MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Methanococcus maripaludis S2 chromosome

Total Repeats: 839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005791	CCTACG	2	12	2515	2526	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_005791	AAGGCC	2	12	3438	3449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_005791	CCTACG	2	12	7556	7567	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_005791	AAGGCC	2	12	8479	8490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_005791	CGGATG	2	12	10358	10369	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	45357564
6	NC_005791	TGGAAA	2	12	11682	11693	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	45357566
7	NC_005791	TCCAAC	2	12	13277	13288	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	45357567
8	NC_005791	ATTTTT	2	12	16421	16432	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	45357569
9	NC_005791	GATGTG	2	12	17782	17793	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	45357571
10	NC_005791	TAATGA	2	12	21013	21024	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45357574
11	NC_005791	ATTTTA	2	12	21260	21271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357574
12	NC_005791	ATCTTG	2	12	22819	22830	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45357576
13	NC_005791	TTTAAA	2	12	27349	27360	50 %	50 %	0 %	0 %	45357580
14	NC_005791	ATCTGA	2	12	27809	27820	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45357581
15	NC_005791	TCCTGT	2	12	28253	28264	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	45357581
16	NC_005791	GATTTT	2	12	28299	28310	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	45357581
17	NC_005791	CAATAT	2	12	31752	31763	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	45357587
18	NC_005791	CTGGAA	2	12	32240	32251	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45357587
19	NC_005791	ATTTCG	2	12	34676	34687	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45357589
20	NC_005791	CCTACG	2	12	39566	39577	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_005791	AAGGCC	2	12	40570	40581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_005791	GCCATT	2	12	45126	45137	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	45357592
23	NC_005791	GCAAAA	2	12	47310	47321	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	45357593
24	NC_005791	TTGATT	2	12	48936	48947	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005791	TTAAAA	2	12	50583	50594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357596
26	NC_005791	TTAATT	2	12	52711	52722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357597
27	NC_005791	TGATTT	2	12	54564	54575	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	45357600
28	NC_005791	AATTTA	2	12	60267	60278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005791	TTAAAT	2	12	60300	60311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005791	ATTGCT	2	12	60671	60682	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45357606
31	NC_005791	TCAATT	2	12	61283	61294	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45357606
32	NC_005791	TAATTT	2	12	65826	65837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357611
33	NC_005791	CATTTT	2	12	67323	67334	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45357615
34	NC_005791	TTTATC	2	12	69464	69475	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45357617
35	NC_005791	TTCTTT	2	12	71152	71163	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	45357619
36	NC_005791	TTTTAT	2	12	73908	73919	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	45357622
37	NC_005791	ATTCTA	2	12	74579	74590	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45357624
38	NC_005791	TTAAAC	2	12	76033	76044	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	45357626
39	NC_005791	TTAAAT	2	12	77516	77527	50 %	50 %	0 %	0 %	45357628
40	NC_005791	TTGCAG	2	12	77816	77827	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45357628
41	NC_005791	AGGATT	2	12	78216	78227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357628
42	NC_005791	TTTTAT	2	12	79454	79465	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	45357631
43	NC_005791	AATTAA	2	12	83324	83335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357634
44	NC_005791	TATCAA	2	12	83413	83424	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	45357634
45	NC_005791	TGAAAT	2	12	85372	85383	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45357636
46	NC_005791	TTCCAG	2	12	85452	85463	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	45357636
47	NC_005791	GAAAAA	2	12	86261	86272	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	45357637
48	NC_005791	TCAAAA	2	12	86564	86575	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	45357637
49	NC_005791	AATACA	2	12	93563	93574	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	45357645
50	NC_005791	TTTTAA	2	12	98538	98549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357650
51	NC_005791	TCCAAA	2	12	100679	100690	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	45357652
52	NC_005791	TAAAAT	2	12	101184	101195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357653
53	NC_005791	ATAATT	2	12	102891	102902	50 %	50 %	0 %	0 %	45357656
54	NC_005791	CTGGAA	2	12	112275	112286	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45357666
55	NC_005791	TTGCAA	2	12	119441	119452	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45357673
56	NC_005791	AAGTTG	2	12	124230	124241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357679
57	NC_005791	ACACAG	2	12	124771	124782	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	45357679
58	NC_005791	GAAAAA	2	12	129277	129288	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	45357686
59	NC_005791	CGCATT	2	12	133645	133656	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	45357690
60	NC_005791	CTTTAG	2	12	134362	134373	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45357690
61	NC_005791	TAAATA	2	12	134796	134807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005791	TCACAC	2	12	135657	135668	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	45357692
63	NC_005791	GATTTT	2	12	137950	137961	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	45357694
64	NC_005791	AACTCC	2	12	139985	139996	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	45357696
65	NC_005791	TGAAAT	2	12	141128	141139	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45357697
66	NC_005791	TAAAAA	2	12	141319	141330	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	45357697
67	NC_005791	TATTAG	2	12	141461	141472	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005791	AAGAAA	2	12	143975	143986	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	45357700
69	NC_005791	GATAAA	2	12	147422	147433	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	45357702
70	NC_005791	CCTGAA	2	12	147893	147904	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	45357702
71	NC_005791	TGCAAT	2	12	148487	148498	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45357703
72	NC_005791	ATTTTC	2	12	150338	150349	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45357703
73	NC_005791	TTTTTC	2	12	151223	151234	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	45357704
74	NC_005791	TTTTCA	2	12	151553	151564	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45357705
75	NC_005791	TCAATT	2	12	154232	154243	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45357707
76	NC_005791	AATTTA	2	12	155390	155401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005791	ATTTAA	2	12	155639	155650	50 %	50 %	0 %	0 %	45357709
78	NC_005791	CTTTAT	2	12	156481	156492	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45357709
79	NC_005791	CAAGTG	2	12	156760	156771	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45357709
80	NC_005791	AAACTG	2	12	159213	159224	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	45357711
81	NC_005791	TTGATG	2	12	159306	159317	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	45357711
82	NC_005791	CTAAAG	2	12	161725	161736	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	45357714
83	NC_005791	GCAAAA	2	12	162846	162857	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	45357715
84	NC_005791	TTGCAG	2	12	163300	163311	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45357715
85	NC_005791	TACAAT	2	12	166542	166553	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	45357717
86	NC_005791	CAAAAA	2	12	168067	168078	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	45357720
87	NC_005791	AAAATT	2	12	169103	169114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005791	ATTTAA	2	12	170521	170532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005791	GAAATT	2	12	171327	171338	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45357724
90	NC_005791	ACGATA	2	12	179676	179687	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	45357734
91	NC_005791	TAGGAA	2	12	184039	184050	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	45357739
92	NC_005791	TTTTAC	2	12	184811	184822	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45357739
93	NC_005791	ATTTAA	2	12	186103	186114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005791	TTTTCA	2	12	187651	187662	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45357742
95	NC_005791	TTTTAA	2	12	187998	188009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357742
96	NC_005791	TTCCTT	2	12	188441	188452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357742
97	NC_005791	CTGCAG	2	12	189038	189049	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	45357742
98	NC_005791	CTTCAT	2	12	190799	190810	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	45357743
99	NC_005791	CTTTGT	2	12	190889	190900	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	45357743
100	NC_005791	TCAATG	2	12	191380	191391	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45357744
101	NC_005791	CCCATA	2	12	191769	191780	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	45357744
102	NC_005791	TAAAAA	2	12	192009	192020	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005791	TAAAAA	3	18	193229	193246	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005791	GAAATG	2	12	194318	194329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	45357748
105	NC_005791	GTATAG	2	12	197580	197591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005791	TCTTTT	2	12	200064	200075	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	45357754
107	NC_005791	TGAAAA	2	12	204598	204609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	45357759
108	NC_005791	CTTATG	2	12	206936	206947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45357762
109	NC_005791	TTTTAA	2	12	209462	209473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005791	TTGGAA	2	12	210959	210970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357765
111	NC_005791	TTTGAT	2	12	212319	212330	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005791	ATCTTC	2	12	219237	219248	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	45357775
113	NC_005791	TTATTT	2	12	224501	224512	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	45357779
114	NC_005791	AATTAC	2	12	224526	224537	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	45357779
115	NC_005791	ATAAAT	2	12	227273	227284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005791	ATGGCA	2	12	229970	229981	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45357784
117	NC_005791	CCATTT	2	12	231224	231235	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	45357787
118	NC_005791	GCAATT	2	12	232820	232831	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45357788
119	NC_005791	CAATAG	2	12	232914	232925	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	45357788
120	NC_005791	AATCAT	2	12	233253	233264	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	45357788
121	NC_005791	AAAATC	2	12	233320	233331	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	45357788
122	NC_005791	TGACGA	2	12	242868	242879	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45357798
123	NC_005791	AATTTT	2	12	244393	244404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357800
124	NC_005791	TATCGA	2	12	245324	245335	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45357802
125	NC_005791	ACTGAT	2	12	246913	246924	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45357804
126	NC_005791	ATTCGG	2	12	247505	247516	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45357804
127	NC_005791	AAGTTG	2	12	249356	249367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357807
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232	NC_005791	TGGAAC	2	12	427068	427079	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45357988
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239	NC_005791	TTAAAA	2	12	433877	433888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357995
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241	NC_005791	AAAAGA	2	12	436385	436396	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	45357999
242	NC_005791	AAATAA	2	12	437312	437323	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	45358000
243	NC_005791	TTTAAT	2	12	440218	440229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_005791	ATGGAT	2	12	440930	440941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45358006
245	NC_005791	TATAAT	2	12	441900	441911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_005791	TCAATT	2	12	444900	444911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45358013
247	NC_005791	TCAAAA	2	12	444951	444962	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	45358013
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250	NC_005791	TAATTT	2	12	449452	449463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_005791	AAATTA	2	12	453516	453527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45358021
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277	NC_005791	AAATTT	2	12	519848	519859	50 %	50 %	0 %	0 %	45358076
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339	NC_005791	AACACA	2	12	643158	643169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45358214
340	NC_005791	GTTTTG	2	12	643178	643189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45358214
341	NC_005791	ATTTAA	2	12	650011	650022	50 %	50 %	0 %	0 %	45358222
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343	NC_005791	TTTATT	2	12	651121	651132	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
344	NC_005791	CATCAA	2	12	653688	653699	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	45358226
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346	NC_005791	TTTGAA	2	12	657032	657043	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
347	NC_005791	AAAAGA	2	12	657884	657895	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	45358231
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352	NC_005791	GATGCA	2	12	668157	668168	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45358242
353	NC_005791	CTTTTG	2	12	671577	671588	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	45358246
354	NC_005791	TTCCAT	2	12	672028	672039	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	45358246
355	NC_005791	CCAAAA	2	12	673146	673157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45358248
356	NC_005791	AACTTT	2	12	675888	675899	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45358251
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