MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome

Total Repeats: 11266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007295	TGA	2	6	82120	82125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893422
1002	NC_007295	TGC	2	6	82141	82146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71893422
1003	NC_007295	ACA	2	6	82265	82270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893422
1004	NC_007295	TGT	2	6	82336	82341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893422
1005	NC_007295	ATA	2	6	82368	82373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893422
1006	NC_007295	GCT	2	6	82409	82414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71893422
1007	NC_007295	AGA	3	9	82543	82551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893422
1008	NC_007295	TAA	2	6	82555	82560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893422
1009	NC_007295	GAT	2	6	82561	82566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893422
1010	NC_007295	GAA	2	6	82577	82582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893422
1011	NC_007295	ACA	2	6	82622	82627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893422
1012	NC_007295	TTA	2	6	82644	82649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893422
1013	NC_007295	TCT	2	6	82741	82746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893422
1014	NC_007295	AGA	2	6	82750	82755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893422
1015	NC_007295	AGC	2	6	82795	82800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71893422
1016	NC_007295	GCA	2	6	82828	82833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71893422
1017	NC_007295	TGA	2	6	82864	82869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893422
1018	NC_007295	TAA	2	6	83057	83062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_007295	ATC	2	6	83211	83216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893423
1020	NC_007295	GAA	2	6	83243	83248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893423
1021	NC_007295	TGA	2	6	83305	83310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893423
1022	NC_007295	TGG	3	9	83365	83373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71893423
1023	NC_007295	GGC	2	6	83441	83446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71893423
1024	NC_007295	GTC	2	6	83466	83471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71893423
1025	NC_007295	TTC	3	9	83599	83607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893423
1026	NC_007295	TGG	2	6	83848	83853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71893423
1027	NC_007295	AAT	2	6	83965	83970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893423
1028	NC_007295	ATT	2	6	84039	84044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893423
1029	NC_007295	TTC	2	6	84069	84074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893423
1030	NC_007295	ATT	2	6	84107	84112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893423
1031	NC_007295	AAT	2	6	84237	84242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893423
1032	NC_007295	TTA	2	6	84274	84279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_007295	ACT	2	6	84286	84291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_007295	TAT	2	6	84292	84297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_007295	CAA	2	6	84355	84360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893424
1036	NC_007295	ATT	2	6	84388	84393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893424
1037	NC_007295	CCA	2	6	84492	84497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71893424
1038	NC_007295	CTA	2	6	84558	84563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893424
1039	NC_007295	ATC	2	6	84594	84599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893424
1040	NC_007295	ATC	2	6	84669	84674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893424
1041	NC_007295	ACA	2	6	84903	84908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893424
1042	NC_007295	TTG	2	6	85026	85031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893425
1043	NC_007295	GAA	2	6	85244	85249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893425
1044	NC_007295	TTA	2	6	85319	85324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893425
1045	NC_007295	ACA	2	6	85371	85376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893425
1046	NC_007295	TAT	2	6	85594	85599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893425
1047	NC_007295	ACA	2	6	85616	85621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893425
1048	NC_007295	TTA	2	6	85781	85786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893425
1049	NC_007295	TCA	2	6	85804	85809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893425
1050	NC_007295	ACA	2	6	85906	85911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893425
1051	NC_007295	GTT	2	6	85964	85969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893425
1052	NC_007295	AAT	2	6	86033	86038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893425
1053	NC_007295	CAA	2	6	86055	86060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893425
1054	NC_007295	GAT	2	6	86092	86097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893425
1055	NC_007295	ATT	2	6	86279	86284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893425
1056	NC_007295	CAG	2	6	86454	86459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71893426
1057	NC_007295	TGT	2	6	86461	86466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893426
1058	NC_007295	TCT	2	6	86531	86536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893426
1059	NC_007295	ACA	2	6	86582	86587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893426
1060	NC_007295	GAA	2	6	86842	86847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893427
1061	NC_007295	ATA	2	6	86870	86875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893428
1062	NC_007295	AAC	2	6	86984	86989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893428
1063	NC_007295	AAT	2	6	87220	87225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893428
1064	NC_007295	ATT	2	6	87232	87237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893428
1065	NC_007295	CCA	2	6	87400	87405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71893428
1066	NC_007295	TAA	2	6	87476	87481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893428
1067	NC_007295	TAA	2	6	87540	87545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893428
1068	NC_007295	GCC	2	6	87634	87639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71893428
1069	NC_007295	TCA	2	6	87823	87828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893428
1070	NC_007295	ATT	2	6	87829	87834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893428
1071	NC_007295	TCA	2	6	87847	87852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893428
1072	NC_007295	TTC	2	6	87908	87913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893428
1073	NC_007295	TTA	2	6	88043	88048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893428
1074	NC_007295	GAA	2	6	88093	88098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893428
1075	NC_007295	AAG	2	6	88539	88544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893428
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1079	NC_007295	GAA	2	6	88859	88864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893429
1080	NC_007295	ATT	2	6	88930	88935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893429
1081	NC_007295	GAA	2	6	88979	88984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893429
1082	NC_007295	TTA	2	6	89202	89207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893429
1083	NC_007295	AAT	2	6	89270	89275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893429
1084	NC_007295	CCA	2	6	89294	89299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71893429
1085	NC_007295	CAA	2	6	89376	89381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893429
1086	NC_007295	ATG	2	6	89384	89389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893429
1087	NC_007295	TTA	2	6	89408	89413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893429
1088	NC_007295	TCG	2	6	89518	89523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71893429
1089	NC_007295	GTA	2	6	89627	89632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893429
1090	NC_007295	GAA	2	6	89649	89654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893429
1091	NC_007295	ATT	2	6	89790	89795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_007295	TAA	2	6	89891	89896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_007295	ACG	3	9	90208	90216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71893430
1094	NC_007295	TGC	2	6	90334	90339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71893430
1095	NC_007295	AGA	2	6	90358	90363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893430
1096	NC_007295	CTT	2	6	90528	90533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893430
1097	NC_007295	ACC	2	6	90580	90585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71893430
1098	NC_007295	CAA	2	6	90699	90704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893430
1099	NC_007295	ATT	2	6	90737	90742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893430
1100	NC_007295	GTT	2	6	90935	90940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893430
1101	NC_007295	CAA	2	6	90954	90959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893430
1102	NC_007295	TCA	2	6	90986	90991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893430
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1104	NC_007295	TTG	2	6	91053	91058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893430
1105	NC_007295	CAA	2	6	91122	91127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893430
1106	NC_007295	ATC	2	6	91171	91176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893430
1107	NC_007295	TCA	2	6	91202	91207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893430
1108	NC_007295	AAT	2	6	91248	91253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893430
1109	NC_007295	ATC	2	6	91268	91273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893430
1110	NC_007295	ACA	2	6	91310	91315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893430
1111	NC_007295	TTG	2	6	91335	91340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893430
1112	NC_007295	TCT	2	6	91385	91390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893430
1113	NC_007295	ATT	2	6	91396	91401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893430
1114	NC_007295	TCA	2	6	91412	91417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893430
1115	NC_007295	TCT	2	6	91505	91510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893430
1116	NC_007295	CAT	2	6	91518	91523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893430
1117	NC_007295	CAA	2	6	91542	91547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893430
1118	NC_007295	TTG	2	6	91707	91712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893430
1119	NC_007295	GTT	2	6	91874	91879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893430
1120	NC_007295	CAT	2	6	91944	91949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71893430
1121	NC_007295	GTT	4	12	92000	92011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893430
1122	NC_007295	TCT	2	6	92144	92149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71893431
1123	NC_007295	TAT	2	6	92175	92180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893431
1124	NC_007295	ATT	2	6	92189	92194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893431
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1497	NC_007295	AGT	2	6	123343	123348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893455
1498	NC_007295	GCG	2	6	123356	123361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71893455
1499	NC_007295	TGA	2	6	123453	123458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893455
1500	NC_007295	CAA	2	6	123466	123471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71893455

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