MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009440	TTTC	2	8	167	174	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009440	TAAG	2	8	27166	27173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009440	TTGA	2	8	27187	27194	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009440	TTCT	2	8	37231	37238	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009440	CAGA	2	8	53438	53445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009440	ACTT	2	8	56964	56971	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009440	TTCT	2	8	58645	58652	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009440	TGTT	2	8	62170	62177	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009440	TAGC	2	8	65343	65350	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009440	CAGG	2	8	73300	73307	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009440	TATC	2	8	99080	99087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009440	CAAG	2	8	100327	100334	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009440	TAAT	2	8	101253	101260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009440	TCAA	2	8	104285	104292	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009440	TTTC	2	8	106355	106362	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009440	TAAA	2	8	107615	107622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009440	TTAA	2	8	107623	107630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009440	AACA	2	8	108079	108086	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009440	TAAA	2	8	108583	108590	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009440	CCTC	2	8	108769	108776	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_009440	ATTT	2	8	112105	112112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009440	AAAC	2	8	112571	112578	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009440	GATA	2	8	118092	118099	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009440	GGAA	2	8	125123	125130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009440	CTTA	2	8	128335	128342	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009440	AGAT	2	8	128451	128458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009440	GTTA	2	8	133046	133053	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009440	TATT	2	8	135334	135341	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009440	GTGG	2	8	141271	141278	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009440	AGGA	2	8	142069	142076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009440	AAGT	2	8	142507	142514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009440	CAGG	2	8	148090	148097	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009440	TCCA	2	8	148149	148156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009440	TTCT	2	8	151776	151783	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009440	TAGA	2	8	158898	158905	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009440	ATTA	2	8	187254	187261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009440	ATAA	2	8	187263	187270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009440	AAGA	2	8	200304	200311	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009440	TTCT	2	8	201227	201234	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009440	AGTT	2	8	201287	201294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009440	ACAA	2	8	203490	203497	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009440	TCAT	2	8	208901	208908	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009440	CAAA	2	8	216438	216445	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009440	CTTT	2	8	222928	222935	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009440	TCTA	2	8	242830	242837	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009440	GATA	2	8	257375	257382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009440	TTCC	2	8	271771	271778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009440	TGAG	2	8	272067	272074	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009440	GATA	2	8	272092	272099	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009440	TAGA	2	8	294735	294742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009440	GGAA	2	8	300993	301000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009440	AAAC	2	8	304844	304851	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009440	TACA	2	8	307775	307782	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009440	TTTA	2	8	307804	307811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009440	CTGT	2	8	313828	313835	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009440	TAAA	2	8	314136	314143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009440	TTCT	2	8	316554	316561	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009440	ATGA	2	8	316576	316583	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009440	TTTA	2	8	316616	316623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009440	TAGA	2	8	321236	321243	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009440	AATT	2	8	321275	321282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009440	TCAT	2	8	327732	327739	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009440	TAAT	2	8	327846	327853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009440	AAGT	2	8	329406	329413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009440	AAGG	2	8	329450	329457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009440	TACT	2	8	330417	330424	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009440	GAAA	2	8	333965	333972	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009440	ACAT	2	8	333974	333981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009440	AGTC	2	8	337929	337936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009440	TACT	2	8	338824	338831	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009440	CAAG	2	8	351518	351525	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009440	GAAA	2	8	358985	358992	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009440	TAGT	2	8	365371	365378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009440	CTAC	2	8	367090	367097	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009440	TCAT	2	8	379716	379723	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009440	TTAT	2	8	383911	383918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009440	TTTA	2	8	384093	384100	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009440	CAAA	2	8	389363	389370	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009440	GTTT	2	8	392004	392011	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009440	TCAA	2	8	396186	396193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009440	AATG	2	8	402773	402780	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009440	TTCT	2	8	404416	404423	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009440	TAAT	2	8	404463	404470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009440	TAAT	2	8	406882	406889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009440	AAAG	2	8	407839	407846	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009440	TTAG	2	8	407996	408003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009440	ATTT	2	8	409607	409614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009440	TTTC	2	8	417755	417762	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009440	TGTA	2	8	420306	420313	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009440	AGTT	2	8	426022	426029	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009440	AGTT	2	8	432832	432839	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009440	AATT	2	8	432902	432909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009440	GGAA	2	8	433118	433125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009440	GATA	2	8	436792	436799	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009440	GATT	2	8	437049	437056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009440	TGAT	2	8	440738	440745	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009440	TTAT	2	8	440751	440758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009440	ATAA	2	8	443835	443842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009440	CTAA	2	8	448846	448853	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009440	TGCG	2	8	448917	448924	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009440	AGTT	2	8	450315	450322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009440	TCCT	2	8	450844	450851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009440	AAAG	2	8	457066	457073	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009440	TGCC	2	8	457550	457557	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009440	CAGT	2	8	457828	457835	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009440	ATGA	2	8	464378	464385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009440	AGTT	2	8	472642	472649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009440	ACGA	2	8	494831	494838	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009440	TCAT	2	8	495761	495768	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009440	GAAA	2	8	495785	495792	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009440	ACCT	2	8	495807	495814	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009440	ACCA	2	8	505895	505902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009440	AGAA	2	8	514067	514074	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009440	GTAA	2	8	516026	516033	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009440	ATTA	2	8	517892	517899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009440	TAAT	2	8	520526	520533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009440	AAAG	2	8	520553	520560	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009440	TTTA	2	8	522615	522622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009440	ATCT	2	8	531915	531922	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009440	TAGT	2	8	531945	531952	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009440	TTAA	2	8	534272	534279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009440	TTTA	2	8	534352	534359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009440	GGTT	2	8	548266	548273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009440	TTTA	2	8	548891	548898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009440	TTGC	2	8	556645	556652	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009440	CAGG	2	8	556697	556704	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009440	TAAG	2	8	573816	573823	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009440	CCAG	2	8	583006	583013	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009440	TCAA	2	8	586966	586973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009440	GGAC	2	8	606612	606619	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009440	CATG	2	8	607752	607759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009440	GTTT	2	8	613331	613338	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009440	ATTT	2	8	617089	617096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009440	GTTC	2	8	645632	645639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009440	ACTA	2	8	648947	648954	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009440	ACTT	2	8	648976	648983	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009440	ATTT	2	8	653300	653307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009440	TTAA	2	8	653429	653436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009440	TAAG	2	8	655059	655066	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009440	TTAA	2	8	655221	655228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009440	GAAC	2	8	667001	667008	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009440	CTAG	2	8	673522	673529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009440	GATA	2	8	677114	677121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009440	ATTT	2	8	681457	681464	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009440	CCTT	2	8	684703	684710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009440	TAAA	2	8	685668	685675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009440	ACTA	2	8	701233	701240	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009440	ATAA	2	8	702645	702652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009440	GAAA	2	8	704736	704743	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009440	TTTC	2	8	709259	709266	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_009440	TTTA	2	8	712367	712374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_009440	GATA	2	8	1499224	1499231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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494	NC_009440	AACC	2	8	1535655	1535662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
495	NC_009440	GCAG	2	8	1535666	1535673	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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