MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 6297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009051	TGAA	2	8	219	226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009051	ACGA	2	8	634	641	50 %	0 %	25 %	25 %	126177953
3	NC_009051	CCGA	2	8	886	893	25 %	0 %	25 %	50 %	126177953
4	NC_009051	GAGC	2	8	1843	1850	25 %	0 %	50 %	25 %	126177954
5	NC_009051	CCAT	2	8	4150	4157	25 %	25 %	0 %	50 %	126177957
6	NC_009051	GACG	2	8	4354	4361	25 %	0 %	50 %	25 %	126177957
7	NC_009051	GCGA	2	8	4402	4409	25 %	0 %	50 %	25 %	126177957
8	NC_009051	GCGG	2	8	5569	5576	0 %	0 %	75 %	25 %	126177959
9	NC_009051	CGTC	2	8	5646	5653	0 %	25 %	25 %	50 %	126177959
10	NC_009051	CTGG	2	8	5698	5705	0 %	25 %	50 %	25 %	126177959
11	NC_009051	CCCG	2	8	5901	5908	0 %	0 %	25 %	75 %	126177960
12	NC_009051	GGCG	2	8	6050	6057	0 %	0 %	75 %	25 %	126177960
13	NC_009051	CCAG	2	8	7240	7247	25 %	0 %	25 %	50 %	126177961
14	NC_009051	CGGG	2	8	7342	7349	0 %	0 %	75 %	25 %	126177961
15	NC_009051	CGGC	2	8	8073	8080	0 %	0 %	50 %	50 %	126177962
16	NC_009051	CCTG	2	8	8537	8544	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009051	CCGG	2	8	8689	8696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009051	CAAA	2	8	8758	8765	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009051	CTGC	2	8	9275	9282	0 %	25 %	25 %	50 %	126177964
20	NC_009051	GAAA	2	8	9315	9322	75 %	0 %	25 %	0 %	126177964
21	NC_009051	AGCC	2	8	9323	9330	25 %	0 %	25 %	50 %	126177964
22	NC_009051	CGGA	2	8	9825	9832	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009051	GACG	2	8	10597	10604	25 %	0 %	50 %	25 %	126177966
24	NC_009051	GACG	2	8	10723	10730	25 %	0 %	50 %	25 %	126177966
25	NC_009051	GGCT	2	8	11238	11245	0 %	25 %	50 %	25 %	126177967
26	NC_009051	GGCC	2	8	11295	11302	0 %	0 %	50 %	50 %	126177967
27	NC_009051	CCGT	2	8	11362	11369	0 %	25 %	25 %	50 %	126177967
28	NC_009051	GAGC	2	8	11617	11624	25 %	0 %	50 %	25 %	126177967
29	NC_009051	CCTG	2	8	11881	11888	0 %	25 %	25 %	50 %	126177968
30	NC_009051	GACG	2	8	12242	12249	25 %	0 %	50 %	25 %	126177968
31	NC_009051	CCCG	2	8	12563	12570	0 %	0 %	25 %	75 %	126177968
32	NC_009051	CCGG	2	8	13345	13352	0 %	0 %	50 %	50 %	126177970
33	NC_009051	GAAG	2	8	13809	13816	50 %	0 %	50 %	0 %	126177972
34	NC_009051	CCTC	2	8	13841	13848	0 %	25 %	0 %	75 %	126177972
35	NC_009051	AGGC	2	8	13949	13956	25 %	0 %	50 %	25 %	126177972
36	NC_009051	CGGG	2	8	14211	14218	0 %	0 %	75 %	25 %	126177972
37	NC_009051	CTCC	2	8	14633	14640	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_009051	ACGG	2	8	15252	15259	25 %	0 %	50 %	25 %	126177973
39	NC_009051	CGAT	2	8	15349	15356	25 %	25 %	25 %	25 %	126177973
40	NC_009051	CCGG	2	8	15416	15423	0 %	0 %	50 %	50 %	126177973
41	NC_009051	GGCA	2	8	15876	15883	25 %	0 %	50 %	25 %	126177974
42	NC_009051	CGGG	2	8	16797	16804	0 %	0 %	75 %	25 %	126177975
43	NC_009051	GACC	2	8	17735	17742	25 %	0 %	25 %	50 %	126177976
44	NC_009051	GACC	2	8	17912	17919	25 %	0 %	25 %	50 %	126177976
45	NC_009051	TTCA	2	8	18111	18118	25 %	50 %	0 %	25 %	126177976
46	NC_009051	GCTC	2	8	18332	18339	0 %	25 %	25 %	50 %	126177977
47	NC_009051	CGGG	2	8	18587	18594	0 %	0 %	75 %	25 %	126177977
48	NC_009051	CCCG	2	8	18851	18858	0 %	0 %	25 %	75 %	126177978
49	NC_009051	ACGA	2	8	18885	18892	50 %	0 %	25 %	25 %	126177978
50	NC_009051	CCCG	2	8	19097	19104	0 %	0 %	25 %	75 %	126177978
51	NC_009051	CGCC	2	8	19282	19289	0 %	0 %	25 %	75 %	126177978
52	NC_009051	CGTG	2	8	19338	19345	0 %	25 %	50 %	25 %	126177978
53	NC_009051	GCCG	2	8	20001	20008	0 %	0 %	50 %	50 %	126177978
54	NC_009051	CGGC	2	8	20167	20174	0 %	0 %	50 %	50 %	126177978
55	NC_009051	GCCT	2	8	20734	20741	0 %	25 %	25 %	50 %	126177979
56	NC_009051	GGAG	2	8	21304	21311	25 %	0 %	75 %	0 %	126177979
57	NC_009051	TCCT	2	8	21573	21580	0 %	50 %	0 %	50 %	126177980
58	NC_009051	CCGA	2	8	21970	21977	25 %	0 %	25 %	50 %	126177980
59	NC_009051	GGGC	2	8	22795	22802	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009051	TTTA	2	8	22852	22859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009051	CCGG	2	8	23742	23749	0 %	0 %	50 %	50 %	126177981
62	NC_009051	AGAC	2	8	24038	24045	50 %	0 %	25 %	25 %	126177982
63	NC_009051	GACG	2	8	24796	24803	25 %	0 %	50 %	25 %	126177982
64	NC_009051	GGAT	2	8	25199	25206	25 %	25 %	50 %	0 %	126177983
65	NC_009051	CCGG	2	8	25770	25777	0 %	0 %	50 %	50 %	126177983
66	NC_009051	GACC	2	8	25869	25876	25 %	0 %	25 %	50 %	126177983
67	NC_009051	CTCC	2	8	26231	26238	0 %	25 %	0 %	75 %	126177984
68	NC_009051	CGAT	2	8	26864	26871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009051	CGAC	2	8	27298	27305	25 %	0 %	25 %	50 %	126177985
70	NC_009051	TCAT	2	8	27459	27466	25 %	50 %	0 %	25 %	126177985
71	NC_009051	CCGC	2	8	27760	27767	0 %	0 %	25 %	75 %	126177985
72	NC_009051	GCAG	2	8	28226	28233	25 %	0 %	50 %	25 %	126177985
73	NC_009051	GAAA	2	8	28314	28321	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009051	TTCT	2	8	28443	28450	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009051	GGCA	2	8	28522	28529	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009051	CATC	2	8	28768	28775	25 %	25 %	0 %	50 %	126177986
77	NC_009051	GGGA	2	8	29360	29367	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009051	GCCG	2	8	29743	29750	0 %	0 %	50 %	50 %	126177987
79	NC_009051	GCAC	2	8	29856	29863	25 %	0 %	25 %	50 %	126177987
80	NC_009051	CGGG	2	8	30422	30429	0 %	0 %	75 %	25 %	126177988
81	NC_009051	GCCG	2	8	30746	30753	0 %	0 %	50 %	50 %	126177989
82	NC_009051	CGGG	2	8	30939	30946	0 %	0 %	75 %	25 %	126177989
83	NC_009051	CCGG	2	8	31086	31093	0 %	0 %	50 %	50 %	126177989
84	NC_009051	AGGT	2	8	31315	31322	25 %	25 %	50 %	0 %	126177990
85	NC_009051	AGCC	2	8	31462	31469	25 %	0 %	25 %	50 %	126177990
86	NC_009051	GGCC	2	8	31621	31628	0 %	0 %	50 %	50 %	126177990
87	NC_009051	GCCG	2	8	31861	31868	0 %	0 %	50 %	50 %	126177990
88	NC_009051	CGAC	2	8	32150	32157	25 %	0 %	25 %	50 %	126177990
89	NC_009051	GGCC	2	8	32969	32976	0 %	0 %	50 %	50 %	126177991
90	NC_009051	CCGC	2	8	33164	33171	0 %	0 %	25 %	75 %	126177991
91	NC_009051	CCGA	2	8	33222	33229	25 %	0 %	25 %	50 %	126177991
92	NC_009051	CGGC	2	8	33703	33710	0 %	0 %	50 %	50 %	126177991
93	NC_009051	CTCG	2	8	33764	33771	0 %	25 %	25 %	50 %	126177991
94	NC_009051	TTCA	2	8	34395	34402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009051	GGAA	2	8	34917	34924	50 %	0 %	50 %	0 %	126177992
96	NC_009051	CGAC	2	8	35087	35094	25 %	0 %	25 %	50 %	126177992
97	NC_009051	TCGA	2	8	36130	36137	25 %	25 %	25 %	25 %	126177992
98	NC_009051	GGGA	2	8	36327	36334	25 %	0 %	75 %	0 %	126177992
99	NC_009051	CATC	2	8	36953	36960	25 %	25 %	0 %	50 %	126177992
100	NC_009051	CCCT	2	8	37580	37587	0 %	25 %	0 %	75 %	126177992
101	NC_009051	CACC	2	8	37650	37657	25 %	0 %	0 %	75 %	126177992
102	NC_009051	ACGA	2	8	38069	38076	50 %	0 %	25 %	25 %	126177992
103	NC_009051	GGAT	2	8	38334	38341	25 %	25 %	50 %	0 %	126177992
104	NC_009051	TTCG	2	8	38550	38557	0 %	50 %	25 %	25 %	126177992
105	NC_009051	TCGT	2	8	39022	39029	0 %	50 %	25 %	25 %	126177992
106	NC_009051	GCCC	2	8	39287	39294	0 %	0 %	25 %	75 %	126177992
107	NC_009051	GATT	2	8	39504	39511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009051	AGTT	2	8	39566	39573	25 %	50 %	25 %	0 %	126177993
109	NC_009051	CCTT	2	8	39698	39705	0 %	50 %	0 %	50 %	126177993
110	NC_009051	CGCC	2	8	40527	40534	0 %	0 %	25 %	75 %	126177995
111	NC_009051	CCGC	2	8	40827	40834	0 %	0 %	25 %	75 %	126177995
112	NC_009051	GAAA	2	8	40878	40885	75 %	0 %	25 %	0 %	126177995
113	NC_009051	CGAA	2	8	43084	43091	50 %	0 %	25 %	25 %	126177996
114	NC_009051	CTGT	2	8	43289	43296	0 %	50 %	25 %	25 %	126177996
115	NC_009051	GATG	2	8	43604	43611	25 %	25 %	50 %	0 %	126177997
116	NC_009051	CGGT	2	8	43747	43754	0 %	25 %	50 %	25 %	126177997
117	NC_009051	GTTC	2	8	44123	44130	0 %	50 %	25 %	25 %	126177997
118	NC_009051	CCGG	2	8	44288	44295	0 %	0 %	50 %	50 %	126177997
119	NC_009051	CCGC	2	8	45218	45225	0 %	0 %	25 %	75 %	126177998
120	NC_009051	TGCG	2	8	46234	46241	0 %	25 %	50 %	25 %	126177999
121	NC_009051	TGGT	2	8	47269	47276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009051	CCTC	2	8	47381	47388	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_009051	CGAA	2	8	47797	47804	50 %	0 %	25 %	25 %	126178000
124	NC_009051	CGGG	2	8	48459	48466	0 %	0 %	75 %	25 %	126178000
125	NC_009051	CGGG	2	8	48474	48481	0 %	0 %	75 %	25 %	126178000
126	NC_009051	GTCG	2	8	48986	48993	0 %	25 %	50 %	25 %	126178001
127	NC_009051	TGGT	2	8	48999	49006	0 %	50 %	50 %	0 %	126178001
128	NC_009051	CGGT	2	8	49873	49880	0 %	25 %	50 %	25 %	126178003
129	NC_009051	GATG	2	8	50239	50246	25 %	25 %	50 %	0 %	126178004
130	NC_009051	CCCG	2	8	50359	50366	0 %	0 %	25 %	75 %	126178004
131	NC_009051	ATCG	2	8	50605	50612	25 %	25 %	25 %	25 %	126178004
132	NC_009051	ACGA	2	8	50675	50682	50 %	0 %	25 %	25 %	126178004
133	NC_009051	GCCG	2	8	51446	51453	0 %	0 %	50 %	50 %	126178005
134	NC_009051	GCCG	2	8	51727	51734	0 %	0 %	50 %	50 %	126178005
135	NC_009051	GCTC	2	8	51904	51911	0 %	25 %	25 %	50 %	126178005
136	NC_009051	CTTC	2	8	52067	52074	0 %	50 %	0 %	50 %	126178006
137	NC_009051	CCCT	2	8	52490	52497	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_009051	CGCC	2	8	53877	53884	0 %	0 %	25 %	75 %	126178008
139	NC_009051	CGGC	2	8	54182	54189	0 %	0 %	50 %	50 %	126178008
140	NC_009051	AACA	2	8	54489	54496	75 %	0 %	0 %	25 %	126178009
141	NC_009051	AGGA	2	8	54731	54738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009051	CTCC	2	8	55182	55189	0 %	25 %	0 %	75 %	126178011
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