MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanosarcina mazei Go1 chromosome

Total Repeats: 35739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_003901	GGT	2	6	425759	425764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21226419
3502	NC_003901	TAA	2	6	425789	425794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226419
3503	NC_003901	AAG	2	6	425811	425816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226419
3504	NC_003901	TCT	2	6	425914	425919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226419
3505	NC_003901	AGA	2	6	426001	426006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226419
3506	NC_003901	CGT	2	6	426092	426097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226419
3507	NC_003901	CTT	2	6	426307	426312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226420
3508	NC_003901	TCT	2	6	426422	426427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226420
3509	NC_003901	TCA	2	6	426518	426523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226420
3510	NC_003901	AGT	2	6	426529	426534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226420
3511	NC_003901	ATG	2	6	426557	426562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226420
3512	NC_003901	CCA	2	6	426785	426790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21226420
3513	NC_003901	TCA	2	6	426893	426898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226420
3514	NC_003901	ATA	2	6	426911	426916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226420
3515	NC_003901	TGA	2	6	426991	426996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226421
3516	NC_003901	AAG	2	6	427129	427134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226421
3517	NC_003901	TTG	2	6	427225	427230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226421
3518	NC_003901	CAT	2	6	427280	427285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226421
3519	NC_003901	AAG	2	6	427315	427320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226421
3520	NC_003901	CAA	2	6	427324	427329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226421
3521	NC_003901	CAA	2	6	427360	427365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226421
3522	NC_003901	CGC	2	6	427529	427534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21226422
3523	NC_003901	GAA	2	6	427621	427626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226422
3524	NC_003901	ATA	2	6	427732	427737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226422
3525	NC_003901	TCT	2	6	427960	427965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226423
3526	NC_003901	CAT	2	6	428006	428011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226423
3527	NC_003901	GTT	2	6	428016	428021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226423
3528	NC_003901	AAT	2	6	428052	428057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226423
3529	NC_003901	CCA	2	6	428138	428143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21226423
3530	NC_003901	AGC	2	6	428223	428228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226423
3531	NC_003901	TCC	2	6	428296	428301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226423
3532	NC_003901	TTC	2	6	428317	428322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226423
3533	NC_003901	CTT	2	6	428480	428485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226423
3534	NC_003901	TCA	2	6	428576	428581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226423
3535	NC_003901	TGC	2	6	428686	428691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226424
3536	NC_003901	GGT	2	6	428729	428734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21226424
3537	NC_003901	AGC	2	6	428782	428787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226424
3538	NC_003901	CAG	2	6	428790	428795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226424
3539	NC_003901	TCA	2	6	428849	428854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226424
3540	NC_003901	GCT	2	6	428873	428878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226424
3541	NC_003901	AAC	2	6	428947	428952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226424
3542	NC_003901	GCC	2	6	428983	428988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21226424
3543	NC_003901	CGT	2	6	429036	429041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226424
3544	NC_003901	CCT	2	6	429111	429116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226424
3545	NC_003901	AGT	2	6	429127	429132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226424
3546	NC_003901	GCA	2	6	429170	429175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226424
3547	NC_003901	ACT	2	6	429176	429181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226424
3548	NC_003901	CAG	2	6	429290	429295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226425
3549	NC_003901	TAC	2	6	429375	429380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226425
3550	NC_003901	ATT	2	6	429505	429510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21226425
3551	NC_003901	CTG	2	6	429629	429634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226425
3552	NC_003901	TCC	2	6	429699	429704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226425
3553	NC_003901	CTG	2	6	429827	429832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226425
3554	NC_003901	ATA	2	6	429913	429918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226425
3555	NC_003901	AAT	2	6	430345	430350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226426
3556	NC_003901	ATA	2	6	430372	430377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226426
3557	NC_003901	TAT	2	6	430381	430386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21226426
3558	NC_003901	ATC	2	6	430387	430392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226426
3559	NC_003901	CGA	2	6	430404	430409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226426
3560	NC_003901	TTG	2	6	430431	430436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226426
3561	NC_003901	ATA	2	6	430443	430448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226426
3562	NC_003901	TAT	2	6	430449	430454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21226426
3563	NC_003901	AAT	2	6	430752	430757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226427
3564	NC_003901	GCC	2	6	430764	430769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21226427
3565	NC_003901	TCA	2	6	431047	431052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226427
3566	NC_003901	TTC	2	6	431082	431087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226427
3567	NC_003901	CTT	2	6	431288	431293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226427
3568	NC_003901	TTC	3	9	431375	431383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226427
3569	NC_003901	GTC	2	6	431457	431462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226427
3570	NC_003901	TTC	2	6	431606	431611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226428
3571	NC_003901	CTT	2	6	431709	431714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226428
3572	NC_003901	CGG	2	6	431920	431925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21226428
3573	NC_003901	GCA	2	6	431988	431993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226428
3574	NC_003901	GCT	2	6	432128	432133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226428
3575	NC_003901	TCA	2	6	432153	432158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226429
3576	NC_003901	ATC	2	6	432160	432165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226429
3577	NC_003901	ATA	2	6	432242	432247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21226429
3578	NC_003901	ATG	2	6	432338	432343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226429
3579	NC_003901	GAA	2	6	432377	432382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226429
3580	NC_003901	TCA	2	6	432425	432430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226429
3581	NC_003901	ATG	2	6	432488	432493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226429
3582	NC_003901	CAA	2	6	432549	432554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226429
3583	NC_003901	AGC	2	6	432635	432640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226429
3584	NC_003901	TCA	2	6	432732	432737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226429
3585	NC_003901	TGG	2	6	432799	432804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21226430
3586	NC_003901	CTG	2	6	432863	432868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226430
3587	NC_003901	GAA	2	6	432962	432967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226430
3588	NC_003901	CTG	2	6	433044	433049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226430
3589	NC_003901	CCA	2	6	433203	433208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21226430
3590	NC_003901	CAG	2	6	433219	433224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21226430
3591	NC_003901	TTG	2	6	433279	433284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226430
3592	NC_003901	CTT	3	9	433315	433323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226430
3593	NC_003901	CTT	3	9	433373	433381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226430
3594	NC_003901	CGT	2	6	433408	433413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226430
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3597	NC_003901	ATC	2	6	433565	433570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226430
3598	NC_003901	TTG	2	6	433626	433631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21226430
3599	NC_003901	CTG	2	6	433781	433786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226430
3600	NC_003901	GGA	2	6	433910	433915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226430
3601	NC_003901	GGT	2	6	433930	433935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21226430
3602	NC_003901	TTC	2	6	433955	433960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226430
3603	NC_003901	GAG	2	6	433993	433998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21226430
3604	NC_003901	TCC	2	6	434094	434099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226430
3605	NC_003901	TTC	2	6	434138	434143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226430
3606	NC_003901	CTG	2	6	434210	434215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226430
3607	NC_003901	CTG	2	6	434246	434251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226430
3608	NC_003901	CGG	2	6	434302	434307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21226430
3609	NC_003901	CTG	2	6	434406	434411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226430
3610	NC_003901	ATT	2	6	434513	434518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21226430
3611	NC_003901	TTC	2	6	434606	434611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226430
3612	NC_003901	CTG	2	6	434619	434624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226430
3613	NC_003901	TCA	2	6	434679	434684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226430
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3615	NC_003901	GTC	2	6	435029	435034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21226430
3616	NC_003901	CAA	2	6	435115	435120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21226430
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3618	NC_003901	TCA	2	6	435255	435260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21226430
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3981	NC_003901	AGA	2	6	473726	473731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21226471
3982	NC_003901	TTC	2	6	473781	473786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226471
3983	NC_003901	TCC	2	6	473866	473871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21226471
3984	NC_003901	TCT	2	6	473896	473901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21226471
3985	NC_003901	TGA	2	6	473953	473958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21226471
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