MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidovorax citrulli AAC00-1 chromosome

Total Repeats: 92672

< Previous12...174175176177178179180181182183184185186Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
92501	NC_008752	CGC	2	6	5342530	5342535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613415
92502	NC_008752	CGC	2	6	5342712	5342717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613415
92503	NC_008752	TGC	2	6	5342813	5342818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613415
92504	NC_008752	GAC	2	6	5342935	5342940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613415
92505	NC_008752	CCG	3	9	5343038	5343046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613415
92506	NC_008752	GCC	2	6	5343101	5343106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613415
92507	NC_008752	TGG	2	6	5343200	5343205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120613415
92508	NC_008752	GCA	2	6	5343300	5343305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613415
92509	NC_008752	TGG	3	9	5343344	5343352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120613415
92510	NC_008752	AGC	2	6	5343355	5343360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613415
92511	NC_008752	CCG	2	6	5343376	5343381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613415
92512	NC_008752	CCT	2	6	5343405	5343410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120613415
92513	NC_008752	GCT	2	6	5343462	5343467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613415
92514	NC_008752	CGG	2	6	5343576	5343581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613415
92515	NC_008752	GGC	2	6	5343701	5343706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613415
92516	NC_008752	TGG	2	6	5343752	5343757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120613415
92517	NC_008752	CTG	2	6	5343823	5343828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613415
92518	NC_008752	CTG	2	6	5344066	5344071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613415
92519	NC_008752	GCA	2	6	5344142	5344147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613415
92520	NC_008752	TCG	2	6	5344163	5344168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613415
92521	NC_008752	GCT	2	6	5344254	5344259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613415
92522	NC_008752	ACA	2	6	5344281	5344286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120613415
92523	NC_008752	GCT	2	6	5344296	5344301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613415
92524	NC_008752	GTG	2	6	5344489	5344494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120613415
92525	NC_008752	CCG	2	6	5344599	5344604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613415
92526	NC_008752	GCC	2	6	5344690	5344695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613416
92527	NC_008752	GTG	2	6	5344774	5344779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120613416
92528	NC_008752	CCG	2	6	5344836	5344841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613416
92529	NC_008752	CAG	2	6	5344959	5344964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613416
92530	NC_008752	GCC	2	6	5344978	5344983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613416
92531	NC_008752	GCA	2	6	5345036	5345041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613416
92532	NC_008752	ATC	2	6	5345287	5345292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120613416
92533	NC_008752	CCG	2	6	5345345	5345350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613416
92534	NC_008752	CAC	2	6	5345382	5345387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120613416
92535	NC_008752	CGC	2	6	5345404	5345409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613416
92536	NC_008752	GGC	2	6	5345433	5345438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613416
92537	NC_008752	CAG	2	6	5345514	5345519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613416
92538	NC_008752	ACG	2	6	5345726	5345731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613417
92539	NC_008752	GCC	2	6	5345769	5345774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613417
92540	NC_008752	GAA	2	6	5345897	5345902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120613417
92541	NC_008752	CAC	2	6	5345915	5345920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120613417
92542	NC_008752	GCA	2	6	5346064	5346069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613417
92543	NC_008752	CAG	2	6	5346080	5346085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613417
92544	NC_008752	CCG	2	6	5346127	5346132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613417
92545	NC_008752	GCC	2	6	5346158	5346163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613417
92546	NC_008752	GGA	2	6	5346203	5346208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120613417
92547	NC_008752	TGG	2	6	5346223	5346228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120613417
92548	NC_008752	CAG	2	6	5346357	5346362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613418
92549	NC_008752	TCG	2	6	5346364	5346369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613418
92550	NC_008752	CTG	2	6	5346402	5346407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613418
92551	NC_008752	CTC	2	6	5346420	5346425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120613418
92552	NC_008752	AGG	2	6	5346430	5346435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120613418
92553	NC_008752	GCC	3	9	5346466	5346474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613418
92554	NC_008752	CAG	2	6	5346570	5346575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613418
92555	NC_008752	CGC	2	6	5346580	5346585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613418
92556	NC_008752	CGG	2	6	5346626	5346631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613418
92557	NC_008752	GCT	2	6	5346676	5346681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613418
92558	NC_008752	CCG	2	6	5346776	5346781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613418
92559	NC_008752	TCG	3	9	5346886	5346894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613418
92560	NC_008752	CCG	2	6	5346908	5346913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613418
92561	NC_008752	CTG	2	6	5346954	5346959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613418
92562	NC_008752	CAG	2	6	5347026	5347031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613418
92563	NC_008752	CAC	2	6	5347065	5347070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120613418
92564	NC_008752	GCA	2	6	5347085	5347090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613418
92565	NC_008752	GCC	2	6	5347141	5347146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613418
92566	NC_008752	TCC	2	6	5347189	5347194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120613418
92567	NC_008752	CCA	2	6	5347214	5347219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120613418
92568	NC_008752	TCG	2	6	5347261	5347266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613418
92569	NC_008752	GGC	2	6	5347305	5347310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613418
92570	NC_008752	CGG	2	6	5347460	5347465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613418
92571	NC_008752	CAG	3	9	5347482	5347490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613418
92572	NC_008752	GCA	2	6	5347493	5347498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613418
92573	NC_008752	GCC	2	6	5347506	5347511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613418
92574	NC_008752	GCG	2	6	5347553	5347558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613418
92575	NC_008752	CCA	2	6	5347664	5347669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120613418
92576	NC_008752	GGC	2	6	5347737	5347742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613418
92577	NC_008752	GCA	2	6	5347763	5347768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613418
92578	NC_008752	TGG	2	6	5347914	5347919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120613419
92579	NC_008752	GTC	2	6	5347939	5347944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613419
92580	NC_008752	GCG	2	6	5347953	5347958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613419
92581	NC_008752	TGG	2	6	5347994	5347999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120613419
92582	NC_008752	GTA	3	9	5348011	5348019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120613419
92583	NC_008752	AGC	2	6	5348051	5348056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613419
92584	NC_008752	GCC	2	6	5348131	5348136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613419
92585	NC_008752	CGT	2	6	5348244	5348249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613419
92586	NC_008752	TCA	2	6	5348253	5348258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120613419
92587	NC_008752	CAG	2	6	5348422	5348427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613419
92588	NC_008752	CTT	2	6	5348428	5348433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120613419
92589	NC_008752	CGT	2	6	5348445	5348450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613419
92590	NC_008752	CCA	2	6	5348502	5348507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120613419
92591	NC_008752	GCG	3	9	5348739	5348747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613419
92592	NC_008752	GGC	2	6	5348797	5348802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613419
92593	NC_008752	ACC	2	6	5348822	5348827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120613419
92594	NC_008752	TCG	2	6	5348828	5348833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613419
92595	NC_008752	CCA	2	6	5348854	5348859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120613419
92596	NC_008752	TTC	2	6	5348867	5348872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120613419
92597	NC_008752	ATG	2	6	5348909	5348914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120613419
92598	NC_008752	GTT	2	6	5348989	5348994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120613419
92599	NC_008752	ATG	2	6	5349017	5349022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120613419
92600	NC_008752	GCA	3	9	5349042	5349050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613419
92601	NC_008752	GTC	2	6	5349088	5349093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613419
92602	NC_008752	CTT	2	6	5349097	5349102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120613419
92603	NC_008752	CGA	2	6	5349124	5349129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613419
92604	NC_008752	CGG	2	6	5349142	5349147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613419
92605	NC_008752	CGT	2	6	5349177	5349182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613419
92606	NC_008752	CCG	2	6	5349183	5349188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613419
92607	NC_008752	CGT	2	6	5349201	5349206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613419
92608	NC_008752	CTG	2	6	5349328	5349333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613419
92609	NC_008752	TGG	2	6	5349353	5349358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120613419
92610	NC_008752	GAG	2	6	5349439	5349444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120613419
92611	NC_008752	GCT	2	6	5349483	5349488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613419
92612	NC_008752	GCG	2	6	5349679	5349684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613420
92613	NC_008752	TTG	2	6	5349699	5349704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120613420
92614	NC_008752	CTG	2	6	5349713	5349718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613420
92615	NC_008752	TGT	2	6	5349733	5349738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120613420
92616	NC_008752	GAA	4	12	5349770	5349781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120613420
92617	NC_008752	CAT	2	6	5349812	5349817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120613420
92618	NC_008752	CGG	2	6	5349836	5349841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613420
92619	NC_008752	TCA	2	6	5349880	5349885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120613420
92620	NC_008752	GAA	2	6	5349899	5349904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120613420
92621	NC_008752	CAG	2	6	5349971	5349976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613420
92622	NC_008752	ATG	2	6	5350014	5350019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120613420
92623	NC_008752	AGC	2	6	5350024	5350029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613420
92624	NC_008752	CAT	2	6	5350067	5350072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120613420
92625	NC_008752	CTG	2	6	5350076	5350081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613420
92626	NC_008752	CTG	2	6	5350085	5350090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613420
92627	NC_008752	AGC	3	9	5350200	5350208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613420
92628	NC_008752	GTT	2	6	5350235	5350240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120613420
92629	NC_008752	AGC	2	6	5350263	5350268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613420
92630	NC_008752	CAG	2	6	5350496	5350501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613420
92631	NC_008752	TGC	2	6	5350521	5350526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613420
92632	NC_008752	TGG	2	6	5350546	5350551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120613420
92633	NC_008752	ACG	2	6	5350657	5350662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613420
92634	NC_008752	CGG	2	6	5350670	5350675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613420
92635	NC_008752	TTG	2	6	5350677	5350682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120613420
92636	NC_008752	GCG	2	6	5350711	5350716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613420
92637	NC_008752	CGT	2	6	5350724	5350729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613420
92638	NC_008752	ACC	2	6	5350740	5350745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120613420
92639	NC_008752	CGC	2	6	5350807	5350812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613420
92640	NC_008752	CAC	2	6	5350880	5350885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120613420
92641	NC_008752	GTC	2	6	5350964	5350969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613420
92642	NC_008752	CAG	2	6	5350970	5350975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613420
92643	NC_008752	CAG	2	6	5351015	5351020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613420
92644	NC_008752	GCC	2	6	5351039	5351044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613420
92645	NC_008752	GCA	2	6	5351065	5351070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613420
92646	NC_008752	GTG	2	6	5351076	5351081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120613420
92647	NC_008752	GCC	2	6	5351118	5351123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613420
92648	NC_008752	GCC	2	6	5351126	5351131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613420
92649	NC_008752	CTG	2	6	5351138	5351143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120613420
92650	NC_008752	CGC	2	6	5351150	5351155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613420
92651	NC_008752	GCC	3	9	5351198	5351206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613420
92652	NC_008752	GAA	2	6	5351246	5351251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120613420
92653	NC_008752	CAG	2	6	5351291	5351296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613420
92654	NC_008752	TCT	2	6	5351355	5351360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120613421
92655	NC_008752	GCG	2	6	5351390	5351395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613421
92656	NC_008752	GCC	2	6	5351470	5351475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613421
92657	NC_008752	CAC	2	6	5351480	5351485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120613421
92658	NC_008752	GAA	2	6	5351617	5351622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120613421
92659	NC_008752	GAG	2	6	5351647	5351652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120613421
92660	NC_008752	CAT	2	6	5351659	5351664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120613421
92661	NC_008752	GCC	2	6	5351704	5351709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613422
92662	NC_008752	GCC	2	6	5351742	5351747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613422
92663	NC_008752	GCA	2	6	5351780	5351785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120613422
92664	NC_008752	CTC	2	6	5351787	5351792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120613422
92665	NC_008752	CAC	2	6	5351865	5351870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120613422
92666	NC_008752	GCG	2	6	5351891	5351896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613422
92667	NC_008752	CGG	2	6	5351996	5352001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613422
92668	NC_008752	CAT	2	6	5352002	5352007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120613422
92669	NC_008752	GGC	2	6	5352153	5352158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613422
92670	NC_008752	GCG	2	6	5352373	5352378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120613423
92671	NC_008752	TGA	2	6	5352384	5352389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120613423
92672	NC_008752	GCC	2	6	5352397	5352402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120613423

< Previous12...174175176177178179180181182183184185186Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.