MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Methanosarcina mazei Go1 chromosome

Total Repeats: 1666

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003901	CAAGCC	2	12	1200611	1200622	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	21227130
502	NC_003901	ATTGCA	2	12	1200625	1200636	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	21227130
503	NC_003901	GATTGC	2	12	1209971	1209982	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	21227135
504	NC_003901	GTTTTT	2	12	1211905	1211916	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_003901	TCCTGT	2	12	1213381	1213392	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	21227138
506	NC_003901	TTCCTC	2	12	1215396	1215407	0 %	50 %	0 %	50 %	21227140
507	NC_003901	AACCAT	2	12	1217967	1217978	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	21227143
508	NC_003901	ACAGGG	2	12	1218918	1218929	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
509	NC_003901	ATATAA	2	12	1224283	1224294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_003901	AAAGAA	2	12	1233639	1233650	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	21227155
511	NC_003901	GACGGG	2	12	1236953	1236964	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	21227156
512	NC_003901	CTTGTC	2	12	1244732	1244743	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	21227162
513	NC_003901	CCCTGA	2	12	1245557	1245568	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	21227163
514	NC_003901	CTTGCC	2	12	1247277	1247288	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	21227164
515	NC_003901	TTCCCT	2	12	1248793	1248804	0 %	50 %	0 %	50 %	21227165
516	NC_003901	GAAAAA	2	12	1258448	1258459	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	21227173
517	NC_003901	ATAGGA	2	12	1261954	1261965	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_003901	TTCATT	2	12	1262118	1262129	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
519	NC_003901	AAGACC	2	12	1262579	1262590	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	21227175
520	NC_003901	GCGGTG	2	12	1262868	1262879	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	21227175
521	NC_003901	TTTGTA	2	12	1264878	1264889	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	21227177
522	NC_003901	ATGCTG	2	12	1267468	1267479	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	21227179
523	NC_003901	GGGAAA	2	12	1267946	1267957	50 %	0 %	50 %	0 %	21227179
524	NC_003901	TTTGAA	2	12	1270957	1270968	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_003901	CTGCTT	2	12	1272240	1272251	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	21227182
526	NC_003901	CCTGAA	2	12	1272758	1272769	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	21227182
527	NC_003901	CAATAA	2	12	1272791	1272802	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	21227182
528	NC_003901	TCAATA	2	12	1274051	1274062	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
529	NC_003901	GGAAAA	2	12	1276276	1276287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21227186
530	NC_003901	GAAGAT	2	12	1276458	1276469	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	21227186
531	NC_003901	AATTAA	2	12	1286245	1286256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21227195
532	NC_003901	TGGATA	2	12	1287151	1287162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21227195
533	NC_003901	GCGAAG	2	12	1287235	1287246	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	21227195
534	NC_003901	AGAAAG	2	12	1293933	1293944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21227202
535	NC_003901	TGATAT	2	12	1296419	1296430	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_003901	CAGCCG	2	12	1302617	1302628	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	21227210
537	NC_003901	TAAAAA	2	12	1305033	1305044	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_003901	TCGAGA	2	12	1305712	1305723	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	21227215
539	NC_003901	AATAGA	2	12	1309174	1309185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	21227218
540	NC_003901	CTCCAG	2	12	1310562	1310573	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
541	NC_003901	ATTCAA	2	12	1316836	1316847	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	21227221
542	NC_003901	GATATG	2	12	1320163	1320174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_003901	GATATA	2	12	1323752	1323763	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	21227224
544	NC_003901	ATATCA	2	12	1327020	1327031	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	21227226
545	NC_003901	CAGAAC	2	12	1330332	1330343	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	21227228
546	NC_003901	GTTAGC	2	12	1338626	1338637	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
547	NC_003901	GAATAA	2	12	1339026	1339037	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	21227237
548	NC_003901	TGATAT	2	12	1339068	1339079	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	21227237
549	NC_003901	AAAGGG	2	12	1341843	1341854	50 %	0 %	50 %	0 %	21227238
550	NC_003901	CCTTTA	2	12	1343699	1343710	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21227238
551	NC_003901	CCACAA	2	12	1349903	1349914	50 %	0 %	0 %	50 %	21227242
552	NC_003901	TTATAA	2	12	1351024	1351035	50 %	50 %	0 %	0 %	21227243
553	NC_003901	ATAAAT	2	12	1351486	1351497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21227243
554	NC_003901	TCAGGA	2	12	1356363	1356374	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	21227246
555	NC_003901	CCTTTA	2	12	1359235	1359246	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21227247
556	NC_003901	CCAATT	2	12	1361528	1361539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21227248
557	NC_003901	CCACAA	2	12	1363940	1363951	50 %	0 %	0 %	50 %	21227249
558	NC_003901	AAAGGC	2	12	1378498	1378509	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	21227260
559	NC_003901	TGGAGA	2	12	1381220	1381231	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_003901	AGATTG	2	12	1381668	1381679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21227264
561	NC_003901	TTTTTC	2	12	1382114	1382125	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	21227264
562	NC_003901	TCAGGT	2	12	1385164	1385175	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
563	NC_003901	ATATTT	2	12	1394681	1394692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_003901	TCATAC	2	12	1397723	1397734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21227280
565	NC_003901	CTTCTG	2	12	1399660	1399671	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	21227281
566	NC_003901	CCTTGC	2	12	1402080	1402091	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	21227282
567	NC_003901	CGGCTG	2	12	1405683	1405694	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	21227285
568	NC_003901	CCTTTG	2	12	1405718	1405729	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	21227285
569	NC_003901	AAAATC	2	12	1407745	1407756	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
570	NC_003901	AAAATC	2	12	1407775	1407786	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
571	NC_003901	AAAATC	3	18	1407793	1407810	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
572	NC_003901	ATAGAA	2	12	1407881	1407892	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_003901	TTAATT	2	12	1412477	1412488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_003901	AGAGAC	2	12	1414697	1414708	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	21227292
575	NC_003901	ACCATT	2	12	1417069	1417080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21227294
576	NC_003901	AATAGA	2	12	1419279	1419290	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_003901	CTTTCA	2	12	1420864	1420875	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21227297
578	NC_003901	ACAGGG	2	12	1428916	1428927	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
579	NC_003901	AAAAAT	2	12	1430310	1430321	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	21227307
580	NC_003901	TTTAAT	2	12	1430461	1430472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21227307
581	NC_003901	TTTTTG	2	12	1431304	1431315	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	21227309
582	NC_003901	CTTCTG	2	12	1434156	1434167	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	21227313
583	NC_003901	TTCTCT	2	12	1436458	1436469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21227316
584	NC_003901	ACAAAT	3	18	1438436	1438453	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
585	NC_003901	CTGCCG	2	12	1440725	1440736	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	21227319
586	NC_003901	TGTATT	2	12	1451188	1451199	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_003901	TTGAAT	2	12	1451532	1451543	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_003901	GAAAAA	2	12	1452057	1452068	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	21227327
589	NC_003901	TATGCT	2	12	1452270	1452281	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21227327
590	NC_003901	ATTTTC	2	12	1464218	1464229	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
591	NC_003901	GAAATA	2	12	1467810	1467821	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	21227341
592	NC_003901	ACCTGA	2	12	1471015	1471026	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	21227344
593	NC_003901	TCCTTC	4	24	1477034	1477057	0 %	50 %	0 %	50 %	21227348
594	NC_003901	CGATCC	2	12	1478053	1478064	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	21227348
595	NC_003901	CGATCT	2	12	1491843	1491854	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	21227358
596	NC_003901	GTTGAA	2	12	1495611	1495622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21227362
597	NC_003901	AAGTTC	2	12	1498686	1498697	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
598	NC_003901	TCAATA	2	12	1500122	1500133	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	21227366
599	NC_003901	TGTAAA	2	12	1500237	1500248	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	21227366
600	NC_003901	AAATAT	2	12	1500354	1500365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21227366
601	NC_003901	CCTGTG	2	12	1506506	1506517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21227373
602	NC_003901	TCGTGG	2	12	1507049	1507060	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	21227374
603	NC_003901	GAAAGC	2	12	1507450	1507461	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	21227374
604	NC_003901	GCAGGA	2	12	1509165	1509176	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	21227376
605	NC_003901	TTTGAA	2	12	1511719	1511730	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	21227378
606	NC_003901	CTGCAA	2	12	1514775	1514786	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	21227381
607	NC_003901	AAGATA	2	12	1516871	1516882	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_003901	TCCATA	2	12	1517645	1517656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21227383
609	NC_003901	CTTGGG	2	12	1521369	1521380	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
610	NC_003901	ACCCGT	2	12	1523928	1523939	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
611	NC_003901	GCTGAA	2	12	1527083	1527094	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	21227387
612	NC_003901	GGAAGA	2	12	1527565	1527576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_003901	TGAAGA	2	12	1529832	1529843	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	21227389
614	NC_003901	TTTCAT	2	12	1533658	1533669	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	21227393
615	NC_003901	GTGCAG	2	12	1534740	1534751	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	21227394
616	NC_003901	GAACTT	2	12	1535242	1535253	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	21227394
617	NC_003901	TGTGGA	2	12	1536717	1536728	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	21227396
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619	NC_003901	TAAGGG	2	12	1541828	1541839	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	21227398
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662	NC_003901	CCTGAA	2	12	1647217	1647228	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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720	NC_003901	AATATA	2	12	1761273	1761284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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723	NC_003901	TATCCG	2	12	1776722	1776733	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	21227592
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727	NC_003901	ATATCC	2	12	1792729	1792740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21227605
728	NC_003901	CAATTG	2	12	1797149	1797160	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
729	NC_003901	CGGATT	2	12	1797167	1797178	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
730	NC_003901	GAATTC	2	12	1803564	1803575	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	21227616
731	NC_003901	TCAAGG	2	12	1811732	1811743	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	21227622
732	NC_003901	ATGCCG	2	12	1813042	1813053	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21227623
733	NC_003901	GCTTGA	2	12	1813589	1813600	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	21227623
734	NC_003901	GCTGAA	2	12	1814267	1814278	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
735	NC_003901	AGGCTG	2	12	1815448	1815459	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	21227624
736	NC_003901	CTTTGC	2	12	1818395	1818406	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	21227627
737	NC_003901	ATATCC	2	12	1819590	1819601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21227628
738	NC_003901	CCACAA	2	12	1819666	1819677	50 %	0 %	0 %	50 %	21227628
739	NC_003901	TCTTTT	2	12	1821069	1821080	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	21227629
740	NC_003901	CTTATT	2	12	1822525	1822536	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	161485674
741	NC_003901	CGGCTT	2	12	1824622	1824633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161485674
742	NC_003901	ACAGGC	2	12	1825664	1825675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
743	NC_003901	TGCGGG	2	12	1827817	1827828	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
744	NC_003901	TGCCGG	2	12	1831922	1831933	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	21227635
745	NC_003901	AGGAAA	2	12	1832438	1832449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21227635
746	NC_003901	TCATGT	2	12	1837887	1837898	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21227641
747	NC_003901	GATCAT	2	12	1843808	1843819	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	21227648
748	NC_003901	GTACCG	2	12	1843929	1843940	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21227648
749	NC_003901	TTCCAG	2	12	1844138	1844149	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	21227649
750	NC_003901	TTATAT	2	12	1845226	1845237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
751	NC_003901	GCTATT	2	12	1847716	1847727	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21227651
752	NC_003901	GTCTGG	2	12	1850820	1850831	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	21227653
753	NC_003901	CTTTTT	2	12	1853747	1853758	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	21227655
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755	NC_003901	TAATAT	2	12	1855948	1855959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
756	NC_003901	TTTATA	2	12	1855987	1855998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
757	NC_003901	CTCTAT	2	12	1859779	1859790	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21227662
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760	NC_003901	GTTACT	2	12	1862688	1862699	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21227665
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766	NC_003901	TTCCAT	2	12	1889236	1889247	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21227690
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772	NC_003901	TTAGAT	2	12	1891245	1891256	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
773	NC_003901	CACTGA	2	12	1892494	1892505	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	21227691
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777	NC_003901	TGAACT	2	12	1900055	1900066	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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784	NC_003901	AGAAAA	2	12	1931169	1931180	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
785	NC_003901	GTTGAA	2	12	1935862	1935873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21227726
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799	NC_003901	TAATAT	2	12	1961575	1961586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
800	NC_003901	ATTTGG	2	12	1963453	1963464	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	21227747
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842	NC_003901	AATATT	2	12	2078473	2078484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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958	NC_003901	AAAGAG	2	12	2387851	2387862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21228105
959	NC_003901	GAAAAC	2	12	2389227	2389238	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	21228106
960	NC_003901	GCAAGG	2	12	2390719	2390730	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	21228106
961	NC_003901	TTGACT	2	12	2391611	2391622	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21228106
962	NC_003901	GCTGAA	2	12	2392502	2392513	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	21228107
963	NC_003901	AAACGA	2	12	2394172	2394183	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	21228109
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965	NC_003901	CACTCG	2	12	2394722	2394733	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
966	NC_003901	TGATGT	2	12	2395401	2395412	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	21228111
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971	NC_003901	TTTTAT	2	12	2399889	2399900	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
972	NC_003901	ACGGGT	2	12	2400952	2400963	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
973	NC_003901	CCCAAG	2	12	2403511	2403522	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
974	NC_003901	ATTGCA	2	12	2412033	2412044	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	21228122
975	NC_003901	AGTTGA	2	12	2412803	2412814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21228122
976	NC_003901	GAAGCT	2	12	2412945	2412956	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	21228122
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981	NC_003901	TGGCTC	2	12	2432493	2432504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21228136
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992	NC_003901	TTTCTG	2	12	2473982	2473993	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
993	NC_003901	CTGAGT	2	12	2478661	2478672	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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