MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 6297

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009051	TCGC	2	8	377785	377792	0 %	25 %	25 %	50 %	126178345
1002	NC_009051	CGGT	2	8	377932	377939	0 %	25 %	50 %	25 %	126178345
1003	NC_009051	GTCG	2	8	378153	378160	0 %	25 %	50 %	25 %	126178345
1004	NC_009051	ATGT	2	8	378484	378491	25 %	50 %	25 %	0 %	126178346
1005	NC_009051	GCGG	2	8	378547	378554	0 %	0 %	75 %	25 %	126178346
1006	NC_009051	CACC	2	8	379377	379384	25 %	0 %	0 %	75 %	126178347
1007	NC_009051	TGCT	2	8	380551	380558	0 %	50 %	25 %	25 %	126178348
1008	NC_009051	CCGG	2	8	380597	380604	0 %	0 %	50 %	50 %	126178348
1009	NC_009051	GACG	2	8	380633	380640	25 %	0 %	50 %	25 %	126178348
1010	NC_009051	ATCA	2	8	381034	381041	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_009051	AACG	2	8	381204	381211	50 %	0 %	25 %	25 %	126178349
1012	NC_009051	GGGC	2	8	381647	381654	0 %	0 %	75 %	25 %	126178349
1013	NC_009051	GGCG	2	8	381684	381691	0 %	0 %	75 %	25 %	126178349
1014	NC_009051	CGGC	2	8	381891	381898	0 %	0 %	50 %	50 %	126178349
1015	NC_009051	CGGT	2	8	382660	382667	0 %	25 %	50 %	25 %	126178349
1016	NC_009051	GCCC	2	8	383019	383026	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1017	NC_009051	GCGG	2	8	383102	383109	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_009051	CGTC	2	8	383433	383440	0 %	25 %	25 %	50 %	126178350
1019	NC_009051	ATCG	2	8	384091	384098	25 %	25 %	25 %	25 %	126178350
1020	NC_009051	GCGG	2	8	385035	385042	0 %	0 %	75 %	25 %	126178352
1021	NC_009051	CGGG	2	8	385140	385147	0 %	0 %	75 %	25 %	126178352
1022	NC_009051	TCAC	2	8	385609	385616	25 %	25 %	0 %	50 %	126178352
1023	NC_009051	GAGT	2	8	386698	386705	25 %	25 %	50 %	0 %	126178353
1024	NC_009051	TCGC	2	8	387376	387383	0 %	25 %	25 %	50 %	126178353
1025	NC_009051	GGTG	2	8	387624	387631	0 %	25 %	75 %	0 %	126178353
1026	NC_009051	GGAC	2	8	387993	388000	25 %	0 %	50 %	25 %	126178353
1027	NC_009051	GCTC	2	8	388392	388399	0 %	25 %	25 %	50 %	126178353
1028	NC_009051	GATG	2	8	388626	388633	25 %	25 %	50 %	0 %	126178353
1029	NC_009051	ACCC	2	8	388904	388911	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1030	NC_009051	CGGG	2	8	388964	388971	0 %	0 %	75 %	25 %	126178354
1031	NC_009051	CCGG	2	8	389734	389741	0 %	0 %	50 %	50 %	126178355
1032	NC_009051	GTGG	2	8	389941	389948	0 %	25 %	75 %	0 %	126178355
1033	NC_009051	TCCT	2	8	390195	390202	0 %	50 %	0 %	50 %	126178355
1034	NC_009051	CGCC	2	8	390603	390610	0 %	0 %	25 %	75 %	126178355
1035	NC_009051	CGGG	2	8	390660	390667	0 %	0 %	75 %	25 %	126178355
1036	NC_009051	CGCC	2	8	390675	390682	0 %	0 %	25 %	75 %	126178355
1037	NC_009051	CGGG	2	8	390981	390988	0 %	0 %	75 %	25 %	126178355
1038	NC_009051	CTCG	2	8	391302	391309	0 %	25 %	25 %	50 %	126178356
1039	NC_009051	CCGC	2	8	391742	391749	0 %	0 %	25 %	75 %	126178356
1040	NC_009051	GCGG	3	12	392814	392825	0 %	0 %	75 %	25 %	126178358
1041	NC_009051	CGCC	2	8	392959	392966	0 %	0 %	25 %	75 %	126178358
1042	NC_009051	CCTG	2	8	393042	393049	0 %	25 %	25 %	50 %	126178358
1043	NC_009051	TTGA	2	8	393651	393658	25 %	50 %	25 %	0 %	126178358
1044	NC_009051	CTTA	2	8	393821	393828	25 %	50 %	0 %	25 %	126178358
1045	NC_009051	GAGG	2	8	394483	394490	25 %	0 %	75 %	0 %	126178359
1046	NC_009051	GGCC	2	8	394564	394571	0 %	0 %	50 %	50 %	126178359
1047	NC_009051	GCGG	2	8	394690	394697	0 %	0 %	75 %	25 %	126178359
1048	NC_009051	CGTG	2	8	396412	396419	0 %	25 %	50 %	25 %	126178362
1049	NC_009051	GTCC	2	8	397121	397128	0 %	25 %	25 %	50 %	126178363
1050	NC_009051	ACGA	2	8	397469	397476	50 %	0 %	25 %	25 %	126178364
1051	NC_009051	GATG	2	8	397747	397754	25 %	25 %	50 %	0 %	126178364
1052	NC_009051	GGGC	2	8	398003	398010	0 %	0 %	75 %	25 %	126178364
1053	NC_009051	TGAA	2	8	398261	398268	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_009051	GGCT	2	8	399189	399196	0 %	25 %	50 %	25 %	126178366
1055	NC_009051	GCAG	2	8	399478	399485	25 %	0 %	50 %	25 %	126178366
1056	NC_009051	TGTC	2	8	399650	399657	0 %	50 %	25 %	25 %	126178366
1057	NC_009051	TGAT	2	8	400243	400250	25 %	50 %	25 %	0 %	126178366
1058	NC_009051	GATG	2	8	400295	400302	25 %	25 %	50 %	0 %	126178366
1059	NC_009051	ATCC	2	8	400998	401005	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_009051	CCCG	2	8	401177	401184	0 %	0 %	25 %	75 %	126178367
1061	NC_009051	CCTG	2	8	401536	401543	0 %	25 %	25 %	50 %	126178367
1062	NC_009051	CCTC	2	8	401866	401873	0 %	25 %	0 %	75 %	126178367
1063	NC_009051	GGAT	2	8	402079	402086	25 %	25 %	50 %	0 %	126178367
1064	NC_009051	GTCC	2	8	402525	402532	0 %	25 %	25 %	50 %	126178367
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1066	NC_009051	GTCG	2	8	402938	402945	0 %	25 %	50 %	25 %	126178367
1067	NC_009051	TCGG	2	8	402996	403003	0 %	25 %	50 %	25 %	126178367
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1074	NC_009051	ATTT	2	8	406665	406672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_009051	CATT	2	8	406912	406919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_009051	CCGG	2	8	407097	407104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_009051	GGTC	2	8	407296	407303	0 %	25 %	50 %	25 %	126178371
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1081	NC_009051	GACC	2	8	409506	409513	25 %	0 %	25 %	50 %	126178372
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1088	NC_009051	CCGG	2	8	412497	412504	0 %	0 %	50 %	50 %	126178375
1089	NC_009051	CCTC	2	8	413231	413238	0 %	25 %	0 %	75 %	126178376
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1092	NC_009051	GCGG	2	8	414600	414607	0 %	0 %	75 %	25 %	126178379
1093	NC_009051	GCCG	2	8	415122	415129	0 %	0 %	50 %	50 %	126178379
1094	NC_009051	GGAT	2	8	415361	415368	25 %	25 %	50 %	0 %	126178379
1095	NC_009051	TCCG	2	8	415532	415539	0 %	25 %	25 %	50 %	126178380
1096	NC_009051	CTGG	2	8	415788	415795	0 %	25 %	50 %	25 %	126178380
1097	NC_009051	CGGA	2	8	415888	415895	25 %	0 %	50 %	25 %	126178380
1098	NC_009051	GATA	2	8	415947	415954	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_009051	GAAG	2	8	416182	416189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_009051	CTCC	2	8	416761	416768	0 %	25 %	0 %	75 %	126178381
1102	NC_009051	CGCC	2	8	416968	416975	0 %	0 %	25 %	75 %	126178381
1103	NC_009051	CCGC	2	8	417103	417110	0 %	0 %	25 %	75 %	126178381
1104	NC_009051	CGAT	2	8	417483	417490	25 %	25 %	25 %	25 %	126178382
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1106	NC_009051	CTGC	2	8	418123	418130	0 %	25 %	25 %	50 %	126178382
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1109	NC_009051	GATC	2	8	420080	420087	25 %	25 %	25 %	25 %	126178384
1110	NC_009051	CCTC	2	8	420317	420324	0 %	25 %	0 %	75 %	126178384
1111	NC_009051	CTCC	2	8	420417	420424	0 %	25 %	0 %	75 %	126178384
1112	NC_009051	ACCT	2	8	420856	420863	25 %	25 %	0 %	50 %	126178384
1113	NC_009051	ATCT	2	8	421019	421026	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_009051	ATCG	2	8	421064	421071	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_009051	CCGT	2	8	421326	421333	0 %	25 %	25 %	50 %	126178385
1116	NC_009051	CGAT	2	8	421788	421795	25 %	25 %	25 %	25 %	126178386
1117	NC_009051	ATCG	2	8	421936	421943	25 %	25 %	25 %	25 %	126178386
1118	NC_009051	CGGG	2	8	422076	422083	0 %	0 %	75 %	25 %	126178386
1119	NC_009051	CCCG	2	8	422285	422292	0 %	0 %	25 %	75 %	126178386
1120	NC_009051	CGGC	2	8	422996	423003	0 %	0 %	50 %	50 %	126178387
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1122	NC_009051	CGGT	2	8	423544	423551	0 %	25 %	50 %	25 %	126178388
1123	NC_009051	GTCC	2	8	424584	424591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_009051	ATGC	2	8	424669	424676	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_009051	CGCA	2	8	424749	424756	25 %	0 %	25 %	50 %	126178390
1126	NC_009051	AAAT	2	8	425274	425281	75 %	25 %	0 %	0 %	126178390
1127	NC_009051	CTTC	2	8	425615	425622	0 %	50 %	0 %	50 %	126178390
1128	NC_009051	CGGT	2	8	425931	425938	0 %	25 %	50 %	25 %	126178390
1129	NC_009051	TCGA	2	8	426253	426260	25 %	25 %	25 %	25 %	126178391
1130	NC_009051	TTTC	2	8	426303	426310	0 %	75 %	0 %	25 %	126178391
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