MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidovorax citrulli AAC00-1 chromosome

Total Repeats: 92672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008752	AGC	2	6	156	161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608715
2	NC_008752	CAG	2	6	182	187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608715
3	NC_008752	TCG	2	6	210	215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608715
4	NC_008752	CTG	2	6	248	253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608715
5	NC_008752	GGT	2	6	388	393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120608715
6	NC_008752	GTG	2	6	401	406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120608715
7	NC_008752	CAG	2	6	407	412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608715
8	NC_008752	CGG	2	6	423	428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120608715
9	NC_008752	TGG	2	6	516	521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120608715
10	NC_008752	CCG	2	6	549	554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608715
11	NC_008752	CGG	2	6	607	612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120608715
12	NC_008752	CTG	2	6	659	664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608715
13	NC_008752	CGA	2	6	751	756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608715
14	NC_008752	CTG	3	9	785	793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608715
15	NC_008752	CGA	2	6	796	801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608715
16	NC_008752	TTC	2	6	809	814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120608715
17	NC_008752	CAA	2	6	817	822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120608715
18	NC_008752	GGA	2	6	835	840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120608715
19	NC_008752	TTC	2	6	842	847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120608715
20	NC_008752	GCT	2	6	862	867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608715
21	NC_008752	AAG	2	6	872	877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120608715
22	NC_008752	TGA	2	6	888	893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120608715
23	NC_008752	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608715
24	NC_008752	CAA	2	6	1015	1020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120608715
25	NC_008752	CTT	2	6	1060	1065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120608715
26	NC_008752	CTG	2	6	1190	1195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608715
27	NC_008752	AGA	2	6	1233	1238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120608715
28	NC_008752	ACT	2	6	1248	1253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120608715
29	NC_008752	AAG	2	6	1283	1288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120608715
30	NC_008752	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120608715
31	NC_008752	ACG	2	6	1397	1402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608715
32	NC_008752	TGC	2	6	1404	1409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608715
33	NC_008752	CAG	2	6	1460	1465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608715
34	NC_008752	TCG	2	6	1719	1724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608716
35	NC_008752	CAC	2	6	1792	1797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120608716
36	NC_008752	CAC	2	6	1822	1827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120608716
37	NC_008752	CAC	3	9	1858	1866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120608716
38	NC_008752	CCG	2	6	1908	1913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608716
39	NC_008752	GCA	2	6	1936	1941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608716
40	NC_008752	GGC	2	6	1961	1966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120608716
41	NC_008752	CCG	2	6	2025	2030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608716
42	NC_008752	CTA	2	6	2119	2124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120608716
43	NC_008752	CTG	2	6	2279	2284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608716
44	NC_008752	CGG	2	6	2293	2298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120608716
45	NC_008752	CAA	2	6	2332	2337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120608716
46	NC_008752	CGG	2	6	2356	2361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120608716
47	NC_008752	CTG	2	6	2462	2467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608716
48	NC_008752	CAT	2	6	2488	2493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120608716
49	NC_008752	CAA	2	6	2557	2562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120608716
50	NC_008752	CGG	2	6	2605	2610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120608716
51	NC_008752	TGA	2	6	2718	2723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120608716
52	NC_008752	CGT	2	6	2752	2757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608716
53	NC_008752	GCC	2	6	2943	2948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608717
54	NC_008752	CAC	2	6	3060	3065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120608717
55	NC_008752	GTG	2	6	3078	3083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120608717
56	NC_008752	CGA	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608717
57	NC_008752	CGA	2	6	3119	3124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608717
58	NC_008752	TCG	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608717
59	NC_008752	GTG	2	6	3162	3167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120608717
60	NC_008752	GAC	2	6	3204	3209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608717
61	NC_008752	GCC	2	6	3231	3236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608717
62	NC_008752	GGC	2	6	3264	3269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120608717
63	NC_008752	GGC	2	6	3300	3305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120608717
64	NC_008752	TGC	2	6	3349	3354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608717
65	NC_008752	CTG	2	6	3387	3392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608717
66	NC_008752	AAC	2	6	3534	3539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120608717
67	NC_008752	AAC	2	6	3591	3596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120608717
68	NC_008752	GAC	2	6	3639	3644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608717
69	NC_008752	TCA	2	6	3682	3687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120608717
70	NC_008752	AAG	2	6	3696	3701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120608717
71	NC_008752	GCC	2	6	3736	3741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608717
72	NC_008752	CGG	2	6	3755	3760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120608717
73	NC_008752	ACG	2	6	3805	3810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608717
74	NC_008752	CAA	2	6	3839	3844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120608717
75	NC_008752	CGG	2	6	3860	3865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120608717
76	NC_008752	AAG	2	6	3939	3944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120608717
77	NC_008752	GCG	2	6	3961	3966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120608717
78	NC_008752	TGC	2	6	3987	3992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608717
79	NC_008752	CAG	2	6	4025	4030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608717
80	NC_008752	TCG	2	6	4084	4089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608717
81	NC_008752	ACG	2	6	4126	4131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608717
82	NC_008752	GCC	2	6	4161	4166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608717
83	NC_008752	CGC	2	6	4206	4211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608717
84	NC_008752	CCG	2	6	4309	4314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608717
85	NC_008752	GCT	2	6	4409	4414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608717
86	NC_008752	TCA	2	6	4438	4443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120608717
87	NC_008752	GCG	2	6	4495	4500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120608717
88	NC_008752	GAC	2	6	4503	4508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608717
89	NC_008752	ACC	2	6	4531	4536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120608717
90	NC_008752	CAT	4	12	4538	4549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120608717
91	NC_008752	CTG	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608717
92	NC_008752	CTT	2	6	4598	4603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120608717
93	NC_008752	GCC	2	6	4655	4660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608717
94	NC_008752	GAA	2	6	4673	4678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120608717
95	NC_008752	CTG	2	6	4728	4733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608717
96	NC_008752	ACC	2	6	4761	4766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120608717
97	NC_008752	GGC	2	6	4767	4772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120608717
98	NC_008752	CAC	3	9	4976	4984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120608717
99	NC_008752	CCG	2	6	4993	4998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608717
100	NC_008752	TGC	2	6	5038	5043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608717
101	NC_008752	GCC	3	9	5050	5058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608717
102	NC_008752	AGC	2	6	5076	5081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608717
103	NC_008752	ATC	2	6	5082	5087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120608717
104	NC_008752	GCC	2	6	5133	5138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608717
105	NC_008752	TGC	2	6	5176	5181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608717
106	NC_008752	GCG	2	6	5182	5187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120608717
107	NC_008752	GAG	2	6	5205	5210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120608717
108	NC_008752	TCA	2	6	5245	5250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120608717
109	NC_008752	CAC	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120608717
110	NC_008752	GCC	2	6	5272	5277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608717
111	NC_008752	GCC	2	6	5347	5352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608717
112	NC_008752	TGC	2	6	5353	5358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608717
113	NC_008752	TTG	2	6	5691	5696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120608718
114	NC_008752	CTG	2	6	5777	5782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608718
115	NC_008752	GTA	2	6	5807	5812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120608718
116	NC_008752	TGG	2	6	5832	5837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120608718
117	NC_008752	CAG	3	9	5978	5986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608718
118	NC_008752	ATC	2	6	6195	6200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120608718
119	NC_008752	CGG	2	6	6233	6238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120608718
120	NC_008752	CCA	2	6	6319	6324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120608718
121	NC_008752	GCC	2	6	6335	6340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608718
122	NC_008752	GCA	2	6	6385	6390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608718
123	NC_008752	AGG	2	6	6492	6497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120608718
124	NC_008752	GCA	2	6	6547	6552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608718
125	NC_008752	CAG	3	9	6611	6619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608718
126	NC_008752	CAG	2	6	6665	6670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608718
127	NC_008752	GCC	2	6	6687	6692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608718
128	NC_008752	GCA	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608718
129	NC_008752	ATC	2	6	6794	6799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120608718
130	NC_008752	CAC	3	9	6815	6823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120608718
131	NC_008752	TCT	2	6	6834	6839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120608718
132	NC_008752	CAC	2	6	6977	6982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120608718
133	NC_008752	TCT	2	6	7075	7080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120608718
134	NC_008752	TCT	2	6	7207	7212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120608718
135	NC_008752	CCA	2	6	7240	7245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120608718
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140	NC_008752	CAC	3	9	7537	7545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120608719
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152	NC_008752	GCG	2	6	9246	9251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120608720
153	NC_008752	CAG	2	6	9257	9262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608720
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164	NC_008752	TCG	2	6	10147	10152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608722
165	NC_008752	GCG	2	6	10155	10160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120608722
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253	NC_008752	AGC	2	6	16465	16470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608729
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255	NC_008752	GCC	2	6	16510	16515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608729
256	NC_008752	GCA	2	6	16579	16584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608729
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258	NC_008752	GCT	2	6	16672	16677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608729
259	NC_008752	CGG	2	6	16805	16810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120608730
260	NC_008752	CCG	2	6	16886	16891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120608730
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380	NC_008752	GCA	2	6	24272	24277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120608735
381	NC_008752	TGC	2	6	24298	24303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120608735
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500	NC_008752	ACC	2	6	32973	32978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120608741

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