MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Methanococcus maripaludis S2 chromosome

Total Repeats: 839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005791	CATTTA	2	12	947051	947062	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45358521
502	NC_005791	GAAAAA	2	12	954483	954494	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	45358530
503	NC_005791	CCTGTT	2	12	955650	955661	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	45358531
504	NC_005791	ATTGGG	2	12	956536	956547	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	45358533
505	NC_005791	AATTAA	2	12	957002	957013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45358533
506	NC_005791	AAATAT	2	12	960205	960216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45358536
507	NC_005791	TAAAAA	2	12	961519	961530	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_005791	CTGCAT	2	12	961822	961833	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	45358538
509	NC_005791	TCTTGT	2	12	966490	966501	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	45358544
510	NC_005791	ATTCCA	2	12	968618	968629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45358546
511	NC_005791	AAACTA	2	12	969381	969392	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	45358546
512	NC_005791	TTTATC	2	12	971661	971672	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45358548
513	NC_005791	TTTCTT	2	12	975003	975014	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	45358551
514	NC_005791	GAAAAA	2	12	978101	978112	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	45358553
515	NC_005791	AATCGG	2	12	978115	978126	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45358553
516	NC_005791	CTGAAA	2	12	979531	979542	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	45358554
517	NC_005791	TAAAAA	2	12	982360	982371	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_005791	TGCAGC	2	12	991167	991178	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	45358570
519	NC_005791	CAATTT	2	12	992284	992295	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45358571
520	NC_005791	CAATTT	2	12	993200	993211	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45358572
521	NC_005791	CAAATC	2	12	995383	995394	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	45358574
522	NC_005791	GAATAC	2	12	998752	998763	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	45358576
523	NC_005791	TGAAAA	2	12	1000014	1000025	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	45358576
524	NC_005791	GTCGAT	2	12	1000420	1000431	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45358576
525	NC_005791	GTTGAA	2	12	1003911	1003922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45358579
526	NC_005791	TACAAC	2	12	1005689	1005700	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	45358580
527	NC_005791	GTTTCA	2	12	1007549	1007560	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45358582
528	NC_005791	TGCAAC	2	12	1009189	1009200	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	45358583
529	NC_005791	TGGTTT	2	12	1009877	1009888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45358584
530	NC_005791	CAGTTC	2	12	1010464	1010475	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	45358584
531	NC_005791	TTTTAA	2	12	1011009	1011020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45358585
532	NC_005791	ATCCAT	2	12	1018731	1018742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45358590
533	NC_005791	AAATAC	2	12	1019675	1019686	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	45358591
534	NC_005791	AAAAGA	2	12	1020859	1020870	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	45358591
535	NC_005791	AAAGAA	2	12	1020893	1020904	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	45358591
536	NC_005791	TTGGAA	2	12	1021182	1021193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45358591
537	NC_005791	TTTTTA	2	12	1022812	1022823	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	45358594
538	NC_005791	AATAAA	2	12	1023368	1023379	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_005791	ATCTAA	2	12	1023408	1023419	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
540	NC_005791	TAAAAT	2	12	1026636	1026647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45358596
541	NC_005791	ATTCTT	2	12	1030457	1030468	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
542	NC_005791	TTTCAT	2	12	1032051	1032062	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45358602
543	NC_005791	CGAAAC	2	12	1032529	1032540	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	45358602
544	NC_005791	TTGAAA	2	12	1032615	1032626	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45358602
545	NC_005791	AATCTT	2	12	1034069	1034080	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45358603
546	NC_005791	AATTAA	2	12	1034533	1034544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45358603
547	NC_005791	CAGTTG	2	12	1037243	1037254	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45358607
548	NC_005791	TAAAAC	2	12	1042658	1042669	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	45358614
549	NC_005791	AAAATT	2	12	1043683	1043694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_005791	ACAAAA	2	12	1044524	1044535	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	45358615
551	NC_005791	GATAGA	2	12	1047692	1047703	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	45358619
552	NC_005791	TGAAAA	2	12	1049089	1049100	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	45358621
553	NC_005791	CAAAAA	2	12	1049492	1049503	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	45358621
554	NC_005791	GAAAAA	2	12	1051793	1051804	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	45358623
555	NC_005791	CATTTG	2	12	1053690	1053701	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45358625
556	NC_005791	TAAAAA	2	12	1060328	1060339	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_005791	GGACTT	2	12	1065244	1065255	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45358637
558	NC_005791	TTCCAT	2	12	1065478	1065489	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	45358638
559	NC_005791	TCTTTT	2	12	1067229	1067240	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	45358640
560	NC_005791	TTAAAT	2	12	1073771	1073782	50 %	50 %	0 %	0 %	45358645
561	NC_005791	CATTTT	2	12	1076965	1076976	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45358648
562	NC_005791	TAAATT	2	12	1079791	1079802	50 %	50 %	0 %	0 %	45358651
563	NC_005791	CAACTT	2	12	1082379	1082390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45358652
564	NC_005791	TAAAAA	2	12	1082449	1082460	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	45358652
565	NC_005791	ATATTT	2	12	1083146	1083157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45358653
566	NC_005791	AAATTA	2	12	1085838	1085849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_005791	CAATTG	2	12	1086157	1086168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45358657
568	NC_005791	AATAGT	2	12	1091693	1091704	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45358661
569	NC_005791	AAATTA	6	36	1091858	1091893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_005791	AATGGA	2	12	1092099	1092110	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	45358662
571	NC_005791	ACTTTT	2	12	1097842	1097853	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45358670
572	NC_005791	TCCTTT	2	12	1098625	1098636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45358671
573	NC_005791	TTTCTA	2	12	1098870	1098881	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45358671
574	NC_005791	TTAATT	2	12	1099828	1099839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45358672
575	NC_005791	ATATCT	2	12	1099858	1099869	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45358672
576	NC_005791	TTGTAA	2	12	1100687	1100698	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	45358673
577	NC_005791	TAAAAT	2	12	1103184	1103195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_005791	CCTTTT	2	12	1104979	1104990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45358678
579	NC_005791	TTTTAA	2	12	1107104	1107115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45358679
580	NC_005791	TTTAAA	2	12	1112696	1112707	50 %	50 %	0 %	0 %	45358685
581	NC_005791	TTATTG	2	12	1120613	1120624	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	45358693
582	NC_005791	ATTTTT	2	12	1122256	1122267	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_005791	TAAAAA	2	12	1122466	1122477	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	45358695
584	NC_005791	AAATAA	2	12	1123034	1123045	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	45358696
585	NC_005791	GCAATG	2	12	1123108	1123119	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45358696
586	NC_005791	ATGAAT	2	12	1125127	1125138	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45358697
587	NC_005791	CTCGAA	2	12	1131095	1131106	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	45358704
588	NC_005791	ACTTGA	2	12	1132504	1132515	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45358704
589	NC_005791	AAATAC	2	12	1134707	1134718	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
590	NC_005791	TCAACA	2	12	1136374	1136385	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	45358709
591	NC_005791	CCAATC	2	12	1136840	1136851	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	45358709
592	NC_005791	CTAATT	2	12	1137692	1137703	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
593	NC_005791	TAATTT	2	12	1141165	1141176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45358715
594	NC_005791	AAAAAT	2	12	1146344	1146355	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	45358724
595	NC_005791	ATTAAA	2	12	1148105	1148116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45358727
596	NC_005791	TCCAAA	2	12	1149131	1149142	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	45358728
597	NC_005791	GTTGGA	2	12	1149465	1149476	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	45358728
598	NC_005791	AAAATG	2	12	1155213	1155224	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	45358734
599	NC_005791	GAAGTT	2	12	1156987	1156998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45358737
600	NC_005791	GTTTCA	2	12	1167167	1167178	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45358746
601	NC_005791	TTAAGA	2	12	1169700	1169711	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45358749
602	NC_005791	TTTAAA	2	12	1171272	1171283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_005791	TATAAA	2	12	1174149	1174160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_005791	AAAATT	2	12	1174217	1174228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_005791	TAGAAT	2	12	1177660	1177671	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45358756
606	NC_005791	TGAAGA	2	12	1177838	1177849	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	45358756
607	NC_005791	AATTGA	2	12	1180034	1180045	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45358756
608	NC_005791	AAAATT	2	12	1180501	1180512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_005791	TTGCAA	2	12	1185104	1185115	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45358761
610	NC_005791	TATGAA	2	12	1187365	1187376	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45358763
611	NC_005791	TCGATT	2	12	1191655	1191666	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45358768
612	NC_005791	ATGAAT	2	12	1192742	1192753	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45358769
613	NC_005791	GATTAC	2	12	1198745	1198756	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45358774
614	NC_005791	GGTAAA	2	12	1200487	1200498	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	45358776
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616	NC_005791	TTGGAA	2	12	1203907	1203918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45358779
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