MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanococcus maripaludis S2 chromosome

Total Repeats: 723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005791	CGGATG	2	12	10358	10369	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	45357564
2	NC_005791	TGGAAA	2	12	11682	11693	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	45357566
3	NC_005791	TCCAAC	2	12	13277	13288	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	45357567
4	NC_005791	ATTTTT	2	12	16421	16432	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	45357569
5	NC_005791	GATGTG	2	12	17782	17793	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	45357571
6	NC_005791	TAATGA	2	12	21013	21024	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45357574
7	NC_005791	ATTTTA	2	12	21260	21271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357574
8	NC_005791	ATCTTG	2	12	22819	22830	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45357576
9	NC_005791	TTTAAA	2	12	27349	27360	50 %	50 %	0 %	0 %	45357580
10	NC_005791	ATCTGA	2	12	27809	27820	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45357581
11	NC_005791	TCCTGT	2	12	28253	28264	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	45357581
12	NC_005791	GATTTT	2	12	28299	28310	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	45357581
13	NC_005791	CAATAT	2	12	31752	31763	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	45357587
14	NC_005791	CTGGAA	2	12	32240	32251	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45357587
15	NC_005791	ATTTCG	2	12	34676	34687	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45357589
16	NC_005791	GCCATT	2	12	45126	45137	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	45357592
17	NC_005791	GCAAAA	2	12	47310	47321	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	45357593
18	NC_005791	TTAAAA	2	12	50583	50594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357596
19	NC_005791	TTAATT	2	12	52711	52722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357597
20	NC_005791	TGATTT	2	12	54564	54575	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	45357600
21	NC_005791	ATTGCT	2	12	60671	60682	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45357606
22	NC_005791	TCAATT	2	12	61283	61294	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45357606
23	NC_005791	TAATTT	2	12	65826	65837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357611
24	NC_005791	CATTTT	2	12	67323	67334	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45357615
25	NC_005791	TTTATC	2	12	69464	69475	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45357617
26	NC_005791	TTCTTT	2	12	71152	71163	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	45357619
27	NC_005791	TTTTAT	2	12	73908	73919	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	45357622
28	NC_005791	ATTCTA	2	12	74579	74590	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45357624
29	NC_005791	TTAAAC	2	12	76033	76044	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	45357626
30	NC_005791	TTAAAT	2	12	77516	77527	50 %	50 %	0 %	0 %	45357628
31	NC_005791	TTGCAG	2	12	77816	77827	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45357628
32	NC_005791	AGGATT	2	12	78216	78227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357628
33	NC_005791	TTTTAT	2	12	79454	79465	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	45357631
34	NC_005791	AATTAA	2	12	83324	83335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357634
35	NC_005791	TATCAA	2	12	83413	83424	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	45357634
36	NC_005791	TGAAAT	2	12	85372	85383	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45357636
37	NC_005791	TTCCAG	2	12	85452	85463	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	45357636
38	NC_005791	GAAAAA	2	12	86261	86272	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	45357637
39	NC_005791	TCAAAA	2	12	86564	86575	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	45357637
40	NC_005791	AATACA	2	12	93563	93574	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	45357645
41	NC_005791	TTTTAA	2	12	98538	98549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357650
42	NC_005791	TCCAAA	2	12	100679	100690	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	45357652
43	NC_005791	TAAAAT	2	12	101184	101195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357653
44	NC_005791	ATAATT	2	12	102891	102902	50 %	50 %	0 %	0 %	45357656
45	NC_005791	CTGGAA	2	12	112275	112286	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45357666
46	NC_005791	TTGCAA	2	12	119441	119452	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45357673
47	NC_005791	AAGTTG	2	12	124230	124241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357679
48	NC_005791	ACACAG	2	12	124771	124782	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	45357679
49	NC_005791	GAAAAA	2	12	129277	129288	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	45357686
50	NC_005791	CGCATT	2	12	133645	133656	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	45357690
51	NC_005791	CTTTAG	2	12	134362	134373	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45357690
52	NC_005791	TCACAC	2	12	135657	135668	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	45357692
53	NC_005791	GATTTT	2	12	137950	137961	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	45357694
54	NC_005791	AACTCC	2	12	139985	139996	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	45357696
55	NC_005791	TGAAAT	2	12	141128	141139	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45357697
56	NC_005791	TAAAAA	2	12	141319	141330	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	45357697
57	NC_005791	AAGAAA	2	12	143975	143986	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	45357700
58	NC_005791	GATAAA	2	12	147422	147433	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	45357702
59	NC_005791	CCTGAA	2	12	147893	147904	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	45357702
60	NC_005791	TGCAAT	2	12	148487	148498	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45357703
61	NC_005791	ATTTTC	2	12	150338	150349	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45357703
62	NC_005791	TTTTTC	2	12	151223	151234	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	45357704
63	NC_005791	TTTTCA	2	12	151553	151564	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45357705
64	NC_005791	TCAATT	2	12	154232	154243	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45357707
65	NC_005791	ATTTAA	2	12	155639	155650	50 %	50 %	0 %	0 %	45357709
66	NC_005791	CTTTAT	2	12	156481	156492	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45357709
67	NC_005791	CAAGTG	2	12	156760	156771	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45357709
68	NC_005791	AAACTG	2	12	159213	159224	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	45357711
69	NC_005791	TTGATG	2	12	159306	159317	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	45357711
70	NC_005791	CTAAAG	2	12	161725	161736	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	45357714
71	NC_005791	GCAAAA	2	12	162846	162857	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	45357715
72	NC_005791	TTGCAG	2	12	163300	163311	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45357715
73	NC_005791	TACAAT	2	12	166542	166553	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	45357717
74	NC_005791	CAAAAA	2	12	168067	168078	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	45357720
75	NC_005791	GAAATT	2	12	171327	171338	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45357724
76	NC_005791	ACGATA	2	12	179676	179687	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	45357734
77	NC_005791	TAGGAA	2	12	184039	184050	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	45357739
78	NC_005791	TTTTAC	2	12	184811	184822	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45357739
79	NC_005791	TTTTCA	2	12	187651	187662	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45357742
80	NC_005791	TTTTAA	2	12	187998	188009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357742
81	NC_005791	TTCCTT	2	12	188441	188452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357742
82	NC_005791	CTGCAG	2	12	189038	189049	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	45357742
83	NC_005791	CTTCAT	2	12	190799	190810	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	45357743
84	NC_005791	CTTTGT	2	12	190889	190900	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	45357743
85	NC_005791	TCAATG	2	12	191380	191391	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45357744
86	NC_005791	CCCATA	2	12	191769	191780	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	45357744
87	NC_005791	GAAATG	2	12	194318	194329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	45357748
88	NC_005791	TCTTTT	2	12	200064	200075	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	45357754
89	NC_005791	TGAAAA	2	12	204598	204609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	45357759
90	NC_005791	CTTATG	2	12	206936	206947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45357762
91	NC_005791	TTGGAA	2	12	210959	210970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357765
92	NC_005791	ATCTTC	2	12	219237	219248	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	45357775
93	NC_005791	TTATTT	2	12	224501	224512	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	45357779
94	NC_005791	AATTAC	2	12	224526	224537	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	45357779
95	NC_005791	ATGGCA	2	12	229970	229981	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45357784
96	NC_005791	CCATTT	2	12	231224	231235	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	45357787
97	NC_005791	GCAATT	2	12	232820	232831	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45357788
98	NC_005791	CAATAG	2	12	232914	232925	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	45357788
99	NC_005791	AATCAT	2	12	233253	233264	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	45357788
100	NC_005791	AAAATC	2	12	233320	233331	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	45357788
101	NC_005791	TGACGA	2	12	242868	242879	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45357798
102	NC_005791	AATTTT	2	12	244393	244404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357800
103	NC_005791	TATCGA	2	12	245324	245335	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45357802
104	NC_005791	ACTGAT	2	12	246913	246924	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45357804
105	NC_005791	ATTCGG	2	12	247505	247516	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45357804
106	NC_005791	AAGTTG	2	12	249356	249367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357807
107	NC_005791	TTAAAA	2	12	250878	250889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357810
108	NC_005791	ATTATC	2	12	250950	250961	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45357810
109	NC_005791	TACTTT	2	12	251163	251174	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45357812
110	NC_005791	CATTTG	2	12	254224	254235	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45357816
111	NC_005791	AAAAAT	2	12	256518	256529	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	45357817
112	NC_005791	GATGCA	2	12	256953	256964	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45357817
113	NC_005791	TTTAAA	2	12	256989	257000	50 %	50 %	0 %	0 %	45357817
114	NC_005791	TGGAAA	2	12	257932	257943	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	45357818
115	NC_005791	GCTGCA	2	12	259704	259715	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	45357821
116	NC_005791	TTTGCA	2	12	261253	261264	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45357823
117	NC_005791	CTAATT	2	12	262080	262091	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45357824
118	NC_005791	GTTTTT	2	12	262099	262110	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	45357824
119	NC_005791	AAAAAC	2	12	264979	264990	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	45357827
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