MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium sp. JLS chromosome

Total Repeats: 3872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009077	TGGCCG	2	12	3035210	3035221	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126435487
2002	NC_009077	GTTCGA	2	12	3038165	3038176	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126435491
2003	NC_009077	GACGTC	2	12	3038570	3038581	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126435492
2004	NC_009077	CGACGG	2	12	3039446	3039457	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126435493
2005	NC_009077	CGGCTG	2	12	3040389	3040400	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126435494
2006	NC_009077	ATCGTC	2	12	3042409	3042420	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126435497
2007	NC_009077	GCAACG	2	12	3043963	3043974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126435500
2008	NC_009077	CCGACG	2	12	3044071	3044082	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126435500
2009	NC_009077	GCCGAC	2	12	3044255	3044266	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126435500
2010	NC_009077	ACGGGC	2	12	3044417	3044428	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126435500
2011	NC_009077	GGCGCG	2	12	3044430	3044441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126435500
2012	NC_009077	CGTCAT	2	12	3044750	3044761	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126435500
2013	NC_009077	GCGCCG	2	12	3044812	3044823	0 %	0 %	50 %	50 %	126435500
2014	NC_009077	GCCGGC	2	12	3048410	3048421	0 %	0 %	50 %	50 %	126435503
2015	NC_009077	TCGCGG	2	12	3050025	3050036	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126435505
2016	NC_009077	TCTGCG	2	12	3050154	3050165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126435506
2017	NC_009077	CGACCG	2	12	3053995	3054006	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126435511
2018	NC_009077	GCGATC	2	12	3054545	3054556	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126435512
2019	NC_009077	GCGCCG	2	12	3058115	3058126	0 %	0 %	50 %	50 %	126435515
2020	NC_009077	GCCGTT	2	12	3058467	3058478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126435516
2021	NC_009077	GTGCTG	2	12	3058588	3058599	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	126435516
2022	NC_009077	CGACGC	2	12	3061683	3061694	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126435518
2023	NC_009077	CACCGC	2	12	3062053	3062064	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	126435518
2024	NC_009077	CCGACG	2	12	3063887	3063898	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126435520
2025	NC_009077	AGCACG	2	12	3064668	3064679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126435521
2026	NC_009077	AGTCGT	2	12	3065721	3065732	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126435522
2027	NC_009077	ACGTCG	2	12	3067089	3067100	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126435524
2028	NC_009077	CACCGA	2	12	3067930	3067941	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	126435525
2029	NC_009077	ACGCCG	2	12	3067992	3068003	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126435525
2030	NC_009077	TGGGTG	2	12	3074705	3074716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126435530
2031	NC_009077	GATGTC	2	12	3074722	3074733	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126435530
2032	NC_009077	TCTCGG	2	12	3075303	3075314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126435531
2033	NC_009077	ACACCG	2	12	3076930	3076941	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	126435532
2034	NC_009077	CCAGCG	2	12	3077011	3077022	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126435532
2035	NC_009077	CCGCGG	2	12	3081305	3081316	0 %	0 %	50 %	50 %	126435536
2036	NC_009077	CGGTGC	2	12	3082901	3082912	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126435538
2037	NC_009077	ACCGCG	2	12	3084634	3084645	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126435539
2038	NC_009077	CGTCGG	2	12	3085835	3085846	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126435540
2039	NC_009077	GCCGAC	2	12	3085959	3085970	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126435540
2040	NC_009077	GATGCC	2	12	3086088	3086099	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126435540
2041	NC_009077	GTCGAA	2	12	3086990	3087001	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126435541
2042	NC_009077	CTCGAT	2	12	3089677	3089688	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126435544
2043	NC_009077	GGGCGT	2	12	3089733	3089744	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	126435544
2044	NC_009077	GCCTCG	2	12	3090062	3090073	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126435544
2045	NC_009077	ACCAGC	2	12	3090173	3090184	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	126435544
2046	NC_009077	ATCGAG	2	12	3092383	3092394	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126435547
2047	NC_009077	CGTAGA	2	12	3092551	3092562	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126435548
2048	NC_009077	GTCGGC	2	12	3099594	3099605	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126435549
2049	NC_009077	CCTCGA	2	12	3100916	3100927	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126435550
2050	NC_009077	GTCGCC	2	12	3105866	3105877	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126435556
2051	NC_009077	TGCAGC	2	12	3106251	3106262	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126435556
2052	NC_009077	CTGCGG	2	12	3108592	3108603	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126435557
2053	NC_009077	CGACCG	2	12	3108744	3108755	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126435557
2054	NC_009077	CGCCGA	2	12	3108840	3108851	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126435557
2055	NC_009077	GTGGGC	2	12	3110267	3110278	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	126435559
2056	NC_009077	CGTGCA	2	12	3110858	3110869	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126435560
2057	NC_009077	TTGCCC	2	12	3111646	3111657	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126435560
2058	NC_009077	GACGCC	2	12	3112309	3112320	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126435561
2059	NC_009077	GGTGGC	2	12	3114480	3114491	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	126435563
2060	NC_009077	GTCGGT	2	12	3114541	3114552	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	126435563
2061	NC_009077	GCCGAG	2	12	3115583	3115594	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126435565
2062	NC_009077	CGGTGA	2	12	3115849	3115860	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126435565
2063	NC_009077	GTCGAG	2	12	3118137	3118148	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126435567
2064	NC_009077	CGACCG	2	12	3125311	3125322	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126435572
2065	NC_009077	CCGGTG	2	12	3126221	3126232	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126435574
2066	NC_009077	ACCTTG	2	12	3126548	3126559	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126435575
2067	NC_009077	GTTCGC	2	12	3128129	3128140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126435577
2068	NC_009077	GACCTG	2	12	3130065	3130076	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126435577
2069	NC_009077	CGCCGA	2	12	3132935	3132946	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126435580
2070	NC_009077	CGTCGA	2	12	3133394	3133405	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126435580
2071	NC_009077	GCAACG	2	12	3133564	3133575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126435580
2072	NC_009077	GTTCCG	2	12	3135225	3135236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126435581
2073	NC_009077	CGACGT	2	12	3136276	3136287	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126435582
2074	NC_009077	ATGCCG	2	12	3143250	3143261	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126435589
2075	NC_009077	GATCGT	2	12	3143279	3143290	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126435589
2076	NC_009077	TGATCA	2	12	3143743	3143754	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126435589
2077	NC_009077	AGCCGG	2	12	3145479	3145490	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126435590
2078	NC_009077	AGCCGG	2	12	3145536	3145547	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126435590
2079	NC_009077	TCGCAG	2	12	3147386	3147397	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126435590
2080	NC_009077	CCTCGA	2	12	3148953	3148964	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126435592
2081	NC_009077	CCACGA	2	12	3150413	3150424	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	126435594
2082	NC_009077	TGCCGG	2	12	3153184	3153195	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126435595
2083	NC_009077	CAGACG	2	12	3154176	3154187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126435597
2084	NC_009077	GTCGAT	2	12	3156128	3156139	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126435599
2085	NC_009077	CCGTCG	2	12	3162771	3162782	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126435605
2086	NC_009077	GGCGTC	2	12	3162806	3162817	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126435605
2087	NC_009077	ACCCTC	2	12	3163448	3163459	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	126435605
2088	NC_009077	CGGCGA	2	12	3164747	3164758	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126435606
2089	NC_009077	CTACGC	2	12	3165360	3165371	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126435607
2090	NC_009077	GCGACG	2	12	3165720	3165731	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126435608
2091	NC_009077	TCGCCG	2	12	3165837	3165848	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126435608
2092	NC_009077	ATGGAG	2	12	3165929	3165940	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	126435608
2093	NC_009077	CCGAAC	2	12	3168583	3168594	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	126435611
2094	NC_009077	CGTCCT	2	12	3169242	3169253	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126435612
2095	NC_009077	CCAGGC	2	12	3171743	3171754	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126435614
2096	NC_009077	TTGATG	2	12	3172135	3172146	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	126435614
2097	NC_009077	CGAGCG	2	12	3172355	3172366	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126435614
2098	NC_009077	CGTTGA	2	12	3172828	3172839	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126435615
2099	NC_009077	TCGTGC	2	12	3176154	3176165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126435620
2100	NC_009077	CGACGT	2	12	3176962	3176973	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126435620
2101	NC_009077	CAAGGG	2	12	3176974	3176985	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126435620
2102	NC_009077	CGTCGG	2	12	3177596	3177607	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126435621
2103	NC_009077	GCGCGG	2	12	3177773	3177784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126435621
2104	NC_009077	TGCAGG	2	12	3179433	3179444	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126435623
2105	NC_009077	GCACCA	2	12	3180812	3180823	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	126435624
2106	NC_009077	GCGCCG	2	12	3181060	3181071	0 %	0 %	50 %	50 %	126435624
2107	NC_009077	CAGCAC	2	12	3181896	3181907	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	126435625
2108	NC_009077	ACCGGA	2	12	3183925	3183936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126435627
2109	NC_009077	CATCGT	2	12	3184377	3184388	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126435628
2110	NC_009077	GCATCC	2	12	3186599	3186610	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126435630
2111	NC_009077	CTGGCC	2	12	3190963	3190974	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126435634
2112	NC_009077	CGCGGT	2	12	3191304	3191315	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126435634
2113	NC_009077	GATGGC	2	12	3191913	3191924	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126435634
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2123	NC_009077	GGCTCG	2	12	3204590	3204601	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126435643
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2205	NC_009077	GTCGAG	2	12	3307195	3307206	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126435733
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2210	NC_009077	ACTGCG	2	12	3312493	3312504	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126435740
2211	NC_009077	CGACCT	2	12	3314908	3314919	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126435740
2212	NC_009077	GTCGGG	2	12	3317606	3317617	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	126435742
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2215	NC_009077	ACACCA	2	12	3320104	3320115	50 %	0 %	0 %	50 %	126435744
2216	NC_009077	TCCCAC	2	12	3321263	3321274	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	126435745
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2328	NC_009077	CGGCGA	2	12	3522589	3522600	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126435938
2329	NC_009077	CAGCTC	2	12	3524430	3524441	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126435940
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2426	NC_009077	CTGGCG	2	12	3683131	3683142	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126436068
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2430	NC_009077	TCGCCA	2	12	3691420	3691431	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126436076
2431	NC_009077	TCGGGA	2	12	3693231	3693242	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126436078
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2433	NC_009077	GCCGGG	2	12	3697414	3697425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126436082
2434	NC_009077	GCGGCC	2	12	3702045	3702056	0 %	0 %	50 %	50 %	126436088
2435	NC_009077	GTCACC	2	12	3702985	3702996	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126436089
2436	NC_009077	TCGGCC	2	12	3703187	3703198	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126436089
2437	NC_009077	GATCGA	2	12	3703714	3703725	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126436090
2438	NC_009077	CAGCGG	2	12	3704132	3704143	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126436090
2439	NC_009077	TCCTGA	2	12	3704945	3704956	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126436091
2440	NC_009077	CCTCGA	2	12	3705440	3705451	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126436092
2441	NC_009077	ACCTCG	2	12	3707208	3707219	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126436093
2442	NC_009077	CAGCGG	2	12	3712270	3712281	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126436098
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2450	NC_009077	TCCGAA	2	12	3721325	3721336	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126436110
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2461	NC_009077	CTCGAT	2	12	3731334	3731345	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	126436119
2462	NC_009077	AGGCCG	2	12	3733697	3733708	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126436121
2463	NC_009077	CGGTGA	2	12	3733773	3733784	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126436121
2464	NC_009077	CGCTGG	2	12	3736273	3736284	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126436123
2465	NC_009077	CGTCAG	2	12	3739626	3739637	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126436125
2466	NC_009077	CGACGG	2	12	3741421	3741432	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126436128
2467	NC_009077	GCGGGA	2	12	3744037	3744048	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	126436130
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2469	NC_009077	TCCTCG	2	12	3745416	3745427	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126436133
2470	NC_009077	TCCTCG	2	12	3745434	3745445	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126436133
2471	NC_009077	TCCTCG	2	12	3745539	3745550	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	126436133
2472	NC_009077	CGATGA	2	12	3746113	3746124	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126436133
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2481	NC_009077	GACGGT	2	12	3758397	3758408	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126436142
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