MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanosarcina mazei Go1 chromosome

Total Repeats: 35739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003901	GCA	2	6	534	539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
2	NC_003901	GAA	2	6	600	605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226103
3	NC_003901	GAT	2	6	792	797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226103
4	NC_003901	ATG	2	6	841	846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226103
5	NC_003901	GCA	2	6	891	896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
6	NC_003901	CAG	2	6	940	945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
7	NC_003901	GAT	2	6	948	953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226103
8	NC_003901	TCA	2	6	994	999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226103
9	NC_003901	CAG	2	6	1066	1071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
10	NC_003901	GCA	2	6	1109	1114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
11	NC_003901	TGC	2	6	1196	1201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226103
12	NC_003901	GAA	3	9	1470	1478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226103
13	NC_003901	TAA	2	6	1508	1513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226103
14	NC_003901	GGC	2	6	1569	1574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21226103
15	NC_003901	TTG	2	6	1600	1605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226103
16	NC_003901	GAA	2	6	1689	1694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226103
17	NC_003901	TAC	2	6	1821	1826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226103
18	NC_003901	TAA	2	6	1853	1858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226103
19	NC_003901	TAA	2	6	1861	1866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226103
20	NC_003901	ACA	2	6	1870	1875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226103
21	NC_003901	CTG	2	6	1879	1884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226103
22	NC_003901	AGC	2	6	1928	1933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
23	NC_003901	CAA	2	6	1934	1939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226103
24	NC_003901	GCA	2	6	2098	2103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226103
25	NC_003901	GTA	2	6	2764	2769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226104
26	NC_003901	GAT	2	6	2881	2886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226104
27	NC_003901	GAT	2	6	2965	2970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226104
28	NC_003901	ACA	2	6	3249	3254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226104
29	NC_003901	CAA	2	6	3516	3521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226104
30	NC_003901	GAA	2	6	3682	3687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226104
31	NC_003901	CAG	2	6	3927	3932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226104
32	NC_003901	GAT	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226104
33	NC_003901	TGT	2	6	4017	4022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226104
34	NC_003901	TAA	2	6	4365	4370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226105
35	NC_003901	GAA	2	6	4445	4450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226105
36	NC_003901	TCT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226106
37	NC_003901	GAA	2	6	4789	4794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226106
38	NC_003901	CTC	2	6	4811	4816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226106
39	NC_003901	GGT	2	6	5114	5119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21226106
40	NC_003901	GGA	2	6	5404	5409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226106
41	NC_003901	TTG	2	6	5417	5422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226106
42	NC_003901	GCA	2	6	5455	5460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226106
43	NC_003901	AGC	2	6	5463	5468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226106
44	NC_003901	CAG	2	6	5587	5592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226106
45	NC_003901	CTG	2	6	5637	5642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226107
46	NC_003901	AGA	2	6	5688	5693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226107
47	NC_003901	CTG	2	6	5696	5701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226107
48	NC_003901	TGC	2	6	5724	5729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226107
49	NC_003901	CTT	2	6	6017	6022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226107
50	NC_003901	GGA	3	9	6050	6058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226107
51	NC_003901	AGC	2	6	6132	6137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226107
52	NC_003901	TGG	2	6	6188	6193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21226107
53	NC_003901	TGG	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21226107
54	NC_003901	AAT	2	6	6457	6462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226107
55	NC_003901	AAT	2	6	6541	6546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226108
56	NC_003901	GAA	2	6	6550	6555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226108
57	NC_003901	TGT	2	6	6693	6698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226108
58	NC_003901	CTT	2	6	6724	6729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226108
59	NC_003901	CCT	2	6	6754	6759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226108
60	NC_003901	GGA	2	6	6915	6920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226108
61	NC_003901	TGA	2	6	6935	6940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226108
62	NC_003901	AGA	2	6	7030	7035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226108
63	NC_003901	TGC	2	6	7260	7265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226108
64	NC_003901	GGA	2	6	7468	7473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226108
65	NC_003901	AAT	2	6	7486	7491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226108
66	NC_003901	AAG	2	6	7567	7572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226109
67	NC_003901	GAG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226109
68	NC_003901	TGT	2	6	8068	8073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226109
69	NC_003901	CTG	2	6	8195	8200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226110
70	NC_003901	TCA	2	6	8259	8264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226110
71	NC_003901	CTG	2	6	8447	8452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226110
72	NC_003901	AAT	2	6	8669	8674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226110
73	NC_003901	CAG	2	6	8680	8685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226110
74	NC_003901	TGC	2	6	8717	8722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226110
75	NC_003901	GGC	2	6	8889	8894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21226110
76	NC_003901	TAA	2	6	8986	8991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226110
77	NC_003901	AAC	2	6	9005	9010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226110
78	NC_003901	TTG	2	6	9073	9078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226110
79	NC_003901	CCG	2	6	9099	9104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21226110
80	NC_003901	AGG	2	6	9152	9157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226110
81	NC_003901	TCT	2	6	9165	9170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226110
82	NC_003901	AGG	2	6	9335	9340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226110
83	NC_003901	AGG	2	6	9704	9709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226111
84	NC_003901	CCT	2	6	9712	9717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226111
85	NC_003901	AGA	2	6	9974	9979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226111
86	NC_003901	GCT	2	6	9993	9998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226111
87	NC_003901	TAT	2	6	10202	10207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21226111
88	NC_003901	TTG	2	6	10495	10500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226111
89	NC_003901	CCG	2	6	10521	10526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21226111
90	NC_003901	TTC	2	6	10607	10612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226111
91	NC_003901	GCT	2	6	10639	10644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226111
92	NC_003901	AGG	2	6	10757	10762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226111
93	NC_003901	TTC	2	6	10795	10800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226111
94	NC_003901	ATA	2	6	10899	10904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226111
95	NC_003901	ATG	2	6	11208	11213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226112
96	NC_003901	TAA	2	6	11214	11219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226112
97	NC_003901	TCC	2	6	11243	11248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226112
98	NC_003901	AAT	2	6	11263	11268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226112
99	NC_003901	GAA	2	6	12775	12780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226113
100	NC_003901	GAA	2	6	13047	13052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226113
101	NC_003901	GAC	2	6	14568	14573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226114
102	NC_003901	AGA	2	6	14582	14587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226114
103	NC_003901	GAA	3	9	14622	14630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226114
104	NC_003901	AGA	2	6	15454	15459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226115
105	NC_003901	TTA	2	6	15510	15515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21226115
106	NC_003901	AAT	2	6	15599	15604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226115
107	NC_003901	TGG	2	6	16178	16183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21226116
108	NC_003901	AGA	2	6	16209	16214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226116
109	NC_003901	CAG	2	6	16358	16363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226116
110	NC_003901	GGA	2	6	16396	16401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226116
111	NC_003901	CTT	2	6	16767	16772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226117
112	NC_003901	CTT	2	6	16831	16836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226117
113	NC_003901	TCT	2	6	16895	16900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226117
114	NC_003901	GCC	2	6	16955	16960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21226117
115	NC_003901	CTG	2	6	16982	16987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226117
116	NC_003901	AAT	2	6	17025	17030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226117
117	NC_003901	GAC	2	6	17042	17047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226117
118	NC_003901	TGG	2	6	17315	17320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21226117
119	NC_003901	CAT	2	6	17335	17340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226117
120	NC_003901	TCC	2	6	17356	17361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226117
121	NC_003901	GTA	2	6	18988	18993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226118
122	NC_003901	CTT	2	6	19768	19773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226119
123	NC_003901	TTG	2	6	19780	19785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226119
124	NC_003901	TTC	2	6	19847	19852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226119
125	NC_003901	TGC	2	6	19935	19940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226119
126	NC_003901	CCT	2	6	20169	20174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226119
127	NC_003901	ATC	2	6	20216	20221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226119
128	NC_003901	GAG	2	6	20235	20240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226119
129	NC_003901	GAA	2	6	20367	20372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226119
130	NC_003901	AAT	2	6	20405	20410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226119
131	NC_003901	CAT	2	6	20483	20488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226119
132	NC_003901	ACA	2	6	21910	21915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226120
133	NC_003901	AGA	2	6	22122	22127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226120
134	NC_003901	TTC	2	6	22758	22763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226121
135	NC_003901	AGA	2	6	22815	22820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226121
136	NC_003901	TGA	2	6	22894	22899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226121
137	NC_003901	TTC	2	6	22945	22950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226121
138	NC_003901	CAG	2	6	22996	23001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226121
139	NC_003901	AAG	2	6	23097	23102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226121
140	NC_003901	AAT	2	6	23227	23232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226121
141	NC_003901	CAC	2	6	23276	23281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21226121
142	NC_003901	AGG	2	6	23292	23297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226121
143	NC_003901	CCT	2	6	23370	23375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226121
144	NC_003901	TGT	2	6	23487	23492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226121
145	NC_003901	ATC	2	6	23496	23501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226121
146	NC_003901	TGC	2	6	23539	23544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226121
147	NC_003901	TCA	2	6	23637	23642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226121
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150	NC_003901	CTT	2	6	24337	24342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226122
151	NC_003901	TCA	2	6	24355	24360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226122
152	NC_003901	TAC	2	6	24435	24440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226122
153	NC_003901	CTT	2	6	24445	24450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226122
154	NC_003901	CTT	3	9	24566	24574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226122
155	NC_003901	AAC	2	6	24639	24644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226122
156	NC_003901	TCC	2	6	24719	24724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226122
157	NC_003901	ACA	2	6	24790	24795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226122
158	NC_003901	CTT	2	6	24797	24802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226122
159	NC_003901	TTC	2	6	24934	24939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226122
160	NC_003901	CGC	2	6	24990	24995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21226122
161	NC_003901	ATT	2	6	24997	25002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21226122
162	NC_003901	AGG	2	6	25097	25102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226122
163	NC_003901	TCT	2	6	25105	25110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226122
164	NC_003901	CTG	2	6	25129	25134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226122
165	NC_003901	TGT	2	6	25162	25167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226122
166	NC_003901	CAC	2	6	25226	25231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21226122
167	NC_003901	TTC	2	6	25258	25263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226122
168	NC_003901	CAG	2	6	25280	25285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226122
169	NC_003901	TCT	2	6	25294	25299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226122
170	NC_003901	AAT	2	6	26034	26039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226123
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173	NC_003901	AAG	2	6	26860	26865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226124
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207	NC_003901	TAA	2	6	31678	31683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226130
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246	NC_003901	GTT	2	6	36584	36589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226133
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250	NC_003901	TTC	2	6	37160	37165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226135
251	NC_003901	TGT	2	6	37208	37213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226135
252	NC_003901	ATA	2	6	37225	37230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226135
253	NC_003901	CAT	2	6	37353	37358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226135
254	NC_003901	ATA	2	6	38016	38021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226136
255	NC_003901	ATA	2	6	38145	38150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226136
256	NC_003901	AAG	2	6	38188	38193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226136
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259	NC_003901	TGA	2	6	38472	38477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226136
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385	NC_003901	CTT	2	6	48523	48528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226140
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