	20 %	146303827
618	NC_009440	TTACC	2	10	985272	985281	20 %	40 %	0 %	40 %	146303828
619	NC_009440	TATGG	2	10	985720	985729	20 %	40 %	40 %	0 %	146303829
620	NC_009440	AAGGA	2	10	986440	986449	60 %	0 %	40 %	0 %	146303830
621	NC_009440	TCACT	2	10	988768	988777	20 %	40 %	0 %	40 %	146303832
622	NC_009440	ACTCC	2	10	990697	990706	20 %	20 %	0 %	60 %	146303834
623	NC_009440	AGATA	2	10	991052	991061	60 %	20 %	20 %	0 %	146303834
624	NC_009440	TGACG	2	10	991330	991339	20 %	20 %	40 %	20 %	146303835
625	NC_009440	AGCAG	2	10	993690	993699	40 %	0 %	40 %	20 %	146303836
626	NC_009440	CCAGC	2	10	997914	997923	20 %	0 %	20 %	60 %	146303839
627	NC_009440	CTTCC	2	10	1000924	1000933	0 %	40 %	0 %	60 %	146303844
628	NC_009440	TCTCC	2	10	1002054	1002063	0 %	40 %	0 %	60 %	146303845
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998	NC_009440	TCCAG	2	10	1627870	1627879	20 %	20 %	20 %	40 %	146304452
999	NC_009440	GAATA	2	10	1631016	1631025	60 %	20 %	20 %	0 %	146304456
1000	NC_009440	CTCCA	2	10	1631657	1631666	20 %	20 %	0 %	60 %	146304456

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