MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alcanivorax borkumensis SK2 chromosome

Total Repeats: 1684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008260	GCAGC	2	10	475	484	20 %	0 %	40 %	40 %	110832862
2	NC_008260	AATCC	2	10	1367	1376	40 %	20 %	0 %	40 %	110832862
3	NC_008260	CTGTT	2	10	2991	3000	0 %	60 %	20 %	20 %	110832864
4	NC_008260	GCTTG	2	10	6987	6996	0 %	40 %	40 %	20 %	110832867
5	NC_008260	TTTGC	2	10	8933	8942	0 %	60 %	20 %	20 %	110832869
6	NC_008260	GGTTG	2	10	10010	10019	0 %	40 %	60 %	0 %	110832869
7	NC_008260	CCCAG	2	10	10866	10875	20 %	0 %	20 %	60 %	110832870
8	NC_008260	ACCGA	2	10	12346	12355	40 %	0 %	20 %	40 %	110832872
9	NC_008260	TGACG	2	10	15082	15091	20 %	20 %	40 %	20 %	110832874
10	NC_008260	ATTCG	2	10	17455	17464	20 %	40 %	20 %	20 %	110832876
11	NC_008260	AGTGA	2	10	17480	17489	40 %	20 %	40 %	0 %	110832876
12	NC_008260	GCCCT	2	10	19002	19011	0 %	20 %	20 %	60 %	110832876
13	NC_008260	AAACT	2	10	20039	20048	60 %	20 %	0 %	20 %	110832878
14	NC_008260	GTCCC	2	10	20507	20516	0 %	20 %	20 %	60 %	110832879
15	NC_008260	TTTGG	2	10	21106	21115	0 %	60 %	40 %	0 %	110832879
16	NC_008260	CGCTA	2	10	21322	21331	20 %	20 %	20 %	40 %	110832880
17	NC_008260	ACCGC	2	10	22981	22990	20 %	0 %	20 %	60 %	110832881
18	NC_008260	ATCGC	2	10	27819	27828	20 %	20 %	20 %	40 %	110832886
19	NC_008260	TCCAG	2	10	28809	28818	20 %	20 %	20 %	40 %	110832887
20	NC_008260	GCCAA	2	10	30733	30742	40 %	0 %	20 %	40 %	110832889
21	NC_008260	GGGCT	2	10	31212	31221	0 %	20 %	60 %	20 %	110832889
22	NC_008260	GGTTT	2	10	31798	31807	0 %	60 %	40 %	0 %	110832890
23	NC_008260	AACGC	2	10	32274	32283	40 %	0 %	20 %	40 %	110832891
24	NC_008260	TCAGT	2	10	32709	32718	20 %	40 %	20 %	20 %	110832891
25	NC_008260	GCATC	2	10	32784	32793	20 %	20 %	20 %	40 %	110832891
26	NC_008260	CAGCC	2	10	33765	33774	20 %	0 %	20 %	60 %	110832893
27	NC_008260	GCTGC	2	10	34398	34407	0 %	20 %	40 %	40 %	110832892
28	NC_008260	AAACG	2	10	35442	35451	60 %	0 %	20 %	20 %	110832894
29	NC_008260	TGAGC	2	10	35600	35609	20 %	20 %	40 %	20 %	110832895
30	NC_008260	TGCCT	2	10	38286	38295	0 %	40 %	20 %	40 %	110832897
31	NC_008260	CTTGG	2	10	39150	39159	0 %	40 %	40 %	20 %	110832898
32	NC_008260	GCCAT	2	10	41667	41676	20 %	20 %	20 %	40 %	110832902
33	NC_008260	GGGTT	2	10	49984	49993	0 %	40 %	60 %	0 %	110832907
34	NC_008260	AGCCG	2	10	54906	54915	20 %	0 %	40 %	40 %	110832914
35	NC_008260	CATGG	2	10	55099	55108	20 %	20 %	40 %	20 %	110832914
36	NC_008260	TTCTT	2	10	57179	57188	0 %	80 %	0 %	20 %	110832916
37	NC_008260	AGAGC	2	10	58511	58520	40 %	0 %	40 %	20 %	110832917
38	NC_008260	TTGGG	2	10	60577	60586	0 %	40 %	60 %	0 %	110832919
39	NC_008260	ATGGA	2	10	63957	63966	40 %	20 %	40 %	0 %	110832922
40	NC_008260	AGCCC	2	10	73989	73998	20 %	0 %	20 %	60 %	110832931
41	NC_008260	GCACA	2	10	78071	78080	40 %	0 %	20 %	40 %	110832935
42	NC_008260	GTTAT	2	10	79373	79382	20 %	60 %	20 %	0 %	110832936
43	NC_008260	TGGAG	2	10	80014	80023	20 %	20 %	60 %	0 %	110832936
44	NC_008260	GGGCA	2	10	81596	81605	20 %	0 %	60 %	20 %	110832937
45	NC_008260	CTGTC	2	10	83049	83058	0 %	40 %	20 %	40 %	110832939
46	NC_008260	TAGCG	2	10	84903	84912	20 %	20 %	40 %	20 %	110832941
47	NC_008260	GGCGC	2	10	85125	85134	0 %	0 %	60 %	40 %	110832941
48	NC_008260	CAGCC	2	10	85926	85935	20 %	0 %	20 %	60 %	110832941
49	NC_008260	AGGGC	2	10	91674	91683	20 %	0 %	60 %	20 %	110832947
50	NC_008260	CAGCA	2	10	91808	91817	40 %	0 %	20 %	40 %	110832947
51	NC_008260	CTTGT	2	10	93627	93636	0 %	60 %	20 %	20 %	110832949
52	NC_008260	GCCGC	2	10	95404	95413	0 %	0 %	40 %	60 %	110832951
53	NC_008260	GGCCC	2	10	96131	96140	0 %	0 %	40 %	60 %	110832952
54	NC_008260	CCCTG	2	10	97755	97764	0 %	20 %	20 %	60 %	110832954
55	NC_008260	ATTTC	2	10	99289	99298	20 %	60 %	0 %	20 %	110832956
56	NC_008260	CACCC	2	10	103087	103096	20 %	0 %	0 %	80 %	110832961
57	NC_008260	CAGGG	2	10	103159	103168	20 %	0 %	60 %	20 %	110832961
58	NC_008260	GCGTA	2	10	103688	103697	20 %	20 %	40 %	20 %	110832961
59	NC_008260	CGGGT	2	10	104633	104642	0 %	20 %	60 %	20 %	110832962
60	NC_008260	TTGAT	2	10	108409	108418	20 %	60 %	20 %	0 %	110832965
61	NC_008260	GGCAA	2	10	108826	108835	40 %	0 %	40 %	20 %	110832965
62	NC_008260	CAAAT	2	10	108957	108966	60 %	20 %	0 %	20 %	110832965
63	NC_008260	GGGGC	2	10	112585	112594	0 %	0 %	80 %	20 %	110832965
64	NC_008260	TGGTC	2	10	114915	114924	0 %	40 %	40 %	20 %	110832967
65	NC_008260	AGGGA	2	10	116006	116015	40 %	0 %	60 %	0 %	110832967
66	NC_008260	TGGTG	2	10	118190	118199	0 %	40 %	60 %	0 %	110832971
67	NC_008260	GCCTT	2	10	121022	121031	0 %	40 %	20 %	40 %	110832974
68	NC_008260	TTGCC	2	10	122997	123006	0 %	40 %	20 %	40 %	110832976
69	NC_008260	CACCC	2	10	124631	124640	20 %	0 %	0 %	80 %	110832978
70	NC_008260	GGCTG	2	10	128264	128273	0 %	20 %	60 %	20 %	110832981
71	NC_008260	GTCTT	2	10	132898	132907	0 %	60 %	20 %	20 %	110832985
72	NC_008260	TGGGT	2	10	133704	133713	0 %	40 %	60 %	0 %	110832986
73	NC_008260	GAGCT	2	10	134086	134095	20 %	20 %	40 %	20 %	110832986
74	NC_008260	GCAAA	2	10	137228	137237	60 %	0 %	20 %	20 %	110832988
75	NC_008260	GTTCG	2	10	138570	138579	0 %	40 %	40 %	20 %	110832989
76	NC_008260	GGGCA	2	10	139509	139518	20 %	0 %	60 %	20 %	110832989
77	NC_008260	TCTCG	2	10	140038	140047	0 %	40 %	20 %	40 %	110832990
78	NC_008260	GCTTA	2	10	141528	141537	20 %	40 %	20 %	20 %	110832991
79	NC_008260	TGGCG	2	10	141567	141576	0 %	20 %	60 %	20 %	110832991
80	NC_008260	CAGCC	2	10	141835	141844	20 %	0 %	20 %	60 %	110832991
81	NC_008260	CCGAA	2	10	146711	146720	40 %	0 %	20 %	40 %	110832996
82	NC_008260	CGGTG	2	10	147044	147053	0 %	20 %	60 %	20 %	110832997
83	NC_008260	GGCGG	2	10	147864	147873	0 %	0 %	80 %	20 %	110832998
84	NC_008260	ACCTG	2	10	151275	151284	20 %	20 %	20 %	40 %	110833001
85	NC_008260	CTTGC	2	10	152864	152873	0 %	40 %	20 %	40 %	110833003
86	NC_008260	TTGGC	2	10	154559	154568	0 %	40 %	40 %	20 %	110833005
87	NC_008260	TGCGG	2	10	154953	154962	0 %	20 %	60 %	20 %	110833005
88	NC_008260	GGGCT	2	10	155182	155191	0 %	20 %	60 %	20 %	110833005
89	NC_008260	TAGCC	2	10	159961	159970	20 %	20 %	20 %	40 %	110833011
90	NC_008260	TAGGG	2	10	163148	163157	20 %	20 %	60 %	0 %	110833015
91	NC_008260	CCCGG	2	10	164149	164158	0 %	0 %	40 %	60 %	110833016
92	NC_008260	ACCAC	2	10	164564	164573	40 %	0 %	0 %	60 %	110833016
93	NC_008260	GCTGT	2	10	165076	165085	0 %	40 %	40 %	20 %	110833017
94	NC_008260	CTGGC	2	10	166801	166810	0 %	20 %	40 %	40 %	110833019
95	NC_008260	ATGAA	2	10	170359	170368	60 %	20 %	20 %	0 %	110833022
96	NC_008260	ACGCC	2	10	170451	170460	20 %	0 %	20 %	60 %	110833022
97	NC_008260	TGGAT	2	10	174323	174332	20 %	40 %	40 %	0 %	110833027
98	NC_008260	AACGG	2	10	178439	178448	40 %	0 %	40 %	20 %	110833029
99	NC_008260	GCATC	2	10	179800	179809	20 %	20 %	20 %	40 %	110833031
100	NC_008260	GTGGA	2	10	179841	179850	20 %	20 %	60 %	0 %	110833031
101	NC_008260	GCTTG	2	10	181501	181510	0 %	40 %	40 %	20 %	110833033
102	NC_008260	AGTGC	2	10	181928	181937	20 %	20 %	40 %	20 %	110833033
103	NC_008260	TTCCG	2	10	181980	181989	0 %	40 %	20 %	40 %	110833033
104	NC_008260	TGGTA	2	10	182420	182429	20 %	40 %	40 %	0 %	110833033
105	NC_008260	TGGCG	2	10	185245	185254	0 %	20 %	60 %	20 %	110833037
106	NC_008260	CCGGC	2	10	190221	190230	0 %	0 %	40 %	60 %	110833041
107	NC_008260	GTTCG	2	10	190237	190246	0 %	40 %	40 %	20 %	110833041
108	NC_008260	TGAGG	2	10	196519	196528	20 %	20 %	60 %	0 %	110833046
109	NC_008260	CTTGC	2	10	200992	201001	0 %	40 %	20 %	40 %	110833050
110	NC_008260	TGGCC	2	10	201762	201771	0 %	20 %	40 %	40 %	110833050
111	NC_008260	ACTCC	2	10	203016	203025	20 %	20 %	0 %	60 %	110833051
112	NC_008260	CGTAG	2	10	203249	203258	20 %	20 %	40 %	20 %	110833051
113	NC_008260	GCGCC	2	10	209089	209098	0 %	0 %	40 %	60 %	110833054
114	NC_008260	GCTTT	2	10	209392	209401	0 %	60 %	20 %	20 %	110833054
115	NC_008260	CGTAG	2	10	209497	209506	20 %	20 %	40 %	20 %	110833054
116	NC_008260	GTTTT	2	10	209959	209968	0 %	80 %	20 %	0 %	110833054
117	NC_008260	TGTCG	2	10	211995	212004	0 %	40 %	40 %	20 %	110833056
118	NC_008260	ATCAC	2	10	213932	213941	40 %	20 %	0 %	40 %	110833058
119	NC_008260	GTAGA	2	10	214084	214093	40 %	20 %	40 %	0 %	110833058
120	NC_008260	TCAGA	2	10	220715	220724	40 %	20 %	20 %	20 %	110833064
121	NC_008260	TGAGC	2	10	224447	224456	20 %	20 %	40 %	20 %	110833067
122	NC_008260	TGGTG	2	10	226012	226021	0 %	40 %	60 %	0 %	110833069
123	NC_008260	GAACC	2	10	226027	226036	40 %	0 %	20 %	40 %	110833069
124	NC_008260	CCAAG	2	10	226129	226138	40 %	0 %	20 %	40 %	110833069
125	NC_008260	CCTGG	2	10	226656	226665	0 %	20 %	40 %	40 %	110833070
126	NC_008260	CCGGC	2	10	231998	232007	0 %	0 %	40 %	60 %	110833074
127	NC_008260	TGATT	2	10	238384	238393	20 %	60 %	20 %	0 %	110833081
128	NC_008260	TGCAG	2	10	239439	239448	20 %	20 %	40 %	20 %	110833082
129	NC_008260	TGCGC	2	10	239664	239673	0 %	20 %	40 %	40 %	110833082
130	NC_008260	GTGCG	2	10	240661	240670	0 %	20 %	60 %	20 %	110833083
131	NC_008260	GGAGT	2	10	242488	242497	20 %	20 %	60 %	0 %	110833085
132	NC_008260	TTGGT	2	10	242918	242927	0 %	60 %	40 %	0 %	110833087
133	NC_008260	GCAAG	2	10	244484	244493	40 %	0 %	40 %	20 %	110833087
134	NC_008260	TGTTT	2	10	248552	248561	0 %	80 %	20 %	0 %	110833092
135	NC_008260	CATCG	2	10	250275	250284	20 %	20 %	20 %	40 %	110833093
136	NC_008260	TGGCT	2	10	251602	251611	0 %	40 %	40 %	20 %	110833094
137	NC_008260	GCTCA	2	10	254276	254285	20 %	20 %	20 %	40 %	110833096
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142	NC_008260	GGTTA	2	10	262720	262729	20 %	40 %	40 %	0 %	110833103
143	NC_008260	GGTGA	2	10	267765	267774	20 %	20 %	60 %	0 %	110833110
144	NC_008260	CTGCG	2	10	268862	268871	0 %	20 %	40 %	40 %	110833110
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149	NC_008260	GTTGG	2	10	279543	279552	0 %	40 %	60 %	0 %	110833120
150	NC_008260	GGCCA	2	10	280443	280452	20 %	0 %	40 %	40 %	110833121
151	NC_008260	GAAAC	2	10	284557	284566	60 %	0 %	20 %	20 %	110833125
152	NC_008260	CAAGC	2	10	287121	287130	40 %	0 %	20 %	40 %	110833127
153	NC_008260	TGCTC	2	10	289567	289576	0 %	40 %	20 %	40 %	110833127
154	NC_008260	CGATA	2	10	290763	290772	40 %	20 %	20 %	20 %	110833128
155	NC_008260	TCCGC	2	10	292858	292867	0 %	20 %	20 %	60 %	110833130
156	NC_008260	CGTAG	2	10	294978	294987	20 %	20 %	40 %	20 %	110833131
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163	NC_008260	GCGTG	2	10	311021	311030	0 %	20 %	60 %	20 %	110833146
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167	NC_008260	GGTCA	2	10	318194	318203	20 %	20 %	40 %	20 %	110833152
168	NC_008260	TGACC	2	10	319018	319027	20 %	20 %	20 %	40 %	110833152
169	NC_008260	GTTAC	2	10	322459	322468	20 %	40 %	20 %	20 %	110833156
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172	NC_008260	GGCAG	2	10	324870	324879	20 %	0 %	60 %	20 %	110833158
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251	NC_008260	TGCGC	2	10	479124	479133	0 %	20 %	40 %	40 %	110833299
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259	NC_008260	TGGTG	2	10	494832	494841	0 %	40 %	60 %	0 %	110833316
260	NC_008260	TTGGC	2	10	497467	497476	0 %	40 %	40 %	20 %	110833318
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