MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Methanosarcina mazei Go1 chromosome

Total Repeats: 1666

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003901	ATAAAA	2	12	2493989	2494000	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_003901	TGTGCT	2	12	2497035	2497046	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	21228194
1003	NC_003901	AAGCAT	2	12	2499596	2499607	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	21228195
1004	NC_003901	AAAGCT	2	12	2500773	2500784	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	21228196
1005	NC_003901	TTTTTA	2	12	2500843	2500854	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_003901	TCCAAA	2	12	2501135	2501146	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	21228197
1007	NC_003901	CTTTCC	2	12	2501920	2501931	0 %	50 %	0 %	50 %	21228198
1008	NC_003901	CTCTTA	2	12	2502572	2502583	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21228198
1009	NC_003901	GCCTGT	2	12	2503537	2503548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_003901	GCTAAT	2	12	2506897	2506908	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1011	NC_003901	TTTTAC	2	12	2511986	2511997	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	21228203
1012	NC_003901	CAAAAT	2	12	2512078	2512089	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	21228203
1013	NC_003901	TGAAAA	2	12	2515232	2515243	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	21228206
1014	NC_003901	AAAATG	2	12	2517649	2517660	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	21228208
1015	NC_003901	TTTTAC	2	12	2518584	2518595	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	21228209
1016	NC_003901	CAACAT	2	12	2518782	2518793	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	21228209
1017	NC_003901	AAAATT	2	12	2520461	2520472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21228210
1018	NC_003901	GTTGAA	2	12	2522113	2522124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_003901	CGAGGT	2	12	2522749	2522760	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	21228212
1020	NC_003901	ATCTTC	2	12	2523445	2523456	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21228213
1021	NC_003901	TTCCAG	2	12	2527797	2527808	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	21228217
1022	NC_003901	CTTGAG	2	12	2536638	2536649	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	21228224
1023	NC_003901	TCCGGG	2	12	2537705	2537716	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_003901	GCTCCT	2	12	2542832	2542843	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	21228232
1025	NC_003901	AGCTTG	2	12	2547322	2547333	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	21228243
1026	NC_003901	CAGAGC	2	12	2547639	2547650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21228244
1027	NC_003901	TTTTTG	2	12	2552358	2552369	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_003901	TTTTTG	7	42	2552398	2552439	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_003901	GTTTTG	2	12	2552440	2552451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_003901	TATTGC	2	12	2552727	2552738	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21228251
1031	NC_003901	AATTAA	2	12	2554971	2554982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_003901	ATTTTT	2	12	2561363	2561374	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_003901	TCATTG	2	12	2562618	2562629	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21228261
1034	NC_003901	ATCAAC	2	12	2566422	2566433	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	21228265
1035	NC_003901	TCACAA	2	12	2566529	2566540	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	21228265
1036	NC_003901	CAAAAA	2	12	2568549	2568560	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	21228268
1037	NC_003901	GTGCAT	2	12	2571891	2571902	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	21228271
1038	NC_003901	GAAAAG	2	12	2576540	2576551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21228275
1039	NC_003901	AAAATT	2	12	2577592	2577603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_003901	TTTTCT	2	12	2582107	2582118	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1041	NC_003901	TTTCAA	2	12	2582356	2582367	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	21228280
1042	NC_003901	AATGCC	2	12	2582609	2582620	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	21228280
1043	NC_003901	GTTTTA	2	12	2582734	2582745	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	21228280
1044	NC_003901	TCTTTC	2	12	2584584	2584595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21228280
1045	NC_003901	AACAGA	2	12	2584816	2584827	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1046	NC_003901	AGATAA	2	12	2591530	2591541	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	21228287
1047	NC_003901	TTCTCC	2	12	2592389	2592400	0 %	50 %	0 %	50 %	21228287
1048	NC_003901	TGATAA	2	12	2594633	2594644	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	21228287
1049	NC_003901	TGGACC	2	12	2594810	2594821	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21228287
1050	NC_003901	TAATTT	2	12	2594934	2594945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21228288
1051	NC_003901	GTCCTA	2	12	2596285	2596296	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	21228289
1052	NC_003901	TTAATG	2	12	2596416	2596427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	21228290
1053	NC_003901	ATCTTT	2	12	2600141	2600152	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1054	NC_003901	GGACTG	2	12	2602348	2602359	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	21228295
1055	NC_003901	AAAGAA	2	12	2604526	2604537	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	21228296
1056	NC_003901	GGCTGG	2	12	2610296	2610307	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	21228299
1057	NC_003901	TATATC	2	12	2610865	2610876	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1058	NC_003901	ACATAT	2	12	2613641	2613652	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	21228301
1059	NC_003901	TAAATT	2	12	2615323	2615334	50 %	50 %	0 %	0 %	21228303
1060	NC_003901	TGGGAT	2	12	2617715	2617726	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	21228306
1061	NC_003901	GAAAAA	2	12	2620089	2620100	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_003901	AATTTC	2	12	2621778	2621789	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1063	NC_003901	CAATTT	2	12	2621923	2621934	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1064	NC_003901	TGATCC	2	12	2622066	2622077	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	21228309
1065	NC_003901	GGCATC	2	12	2622773	2622784	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21228310
1066	NC_003901	CCCCAT	2	12	2622854	2622865	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	21228310
1067	NC_003901	GGTAGC	2	12	2624710	2624721	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	21228311
1068	NC_003901	ACCCTG	2	12	2625176	2625187	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	21228311
1069	NC_003901	AATATC	2	12	2625538	2625549	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	21228311
1070	NC_003901	TTTTTA	2	12	2631104	2631115	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21228313
1071	NC_003901	CTAAAT	2	12	2632558	2632569	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	21228314
1072	NC_003901	AAATGA	2	12	2633783	2633794	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_003901	TTCAGG	2	12	2636736	2636747	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	21228315
1074	NC_003901	AGTTAT	2	12	2642482	2642493	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	21228319
1075	NC_003901	GATATG	2	12	2646040	2646051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21228322
1076	NC_003901	TAAAAA	2	12	2651349	2651360	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_003901	CCTTTT	2	12	2655504	2655515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21228330
1078	NC_003901	GGGAGT	2	12	2659047	2659058	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_003901	TAATTT	2	12	2659683	2659694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_003901	CACTTT	2	12	2661260	2661271	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21228335
1081	NC_003901	TTCCGT	2	12	2662067	2662078	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	21228335
1082	NC_003901	CACATT	2	12	2662419	2662430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21228335
1083	NC_003901	TAAGAT	2	12	2668840	2668851	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	21228341
1084	NC_003901	CAGGAA	2	12	2669832	2669843	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	21228342
1085	NC_003901	TCACAA	2	12	2673303	2673314	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	21228347
1086	NC_003901	TTGTTC	2	12	2676302	2676313	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	21228350
1087	NC_003901	TTCAGG	2	12	2678136	2678147	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	21228353
1088	NC_003901	CTTCGG	2	12	2680795	2680806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21228355
1089	NC_003901	GAAACC	2	12	2681733	2681744	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	21228355
1090	NC_003901	CTCCAT	2	12	2685567	2685578	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	21228361
1091	NC_003901	ACCTTT	2	12	2686321	2686332	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21228363
1092	NC_003901	TTCGTT	2	12	2686410	2686421	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	21228363
1093	NC_003901	CTCTTT	2	12	2687802	2687813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21228364
1094	NC_003901	AATTTC	2	12	2688346	2688357	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1095	NC_003901	TGCATG	2	12	2692019	2692030	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	21228367
1096	NC_003901	ACTACC	2	12	2692527	2692538	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	21228367
1097	NC_003901	GCCTGC	2	12	2692745	2692756	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	21228367
1098	NC_003901	ATGGGC	2	12	2697876	2697887	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	21228373
1099	NC_003901	TGTTCT	2	12	2700159	2700170	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	21228374
1100	NC_003901	TTTAAT	2	12	2703737	2703748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21228377
1101	NC_003901	GTCCCA	2	12	2709004	2709015	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	21228378
1102	NC_003901	CTCTAT	2	12	2711716	2711727	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21228379
1103	NC_003901	TCCCAG	2	12	2712840	2712851	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	21228379
1104	NC_003901	GCTTCA	2	12	2722611	2722622	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	21228385
1105	NC_003901	TCACAC	2	12	2728332	2728343	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	21228391
1106	NC_003901	CCTGAG	2	12	2733604	2733615	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21228394
1107	NC_003901	CGTGAA	2	12	2733792	2733803	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	21228394
1108	NC_003901	AGGTTG	2	12	2737627	2737638	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	21228396
1109	NC_003901	CAATAA	2	12	2737829	2737840	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	21228396
1110	NC_003901	ATTTTA	2	12	2740058	2740069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_003901	AGTGGA	2	12	2740195	2740206	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	21228397
1112	NC_003901	CCCATT	2	12	2746296	2746307	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	21228399
1113	NC_003901	CAGGGA	2	12	2748932	2748943	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	21228400
1114	NC_003901	TCCTCT	2	12	2749134	2749145	0 %	50 %	0 %	50 %	21228400
1115	NC_003901	ATTTTC	2	12	2750695	2750706	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	21228401
1116	NC_003901	TTCATT	2	12	2750710	2750721	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	21228401
1117	NC_003901	AAATTT	2	12	2754242	2754253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_003901	TGGAGG	2	12	2754887	2754898	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	21228404
1119	NC_003901	TTTTTC	2	12	2763961	2763972	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	21228410
1120	NC_003901	TACAGG	2	12	2764846	2764857	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	21228411
1121	NC_003901	CTTTTC	2	12	2765026	2765037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21228411
1122	NC_003901	CTGCAC	2	12	2765796	2765807	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	21228412
1123	NC_003901	CATGCA	2	12	2771529	2771540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	21228416
1124	NC_003901	ATAATT	2	12	2772252	2772263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_003901	AGGTTA	2	12	2774608	2774619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21228419
1126	NC_003901	GAATGC	2	12	2774784	2774795	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	21228419
1127	NC_003901	GTTGTG	2	12	2775424	2775435	0 %	50 %	50 %	0 %	21228420
1128	NC_003901	GTTGAT	2	12	2775532	2775543	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	21228420
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1130	NC_003901	TAATTT	2	12	2778167	2778178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_003901	TGGTGT	2	12	2778557	2778568	0 %	50 %	50 %	0 %	21228422
1132	NC_003901	GGAATT	2	12	2779134	2779145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21228422
1133	NC_003901	ATTTTT	2	12	2783520	2783531	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_003901	TTCAGG	2	12	2786486	2786497	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	21228430
1135	NC_003901	GTTGCA	2	12	2787269	2787280	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	21228430
1136	NC_003901	TTCGGT	2	12	2787787	2787798	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	21228430
1137	NC_003901	TTTCTC	2	12	2788527	2788538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21228433
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1139	NC_003901	AAAATC	2	12	2792033	2792044	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	21228435
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1141	NC_003901	TAAACT	2	12	2794512	2794523	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1142	NC_003901	CAAAAA	2	12	2796176	2796187	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	21228441
1143	NC_003901	CTTTTA	2	12	2796335	2796346	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1144	NC_003901	CTTTTA	2	12	2796489	2796500	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	21228442
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1146	NC_003901	TTTAAA	2	12	2805958	2805969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_003901	TTAAAA	2	12	2807511	2807522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21228450
1148	NC_003901	AGTAAA	2	12	2808550	2808561	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_003901	TCTGGC	2	12	2810299	2810310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1150	NC_003901	GAACCT	2	12	2815868	2815879	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	21228460
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1153	NC_003901	TATAAT	3	18	2827862	2827879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1154	NC_003901	TGTAAT	2	12	2827985	2827996	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1155	NC_003901	GCAACC	2	12	2838754	2838765	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	21228482
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1163	NC_003901	TTACAA	2	12	2853008	2853019	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1164	NC_003901	AGAGCC	2	12	2854758	2854769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21228494
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1181	NC_003901	GTTGAA	2	12	2899283	2899294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21228532
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1214	NC_003901	TAATCT	2	12	2998156	2998167	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1215	NC_003901	GACAGG	2	12	3000258	3000269	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	21228617
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1217	NC_003901	GAAAGC	2	12	3004466	3004477	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	21228620
1218	NC_003901	GGGCTT	2	12	3006176	3006187	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	21228620
1219	NC_003901	ACCTGG	2	12	3008079	3008090	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21228622
1220	NC_003901	TTAATA	2	12	3009114	3009125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1221	NC_003901	GTTTTT	2	12	3010225	3010236	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	21228626
1222	NC_003901	CAACTG	2	12	3010697	3010708	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	21228626
1223	NC_003901	CTGGAG	2	12	3010761	3010772	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	21228626
1224	NC_003901	GTTTTG	2	12	3011752	3011763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21228627
1225	NC_003901	TCAACA	2	12	3014573	3014584	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	21228630
1226	NC_003901	CTGTTT	2	12	3015360	3015371	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	21228631
1227	NC_003901	ATCTTC	2	12	3015514	3015525	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1228	NC_003901	AAAGGA	2	12	3017037	3017048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21228632
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1231	NC_003901	GTTTTG	2	12	3039002	3039013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21228656
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1242	NC_003901	GATCCA	2	12	3058139	3058150	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	21228669
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1325	NC_003901	AATTGT	2	12	3303277	3303288	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1330	NC_003901	AAGAGA	2	12	3317513	3317524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21228869
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1333	NC_003901	TCAGTA	2	12	3319969	3319980	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	21228871
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1335	NC_003901	CCTTAA	2	12	3324670	3324681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1336	NC_003901	TTTCAA	2	12	3325107	3325118	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	21228875
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1339	NC_003901	TCCTAT	2	12	3330783	3330794	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21228880
1340	NC_003901	AATAAA	2	12	3333284	3333295	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1341	NC_003901	AATGCG	2	12	3334382	3334393	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	21228882
1342	NC_003901	GAAGCT	2	12	3335169	3335180	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1343	NC_003901	GCTAAT	2	12	3338813	3338824	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1344	NC_003901	CAAGTA	2	12	3339342	3339353	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	21228887
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1446	NC_003901	GCTTAT	2	12	3586732	3586743	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1451	NC_003901	TTTCAG	2	12	3592465	3592476	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21229076
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1455	NC_003901	GTGGCT	2	12	3601028	3601039	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	21229083
1456	NC_003901	TTCAGG	2	12	3604216	3604227	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	21229085
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1458	NC_003901	TATTTT	2	12	3605382	3605393	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1459	NC_003901	ATCAAT	2	12	3607495	3607506	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	21229089
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1462	NC_003901	CTGGTC	2	12	3610402	3610413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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