MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 1815

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009051	ACCCT	2	10	689143	689152	20 %	20 %	0 %	60 %	126178657
502	NC_009051	CCGAG	2	10	692119	692128	20 %	0 %	40 %	40 %	126178661
503	NC_009051	AGACG	2	10	694082	694091	40 %	0 %	40 %	20 %	126178663
504	NC_009051	CCCCT	2	10	696929	696938	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
505	NC_009051	CGTCC	2	10	697004	697013	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
506	NC_009051	CGCGG	2	10	697879	697888	0 %	0 %	60 %	40 %	126178669
507	NC_009051	TTGCC	2	10	698299	698308	0 %	40 %	20 %	40 %	126178671
508	NC_009051	GCCGA	2	10	698331	698340	20 %	0 %	40 %	40 %	126178671
509	NC_009051	GTAGC	2	10	698668	698677	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
510	NC_009051	CGGTC	2	10	698943	698952	0 %	20 %	40 %	40 %	126178672
511	NC_009051	GCTCC	2	10	702535	702544	0 %	20 %	20 %	60 %	126178675
512	NC_009051	TCGGA	2	10	703163	703172	20 %	20 %	40 %	20 %	126178675
513	NC_009051	TCCCG	2	10	706684	706693	0 %	20 %	20 %	60 %	126178678
514	NC_009051	AGCCG	2	10	707977	707986	20 %	0 %	40 %	40 %	126178678
515	NC_009051	TGCGG	2	10	710554	710563	0 %	20 %	60 %	20 %	126178682
516	NC_009051	TCCCC	2	10	712797	712806	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
517	NC_009051	ACCCT	2	10	712933	712942	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
518	NC_009051	CGGCC	2	10	713140	713149	0 %	0 %	40 %	60 %	126178685
519	NC_009051	CGACG	2	10	713537	713546	20 %	0 %	40 %	40 %	126178685
520	NC_009051	CCGGA	2	10	714347	714356	20 %	0 %	40 %	40 %	126178686
521	NC_009051	CGACC	2	10	716212	716221	20 %	0 %	20 %	60 %	126178688
522	NC_009051	GCGGA	2	10	717961	717970	20 %	0 %	60 %	20 %	126178691
523	NC_009051	CTCCC	2	10	719777	719786	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
524	NC_009051	CCCGG	2	10	720806	720815	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
525	NC_009051	TACTG	2	10	720841	720850	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
526	NC_009051	GGCGA	2	10	722414	722423	20 %	0 %	60 %	20 %	126178695
527	NC_009051	CGCCC	2	10	725362	725371	0 %	0 %	20 %	80 %	126178699
528	NC_009051	TCATC	2	10	725937	725946	20 %	40 %	0 %	40 %	126178700
529	NC_009051	ACGCC	2	10	726306	726315	20 %	0 %	20 %	60 %	126178700
530	NC_009051	GATCG	2	10	726998	727007	20 %	20 %	40 %	20 %	126178700
531	NC_009051	CCGGT	2	10	727217	727226	0 %	20 %	40 %	40 %	126178701
532	NC_009051	CCAGG	2	10	727847	727856	20 %	0 %	40 %	40 %	126178701
533	NC_009051	TCGCC	2	10	728533	728542	0 %	20 %	20 %	60 %	126178702
534	NC_009051	GGGGA	2	10	729350	729359	20 %	0 %	80 %	0 %	126178703
535	NC_009051	CGTCC	2	10	732510	732519	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
536	NC_009051	TCCGC	2	10	734111	734120	0 %	20 %	20 %	60 %	126178706
537	NC_009051	CGGTC	2	10	734156	734165	0 %	20 %	40 %	40 %	126178706
538	NC_009051	CCTGG	2	10	734740	734749	0 %	20 %	40 %	40 %	126178707
539	NC_009051	GCCAC	2	10	734781	734790	20 %	0 %	20 %	60 %	126178707
540	NC_009051	ATTTA	2	10	736417	736426	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009051	CGTGG	2	10	738483	738492	0 %	20 %	60 %	20 %	126178709
542	NC_009051	GTAGT	2	10	740751	740760	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
543	NC_009051	GATCG	2	10	742404	742413	20 %	20 %	40 %	20 %	126178713
544	NC_009051	CGGCG	2	10	742767	742776	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
545	NC_009051	CTTCG	2	10	743688	743697	0 %	40 %	20 %	40 %	126178714
546	NC_009051	AGGGG	2	10	744869	744878	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009051	TCCGT	2	10	745610	745619	0 %	40 %	20 %	40 %	126178716
548	NC_009051	GCGCG	2	10	747089	747098	0 %	0 %	60 %	40 %	126178717
549	NC_009051	TCTGT	2	10	747185	747194	0 %	60 %	20 %	20 %	126178717
550	NC_009051	CTCGC	2	10	747720	747729	0 %	20 %	20 %	60 %	126178718
551	NC_009051	CCGTC	2	10	748039	748048	0 %	20 %	20 %	60 %	126178718
552	NC_009051	TTGCC	2	10	749966	749975	0 %	40 %	20 %	40 %	126178720
553	NC_009051	ACCGG	2	10	752838	752847	20 %	0 %	40 %	40 %	126178721
554	NC_009051	GTTCG	2	10	753183	753192	0 %	40 %	40 %	20 %	126178721
555	NC_009051	GAGGT	2	10	755203	755212	20 %	20 %	60 %	0 %	126178724
556	NC_009051	GACGT	2	10	756296	756305	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
557	NC_009051	CTGCT	2	10	756482	756491	0 %	40 %	20 %	40 %	126178725
558	NC_009051	TTCGA	2	10	757319	757328	20 %	40 %	20 %	20 %	126178725
559	NC_009051	CGAAT	2	10	758913	758922	40 %	20 %	20 %	20 %	126178726
560	NC_009051	GGGAA	2	10	760820	760829	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
561	NC_009051	GATGG	2	10	761310	761319	20 %	20 %	60 %	0 %	126178729
562	NC_009051	GATGG	2	10	763295	763304	20 %	20 %	60 %	0 %	126178731
563	NC_009051	TCGAG	2	10	763797	763806	20 %	20 %	40 %	20 %	126178732
564	NC_009051	TACCA	2	10	765411	765420	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
565	NC_009051	CAGAG	2	10	765581	765590	40 %	0 %	40 %	20 %	126178733
566	NC_009051	GGCGA	2	10	765828	765837	20 %	0 %	60 %	20 %	126178733
567	NC_009051	CCCTG	2	10	767547	767556	0 %	20 %	20 %	60 %	126178735
568	NC_009051	CGAGG	2	10	769383	769392	20 %	0 %	60 %	20 %	126178737
569	NC_009051	TCCGC	2	10	771944	771953	0 %	20 %	20 %	60 %	126178739
570	NC_009051	CCCCT	2	10	773994	774003	0 %	20 %	0 %	80 %	126178741
571	NC_009051	CGGTG	2	10	774128	774137	0 %	20 %	60 %	20 %	126178741
572	NC_009051	TGCCG	2	10	777672	777681	0 %	20 %	40 %	40 %	126178746
573	NC_009051	GAGTA	2	10	778039	778048	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
574	NC_009051	CTGAG	2	10	781895	781904	20 %	20 %	40 %	20 %	126178749
575	NC_009051	GCCAT	2	10	782661	782670	20 %	20 %	20 %	40 %	126178750
576	NC_009051	CTGAT	2	10	783241	783250	20 %	40 %	20 %	20 %	126178751
577	NC_009051	TCTCC	2	10	783298	783307	0 %	40 %	0 %	60 %	126178751
578	NC_009051	CGCTC	2	10	784173	784182	0 %	20 %	20 %	60 %	126178752
579	NC_009051	GGTTC	2	10	785928	785937	0 %	40 %	40 %	20 %	126178754
580	NC_009051	CGGCA	2	10	785978	785987	20 %	0 %	40 %	40 %	126178754
581	NC_009051	CCCGG	2	10	787891	787900	0 %	0 %	40 %	60 %	126178755
582	NC_009051	TCGCT	2	10	796988	796997	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
583	NC_009051	GGAGC	2	10	804358	804367	20 %	0 %	60 %	20 %	126178771
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585	NC_009051	CCAAT	2	10	807809	807818	40 %	20 %	0 %	40 %	126178776
586	NC_009051	GTTCC	2	10	808041	808050	0 %	40 %	20 %	40 %	126178777
587	NC_009051	CGGCC	2	10	810820	810829	0 %	0 %	40 %	60 %	126178780
588	NC_009051	CGCCC	2	10	811876	811885	0 %	0 %	20 %	80 %	126178781
589	NC_009051	GGTGC	2	10	812236	812245	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
590	NC_009051	CGGGG	2	10	814083	814092	0 %	0 %	80 %	20 %	126178783
591	NC_009051	TGGTG	2	10	815398	815407	0 %	40 %	60 %	0 %	126178785
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594	NC_009051	CCCTC	2	10	819413	819422	0 %	20 %	0 %	80 %	126178790
595	NC_009051	CCCGA	2	10	823032	823041	20 %	0 %	20 %	60 %	126178794
596	NC_009051	GTTCC	2	10	823860	823869	0 %	40 %	20 %	40 %	126178795
597	NC_009051	CCATC	2	10	827299	827308	20 %	20 %	0 %	60 %	126178800
598	NC_009051	CCTGC	2	10	828111	828120	0 %	20 %	20 %	60 %	126178801
599	NC_009051	AGGGG	2	10	828934	828943	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
600	NC_009051	GCCCA	2	10	829631	829640	20 %	0 %	20 %	60 %	126178802
601	NC_009051	GCCCG	2	10	830783	830792	0 %	0 %	40 %	60 %	126178803
602	NC_009051	ACCGG	2	10	830891	830900	20 %	0 %	40 %	40 %	126178803
603	NC_009051	CCCGG	2	10	833714	833723	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
604	NC_009051	CCGTC	2	10	834916	834925	0 %	20 %	20 %	60 %	126178807
605	NC_009051	GTCCG	2	10	836314	836323	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
606	NC_009051	TGGGC	2	10	836862	836871	0 %	20 %	60 %	20 %	126178810
607	NC_009051	TCTTT	2	10	838095	838104	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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609	NC_009051	CCACG	2	10	839333	839342	20 %	0 %	20 %	60 %	126178812
610	NC_009051	GATCT	2	10	841253	841262	20 %	40 %	20 %	20 %	126178814
611	NC_009051	CGGTG	2	10	841495	841504	0 %	20 %	60 %	20 %	126178814
612	NC_009051	TGCAT	2	10	841609	841618	20 %	40 %	20 %	20 %	126178814
613	NC_009051	AGCGT	2	10	842739	842748	20 %	20 %	40 %	20 %	126178814
614	NC_009051	CCGGG	2	10	843042	843051	0 %	0 %	60 %	40 %	126178814
615	NC_009051	GCCGG	2	10	843190	843199	0 %	0 %	60 %	40 %	126178814
616	NC_009051	TGCAC	2	10	844224	844233	20 %	20 %	20 %	40 %	126178817
617	NC_009051	CGATA	2	10	846374	846383	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
618	NC_009051	GCGAG	2	10	849395	849404	20 %	0 %	60 %	20 %	126178821
619	NC_009051	CCGAT	2	10	850958	850967	20 %	20 %	20 %	40 %	126178822
620	NC_009051	CCTAT	2	10	851356	851365	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
621	NC_009051	GGAGA	2	10	852820	852829	40 %	0 %	60 %	0 %	126178824
622	NC_009051	CCCCT	2	10	856356	856365	0 %	20 %	0 %	80 %	126178826
623	NC_009051	CGGAG	2	10	858152	858161	20 %	0 %	60 %	20 %	126178829
624	NC_009051	CTTCG	2	10	858897	858906	0 %	40 %	20 %	40 %	126178829
625	NC_009051	TCGGG	2	10	859810	859819	0 %	20 %	60 %	20 %	126178831
626	NC_009051	CGGGG	2	10	868372	868381	0 %	0 %	80 %	20 %	126178838
627	NC_009051	AGCGG	2	10	870587	870596	20 %	0 %	60 %	20 %	126178841
628	NC_009051	GTGCC	2	10	872530	872539	0 %	20 %	40 %	40 %	126178843
629	NC_009051	GAACA	2	10	874525	874534	60 %	0 %	20 %	20 %	126178845
630	NC_009051	TGAAG	2	10	874589	874598	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
631	NC_009051	GAGCG	2	10	876963	876972	20 %	0 %	60 %	20 %	126178848
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