MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome

Total Repeats: 605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007295	AAAATA	2	12	1592	1603	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71893360
2	NC_007295	ATTTTG	2	12	5879	5890	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	71893364
3	NC_007295	TAAAAA	2	12	6427	6438	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71893365
4	NC_007295	TCATTT	2	12	6467	6478	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71893365
5	NC_007295	AATTTA	2	12	6591	6602	50 %	50 %	0 %	0 %	71893365
6	NC_007295	AAGAAA	2	12	7071	7082	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	71893365
7	NC_007295	TAATTT	2	12	7973	7984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007295	GAAAAT	2	12	11548	11559	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71893369
9	NC_007295	AATCAA	2	12	14542	14553	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71893371
10	NC_007295	ATTAAC	2	12	15032	15043	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71893373
11	NC_007295	TAATTT	2	12	16008	16019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893374
12	NC_007295	CAAAAA	2	12	18001	18012	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71893377
13	NC_007295	ATTGAA	2	12	21616	21627	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71893378
14	NC_007295	TCAAAA	2	12	21838	21849	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71893378
15	NC_007295	ATTTCA	2	12	21883	21894	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71893378
16	NC_007295	TTTTCA	2	12	22147	22158	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71893378
17	NC_007295	AATAAG	2	12	23568	23579	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71893379
18	NC_007295	TTTCAT	2	12	23763	23774	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71893379
19	NC_007295	TTTTCA	2	12	24548	24559	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71893379
20	NC_007295	TTATTT	2	12	26102	26113	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71893381
21	NC_007295	TGGTTT	2	12	27922	27933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893383
22	NC_007295	TTGAAA	2	12	28651	28662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71893384
23	NC_007295	ATTAAA	2	12	30842	30853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893386
24	NC_007295	TGCAAT	2	12	31574	31585	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893387
25	NC_007295	ATCAAT	2	12	33838	33849	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71893388
26	NC_007295	TTTTTG	2	12	34690	34701	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	71893388
27	NC_007295	GTTCGA	2	12	35424	35435	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	71893388
28	NC_007295	TTATTT	2	12	35616	35627	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71893388
29	NC_007295	TTAAAA	2	12	36733	36744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893389
30	NC_007295	TGAAGT	2	12	38643	38654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893390
31	NC_007295	ATAAAA	2	12	40510	40521	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71893391
32	NC_007295	TTTTAA	2	12	42478	42489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893392
33	NC_007295	AATAAA	2	12	45068	45079	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71893393
34	NC_007295	TTTTGT	2	12	46203	46214	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	71893394
35	NC_007295	AATTTT	2	12	46964	46975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893395
36	NC_007295	GGGAAT	2	12	48236	48247	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	71893396
37	NC_007295	TGAATT	2	12	48809	48820	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71893396
38	NC_007295	ATATTG	2	12	50992	51003	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71893400
39	NC_007295	ATGATT	2	12	51916	51927	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71893400
40	NC_007295	TATAAA	2	12	52524	52535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893401
41	NC_007295	CAAAAA	2	12	52543	52554	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71893401
42	NC_007295	TAATTT	2	12	53111	53122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893402
43	NC_007295	TAATTT	2	12	53605	53616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893403
44	NC_007295	AAAATT	2	12	53637	53648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007295	ATGTTT	2	12	53733	53744	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	71893404
46	NC_007295	GGTATT	2	12	59072	59083	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	71893409
47	NC_007295	TAAAAA	2	12	60669	60680	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007295	AGCAAC	2	12	61081	61092	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	71893411
49	NC_007295	GTCGAA	2	12	62877	62888	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	71893412
50	NC_007295	AATTTT	2	12	63869	63880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893413
51	NC_007295	TGTTTT	2	12	64058	64069	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	71893413
52	NC_007295	GAACAA	2	12	71570	71581	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	71893419
53	NC_007295	TTAATT	2	12	72747	72758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893419
54	NC_007295	GAAAAA	2	12	72809	72820	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	71893419
55	NC_007295	TAAAAT	2	12	73386	73397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893419
56	NC_007295	AACAAA	2	12	74893	74904	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71893419
57	NC_007295	AATCAC	2	12	75645	75656	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	71893419
58	NC_007295	CTAATT	2	12	80166	80177	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71893421
59	NC_007295	TTGAAC	2	12	81906	81917	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893422
60	NC_007295	AATTAA	2	12	82767	82778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893422
61	NC_007295	ATCTGA	2	12	82843	82854	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893422
62	NC_007295	TGGTTT	2	12	83428	83439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893423
63	NC_007295	CAAAAT	2	12	84537	84548	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71893424
64	NC_007295	TTGGTT	2	12	87860	87871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893428
65	NC_007295	TGCAAG	2	12	91435	91446	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	71893430
66	NC_007295	GGAATT	2	12	91481	91492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893430
67	NC_007295	CAAAAA	2	12	93292	93303	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71893433
68	NC_007295	TTTTGC	2	12	94986	94997	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	71893436
69	NC_007295	CATATG	2	12	95036	95047	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893436
70	NC_007295	TTGGTT	2	12	95303	95314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893436
71	NC_007295	TTAGGA	2	12	95548	95559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893436
72	NC_007295	TTCAGG	2	12	97971	97982	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	71893438
73	NC_007295	AATTTT	2	12	98370	98381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893438
74	NC_007295	ATTTTA	2	12	98563	98574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893438
75	NC_007295	TAGTAA	2	12	105027	105038	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71893442
76	NC_007295	TTTCTT	2	12	105356	105367	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	71893442
77	NC_007295	TAAAAC	2	12	105528	105539	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71893442
78	NC_007295	AATTTA	2	12	105960	105971	50 %	50 %	0 %	0 %	71893443
79	NC_007295	TTTTAA	2	12	109575	109586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893444
80	NC_007295	CAAGAA	2	12	110032	110043	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	71893445
81	NC_007295	AAAGAT	2	12	110044	110055	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71893445
82	NC_007295	TAAATT	2	12	111228	111239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007295	TCCAGA	2	12	112340	112351	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	71893447
84	NC_007295	ATTTTT	2	12	114645	114656	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71893448
85	NC_007295	ACAAAA	2	12	115324	115335	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71893448
86	NC_007295	AATTTT	2	12	115713	115724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893448
87	NC_007295	TCATAA	2	12	116851	116862	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_007295	ATTTTT	2	12	117360	117371	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007295	TAATTT	2	12	119887	119898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007295	AAGGAA	2	12	125131	125142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893455
91	NC_007295	AGTTCA	2	12	129692	129703	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893457
92	NC_007295	ATAATT	2	12	129866	129877	50 %	50 %	0 %	0 %	71893457
93	NC_007295	TATAAT	2	12	132937	132948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007295	CTTGAT	2	12	134250	134261	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_007295	TGACTT	2	12	134612	134623	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_007295	GCAATT	2	12	137051	137062	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893460
97	NC_007295	AGGCAA	2	12	137203	137214	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_007295	ATAATT	2	12	141730	141741	50 %	50 %	0 %	0 %	71893462
99	NC_007295	TTTTAA	2	12	142327	142338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893462
100	NC_007295	TTTTTC	3	18	143879	143896	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	71893463
101	NC_007295	TTTAAA	2	12	145640	145651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007295	TTTAAA	2	12	145881	145892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007295	TTTAAT	2	12	147283	147294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007295	ATTTAA	2	12	148657	148668	50 %	50 %	0 %	0 %	71893465
105	NC_007295	ATTGCA	2	12	149545	149556	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893466
106	NC_007295	TATCGT	2	12	150225	150236	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71893466
107	NC_007295	TTGAAC	2	12	150791	150802	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893467
108	NC_007295	AATGTT	2	12	151468	151479	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71893468
109	NC_007295	TGGAGT	2	12	152384	152395	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	71893469
110	NC_007295	TAAAAA	2	12	153932	153943	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007295	TATAAT	2	12	153973	153984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007295	AGATCA	2	12	154258	154269	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71893470
113	NC_007295	AAAAAC	2	12	156191	156202	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_007295	TAAAAA	2	12	156302	156313	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007295	TATAAT	2	12	156342	156353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007295	AGATCA	2	12	156627	156638	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71893473
117	NC_007295	GAATCT	2	12	160930	160941	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893479
118	NC_007295	TTTTTG	2	12	161085	161096	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	71893479
119	NC_007295	AAATTT	2	12	161585	161596	50 %	50 %	0 %	0 %	71893480
120	NC_007295	CTAAAA	2	12	165429	165440	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71893486
121	NC_007295	TTTTGA	2	12	169372	169383	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	71893489
122	NC_007295	AAAGAA	2	12	170111	170122	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	71893489
123	NC_007295	TTGACT	2	12	171839	171850	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71893490
124	NC_007295	TCTTGA	2	12	172743	172754	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71893490
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