MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alcanivorax borkumensis SK2 chromosome

Total Repeats: 1684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008260	AACTT	2	10	2777294	2777303	40 %	40 %	0 %	20 %	110835314
1502	NC_008260	CTGGG	2	10	2778220	2778229	0 %	20 %	60 %	20 %	110835314
1503	NC_008260	GCGAT	2	10	2779668	2779677	20 %	20 %	40 %	20 %	110835315
1504	NC_008260	GGCCT	2	10	2780316	2780325	0 %	20 %	40 %	40 %	110835316
1505	NC_008260	CCCGC	2	10	2781492	2781501	0 %	0 %	20 %	80 %	110835317
1506	NC_008260	GTGAC	2	10	2781621	2781630	20 %	20 %	40 %	20 %	110835317
1507	NC_008260	GTCAT	2	10	2782430	2782439	20 %	40 %	20 %	20 %	110835318
1508	NC_008260	CGTGC	2	10	2783628	2783637	0 %	20 %	40 %	40 %	110835320
1509	NC_008260	GTATC	2	10	2785053	2785062	20 %	40 %	20 %	20 %	110835321
1510	NC_008260	CCCTG	2	10	2785080	2785089	0 %	20 %	20 %	60 %	110835321
1511	NC_008260	TCCTC	2	10	2785385	2785394	0 %	40 %	0 %	60 %	110835321
1512	NC_008260	ACCGC	2	10	2787095	2787104	20 %	0 %	20 %	60 %	110835322
1513	NC_008260	CCAGA	2	10	2787599	2787608	40 %	0 %	20 %	40 %	110835322
1514	NC_008260	CTGAA	2	10	2789221	2789230	40 %	20 %	20 %	20 %	110835324
1515	NC_008260	ATCTT	2	10	2789420	2789429	20 %	60 %	0 %	20 %	110835324
1516	NC_008260	CAAGC	2	10	2794020	2794029	40 %	0 %	20 %	40 %	110835327
1517	NC_008260	CGCCA	2	10	2794675	2794684	20 %	0 %	20 %	60 %	110835327
1518	NC_008260	TATTT	2	10	2796324	2796333	20 %	80 %	0 %	0 %	110835328
1519	NC_008260	GGCCA	2	10	2801525	2801534	20 %	0 %	40 %	40 %	110835332
1520	NC_008260	GGCCA	2	10	2801585	2801594	20 %	0 %	40 %	40 %	110835332
1521	NC_008260	GGGTC	2	10	2804634	2804643	0 %	20 %	60 %	20 %	110835334
1522	NC_008260	CAGCG	2	10	2808635	2808644	20 %	0 %	40 %	40 %	110835338
1523	NC_008260	CAGCG	2	10	2810486	2810495	20 %	0 %	40 %	40 %	110835340
1524	NC_008260	TGCCC	2	10	2812989	2812998	0 %	20 %	20 %	60 %	110835342
1525	NC_008260	CAGTG	2	10	2814857	2814866	20 %	20 %	40 %	20 %	110835343
1526	NC_008260	CCAAA	2	10	2815268	2815277	60 %	0 %	0 %	40 %	110835343
1527	NC_008260	CCAGA	2	10	2818006	2818015	40 %	0 %	20 %	40 %	110835345
1528	NC_008260	ACGCC	2	10	2818773	2818782	20 %	0 %	20 %	60 %	110835346
1529	NC_008260	AATCA	2	10	2826215	2826224	60 %	20 %	0 %	20 %	110835354
1530	NC_008260	ATCGG	2	10	2826648	2826657	20 %	20 %	40 %	20 %	110835354
1531	NC_008260	CCACT	2	10	2827718	2827727	20 %	20 %	0 %	60 %	110835354
1532	NC_008260	GGCCC	2	10	2833791	2833800	0 %	0 %	40 %	60 %	110835360
1533	NC_008260	GCTCT	2	10	2836388	2836397	0 %	40 %	20 %	40 %	110835361
1534	NC_008260	TTGCC	2	10	2836968	2836977	0 %	40 %	20 %	40 %	110835362
1535	NC_008260	CGTAC	2	10	2839477	2839486	20 %	20 %	20 %	40 %	110835363
1536	NC_008260	GGAAT	2	10	2841358	2841367	40 %	20 %	40 %	0 %	110835366
1537	NC_008260	GGGCT	2	10	2847890	2847899	0 %	20 %	60 %	20 %	110835371
1538	NC_008260	GGCTG	2	10	2849884	2849893	0 %	20 %	60 %	20 %	110835373
1539	NC_008260	ACCGT	2	10	2853044	2853053	20 %	20 %	20 %	40 %	110835377
1540	NC_008260	CGTGG	2	10	2854082	2854091	0 %	20 %	60 %	20 %	110835377
1541	NC_008260	GCGGT	2	10	2856202	2856211	0 %	20 %	60 %	20 %	110835379
1542	NC_008260	ACTGG	2	10	2861765	2861774	20 %	20 %	40 %	20 %	110835383
1543	NC_008260	CCGGG	2	10	2863639	2863648	0 %	0 %	60 %	40 %	110835384
1544	NC_008260	CCTGC	2	10	2863757	2863766	0 %	20 %	20 %	60 %	110835384
1545	NC_008260	TTCAA	2	10	2869365	2869374	40 %	40 %	0 %	20 %	110835390
1546	NC_008260	CGGTG	2	10	2876966	2876975	0 %	20 %	60 %	20 %	110835398
1547	NC_008260	TGACC	2	10	2877541	2877550	20 %	20 %	20 %	40 %	110835399
1548	NC_008260	GGCGC	2	10	2878074	2878083	0 %	0 %	60 %	40 %	110835399
1549	NC_008260	ACGCC	2	10	2878547	2878556	20 %	0 %	20 %	60 %	110835399
1550	NC_008260	AGCAC	2	10	2882888	2882897	40 %	0 %	20 %	40 %	110835402
1551	NC_008260	AAGCA	2	10	2883116	2883125	60 %	0 %	20 %	20 %	110835402
1552	NC_008260	CACCG	2	10	2885250	2885259	20 %	0 %	20 %	60 %	110835405
1553	NC_008260	CGCAT	2	10	2885302	2885311	20 %	20 %	20 %	40 %	110835405
1554	NC_008260	CCGTT	2	10	2888157	2888166	0 %	40 %	20 %	40 %	110835408
1555	NC_008260	CGGCG	2	10	2888379	2888388	0 %	0 %	60 %	40 %	110835408
1556	NC_008260	CGTGG	2	10	2889423	2889432	0 %	20 %	60 %	20 %	110835408
1557	NC_008260	CAGCT	2	10	2890588	2890597	20 %	20 %	20 %	40 %	110835410
1558	NC_008260	ACACC	2	10	2895363	2895372	40 %	0 %	0 %	60 %	110835416
1559	NC_008260	TTTCC	2	10	2895416	2895425	0 %	60 %	0 %	40 %	110835416
1560	NC_008260	AAAAC	2	10	2896616	2896625	80 %	0 %	0 %	20 %	110835417
1561	NC_008260	TACGT	2	10	2898407	2898416	20 %	40 %	20 %	20 %	110835419
1562	NC_008260	CAATG	2	10	2902947	2902956	40 %	20 %	20 %	20 %	110835422
1563	NC_008260	GAACG	2	10	2903979	2903988	40 %	0 %	40 %	20 %	110835423
1564	NC_008260	CAAAG	2	10	2905181	2905190	60 %	0 %	20 %	20 %	110835425
1565	NC_008260	GAAGG	2	10	2905521	2905530	40 %	0 %	60 %	0 %	110835425
1566	NC_008260	TGGCC	2	10	2906559	2906568	0 %	20 %	40 %	40 %	110835426
1567	NC_008260	CCAAC	2	10	2911262	2911271	40 %	0 %	0 %	60 %	110835430
1568	NC_008260	GCTCT	2	10	2911946	2911955	0 %	40 %	20 %	40 %	110835430
1569	NC_008260	TCACC	2	10	2914984	2914993	20 %	20 %	0 %	60 %	110835435
1570	NC_008260	CCCAG	2	10	2916386	2916395	20 %	0 %	20 %	60 %	110835436
1571	NC_008260	TCGTT	2	10	2920156	2920165	0 %	60 %	20 %	20 %	110835440
1572	NC_008260	ATCGC	2	10	2922627	2922636	20 %	20 %	20 %	40 %	110835443
1573	NC_008260	CCGGC	2	10	2925830	2925839	0 %	0 %	40 %	60 %	110835445
1574	NC_008260	CATTT	2	10	2927643	2927652	20 %	60 %	0 %	20 %	110835447
1575	NC_008260	TGGCT	2	10	2927726	2927735	0 %	40 %	40 %	20 %	110835447
1576	NC_008260	GCGAT	2	10	2928520	2928529	20 %	20 %	40 %	20 %	110835448
1577	NC_008260	TGCCG	3	15	2928943	2928957	0 %	20 %	40 %	40 %	110835449
1578	NC_008260	AATAA	2	10	2929860	2929869	80 %	20 %	0 %	0 %	110835451
1579	NC_008260	AAAAT	2	10	2930010	2930019	80 %	20 %	0 %	0 %	110835451
1580	NC_008260	ATCAC	2	10	2936364	2936373	40 %	20 %	0 %	40 %	110835456
1581	NC_008260	AGGCA	2	10	2939551	2939560	40 %	0 %	40 %	20 %	110835457
1582	NC_008260	CAGCA	2	10	2940154	2940163	40 %	0 %	20 %	40 %	110835457
1583	NC_008260	CAGAC	2	10	2941618	2941627	40 %	0 %	20 %	40 %	110835458
1584	NC_008260	GGCTG	2	10	2945023	2945032	0 %	20 %	60 %	20 %	110835461
1585	NC_008260	CCGGC	2	10	2945421	2945430	0 %	0 %	40 %	60 %	110835461
1586	NC_008260	GCCCG	2	10	2947683	2947692	0 %	0 %	40 %	60 %	110835465
1587	NC_008260	ATTGT	2	10	2948109	2948118	20 %	60 %	20 %	0 %	110835465
1588	NC_008260	CCCTG	2	10	2952990	2952999	0 %	20 %	20 %	60 %	110835470
1589	NC_008260	GCACC	2	10	2957595	2957604	20 %	0 %	20 %	60 %	110835475
1590	NC_008260	CCCAG	2	10	2959183	2959192	20 %	0 %	20 %	60 %	110835476
1591	NC_008260	GCCAA	2	10	2961736	2961745	40 %	0 %	20 %	40 %	110835478
1592	NC_008260	ACCGC	2	10	2964206	2964215	20 %	0 %	20 %	60 %	110835480
1593	NC_008260	ATGCC	2	10	2967169	2967178	20 %	20 %	20 %	40 %	110835482
1594	NC_008260	GCTCG	2	10	2968097	2968106	0 %	20 %	40 %	40 %	110835483
1595	NC_008260	GCTGT	2	10	2968500	2968509	0 %	40 %	40 %	20 %	110835483
1596	NC_008260	CCAGC	2	10	2969565	2969574	20 %	0 %	20 %	60 %	110835484
1597	NC_008260	GCGCG	2	10	2971992	2972001	0 %	0 %	60 %	40 %	110835486
1598	NC_008260	CCCCA	2	10	2976792	2976801	20 %	0 %	0 %	80 %	110835491
1599	NC_008260	GCTTC	2	10	2980020	2980029	0 %	40 %	20 %	40 %	110835492
1600	NC_008260	AGGCA	2	10	2981304	2981313	40 %	0 %	40 %	20 %	110835493
1601	NC_008260	CCTTG	2	10	2984806	2984815	0 %	40 %	20 %	40 %	110835499
1602	NC_008260	GGCCG	2	10	2985298	2985307	0 %	0 %	60 %	40 %	110835500
1603	NC_008260	CTGAC	2	10	2986268	2986277	20 %	20 %	20 %	40 %	110835501
1604	NC_008260	CCTGC	2	10	2986645	2986654	0 %	20 %	20 %	60 %	110835501
1605	NC_008260	TGATT	2	10	2987022	2987031	20 %	60 %	20 %	0 %	110835501
1606	NC_008260	ACCTG	2	10	2987214	2987223	20 %	20 %	20 %	40 %	110835502
1607	NC_008260	CCAGA	2	10	2987328	2987337	40 %	0 %	20 %	40 %	110835502
1608	NC_008260	TCACT	2	10	2987869	2987878	20 %	40 %	0 %	40 %	110835502
1609	NC_008260	ACGAT	2	10	2989691	2989700	40 %	20 %	20 %	20 %	110835504
1610	NC_008260	GTCAC	2	10	2989796	2989805	20 %	20 %	20 %	40 %	110835504
1611	NC_008260	GCCGT	2	10	2993324	2993333	0 %	20 %	40 %	40 %	110835507
1612	NC_008260	AGCAA	2	10	2993934	2993943	60 %	0 %	20 %	20 %	110835507
1613	NC_008260	GTAAT	2	10	2995283	2995292	40 %	40 %	20 %	0 %	110835509
1614	NC_008260	CGGGC	2	10	2995422	2995431	0 %	0 %	60 %	40 %	110835509
1615	NC_008260	CCAAG	2	10	2995792	2995801	40 %	0 %	20 %	40 %	110835510
1616	NC_008260	AGCCA	2	10	3001190	3001199	40 %	0 %	20 %	40 %	110835517
1617	NC_008260	GGCTC	2	10	3005783	3005792	0 %	20 %	40 %	40 %	110835520
1618	NC_008260	CCAGA	2	10	3006313	3006322	40 %	0 %	20 %	40 %	110835520
1619	NC_008260	CACGG	2	10	3014022	3014031	20 %	0 %	40 %	40 %	110835527
1620	NC_008260	TCAAA	2	10	3015581	3015590	60 %	20 %	0 %	20 %	110835528
1621	NC_008260	TCGGT	2	10	3015632	3015641	0 %	40 %	40 %	20 %	110835528
1622	NC_008260	CCGGA	2	10	3016569	3016578	20 %	0 %	40 %	40 %	110835529
1623	NC_008260	CCCGC	2	10	3016911	3016920	0 %	0 %	20 %	80 %	110835529
1624	NC_008260	CGGGC	2	10	3017009	3017018	0 %	0 %	60 %	40 %	110835529
1625	NC_008260	GCCCC	2	10	3017592	3017601	0 %	0 %	20 %	80 %	110835530
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1629	NC_008260	CCCGC	2	10	3020892	3020901	0 %	0 %	20 %	80 %	110835534
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1672	NC_008260	CCCCA	2	10	3093872	3093881	20 %	0 %	0 %	80 %	110835598
1673	NC_008260	CGCCC	2	10	3095281	3095290	0 %	0 %	20 %	80 %	110835599
1674	NC_008260	GTTTG	2	10	3095601	3095610	0 %	60 %	40 %	0 %	110835599
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1683	NC_008260	CCGCC	2	10	3117135	3117144	0 %	0 %	20 %	80 %	110835613
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.