MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium sp. JLS chromosome

Total Repeats: 3872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009077	GCCGGC	2	12	5471865	5471876	0 %	0 %	50 %	50 %	126437789
3502	NC_009077	GGCCGT	2	12	5472065	5472076	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126437789
3503	NC_009077	CACCCG	2	12	5474228	5474239	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	126437791
3504	NC_009077	TGCCGC	2	12	5474988	5474999	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126437792
3505	NC_009077	GTCCCG	2	12	5475401	5475412	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126437792
3506	NC_009077	CATCGT	2	12	5476101	5476112	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126437793
3507	NC_009077	ACCGCA	2	12	5476643	5476654	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	126437793
3508	NC_009077	CGATCC	2	12	5476884	5476895	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126437794
3509	NC_009077	GGCCTC	2	12	5479953	5479964	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126437797
3510	NC_009077	GGGTGT	2	12	5480465	5480476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126437797
3511	NC_009077	CCGTCG	2	12	5480551	5480562	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126437797
3512	NC_009077	CCCGAC	2	12	5483597	5483608	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	126437798
3513	NC_009077	CGTCGG	2	12	5485702	5485713	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126437799
3514	NC_009077	ACGCCG	2	12	5487743	5487754	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126437801
3515	NC_009077	TTCGGT	2	12	5489491	5489502	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	126437803
3516	NC_009077	GGTCAC	2	12	5492605	5492616	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126437805
3517	NC_009077	CGCGGG	2	12	5492673	5492684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126437805
3518	NC_009077	CGCGGT	2	12	5494094	5494105	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126437806
3519	NC_009077	GCACCG	2	12	5496746	5496757	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126437809
3520	NC_009077	CGTCGA	2	12	5498407	5498418	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126437810
3521	NC_009077	GCCTCG	2	12	5499925	5499936	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126437812
3522	NC_009077	ACCGGC	2	12	5501250	5501261	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126437813
3523	NC_009077	AGCCCG	2	12	5501670	5501681	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126437813
3524	NC_009077	CCTCGA	2	12	5501899	5501910	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126437813
3525	NC_009077	CACCCC	2	12	5503997	5504008	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	126437817
3526	NC_009077	GTTCCG	2	12	5505311	5505322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126437818
3527	NC_009077	CCTCGA	2	12	5506348	5506359	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126437819
3528	NC_009077	ACGTGA	2	12	5506843	5506854	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126437820
3529	NC_009077	CGTCGG	2	12	5506912	5506923	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126437820
3530	NC_009077	TCGACG	2	12	5508301	5508312	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126437821
3531	NC_009077	CCTGCA	2	12	5510688	5510699	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126437823
3532	NC_009077	GGGCCT	2	12	5510754	5510765	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126437823
3533	NC_009077	TCGCGG	2	12	5511005	5511016	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126437823
3534	NC_009077	GAGCCC	2	12	5512168	5512179	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126437824
3535	NC_009077	TGTGGT	2	12	5514336	5514347	0 %	50 %	50 %	0 %	126437827
3536	NC_009077	CCGGTG	2	12	5514967	5514978	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126437827
3537	NC_009077	ACAGCC	2	12	5515971	5515982	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	126437828
3538	NC_009077	CCTAGA	2	12	5518580	5518591	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126437830
3539	NC_009077	CAGGTC	2	12	5520688	5520699	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126437832
3540	NC_009077	ACGGCG	2	12	5520924	5520935	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126437833
3541	NC_009077	GCGGTT	2	12	5520958	5520969	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	126437833
3542	NC_009077	GGGACG	2	12	5521392	5521403	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	126437833
3543	NC_009077	TCCGGA	2	12	5523173	5523184	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126437836
3544	NC_009077	TCGAAC	2	12	5524415	5524426	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126437838
3545	NC_009077	GCCGGG	2	12	5527220	5527231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126437840
3546	NC_009077	CCGGCG	2	12	5528997	5529008	0 %	0 %	50 %	50 %	126437841
3547	NC_009077	ACCGGC	2	12	5531183	5531194	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126437843
3548	NC_009077	CGGCGT	2	12	5531761	5531772	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126437843
3549	NC_009077	TCGAAC	2	12	5532071	5532082	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126437844
3550	NC_009077	CGCGAG	2	12	5532313	5532324	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126437844
3551	NC_009077	TCGACG	2	12	5533007	5533018	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126437845
3552	NC_009077	TTGACC	2	12	5535305	5535316	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126437847
3553	NC_009077	TGCGCG	2	12	5537510	5537521	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126437849
3554	NC_009077	CGCCCG	2	12	5538486	5538497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126437849
3555	NC_009077	CCGACG	2	12	5540357	5540368	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126437850
3556	NC_009077	CACCGA	2	12	5542717	5542728	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	126437852
3557	NC_009077	CGCCGA	2	12	5543056	5543067	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126437852
3558	NC_009077	GCCGCT	2	12	5543167	5543178	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126437852
3559	NC_009077	GGCTCG	2	12	5543793	5543804	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126437852
3560	NC_009077	GCCCCT	2	12	5549102	5549113	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	126437857
3561	NC_009077	GATGAG	2	12	5549806	5549817	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	126437858
3562	NC_009077	ACCAAC	2	12	5552383	5552394	50 %	0 %	0 %	50 %	126437862
3563	NC_009077	TCGGCG	2	12	5556201	5556212	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126437867
3564	NC_009077	TCGCCG	2	12	5557967	5557978	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126437868
3565	NC_009077	GGTCGG	2	12	5558183	5558194	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	126437868
3566	NC_009077	GAAGGA	2	12	5561683	5561694	50 %	0 %	50 %	0 %	126437872
3567	NC_009077	GTCGGG	2	12	5564135	5564146	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	126437874
3568	NC_009077	CCGGGC	2	12	5565091	5565102	0 %	0 %	50 %	50 %	126437876
3569	NC_009077	ATGTCG	2	12	5565225	5565236	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126437876
3570	NC_009077	ACAGCC	2	12	5568802	5568813	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	126437880
3571	NC_009077	GGGTCG	2	12	5571699	5571710	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	126437882
3572	NC_009077	CGTCGA	2	12	5572677	5572688	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126437883
3573	NC_009077	TGCGCA	2	12	5574196	5574207	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126437884
3574	NC_009077	TGACGA	2	12	5576173	5576184	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126437886
3575	NC_009077	CGGTGA	2	12	5581495	5581506	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126437891
3576	NC_009077	AGGAAC	2	12	5581773	5581784	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	126437891
3577	NC_009077	CGCGGT	2	12	5582033	5582044	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126437891
3578	NC_009077	CACCGT	2	12	5584115	5584126	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126437893
3579	NC_009077	GTTCAT	2	12	5585372	5585383	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	126437895
3580	NC_009077	CGCCGG	2	12	5586708	5586719	0 %	0 %	50 %	50 %	126437896
3581	NC_009077	CCTCGA	2	12	5587746	5587757	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126437896
3582	NC_009077	CCGGAC	2	12	5588621	5588632	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126437898
3583	NC_009077	AGATCG	2	12	5589823	5589834	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126437898
3584	NC_009077	CGACGG	2	12	5591407	5591418	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126437899
3585	NC_009077	CACGGT	2	12	5591992	5592003	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126437899
3586	NC_009077	TGGGCC	2	12	5595765	5595776	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126437906
3587	NC_009077	AGCGCC	2	12	5597457	5597468	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126437908
3588	NC_009077	TGGCCC	2	12	5598090	5598101	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126437909
3589	NC_009077	TGCCGA	2	12	5600555	5600566	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126437911
3590	NC_009077	CTCATC	2	12	5601116	5601127	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	126437912
3591	NC_009077	GTCGAG	2	12	5602307	5602318	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126437913
3592	NC_009077	GGTCGG	2	12	5602930	5602941	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	126437914
3593	NC_009077	CGATGA	2	12	5605335	5605346	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126437916
3594	NC_009077	CCCGGC	2	12	5608193	5608204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126437920
3595	NC_009077	TCGGCC	2	12	5609018	5609029	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126437920
3596	NC_009077	GCGGTG	2	12	5610871	5610882	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	126437924
3597	NC_009077	CGCCGA	2	12	5613731	5613742	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126437926
3598	NC_009077	GTTCGC	2	12	5618153	5618164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126437933
3599	NC_009077	ATCACC	2	12	5618268	5618279	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	126437933
3600	NC_009077	CGACAG	2	12	5618351	5618362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126437933
3601	NC_009077	GGCGCT	2	12	5622444	5622455	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126437937
3602	NC_009077	TTGCGC	2	12	5623903	5623914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126437938
3603	NC_009077	GTTACG	2	12	5624867	5624878	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126437939
3604	NC_009077	CCCGGC	2	12	5626542	5626553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126437942
3605	NC_009077	GATGCG	2	12	5627341	5627352	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126437942
3606	NC_009077	ACACCG	2	12	5628384	5628395	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	126437944
3607	NC_009077	CCTCGG	2	12	5630038	5630049	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126437945
3608	NC_009077	GGTCGC	2	12	5636790	5636801	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126437948
3609	NC_009077	CGCGTT	2	12	5637201	5637212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126437948
3610	NC_009077	CACCCG	2	12	5639048	5639059	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	126437949
3611	NC_009077	TCGCCG	2	12	5640001	5640012	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126437949
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3704	NC_009077	CTCGCC	2	12	5776447	5776458	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	126438082
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3710	NC_009077	GATCGG	2	12	5784174	5784185	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126438090
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3716	NC_009077	TCGACC	2	12	5791043	5791054	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126438099
3717	NC_009077	CACCGC	2	12	5791093	5791104	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	126438099
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3720	NC_009077	TCGCCG	2	12	5793349	5793360	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126438102
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3826	NC_009077	AGGCCG	2	12	5974775	5974786	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126438285
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3829	NC_009077	GAGATC	2	12	5978469	5978480	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126438288
3830	NC_009077	GGGATT	2	12	5982725	5982736	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	126438292
3831	NC_009077	GCGTCG	2	12	5987266	5987277	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126438297
3832	NC_009077	CCGCAC	2	12	5988378	5988389	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	126438298
3833	NC_009077	TCGCCA	2	12	5988590	5988601	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126438298
3834	NC_009077	AATCCG	2	12	5990327	5990338	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126438301
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3857	NC_009077	TTGCCG	2	12	6028065	6028076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126438334
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.