MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome

Total Repeats: 11266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007295	TTA	2	6	93	98	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007295	TGT	2	6	142	147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007295	TAC	2	6	178	183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007295	AAT	2	6	222	227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893360
5	NC_007295	ACA	2	6	254	259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893360
6	NC_007295	TTA	2	6	270	275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893360
7	NC_007295	TGT	2	6	286	291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893360
8	NC_007295	AAC	2	6	294	299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893360
9	NC_007295	ATT	2	6	342	347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893360
10	NC_007295	AAT	2	6	462	467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893360
11	NC_007295	TTA	2	6	688	693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893360
12	NC_007295	AGA	2	6	724	729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893360
13	NC_007295	TTC	2	6	770	775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893360
14	NC_007295	TGA	2	6	851	856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893360
15	NC_007295	TTG	2	6	892	897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893360
16	NC_007295	ATA	2	6	942	947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893360
17	NC_007295	CTT	2	6	964	969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893360
18	NC_007295	TGG	2	6	974	979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71893360
19	NC_007295	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893360
20	NC_007295	GAA	2	6	1083	1088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893360
21	NC_007295	ATG	2	6	1114	1119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893360
22	NC_007295	TTG	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893360
23	NC_007295	ATA	2	6	1438	1443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893360
24	NC_007295	AAC	2	6	1461	1466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893360
25	NC_007295	AGA	2	6	1467	1472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893360
26	NC_007295	AAT	2	6	1481	1486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893360
27	NC_007295	CAA	2	6	1523	1528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893360
28	NC_007295	TTA	2	6	1675	1680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007295	TAT	2	6	1685	1690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007295	ATT	2	6	1725	1730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007295	ATA	2	6	1810	1815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893361
32	NC_007295	AAG	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893361
33	NC_007295	ATT	2	6	1862	1867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893361
34	NC_007295	CAA	2	6	1876	1881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893361
35	NC_007295	TAA	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893361
36	NC_007295	ATG	2	6	1936	1941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893361
37	NC_007295	TTA	2	6	1981	1986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893361
38	NC_007295	TTC	2	6	2078	2083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893361
39	NC_007295	CAA	3	9	2176	2184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893361
40	NC_007295	CAA	2	6	2513	2518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893361
41	NC_007295	ACA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893361
42	NC_007295	TTA	2	6	2578	2583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893361
43	NC_007295	TTG	2	6	3026	3031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893362
44	NC_007295	GGC	2	6	3037	3042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71893362
45	NC_007295	ATT	2	6	3069	3074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893362
46	NC_007295	GTT	2	6	3091	3096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893362
47	NC_007295	TAA	2	6	3098	3103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893362
48	NC_007295	TGG	2	6	3150	3155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71893362
49	NC_007295	GGA	2	6	3196	3201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71893362
50	NC_007295	ATT	2	6	3451	3456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893362
51	NC_007295	ACA	2	6	3457	3462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893362
52	NC_007295	TTC	2	6	3485	3490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893362
53	NC_007295	CAA	2	6	3526	3531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893362
54	NC_007295	AAT	2	6	3550	3555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893362
55	NC_007295	CTT	2	6	3617	3622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893362
56	NC_007295	ACA	2	6	3733	3738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893362
57	NC_007295	CCA	2	6	3870	3875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71893362
58	NC_007295	ATG	2	6	4028	4033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893362
59	NC_007295	GAA	2	6	4126	4131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893362
60	NC_007295	ATG	2	6	4211	4216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893362
61	NC_007295	TGA	2	6	4236	4241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893362
62	NC_007295	GAT	2	6	4632	4637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893362
63	NC_007295	TCA	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893362
64	NC_007295	GTG	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71893362
65	NC_007295	CTG	2	6	4775	4780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71893362
66	NC_007295	AAT	2	6	4853	4858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893363
67	NC_007295	TAA	2	6	4910	4915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893363
68	NC_007295	TGA	2	6	5144	5149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893363
69	NC_007295	ACC	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71893363
70	NC_007295	ATA	2	6	5363	5368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893364
71	NC_007295	TCA	2	6	5379	5384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893364
72	NC_007295	CAA	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893364
73	NC_007295	CTG	2	6	5579	5584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71893364
74	NC_007295	GCT	2	6	5713	5718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71893364
75	NC_007295	GAT	2	6	5724	5729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893364
76	NC_007295	CTA	2	6	5737	5742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893364
77	NC_007295	GAA	2	6	5746	5751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893364
78	NC_007295	CAA	2	6	5831	5836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893364
79	NC_007295	TGC	2	6	5856	5861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71893364
80	NC_007295	AAG	2	6	5927	5932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893364
81	NC_007295	GCA	2	6	6193	6198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71893364
82	NC_007295	TTG	2	6	6540	6545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893365
83	NC_007295	ACC	2	6	6621	6626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71893365
84	NC_007295	GAT	2	6	6638	6643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893365
85	NC_007295	ATT	2	6	6835	6840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893365
86	NC_007295	GAG	2	6	7143	7148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71893365
87	NC_007295	ATT	2	6	7178	7183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893365
88	NC_007295	TGG	2	6	7339	7344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71893366
89	NC_007295	ATT	2	6	7410	7415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893366
90	NC_007295	TTG	2	6	7650	7655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893366
91	NC_007295	AGA	2	6	7678	7683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893366
92	NC_007295	TGA	2	6	7723	7728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893366
93	NC_007295	GAT	2	6	7758	7763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893366
94	NC_007295	TAA	2	6	7815	7820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893366
95	NC_007295	TGA	3	9	7900	7908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893366
96	NC_007295	ATT	2	6	7943	7948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007295	TAA	2	6	7991	7996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007295	TGA	2	6	8172	8177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893367
99	NC_007295	GAA	2	6	8188	8193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893367
100	NC_007295	AGA	2	6	8196	8201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893367
101	NC_007295	TAA	2	6	8207	8212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893367
102	NC_007295	AAT	2	6	8244	8249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893367
103	NC_007295	AAT	2	6	8287	8292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893367
104	NC_007295	AAT	2	6	8310	8315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893367
105	NC_007295	ACT	2	6	8431	8436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893367
106	NC_007295	GCT	2	6	8494	8499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71893367
107	NC_007295	CAA	2	6	8777	8782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893367
108	NC_007295	AGG	2	6	8874	8879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71893367
109	NC_007295	AAG	2	6	8996	9001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893367
110	NC_007295	TGG	2	6	9219	9224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71893368
111	NC_007295	ATA	2	6	9269	9274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893368
112	NC_007295	ATT	2	6	9334	9339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893368
113	NC_007295	TCA	2	6	9389	9394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893368
114	NC_007295	ATT	2	6	9490	9495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893368
115	NC_007295	GAA	2	6	9889	9894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893368
116	NC_007295	ATT	2	6	9913	9918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893368
117	NC_007295	AAC	2	6	10008	10013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893368
118	NC_007295	TAA	2	6	10014	10019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893368
119	NC_007295	GAT	2	6	10141	10146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893368
120	NC_007295	CAA	3	9	10250	10258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893368
121	NC_007295	TTG	2	6	10262	10267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893368
122	NC_007295	AGA	2	6	10308	10313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893368
123	NC_007295	GAT	2	6	10323	10328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893368
124	NC_007295	TTC	2	6	10352	10357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893368
125	NC_007295	GAA	2	6	10513	10518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893368
126	NC_007295	ATT	2	6	10600	10605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893368
127	NC_007295	ATT	2	6	10708	10713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893368
128	NC_007295	ATT	2	6	10720	10725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893368
129	NC_007295	TAA	2	6	10728	10733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893368
130	NC_007295	CAA	2	6	10780	10785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893368
131	NC_007295	ATA	2	6	10859	10864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893368
132	NC_007295	GAA	2	6	10996	11001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893368
133	NC_007295	GAA	2	6	11056	11061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893368
134	NC_007295	CGT	2	6	11590	11595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71893369
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