MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanococcus maripaludis S2 chromosome

Total Repeats: 723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005791	GCAATG	2	12	1123108	1123119	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45358696
502	NC_005791	ATGAAT	2	12	1125127	1125138	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45358697
503	NC_005791	CTCGAA	2	12	1131095	1131106	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	45358704
504	NC_005791	ACTTGA	2	12	1132504	1132515	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45358704
505	NC_005791	TCAACA	2	12	1136374	1136385	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	45358709
506	NC_005791	CCAATC	2	12	1136840	1136851	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	45358709
507	NC_005791	TAATTT	2	12	1141165	1141176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45358715
508	NC_005791	AAAAAT	2	12	1146344	1146355	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	45358724
509	NC_005791	ATTAAA	2	12	1148105	1148116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45358727
510	NC_005791	TCCAAA	2	12	1149131	1149142	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	45358728
511	NC_005791	GTTGGA	2	12	1149465	1149476	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	45358728
512	NC_005791	AAAATG	2	12	1155213	1155224	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	45358734
513	NC_005791	GAAGTT	2	12	1156987	1156998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45358737
514	NC_005791	GTTTCA	2	12	1167167	1167178	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45358746
515	NC_005791	TTAAGA	2	12	1169700	1169711	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45358749
516	NC_005791	TAGAAT	2	12	1177660	1177671	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45358756
517	NC_005791	TGAAGA	2	12	1177838	1177849	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	45358756
518	NC_005791	AATTGA	2	12	1180034	1180045	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45358756
519	NC_005791	TTGCAA	2	12	1185104	1185115	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45358761
520	NC_005791	TATGAA	2	12	1187365	1187376	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45358763
521	NC_005791	TCGATT	2	12	1191655	1191666	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45358768
522	NC_005791	ATGAAT	2	12	1192742	1192753	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45358769
523	NC_005791	GATTAC	2	12	1198745	1198756	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45358774
524	NC_005791	GGTAAA	2	12	1200487	1200498	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	45358776
525	NC_005791	AATCAA	2	12	1200812	1200823	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	45358777
526	NC_005791	TTGGAA	2	12	1203907	1203918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45358779
527	NC_005791	CAAATC	2	12	1204665	1204676	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	45358780
528	NC_005791	CCAGTT	2	12	1205623	1205634	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	45358781
529	NC_005791	TTTCCC	2	12	1208071	1208082	0 %	50 %	0 %	50 %	45358782
530	NC_005791	GAAACA	2	12	1210238	1210249	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	45358784
531	NC_005791	TTTTGA	2	12	1214729	1214740	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	45358788
532	NC_005791	TGGAAA	2	12	1215265	1215276	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	45358788
533	NC_005791	AAATTC	2	12	1216807	1216818	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	45358790
534	NC_005791	ATTGGA	2	12	1219721	1219732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45358794
535	NC_005791	TTGCAA	2	12	1220646	1220657	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45358795
536	NC_005791	TTGGAA	2	12	1222252	1222263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45358797
537	NC_005791	ACGTTG	2	12	1222394	1222405	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45358798
538	NC_005791	TTGAAT	2	12	1222517	1222528	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	45358798
539	NC_005791	TTGGGG	2	12	1231777	1231788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45358811
540	NC_005791	TTTGAA	2	12	1239551	1239562	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	45358818
541	NC_005791	TCGAAC	2	12	1239669	1239680	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	45358818
542	NC_005791	TTCAGT	2	12	1243124	1243135	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45358822
543	NC_005791	ATTTCT	2	12	1245612	1245623	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45358825
544	NC_005791	CACCTT	2	12	1246032	1246043	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	45358826
545	NC_005791	AATTTG	2	12	1246662	1246673	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	45358826
546	NC_005791	TGCAAC	2	12	1246746	1246757	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	45358826
547	NC_005791	TTTTTA	2	12	1246950	1246961	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	45358827
548	NC_005791	GTAATT	2	12	1248979	1248990	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	45358828
549	NC_005791	TTGCAA	2	12	1252013	1252024	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45358830
550	NC_005791	AGAATT	2	12	1253844	1253855	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45358832
551	NC_005791	TAACTG	2	12	1254393	1254404	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45358833
552	NC_005791	TAAAAT	2	12	1254952	1254963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45358833
553	NC_005791	CATCTT	2	12	1258492	1258503	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	45358837
554	NC_005791	CGGTCT	2	12	1258753	1258764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45358837
555	NC_005791	GTCGTA	2	12	1258985	1258996	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45358837
556	NC_005791	TCCTTT	2	12	1260167	1260178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45358838
557	NC_005791	AAAGAA	2	12	1265622	1265633	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	45358847
558	NC_005791	ATTTTT	2	12	1266354	1266365	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	45358847
559	NC_005791	TGAAGA	2	12	1267308	1267319	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	45358847
560	NC_005791	TACAAT	2	12	1268486	1268497	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	45358848
561	NC_005791	TAAAAT	2	12	1268802	1268813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45358848
562	NC_005791	TGTACT	2	12	1272750	1272761	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45358852
563	NC_005791	ATTTCC	2	12	1276856	1276867	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	45358855
564	NC_005791	TTGCAA	2	12	1278660	1278671	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45358857
565	NC_005791	AAAAGA	2	12	1279988	1279999	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	45358858
566	NC_005791	GAAAAA	2	12	1280333	1280344	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	45358858
567	NC_005791	AAAAGA	2	12	1282448	1282459	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	45358859
568	NC_005791	TTTGGA	2	12	1283052	1283063	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	45358860
569	NC_005791	CAAGAC	2	12	1288828	1288839	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	45358866
570	NC_005791	TTTGAA	2	12	1291741	1291752	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	45358868
571	NC_005791	TAAAAA	2	12	1292073	1292084	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	45358868
572	NC_005791	CTAAAA	2	12	1293226	1293237	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	45358869
573	NC_005791	TTTAAT	2	12	1297288	1297299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45358875
574	NC_005791	ATTTTT	2	12	1298322	1298333	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	45358876
575	NC_005791	CCATTG	2	12	1298930	1298941	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	45358877
576	NC_005791	TTTTTA	2	12	1302880	1302891	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	45358880
577	NC_005791	TTAAAA	2	12	1304162	1304173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45358881
578	NC_005791	AATGTG	2	12	1304979	1304990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45358881
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580	NC_005791	TAATTT	2	12	1316398	1316409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45358898
581	NC_005791	ACTGCG	2	12	1317189	1317200	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	45358899
582	NC_005791	TAGAAT	2	12	1321295	1321306	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45358904
583	NC_005791	TCTGAA	2	12	1321693	1321704	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45358904
584	NC_005791	TGAAAA	2	12	1323036	1323047	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	45358904
585	NC_005791	AAAATT	2	12	1324214	1324225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45358905
586	NC_005791	TTCGTC	2	12	1329120	1329131	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	45358912
587	NC_005791	ACTTTT	2	12	1334333	1334344	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	45358917
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589	NC_005791	TGGAAT	2	12	1337951	1337962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45358922
590	NC_005791	GGTGAA	2	12	1339647	1339658	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	45358924
591	NC_005791	AGTTAG	2	12	1341942	1341953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45358925
592	NC_005791	AGCTGA	2	12	1344231	1344242	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	45358926
593	NC_005791	TTAAAA	2	12	1347831	1347842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45358930
594	NC_005791	TCGAGT	2	12	1354466	1354477	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	45358936
595	NC_005791	GTTTTA	2	12	1356919	1356930	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	45358938
596	NC_005791	ATGAAA	2	12	1358577	1358588	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	45358940
597	NC_005791	TTGGAA	2	12	1360635	1360646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45358943
598	NC_005791	ACATTT	2	12	1360811	1360822	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45358943
599	NC_005791	GCAGGA	2	12	1363976	1363987	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	45358946
600	NC_005791	TGCGTC	2	12	1366872	1366883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45358949
601	NC_005791	TTGAAG	2	12	1372756	1372767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45358956
602	NC_005791	AATCTA	2	12	1381774	1381785	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	45358961
603	NC_005791	ATGAAA	2	12	1382729	1382740	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	45358962
604	NC_005791	AAAAGT	2	12	1383457	1383468	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	45358964
605	NC_005791	ATCGAT	2	12	1386041	1386052	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45358970
606	NC_005791	GTTGAA	2	12	1388032	1388043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45358974
607	NC_005791	AAAAGA	2	12	1390205	1390216	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	45358979
608	NC_005791	AAGCTA	2	12	1397482	1397493	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	45358987
609	NC_005791	GCAGAA	2	12	1397523	1397534	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	45358987
610	NC_005791	AAAAAT	2	12	1400984	1400995	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	45358991
611	NC_005791	TCCTGT	2	12	1404626	1404637	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	45358995
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