MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidothermus cellulolyticus 11B chromosome

Total Repeats: 48605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_008578	TCG	2	6	2438076	2438081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117929361
48502	NC_008578	TCG	2	6	2438118	2438123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117929361
48503	NC_008578	CGA	2	6	2438238	2438243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117929361
48504	NC_008578	TCT	2	6	2438266	2438271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117929361
48505	NC_008578	CCT	2	6	2438363	2438368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48506	NC_008578	GCC	2	6	2438563	2438568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117929362
48507	NC_008578	CGG	2	6	2438612	2438617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117929362
48508	NC_008578	TCA	2	6	2438633	2438638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117929362
48509	NC_008578	TCC	2	6	2438756	2438761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117929362
48510	NC_008578	CGT	2	6	2438762	2438767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117929362
48511	NC_008578	AGC	2	6	2438839	2438844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117929362
48512	NC_008578	GTA	2	6	2438865	2438870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117929362
48513	NC_008578	TCC	2	6	2438896	2438901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117929362
48514	NC_008578	GGC	2	6	2438976	2438981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117929362
48515	NC_008578	CGC	3	9	2439249	2439257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117929362
48516	NC_008578	CGT	2	6	2439270	2439275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117929362
48517	NC_008578	CGC	2	6	2439287	2439292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117929362
48518	NC_008578	GCC	2	6	2439373	2439378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117929362
48519	NC_008578	GTC	2	6	2439396	2439401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117929362
48520	NC_008578	CCG	2	6	2439480	2439485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48521	NC_008578	CAG	2	6	2439527	2439532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48522	NC_008578	ATC	2	6	2439555	2439560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48523	NC_008578	GCG	2	6	2439674	2439679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48524	NC_008578	CTT	2	6	2439682	2439687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48525	NC_008578	CGG	2	6	2439688	2439693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48526	NC_008578	TGC	2	6	2439817	2439822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48527	NC_008578	GAC	2	6	2439826	2439831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48528	NC_008578	ACG	2	6	2439856	2439861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48529	NC_008578	TGA	2	6	2439880	2439885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117929363
48530	NC_008578	ACG	2	6	2439891	2439896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117929363
48531	NC_008578	CGA	2	6	2439906	2439911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117929363
48532	NC_008578	CAG	2	6	2440007	2440012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117929363
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48534	NC_008578	AAG	2	6	2440061	2440066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117929363
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48543	NC_008578	GCA	2	6	2440573	2440578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48544	NC_008578	TCG	2	6	2440603	2440608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117929364
48545	NC_008578	ACG	2	6	2440642	2440647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117929364
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48550	NC_008578	CGA	2	6	2440958	2440963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117929364
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48553	NC_008578	GCC	2	6	2441124	2441129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117929364
48554	NC_008578	CGT	2	6	2441153	2441158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117929364
48555	NC_008578	ACG	2	6	2441170	2441175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117929364
48556	NC_008578	CCT	2	6	2441194	2441199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48557	NC_008578	CTA	2	6	2441233	2441238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117929365
48558	NC_008578	TGC	2	6	2441280	2441285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117929365
48559	NC_008578	GCG	2	6	2441286	2441291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117929365
48560	NC_008578	CTG	2	6	2441302	2441307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117929365
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48565	NC_008578	CGG	2	6	2441506	2441511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117929365
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48569	NC_008578	TTC	2	6	2441567	2441572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117929365
48570	NC_008578	CGT	3	9	2441599	2441607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117929365
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48586	NC_008578	CAG	2	6	2442542	2442547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117929367
48587	NC_008578	CAG	2	6	2442559	2442564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117929367
48588	NC_008578	GCG	2	6	2442588	2442593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117929367
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48599	NC_008578	GCG	2	6	2443106	2443111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48600	NC_008578	ACG	2	6	2443125	2443130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48601	NC_008578	TCA	2	6	2443228	2443233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48602	NC_008578	AAG	2	6	2443279	2443284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48603	NC_008578	GGT	2	6	2443317	2443322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48604	NC_008578	CCT	2	6	2443377	2443382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48605	NC_008578	CGG	2	6	2443433	2443438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.