MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium sp. JLS chromosome

Total Repeats: 5457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009077	ATCTC	2	10	1417	1426	20 %	40 %	0 %	40 %	126432614
2	NC_009077	GACCG	2	10	3498	3507	20 %	0 %	40 %	40 %	126432615
3	NC_009077	GTCCG	2	10	3705	3714	0 %	20 %	40 %	40 %	126432616
4	NC_009077	CCAGC	2	10	7219	7228	20 %	0 %	20 %	60 %	126432619
5	NC_009077	GCAGC	2	10	8125	8134	20 %	0 %	40 %	40 %	126432619
6	NC_009077	GCAGC	2	10	8542	8551	20 %	0 %	40 %	40 %	126432620
7	NC_009077	GGGCA	2	10	8804	8813	20 %	0 %	60 %	20 %	126432620
8	NC_009077	CCAGT	2	10	9382	9391	20 %	20 %	20 %	40 %	126432620
9	NC_009077	TGCTC	2	10	10458	10467	0 %	40 %	20 %	40 %	126432620
10	NC_009077	GGTCG	2	10	11110	11119	0 %	20 %	60 %	20 %	126432621
11	NC_009077	TCCGG	2	10	11392	11401	0 %	20 %	40 %	40 %	126432621
12	NC_009077	CGGTC	2	10	11502	11511	0 %	20 %	40 %	40 %	126432621
13	NC_009077	CGTCG	2	10	11530	11539	0 %	20 %	40 %	40 %	126432621
14	NC_009077	CACGG	2	10	12141	12150	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009077	GCCGG	2	10	13136	13145	0 %	0 %	60 %	40 %	126432623
16	NC_009077	ACCGG	2	10	14304	14313	20 %	0 %	40 %	40 %	126432626
17	NC_009077	CCCGG	2	10	15300	15309	0 %	0 %	40 %	60 %	126432627
18	NC_009077	TCGGT	2	10	16737	16746	0 %	40 %	40 %	20 %	126432628
19	NC_009077	GTGCG	2	10	16756	16765	0 %	20 %	60 %	20 %	126432628
20	NC_009077	CACCG	2	10	17203	17212	20 %	0 %	20 %	60 %	126432628
21	NC_009077	CGGCC	2	10	17401	17410	0 %	0 %	40 %	60 %	126432628
22	NC_009077	CTCGC	2	10	18989	18998	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_009077	CGGCG	2	10	19063	19072	0 %	0 %	60 %	40 %	126432630
24	NC_009077	ATCAG	2	10	19286	19295	40 %	20 %	20 %	20 %	126432630
25	NC_009077	GCGGT	2	10	19674	19683	0 %	20 %	60 %	20 %	126432630
26	NC_009077	GCGTT	2	10	22548	22557	0 %	40 %	40 %	20 %	126432632
27	NC_009077	CGCTG	2	10	23661	23670	0 %	20 %	40 %	40 %	126432633
28	NC_009077	GGTCA	2	10	25158	25167	20 %	20 %	40 %	20 %	126432634
29	NC_009077	CGCTG	2	10	25806	25815	0 %	20 %	40 %	40 %	126432635
30	NC_009077	CAACG	2	10	27504	27513	40 %	0 %	20 %	40 %	126432637
31	NC_009077	ATCGC	2	10	28034	28043	20 %	20 %	20 %	40 %	126432637
32	NC_009077	ACACC	2	10	29064	29073	40 %	0 %	0 %	60 %	126432638
33	NC_009077	GGTCG	2	10	30008	30017	0 %	20 %	60 %	20 %	126432639
34	NC_009077	GTCCG	2	10	31009	31018	0 %	20 %	40 %	40 %	126432640
35	NC_009077	GTGCG	2	10	31309	31318	0 %	20 %	60 %	20 %	126432640
36	NC_009077	CGACG	2	10	32758	32767	20 %	0 %	40 %	40 %	126432641
37	NC_009077	AGACG	2	10	33136	33145	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009077	CGTCT	2	10	33149	33158	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_009077	CCGGC	2	10	33543	33552	0 %	0 %	40 %	60 %	126432642
40	NC_009077	CTGCA	2	10	34562	34571	20 %	20 %	20 %	40 %	126432643
41	NC_009077	CCGCG	2	10	34962	34971	0 %	0 %	40 %	60 %	126432643
42	NC_009077	CGGCC	2	10	35504	35513	0 %	0 %	40 %	60 %	126432643
43	NC_009077	GCCGG	2	10	36175	36184	0 %	0 %	60 %	40 %	126432643
44	NC_009077	CGGTT	2	10	36836	36845	0 %	40 %	40 %	20 %	126432644
45	NC_009077	TCGGG	2	10	38867	38876	0 %	20 %	60 %	20 %	126432647
46	NC_009077	TGCGG	2	10	39207	39216	0 %	20 %	60 %	20 %	126432647
47	NC_009077	CGCGA	2	10	39235	39244	20 %	0 %	40 %	40 %	126432647
48	NC_009077	AGGCG	2	10	41380	41389	20 %	0 %	60 %	20 %	126432650
49	NC_009077	GGACA	2	10	41423	41432	40 %	0 %	40 %	20 %	126432650
50	NC_009077	TGCGC	2	10	41490	41499	0 %	20 %	40 %	40 %	126432650
51	NC_009077	ACCGC	3	15	43413	43427	20 %	0 %	20 %	60 %	126432651
52	NC_009077	GACGT	2	10	43783	43792	20 %	20 %	40 %	20 %	126432651
53	NC_009077	CCGAC	2	10	44095	44104	20 %	0 %	20 %	60 %	126432651
54	NC_009077	GCGAC	2	10	44135	44144	20 %	0 %	40 %	40 %	126432651
55	NC_009077	TGACG	2	10	45097	45106	20 %	20 %	40 %	20 %	126432651
56	NC_009077	GCCTG	2	10	45333	45342	0 %	20 %	40 %	40 %	126432652
57	NC_009077	CGGTG	2	10	46221	46230	0 %	20 %	60 %	20 %	126432652
58	NC_009077	GCCGG	2	10	49069	49078	0 %	0 %	60 %	40 %	126432656
59	NC_009077	GGTCG	2	10	49233	49242	0 %	20 %	60 %	20 %	126432656
60	NC_009077	GACAT	2	10	52154	52163	40 %	20 %	20 %	20 %	126432662
61	NC_009077	GCCCG	2	10	52358	52367	0 %	0 %	40 %	60 %	126432662
62	NC_009077	CCGCA	2	10	52669	52678	20 %	0 %	20 %	60 %	126432662
63	NC_009077	ACGCC	2	10	52941	52950	20 %	0 %	20 %	60 %	126432662
64	NC_009077	GCACC	2	10	56608	56617	20 %	0 %	20 %	60 %	126432665
65	NC_009077	CGGCG	2	10	59406	59415	0 %	0 %	60 %	40 %	126432668
66	NC_009077	ACCTC	2	10	59534	59543	20 %	20 %	0 %	60 %	126432668
67	NC_009077	TCGAC	2	10	59765	59774	20 %	20 %	20 %	40 %	126432668
68	NC_009077	CGACC	2	10	60117	60126	20 %	0 %	20 %	60 %	126432668
69	NC_009077	CACCC	2	10	60793	60802	20 %	0 %	0 %	80 %	126432669
70	NC_009077	CGGGT	2	10	63463	63472	0 %	20 %	60 %	20 %	126432670
71	NC_009077	GGTGC	2	10	65985	65994	0 %	20 %	60 %	20 %	126432672
72	NC_009077	CGGCG	2	10	66407	66416	0 %	0 %	60 %	40 %	126432672
73	NC_009077	TGGCC	2	10	67834	67843	0 %	20 %	40 %	40 %	126432675
74	NC_009077	GCGGG	2	10	68437	68446	0 %	0 %	80 %	20 %	126432675
75	NC_009077	CCGCG	2	10	69229	69238	0 %	0 %	40 %	60 %	126432676
76	NC_009077	CGGCG	2	10	70273	70282	0 %	0 %	60 %	40 %	126432676
77	NC_009077	CGGAC	2	10	72913	72922	20 %	0 %	40 %	40 %	126432680
78	NC_009077	CCGAT	2	10	73033	73042	20 %	20 %	20 %	40 %	126432680
79	NC_009077	CGTGC	2	10	75031	75040	0 %	20 %	40 %	40 %	126432681
80	NC_009077	GCCGA	2	10	75822	75831	20 %	0 %	40 %	40 %	126432682
81	NC_009077	GCACC	2	10	76786	76795	20 %	0 %	20 %	60 %	126432683
82	NC_009077	GCGCG	2	10	77743	77752	0 %	0 %	60 %	40 %	126432683
83	NC_009077	CCGGT	2	10	78164	78173	0 %	20 %	40 %	40 %	126432684
84	NC_009077	GCGCC	2	10	78573	78582	0 %	0 %	40 %	60 %	126432684
85	NC_009077	CGGAA	2	10	78665	78674	40 %	0 %	40 %	20 %	126432684
86	NC_009077	GCACC	2	10	78819	78828	20 %	0 %	20 %	60 %	126432684
87	NC_009077	GCACC	2	10	79490	79499	20 %	0 %	20 %	60 %	126432685
88	NC_009077	CCGCG	2	10	79979	79988	0 %	0 %	40 %	60 %	126432686
89	NC_009077	ACGGC	2	10	80452	80461	20 %	0 %	40 %	40 %	126432686
90	NC_009077	GGGCC	2	10	80548	80557	0 %	0 %	60 %	40 %	126432686
91	NC_009077	CGCGG	2	10	80615	80624	0 %	0 %	60 %	40 %	126432686
92	NC_009077	ACCGA	2	10	80694	80703	40 %	0 %	20 %	40 %	126432686
93	NC_009077	ATCCG	2	10	82219	82228	20 %	20 %	20 %	40 %	126432687
94	NC_009077	CCGCC	2	10	82301	82310	0 %	0 %	20 %	80 %	126432687
95	NC_009077	CCGAA	2	10	83215	83224	40 %	0 %	20 %	40 %	126432688
96	NC_009077	GCGGG	2	10	84128	84137	0 %	0 %	80 %	20 %	126432688
97	NC_009077	TGCGG	2	10	84345	84354	0 %	20 %	60 %	20 %	126432688
98	NC_009077	ACCGA	2	10	84462	84471	40 %	0 %	20 %	40 %	126432688
99	NC_009077	ACCCG	2	10	89281	89290	20 %	0 %	20 %	60 %	126432693
100	NC_009077	GGCCG	2	10	89622	89631	0 %	0 %	60 %	40 %	126432694
101	NC_009077	GGCCA	2	10	89910	89919	20 %	0 %	40 %	40 %	126432694
102	NC_009077	CGTCG	2	10	90230	90239	0 %	20 %	40 %	40 %	126432694
103	NC_009077	GGTCT	2	10	90347	90356	0 %	40 %	40 %	20 %	126432695
104	NC_009077	CGGTC	2	10	90507	90516	0 %	20 %	40 %	40 %	126432695
105	NC_009077	CGGGC	2	10	91678	91687	0 %	0 %	60 %	40 %	126432696
106	NC_009077	CCGAT	2	10	91812	91821	20 %	20 %	20 %	40 %	126432696
107	NC_009077	TGCCG	2	10	93593	93602	0 %	20 %	40 %	40 %	126432699
108	NC_009077	CCGGT	2	10	94487	94496	0 %	20 %	40 %	40 %	126432700
109	NC_009077	CCCGG	2	10	94758	94767	0 %	0 %	40 %	60 %	126432700
110	NC_009077	GCCGT	2	10	94768	94777	0 %	20 %	40 %	40 %	126432700
111	NC_009077	GCGCG	2	10	94833	94842	0 %	0 %	60 %	40 %	126432700
112	NC_009077	CCAGC	2	10	98267	98276	20 %	0 %	20 %	60 %	126432703
113	NC_009077	TGACC	2	10	99976	99985	20 %	20 %	20 %	40 %	126432704
114	NC_009077	GGCGA	2	10	100828	100837	20 %	0 %	60 %	20 %	126432705
115	NC_009077	GCCGA	2	10	102366	102375	20 %	0 %	40 %	40 %	126432706
116	NC_009077	CGCCC	2	10	102734	102743	0 %	0 %	20 %	80 %	126432706
117	NC_009077	CGCGC	2	10	103148	103157	0 %	0 %	40 %	60 %	126432707
118	NC_009077	GTCAG	2	10	105478	105487	20 %	20 %	40 %	20 %	126432709
119	NC_009077	CGGCG	2	10	107385	107394	0 %	0 %	60 %	40 %	126432712
120	NC_009077	ACCGC	2	10	108386	108395	20 %	0 %	20 %	60 %	126432713
121	NC_009077	GCAGG	2	10	108512	108521	20 %	0 %	60 %	20 %	126432713
122	NC_009077	GGGCG	2	10	108914	108923	0 %	0 %	80 %	20 %	126432713
123	NC_009077	GGACC	2	10	109247	109256	20 %	0 %	40 %	40 %	126432713
124	NC_009077	CGGGG	2	10	109534	109543	0 %	0 %	80 %	20 %	126432714
125	NC_009077	ACGCG	2	10	110759	110768	20 %	0 %	40 %	40 %	126432715
126	NC_009077	GGTGC	2	10	112786	112795	0 %	20 %	60 %	20 %	126432718
127	NC_009077	GCGCA	2	10	113054	113063	20 %	0 %	40 %	40 %	126432718
128	NC_009077	GCGCC	2	10	113108	113117	0 %	0 %	40 %	60 %	126432718
129	NC_009077	GCTCG	2	10	113244	113253	0 %	20 %	40 %	40 %	126432718
130	NC_009077	TCAGG	2	10	114125	114134	20 %	20 %	40 %	20 %	126432719
131	NC_009077	GCCGA	2	10	115782	115791	20 %	0 %	40 %	40 %	126432721
132	NC_009077	CTTCG	2	10	115901	115910	0 %	40 %	20 %	40 %	126432721
133	NC_009077	CGGCC	2	10	117143	117152	0 %	0 %	40 %	60 %	126432722
134	NC_009077	GGTGA	2	10	117578	117587	20 %	20 %	60 %	0 %	126432722
135	NC_009077	GGGCC	2	10	119527	119536	0 %	0 %	60 %	40 %	126432723
136	NC_009077	GCCCG	2	10	121061	121070	0 %	0 %	40 %	60 %	126432724
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