MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium sp. JLS chromosome

Total Repeats: 5457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009077	CCGAT	2	10	497453	497462	20 %	20 %	20 %	40 %	126433058
502	NC_009077	CCACC	2	10	497740	497749	20 %	0 %	0 %	80 %	126433059
503	NC_009077	CGTCG	2	10	498511	498520	0 %	20 %	40 %	40 %	126433060
504	NC_009077	AGCTC	2	10	499906	499915	20 %	20 %	20 %	40 %	126433061
505	NC_009077	CTCGT	2	10	503379	503388	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
506	NC_009077	GTCTG	2	10	506066	506075	0 %	40 %	40 %	20 %	126433066
507	NC_009077	GATCG	2	10	506273	506282	20 %	20 %	40 %	20 %	126433066
508	NC_009077	CACCG	2	10	507100	507109	20 %	0 %	20 %	60 %	126433067
509	NC_009077	GCGGT	2	10	508262	508271	0 %	20 %	60 %	20 %	126433068
510	NC_009077	CGCAG	2	10	510163	510172	20 %	0 %	40 %	40 %	126433070
511	NC_009077	CACCC	2	10	510311	510320	20 %	0 %	0 %	80 %	126433070
512	NC_009077	GCGCC	2	10	510383	510392	0 %	0 %	40 %	60 %	126433070
513	NC_009077	CGAGC	2	10	510420	510429	20 %	0 %	40 %	40 %	126433070
514	NC_009077	GGCCG	2	10	510780	510789	0 %	0 %	60 %	40 %	126433070
515	NC_009077	GTTCG	2	10	511415	511424	0 %	40 %	40 %	20 %	126433071
516	NC_009077	GACCG	2	10	511559	511568	20 %	0 %	40 %	40 %	126433071
517	NC_009077	GCGTG	2	10	511927	511936	0 %	20 %	60 %	20 %	126433072
518	NC_009077	CGGCC	2	10	512167	512176	0 %	0 %	40 %	60 %	126433072
519	NC_009077	AGATC	2	10	514595	514604	40 %	20 %	20 %	20 %	126433075
520	NC_009077	CGAGG	2	10	514701	514710	20 %	0 %	60 %	20 %	126433075
521	NC_009077	GCGCC	2	10	522879	522888	0 %	0 %	40 %	60 %	126433084
522	NC_009077	CACTC	2	10	524310	524319	20 %	20 %	0 %	60 %	126433085
523	NC_009077	ACCCG	2	10	525135	525144	20 %	0 %	20 %	60 %	126433086
524	NC_009077	CGCAG	2	10	527642	527651	20 %	0 %	40 %	40 %	126433087
525	NC_009077	GCGCC	2	10	529018	529027	0 %	0 %	40 %	60 %	126433089
526	NC_009077	GCCTG	2	10	531867	531876	0 %	20 %	40 %	40 %	126433092
527	NC_009077	CCGCG	2	10	534498	534507	0 %	0 %	40 %	60 %	126433093
528	NC_009077	GCGAC	2	10	536091	536100	20 %	0 %	40 %	40 %	126433095
529	NC_009077	CGGCC	2	10	536452	536461	0 %	0 %	40 %	60 %	126433096
530	NC_009077	CCCGT	3	15	536613	536627	0 %	20 %	20 %	60 %	126433096
531	NC_009077	GGCCC	2	10	536628	536637	0 %	0 %	40 %	60 %	126433096
532	NC_009077	GCCGC	2	10	536847	536856	0 %	0 %	40 %	60 %	126433096
533	NC_009077	ACCGC	2	10	539482	539491	20 %	0 %	20 %	60 %	126433099
534	NC_009077	CGATG	2	10	539564	539573	20 %	20 %	40 %	20 %	126433099
535	NC_009077	CGCAC	2	10	540566	540575	20 %	0 %	20 %	60 %	126433099
536	NC_009077	TCACC	2	10	542078	542087	20 %	20 %	0 %	60 %	126433101
537	NC_009077	TCGAC	2	10	544069	544078	20 %	20 %	20 %	40 %	126433103
538	NC_009077	GGGCC	2	10	544403	544412	0 %	0 %	60 %	40 %	126433103
539	NC_009077	GGATT	2	10	545184	545193	20 %	40 %	40 %	0 %	126433104
540	NC_009077	CGGCA	2	10	546415	546424	20 %	0 %	40 %	40 %	126433106
541	NC_009077	CGGAC	2	10	546459	546468	20 %	0 %	40 %	40 %	126433106
542	NC_009077	CCGCC	2	10	548268	548277	0 %	0 %	20 %	80 %	126433108
543	NC_009077	CGCGG	2	10	548846	548855	0 %	0 %	60 %	40 %	126433109
544	NC_009077	TCGAC	2	10	549037	549046	20 %	20 %	20 %	40 %	126433109
545	NC_009077	ATTCG	2	10	552040	552049	20 %	40 %	20 %	20 %	126433112
546	NC_009077	CAGCG	2	10	552086	552095	20 %	0 %	40 %	40 %	126433112
547	NC_009077	GTCCG	2	10	552975	552984	0 %	20 %	40 %	40 %	126433112
548	NC_009077	GCGCG	2	10	556007	556016	0 %	0 %	60 %	40 %	126433115
549	NC_009077	AAAGG	2	10	556640	556649	60 %	0 %	40 %	0 %	126433116
550	NC_009077	CGACC	2	10	557050	557059	20 %	0 %	20 %	60 %	126433116
551	NC_009077	ACGTC	2	10	557304	557313	20 %	20 %	20 %	40 %	126433116
552	NC_009077	CGGGA	2	10	557841	557850	20 %	0 %	60 %	20 %	126433116
553	NC_009077	CCGCG	2	10	557911	557920	0 %	0 %	40 %	60 %	126433117
554	NC_009077	TTCGA	2	10	558295	558304	20 %	40 %	20 %	20 %	126433117
555	NC_009077	CGGCG	2	10	558696	558705	0 %	0 %	60 %	40 %	126433118
556	NC_009077	GAGCG	2	10	560687	560696	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
557	NC_009077	CGACG	2	10	561633	561642	20 %	0 %	40 %	40 %	126433121
558	NC_009077	ACTCG	2	10	562635	562644	20 %	20 %	20 %	40 %	126433121
559	NC_009077	CCGCG	2	10	562797	562806	0 %	0 %	40 %	60 %	126433122
560	NC_009077	CGCAC	2	10	563192	563201	20 %	0 %	20 %	60 %	126433122
561	NC_009077	ACACC	2	10	563807	563816	40 %	0 %	0 %	60 %	126433123
562	NC_009077	GCCGC	2	10	564980	564989	0 %	0 %	40 %	60 %	126433124
563	NC_009077	GGCGA	2	10	565085	565094	20 %	0 %	60 %	20 %	126433124
564	NC_009077	ATCCG	2	10	566588	566597	20 %	20 %	20 %	40 %	126433126
565	NC_009077	CGTGC	2	10	566800	566809	0 %	20 %	40 %	40 %	126433126
566	NC_009077	GTTCG	2	10	567857	567866	0 %	40 %	40 %	20 %	126433128
567	NC_009077	CCGGC	2	10	568243	568252	0 %	0 %	40 %	60 %	126433128
568	NC_009077	CACCC	2	10	570276	570285	20 %	0 %	0 %	80 %	126433131
569	NC_009077	CCGCG	2	10	573554	573563	0 %	0 %	40 %	60 %	126433135
570	NC_009077	GCGCC	2	10	574563	574572	0 %	0 %	40 %	60 %	126433136
571	NC_009077	GGCGT	2	10	575438	575447	0 %	20 %	60 %	20 %	126433136
572	NC_009077	CGGCC	2	10	578538	578547	0 %	0 %	40 %	60 %	126433138
573	NC_009077	CGTCG	2	10	579481	579490	0 %	20 %	40 %	40 %	126433139
574	NC_009077	CCCGA	2	10	581060	581069	20 %	0 %	20 %	60 %	126433139
575	NC_009077	GCAGC	2	10	581386	581395	20 %	0 %	40 %	40 %	126433139
576	NC_009077	GCGAC	2	10	582549	582558	20 %	0 %	40 %	40 %	126433140
577	NC_009077	CGGCG	2	10	582626	582635	0 %	0 %	60 %	40 %	126433140
578	NC_009077	CTTGA	2	10	584899	584908	20 %	40 %	20 %	20 %	126433142
579	NC_009077	GATCG	2	10	586437	586446	20 %	20 %	40 %	20 %	126433143
580	NC_009077	CGCGC	3	15	589598	589612	0 %	0 %	40 %	60 %	126433147
581	NC_009077	CGGGA	2	10	590785	590794	20 %	0 %	60 %	20 %	126433149
582	NC_009077	GGCCG	2	10	592182	592191	0 %	0 %	60 %	40 %	126433150
583	NC_009077	ACCGC	2	10	592528	592537	20 %	0 %	20 %	60 %	126433151
584	NC_009077	CTGAC	2	10	595051	595060	20 %	20 %	20 %	40 %	126433153
585	NC_009077	CGCGG	2	10	598085	598094	0 %	0 %	60 %	40 %	126433155
586	NC_009077	ACCGC	2	10	598896	598905	20 %	0 %	20 %	60 %	126433155
587	NC_009077	CCCGC	2	10	599083	599092	0 %	0 %	20 %	80 %	126433156
588	NC_009077	GACCG	2	10	600172	600181	20 %	0 %	40 %	40 %	126433156
589	NC_009077	CGGCG	2	10	600285	600294	0 %	0 %	60 %	40 %	126433156
590	NC_009077	GCAAC	2	10	600857	600866	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
591	NC_009077	CGAGC	2	10	602361	602370	20 %	0 %	40 %	40 %	126433158
592	NC_009077	CGACG	2	10	603258	603267	20 %	0 %	40 %	40 %	126433158
593	NC_009077	TCGCG	2	10	603806	603815	0 %	20 %	40 %	40 %	126433159
594	NC_009077	GCGCC	2	10	607023	607032	0 %	0 %	40 %	60 %	126433163
595	NC_009077	GACCG	2	10	609629	609638	20 %	0 %	40 %	40 %	126433166
596	NC_009077	ACGAA	2	10	610656	610665	60 %	0 %	20 %	20 %	126433167
597	NC_009077	ACGGC	2	10	613336	613345	20 %	0 %	40 %	40 %	126433168
598	NC_009077	TGACC	2	10	614752	614761	20 %	20 %	20 %	40 %	126433168
599	NC_009077	CCCGG	2	10	615375	615384	0 %	0 %	40 %	60 %	126433169
600	NC_009077	GGCCA	2	10	616638	616647	20 %	0 %	40 %	40 %	126433170
601	NC_009077	ACCTC	2	10	618906	618915	20 %	20 %	0 %	60 %	126433174
602	NC_009077	CTCAT	2	10	621385	621394	20 %	40 %	0 %	40 %	126433178
603	NC_009077	TCACC	2	10	622108	622117	20 %	20 %	0 %	60 %	126433178
604	NC_009077	TGCGC	2	10	622282	622291	0 %	20 %	40 %	40 %	126433178
605	NC_009077	ATCGG	2	10	622853	622862	20 %	20 %	40 %	20 %	126433179
606	NC_009077	GACCG	2	10	623077	623086	20 %	0 %	40 %	40 %	126433179
607	NC_009077	TCGAG	2	10	624983	624992	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
608	NC_009077	TCCCG	2	10	625142	625151	0 %	20 %	20 %	60 %	126433182
609	NC_009077	CGGTG	2	10	625857	625866	0 %	20 %	60 %	20 %	126433183
610	NC_009077	CGGCC	2	10	626297	626306	0 %	0 %	40 %	60 %	126433184
611	NC_009077	CTGGT	2	10	626531	626540	0 %	40 %	40 %	20 %	126433185
612	NC_009077	CGGCC	2	10	626999	627008	0 %	0 %	40 %	60 %	126433186
613	NC_009077	TGCCC	2	10	628220	628229	0 %	20 %	20 %	60 %	126433186
614	NC_009077	CAGCG	2	10	628398	628407	20 %	0 %	40 %	40 %	126433186
615	NC_009077	AGGCC	2	10	629268	629277	20 %	0 %	40 %	40 %	126433188
616	NC_009077	CGCGG	2	10	629603	629612	0 %	0 %	60 %	40 %	126433188
617	NC_009077	GACGC	2	10	629642	629651	20 %	0 %	40 %	40 %	126433188
618	NC_009077	GCTCG	2	10	630592	630601	0 %	20 %	40 %	40 %	126433188
619	NC_009077	CGACC	2	10	632265	632274	20 %	0 %	20 %	60 %	126433189
620	NC_009077	ACCGA	2	10	632392	632401	40 %	0 %	20 %	40 %	126433189
621	NC_009077	GCCGC	2	10	632854	632863	0 %	0 %	40 %	60 %	126433189
622	NC_009077	CACCG	2	10	633408	633417	20 %	0 %	20 %	60 %	126433190
623	NC_009077	CGGGC	2	10	639889	639898	0 %	0 %	60 %	40 %	126433197
624	NC_009077	CGCGC	2	10	640046	640055	0 %	0 %	40 %	60 %	126433197
625	NC_009077	CGCGG	2	10	643945	643954	0 %	0 %	60 %	40 %	126433201
626	NC_009077	GCCGC	2	10	646410	646419	0 %	0 %	40 %	60 %	126433203
627	NC_009077	GCGTC	2	10	647283	647292	0 %	20 %	40 %	40 %	126433204
628	NC_009077	GGGTG	2	10	649270	649279	0 %	20 %	80 %	0 %	126433205
629	NC_009077	CGACC	2	10	656198	656207	20 %	0 %	20 %	60 %	126433210
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