MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidothermus cellulolyticus 11B chromosome

Total Repeats: 48605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008578	CCG	2	6	217	222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927212
2	NC_008578	CGC	2	6	287	292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927212
3	NC_008578	CCA	2	6	373	378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117927212
4	NC_008578	GCG	2	6	470	475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927212
5	NC_008578	GCC	2	6	555	560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927212
6	NC_008578	GCC	3	9	567	575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927212
7	NC_008578	TCA	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117927212
8	NC_008578	CCG	2	6	767	772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927212
9	NC_008578	CGA	2	6	803	808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927212
10	NC_008578	CAA	2	6	881	886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117927212
11	NC_008578	AAC	2	6	919	924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117927212
12	NC_008578	TCA	2	6	970	975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117927212
13	NC_008578	ACC	2	6	986	991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117927212
14	NC_008578	TCC	2	6	1015	1020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117927212
15	NC_008578	AAG	2	6	1023	1028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117927212
16	NC_008578	GCG	2	6	1029	1034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927212
17	NC_008578	AAG	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117927212
18	NC_008578	GGT	2	6	1181	1186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927212
19	NC_008578	TCA	2	6	1237	1242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117927212
20	NC_008578	ACG	2	6	1407	1412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927212
21	NC_008578	GAT	2	6	1513	1518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927212
22	NC_008578	GAC	2	6	1571	1576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008578	ATC	2	6	1678	1683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008578	GTC	2	6	1732	1737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008578	CAC	2	6	1818	1823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_008578	TGC	2	6	2240	2245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927213
27	NC_008578	GAG	2	6	2251	2256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927213
28	NC_008578	GCC	2	6	2268	2273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927213
29	NC_008578	GTG	2	6	2335	2340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927213
30	NC_008578	CGA	2	6	2352	2357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927213
31	NC_008578	TGA	2	6	2405	2410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927213
32	NC_008578	GGC	2	6	2415	2420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927213
33	NC_008578	CGG	2	6	2486	2491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927213
34	NC_008578	GAC	2	6	2535	2540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927213
35	NC_008578	ACG	3	9	2635	2643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927213
36	NC_008578	CGG	2	6	2687	2692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927213
37	NC_008578	CGC	2	6	2743	2748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927213
38	NC_008578	AGC	2	6	2872	2877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927213
39	NC_008578	GAC	3	9	2952	2960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927213
40	NC_008578	CAA	2	6	2979	2984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117927213
41	NC_008578	CGG	2	6	2987	2992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927213
42	NC_008578	CGA	2	6	3039	3044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927213
43	NC_008578	GGC	2	6	3076	3081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927213
44	NC_008578	TCG	2	6	3179	3184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927214
45	NC_008578	TCG	2	6	3212	3217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927214
46	NC_008578	GCC	2	6	3329	3334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927214
47	NC_008578	CGC	2	6	3403	3408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927214
48	NC_008578	GTC	2	6	3436	3441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927214
49	NC_008578	GGA	2	6	3453	3458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927214
50	NC_008578	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927214
51	NC_008578	TTC	2	6	3587	3592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117927214
52	NC_008578	CAG	2	6	3613	3618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927214
53	NC_008578	ACG	3	9	3687	3695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927214
54	NC_008578	TCG	2	6	3719	3724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927214
55	NC_008578	CGC	2	6	3735	3740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927214
56	NC_008578	GGC	2	6	3748	3753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927214
57	NC_008578	GAA	2	6	3793	3798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117927214
58	NC_008578	CGA	2	6	3813	3818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927214
59	NC_008578	CGC	2	6	3843	3848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927214
60	NC_008578	TCG	2	6	3893	3898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927214
61	NC_008578	GAT	2	6	3910	3915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927214
62	NC_008578	GCC	2	6	3935	3940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927214
63	NC_008578	GCT	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927214
64	NC_008578	TGA	2	6	4040	4045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927214
65	NC_008578	GAC	2	6	4051	4056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927214
66	NC_008578	CAG	2	6	4075	4080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927214
67	NC_008578	TCA	2	6	4127	4132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117927214
68	NC_008578	CGT	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927214
69	NC_008578	GGC	2	6	4258	4263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927215
70	NC_008578	CGG	2	6	4289	4294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927215
71	NC_008578	GCC	2	6	4303	4308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927215
72	NC_008578	CGC	2	6	4322	4327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927215
73	NC_008578	CTT	2	6	4358	4363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117927215
74	NC_008578	ATC	2	6	4448	4453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117927215
75	NC_008578	CTT	2	6	4550	4555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117927215
76	NC_008578	AGG	2	6	4581	4586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927215
77	NC_008578	CCG	2	6	4587	4592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927215
78	NC_008578	ACG	2	6	4802	4807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008578	GCT	2	6	4835	4840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008578	GCG	2	6	4882	4887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008578	GCG	2	6	4923	4928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008578	GGA	2	6	4935	4940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008578	AGT	2	6	4974	4979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117927216
84	NC_008578	ACG	2	6	4981	4986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
85	NC_008578	CAC	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117927216
86	NC_008578	GGT	2	6	5090	5095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927216
87	NC_008578	CGA	2	6	5108	5113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
88	NC_008578	CGG	2	6	5162	5167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927216
89	NC_008578	CGA	2	6	5204	5209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
90	NC_008578	CGG	2	6	5230	5235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927216
91	NC_008578	GGC	2	6	5277	5282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927216
92	NC_008578	CGT	2	6	5327	5332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927216
93	NC_008578	GGC	2	6	5386	5391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927216
94	NC_008578	CCG	2	6	5399	5404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927216
95	NC_008578	ACG	2	6	5457	5462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
96	NC_008578	GAC	2	6	5495	5500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
97	NC_008578	CCG	2	6	5590	5595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927216
98	NC_008578	CGA	2	6	5609	5614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
99	NC_008578	GCG	2	6	5632	5637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927216
100	NC_008578	TTA	2	6	5654	5659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117927216
101	NC_008578	ACG	2	6	5665	5670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
102	NC_008578	TGG	2	6	5677	5682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927216
103	NC_008578	GCA	2	6	5725	5730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
104	NC_008578	TGC	2	6	5876	5881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927216
105	NC_008578	GAG	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927216
106	NC_008578	TCA	2	6	5923	5928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117927216
107	NC_008578	GAA	2	6	6104	6109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117927216
108	NC_008578	GGC	2	6	6149	6154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927216
109	NC_008578	CGG	2	6	6215	6220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927216
110	NC_008578	GGA	2	6	6266	6271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927216
111	NC_008578	TCG	2	6	6286	6291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927216
112	NC_008578	AAC	2	6	6411	6416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117927216
113	NC_008578	ACG	2	6	6457	6462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
114	NC_008578	GGT	2	6	6494	6499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927216
115	NC_008578	CTC	3	9	6543	6551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117927216
116	NC_008578	GCC	2	6	6702	6707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927216
117	NC_008578	GAA	2	6	6710	6715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117927216
118	NC_008578	GAC	2	6	6782	6787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
119	NC_008578	CGA	2	6	6830	6835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
120	NC_008578	GCG	2	6	6837	6842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927216
121	NC_008578	TCT	2	6	6856	6861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117927216
122	NC_008578	CGA	2	6	6875	6880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927216
123	NC_008578	CAG	2	6	6949	6954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008578	CGA	2	6	6958	6963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008578	GGC	2	6	7013	7018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117927217
126	NC_008578	TCG	2	6	7086	7091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927217
127	NC_008578	ACG	2	6	7158	7163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117927217
128	NC_008578	GGT	2	6	7204	7209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927217
129	NC_008578	ACC	2	6	7230	7235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117927217
130	NC_008578	TGC	2	6	7246	7251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927217
131	NC_008578	TCG	2	6	7305	7310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927217
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493	NC_008578	CCT	2	6	24547	24552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
494	NC_008578	CTG	2	6	24574	24579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
495	NC_008578	GTT	2	6	24671	24676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
496	NC_008578	CAC	2	6	24779	24784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
497	NC_008578	GTG	2	6	24830	24835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117927236
498	NC_008578	CCG	2	6	24836	24841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117927236
499	NC_008578	GAG	2	6	24874	24879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117927236
500	NC_008578	GTC	2	6	24901	24906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117927236

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