MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 1815

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009051	GGACG	2	10	1326132	1326141	20 %	0 %	60 %	20 %	126179287
1002	NC_009051	CCGGG	2	10	1326421	1326430	0 %	0 %	60 %	40 %	126179287
1003	NC_009051	TCACC	2	10	1326887	1326896	20 %	20 %	0 %	60 %	126179287
1004	NC_009051	GTGAT	2	10	1328060	1328069	20 %	40 %	40 %	0 %	126179288
1005	NC_009051	CGGCG	2	10	1330220	1330229	0 %	0 %	60 %	40 %	126179290
1006	NC_009051	GTTCC	2	10	1331591	1331600	0 %	40 %	20 %	40 %	126179293
1007	NC_009051	GAAGG	2	10	1332108	1332117	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_009051	CCACG	2	10	1333804	1333813	20 %	0 %	20 %	60 %	126179294
1009	NC_009051	CTCCG	3	15	1333984	1333998	0 %	20 %	20 %	60 %	126179294
1010	NC_009051	CGGGG	2	10	1334056	1334065	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1011	NC_009051	GCCGG	2	10	1334069	1334078	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1012	NC_009051	ATTCT	2	10	1334234	1334243	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1013	NC_009051	CGCAA	2	10	1335275	1335284	40 %	0 %	20 %	40 %	126179295
1014	NC_009051	GCCGG	2	10	1337453	1337462	0 %	0 %	60 %	40 %	126179296
1015	NC_009051	AAAGG	2	10	1339379	1339388	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_009051	CCCCT	2	10	1341595	1341604	0 %	20 %	0 %	80 %	126179298
1017	NC_009051	TCTCC	2	10	1341659	1341668	0 %	40 %	0 %	60 %	126179298
1018	NC_009051	CCGGC	2	10	1343147	1343156	0 %	0 %	40 %	60 %	126179299
1019	NC_009051	GGGGA	2	10	1343997	1344006	20 %	0 %	80 %	0 %	126179299
1020	NC_009051	GGCAA	2	10	1344496	1344505	40 %	0 %	40 %	20 %	126179299
1021	NC_009051	AGAGA	2	10	1348570	1348579	60 %	0 %	40 %	0 %	126179302
1022	NC_009051	GAGAA	2	10	1348664	1348673	60 %	0 %	40 %	0 %	126179302
1023	NC_009051	GCCCG	2	10	1350654	1350663	0 %	0 %	40 %	60 %	126179304
1024	NC_009051	GGGGC	2	10	1351843	1351852	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1025	NC_009051	CCCTT	2	10	1353358	1353367	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1026	NC_009051	CCCCT	2	10	1355695	1355704	0 %	20 %	0 %	80 %	126179309
1027	NC_009051	CGTCC	2	10	1355770	1355779	0 %	20 %	20 %	60 %	126179309
1028	NC_009051	CACCC	2	10	1355784	1355793	20 %	0 %	0 %	80 %	126179309
1029	NC_009051	CCCCG	2	10	1356617	1356626	0 %	0 %	20 %	80 %	126179310
1030	NC_009051	ACGGA	2	10	1358177	1358186	40 %	0 %	40 %	20 %	126179312
1031	NC_009051	CGCTG	2	10	1359532	1359541	0 %	20 %	40 %	40 %	126179313
1032	NC_009051	TGGGG	2	10	1361036	1361045	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_009051	CCCCT	2	10	1361065	1361074	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1034	NC_009051	CCTGC	2	10	1362433	1362442	0 %	20 %	20 %	60 %	126179316
1035	NC_009051	GCAGG	2	10	1364480	1364489	20 %	0 %	60 %	20 %	126179317
1036	NC_009051	GTTCG	2	10	1364505	1364514	0 %	40 %	40 %	20 %	126179317
1037	NC_009051	TACCC	2	10	1365459	1365468	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1038	NC_009051	CAGCG	2	10	1366816	1366825	20 %	0 %	40 %	40 %	126179321
1039	NC_009051	CATCG	2	10	1370411	1370420	20 %	20 %	20 %	40 %	126179324
1040	NC_009051	CACAG	2	10	1370758	1370767	40 %	0 %	20 %	40 %	126179325
1041	NC_009051	TCGCC	2	10	1371378	1371387	0 %	20 %	20 %	60 %	126179325
1042	NC_009051	CACAG	2	10	1374194	1374203	40 %	0 %	20 %	40 %	126179327
1043	NC_009051	TCGCC	2	10	1374814	1374823	0 %	20 %	20 %	60 %	126179327
1044	NC_009051	GAAAA	2	10	1376508	1376517	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_009051	CCGTC	2	10	1377745	1377754	0 %	20 %	20 %	60 %	126179329
1046	NC_009051	ACCGC	2	10	1379035	1379044	20 %	0 %	20 %	60 %	126179330
1047	NC_009051	TTCTT	2	10	1380772	1380781	0 %	80 %	0 %	20 %	126179333
1048	NC_009051	CGTTT	2	10	1381004	1381013	0 %	60 %	20 %	20 %	126179333
1049	NC_009051	CGGTG	2	10	1382881	1382890	0 %	20 %	60 %	20 %	126179335
1050	NC_009051	TGAGA	2	10	1384548	1384557	40 %	20 %	40 %	0 %	126179337
1051	NC_009051	CGGAC	2	10	1390359	1390368	20 %	0 %	40 %	40 %	126179344
1052	NC_009051	CCCCT	2	10	1392797	1392806	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1053	NC_009051	CCCCG	2	10	1392936	1392945	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1054	NC_009051	CGCGG	2	10	1393264	1393273	0 %	0 %	60 %	40 %	126179347
1055	NC_009051	AAGGG	2	10	1396087	1396096	40 %	0 %	60 %	0 %	126179350
1056	NC_009051	GCCGT	2	10	1396395	1396404	0 %	20 %	40 %	40 %	126179351
1057	NC_009051	CGGAC	2	10	1400829	1400838	20 %	0 %	40 %	40 %	126179354
1058	NC_009051	GCGAG	2	10	1401563	1401572	20 %	0 %	60 %	20 %	126179354
1059	NC_009051	TGCTC	2	10	1402745	1402754	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1060	NC_009051	ACCGC	2	10	1403950	1403959	20 %	0 %	20 %	60 %	126179357
1061	NC_009051	GGAAT	2	10	1405946	1405955	40 %	20 %	40 %	0 %	126179359
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1063	NC_009051	GGACG	2	10	1408274	1408283	20 %	0 %	60 %	20 %	126179364
1064	NC_009051	CGGGG	2	10	1408286	1408295	0 %	0 %	80 %	20 %	126179364
1065	NC_009051	CGGGG	2	10	1408298	1408307	0 %	0 %	80 %	20 %	126179364
1066	NC_009051	AGCGA	2	10	1412447	1412456	40 %	0 %	40 %	20 %	126179366
1067	NC_009051	CGTCC	2	10	1413977	1413986	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1068	NC_009051	TGAGG	2	10	1414080	1414089	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_009051	GAAGA	2	10	1414097	1414106	60 %	0 %	40 %	0 %	126179368
1070	NC_009051	GAAGG	2	10	1414712	1414721	40 %	0 %	60 %	0 %	126179368
1071	NC_009051	CCCGG	2	10	1414795	1414804	0 %	0 %	40 %	60 %	126179368
1072	NC_009051	GGAAG	2	10	1414889	1414898	40 %	0 %	60 %	0 %	126179368
1073	NC_009051	GAAGA	2	10	1416051	1416060	60 %	0 %	40 %	0 %	126179370
1074	NC_009051	AACTC	2	10	1418695	1418704	40 %	20 %	0 %	40 %	126179372
1075	NC_009051	CGAAC	2	10	1419402	1419411	40 %	0 %	20 %	40 %	126179373
1076	NC_009051	CGACG	2	10	1419417	1419426	20 %	0 %	40 %	40 %	126179373
1077	NC_009051	GGGCG	2	10	1419441	1419450	0 %	0 %	80 %	20 %	126179373
1078	NC_009051	CCCTG	2	10	1419578	1419587	0 %	20 %	20 %	60 %	126179373
1079	NC_009051	CCCCA	2	10	1419840	1419849	20 %	0 %	0 %	80 %	126179373
1080	NC_009051	ATCCG	2	10	1424456	1424465	20 %	20 %	20 %	40 %	126179379
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1082	NC_009051	ATCGG	2	10	1425677	1425686	20 %	20 %	40 %	20 %	126179380
1083	NC_009051	ACGAC	2	10	1426389	1426398	40 %	0 %	20 %	40 %	126179380
1084	NC_009051	AGGGC	2	10	1426470	1426479	20 %	0 %	60 %	20 %	126179380
1085	NC_009051	GCCGA	2	10	1427199	1427208	20 %	0 %	40 %	40 %	126179381
1086	NC_009051	GTGCA	2	10	1427934	1427943	20 %	20 %	40 %	20 %	126179381
1087	NC_009051	CCGGC	2	10	1428278	1428287	0 %	0 %	40 %	60 %	126179381
1088	NC_009051	GCGGA	2	10	1428803	1428812	20 %	0 %	60 %	20 %	126179382
1089	NC_009051	CCCCT	2	10	1429701	1429710	0 %	20 %	0 %	80 %	126179383
1090	NC_009051	GACGG	2	10	1432040	1432049	20 %	0 %	60 %	20 %	126179385
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1092	NC_009051	TCCCC	2	10	1434702	1434711	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1093	NC_009051	GGACG	2	10	1435184	1435193	20 %	0 %	60 %	20 %	126179388
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1095	NC_009051	TGGGG	2	10	1436020	1436029	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_009051	CCCCT	2	10	1436049	1436058	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1097	NC_009051	GACTA	2	10	1436427	1436436	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_009051	GTACA	2	10	1437374	1437383	40 %	20 %	20 %	20 %	126179389
1099	NC_009051	TCATA	2	10	1437565	1437574	40 %	40 %	0 %	20 %	126179389
1100	NC_009051	CAGAA	2	10	1441342	1441351	60 %	0 %	20 %	20 %	126179393
1101	NC_009051	GGTGC	2	10	1441553	1441562	0 %	20 %	60 %	20 %	126179393
1102	NC_009051	GAACA	2	10	1443924	1443933	60 %	0 %	20 %	20 %	126179396
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1105	NC_009051	CTGAT	2	10	1452522	1452531	20 %	40 %	20 %	20 %	126179409
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1109	NC_009051	GCGCC	2	10	1458936	1458945	0 %	0 %	40 %	60 %	126179415
1110	NC_009051	GTGCC	2	10	1458956	1458965	0 %	20 %	40 %	40 %	126179415
1111	NC_009051	AACAA	2	10	1459550	1459559	80 %	0 %	0 %	20 %	126179416
1112	NC_009051	GGTAG	2	10	1460068	1460077	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_009051	CGGGG	2	10	1461777	1461786	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1114	NC_009051	TCCCG	2	10	1462669	1462678	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1115	NC_009051	GTTTT	2	10	1464440	1464449	0 %	80 %	20 %	0 %	126179420
1116	NC_009051	TGCTG	2	10	1465236	1465245	0 %	40 %	40 %	20 %	126179420
1117	NC_009051	TTCTT	2	10	1465381	1465390	0 %	80 %	0 %	20 %	126179420
1118	NC_009051	AAGTT	2	10	1466203	1466212	40 %	40 %	20 %	0 %	126179420
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1120	NC_009051	GGATA	2	10	1468274	1468283	40 %	20 %	40 %	0 %	126179421
1121	NC_009051	ATACC	2	10	1469432	1469441	40 %	20 %	0 %	40 %	126179422
1122	NC_009051	GATCT	2	10	1470087	1470096	20 %	40 %	20 %	20 %	126179422
1123	NC_009051	GGTTC	2	10	1471658	1471667	0 %	40 %	40 %	20 %	126179423
1124	NC_009051	GTTTG	2	10	1472648	1472657	0 %	60 %	40 %	0 %	126179424
1125	NC_009051	TCCCC	2	10	1477744	1477753	0 %	20 %	0 %	80 %	126179426
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