MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome

Total Repeats: 605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007295	AAATTG	2	12	729476	729487	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71893914
502	NC_007295	TTTATT	2	12	736360	736371	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71893919
503	NC_007295	TGTTTT	2	12	738829	738840	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	71893920
504	NC_007295	AATTTT	2	12	740065	740076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893921
505	NC_007295	CAAAAC	2	12	744193	744204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893924
506	NC_007295	TTAAAA	2	12	745644	745655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_007295	ATCAAA	2	12	749731	749742	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71893931
508	NC_007295	ATATCG	2	12	752431	752442	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893932
509	NC_007295	TCATAT	2	12	752653	752664	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71893932
510	NC_007295	TTGAAT	2	12	752808	752819	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71893932
511	NC_007295	TCAATT	2	12	753244	753255	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71893932
512	NC_007295	AAATCA	2	12	755914	755925	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71893935
513	NC_007295	AAATAA	2	12	758114	758125	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_007295	TGCTAA	2	12	763698	763709	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893938
515	NC_007295	AAAATT	2	12	764031	764042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893939
516	NC_007295	TCGTTT	2	12	767051	767062	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	71893941
517	NC_007295	AGAAAA	2	12	767074	767085	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	71893941
518	NC_007295	AAACAA	2	12	768136	768147	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71893941
519	NC_007295	AGTTGG	2	12	768450	768461	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	71893942
520	NC_007295	TGAAAA	2	12	768735	768746	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71893942
521	NC_007295	TTGAAC	2	12	770458	770469	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893944
522	NC_007295	TTTCTT	2	12	771014	771025	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
523	NC_007295	ATAATG	2	12	772164	772175	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71893945
524	NC_007295	TTTAAT	2	12	773780	773791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893946
525	NC_007295	AATGAT	2	12	775499	775510	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71893947
526	NC_007295	TTTAAT	2	12	777134	777145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893948
527	NC_007295	TCGACT	2	12	778109	778120	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	71893949
528	NC_007295	TTTAAT	2	12	779138	779149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893949
529	NC_007295	ACTAAA	2	12	780515	780526	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71893950
530	NC_007295	TTTAAT	2	12	782572	782583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893951
531	NC_007295	TAATAT	2	12	784204	784215	50 %	50 %	0 %	0 %	71893952
532	NC_007295	GGCTTA	2	12	785983	785994	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	71893955
533	NC_007295	TAGAAC	2	12	788359	788370	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71893956
534	NC_007295	TAAAAA	2	12	790374	790385	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71893957
535	NC_007295	GAAAAA	2	12	792838	792849	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_007295	AAGGAA	2	12	793326	793337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893961
537	NC_007295	TTAAAG	2	12	794090	794101	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71893962
538	NC_007295	CAAGAT	2	12	796246	796257	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71893962
539	NC_007295	CATATA	2	12	805474	805485	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71893967
540	NC_007295	TTAGAC	2	12	808972	808983	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893968
541	NC_007295	ACCAAA	2	12	812395	812406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893970
542	NC_007295	TTCAAA	2	12	815120	815131	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71893971
543	NC_007295	TATAAT	2	12	817103	817114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_007295	ATTTAT	2	12	817256	817267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_007295	AATTTT	2	12	817954	817965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893973
546	NC_007295	TGGTAA	2	12	818334	818345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893973
547	NC_007295	AAATTT	2	12	818485	818496	50 %	50 %	0 %	0 %	71893973
548	NC_007295	AAATCT	2	12	820667	820678	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71893974
549	NC_007295	TTCATC	2	12	823803	823814	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	71893975
550	NC_007295	ATTACA	2	12	823997	824008	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
551	NC_007295	ATTTTT	2	12	824201	824212	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71893976
552	NC_007295	ATTAAT	2	12	824371	824382	50 %	50 %	0 %	0 %	71893976
553	NC_007295	AAATTT	2	12	825157	825168	50 %	50 %	0 %	0 %	71893976
554	NC_007295	AATGAA	2	12	825176	825187	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71893976
555	NC_007295	GGTTAA	2	12	827850	827861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893978
556	NC_007295	TAAAAA	2	12	829192	829203	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71893978
557	NC_007295	TGATTT	2	12	834262	834273	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	71893983
558	NC_007295	ATTTTA	2	12	834750	834761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893983
559	NC_007295	AAAAGA	2	12	834769	834780	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	71893983
560	NC_007295	CTGAAA	2	12	834933	834944	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71893983
561	NC_007295	TTAAAA	2	12	835260	835271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893983
562	NC_007295	AACAAA	2	12	835474	835485	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71893983
563	NC_007295	TTTTTG	2	12	835971	835982	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	71893983
564	NC_007295	ATTTTT	2	12	837722	837733	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_007295	TATAAT	2	12	837746	837757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_007295	TTATAA	2	12	839235	839246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_007295	TTTTCG	2	12	841109	841120	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	71893989
568	NC_007295	AACGGC	2	12	847330	847341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71893994
569	NC_007295	TCTTTT	2	12	848360	848371	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	71893995
570	NC_007295	TTAAAA	2	12	849861	849872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_007295	ATTTGA	2	12	855274	855285	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71894001
572	NC_007295	TTATAA	2	12	859821	859832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_007295	AAATTG	2	12	860019	860030	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71894005
574	NC_007295	ATTAAT	2	12	861848	861859	50 %	50 %	0 %	0 %	71894005
575	NC_007295	CAAAAT	2	12	862148	862159	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71894005
576	NC_007295	AAAAAT	2	12	864268	864279	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_007295	TACAAA	2	12	867228	867239	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71894009
578	NC_007295	CTTGGG	2	12	868447	868458	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	71894010
579	NC_007295	TAATTT	2	12	868708	868719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71894010
580	NC_007295	TTTTCG	2	12	868812	868823	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	71894010
581	NC_007295	TTGTTT	2	12	869606	869617	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	71894010
582	NC_007295	TGAAGA	2	12	869843	869854	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	71894010
583	NC_007295	TTTTTC	2	12	870512	870523	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	71894010
584	NC_007295	GGAATT	2	12	870588	870599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71894010
585	NC_007295	TTGCTT	2	12	871864	871875	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
586	NC_007295	TTCCTT	2	12	872145	872156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71894011
587	NC_007295	TTCTCT	2	12	872167	872178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71894011
588	NC_007295	GATGAA	2	12	872662	872673	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	71894011
589	NC_007295	TGGACT	2	12	873756	873767	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	71894011
590	NC_007295	TTTGCA	2	12	874255	874266	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71894011
591	NC_007295	TGAGGT	2	12	874579	874590	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	71894011
592	NC_007295	GCTGTT	2	12	875809	875820	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	71894011
593	NC_007295	GATTGT	2	12	877153	877164	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	71894012
594	NC_007295	TATTAG	2	12	877717	877728	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_007295	AGAATA	2	12	880985	880996	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_007295	AGTTGA	2	12	884253	884264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71894015
597	NC_007295	AAAAAT	2	12	887195	887206	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71894018
598	NC_007295	TTAAAA	2	12	887253	887264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71894018
599	NC_007295	AAAATT	2	12	887497	887508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71894018
600	NC_007295	TGCTTT	2	12	890192	890203	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	71894019
601	NC_007295	TTGAAT	2	12	891992	892003	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71894020
602	NC_007295	TTTTCT	2	12	893600	893611	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	71894021
603	NC_007295	AAAATT	2	12	894547	894558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71894021
604	NC_007295	ATTTTT	2	12	894832	894843	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71894021
605	NC_007295	TTTAAA	2	12	896833	896844	50 %	50 %	0 %	0 %	71894022

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