MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 64803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003552	AAT	2	6	114	119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003552	TTG	2	6	279	284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088900
3	NC_003552	AAG	2	6	332	337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088900
4	NC_003552	ATG	2	6	494	499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088900
5	NC_003552	TTC	2	6	674	679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088900
6	NC_003552	AGG	2	6	729	734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088900
7	NC_003552	CGG	2	6	744	749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20088900
8	NC_003552	CGT	2	6	814	819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088900
9	NC_003552	CAT	2	6	868	873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088900
10	NC_003552	TTC	3	9	890	898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088900
11	NC_003552	CAT	2	6	1021	1026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088900
12	NC_003552	TCG	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088900
13	NC_003552	ATG	2	6	1065	1070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088900
14	NC_003552	CTT	3	9	1147	1155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088900
15	NC_003552	AAG	2	6	1178	1183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088900
16	NC_003552	ACA	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088900
17	NC_003552	TAA	2	6	1400	1405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20088900
18	NC_003552	AAG	2	6	1420	1425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088900
19	NC_003552	GAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088900
20	NC_003552	ATT	2	6	1796	1801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003552	ATT	2	6	1845	1850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003552	ATT	2	6	1940	1945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003552	TAT	2	6	2180	2185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003552	TTA	2	6	2202	2207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003552	AAT	3	9	2381	2389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003552	GAA	2	6	2514	2519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003552	ATC	2	6	2526	2531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_003552	GAA	2	6	2610	2615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003552	ATA	2	6	2675	2680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003552	ATA	2	6	2731	2736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003552	CTG	2	6	3044	3049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_003552	TAC	2	6	3082	3087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_003552	CTA	2	6	3108	3113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_003552	TCA	2	6	3355	3360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088901
35	NC_003552	GAA	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088901
36	NC_003552	AAT	2	6	3487	3492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20088901
37	NC_003552	AGT	2	6	3612	3617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088901
38	NC_003552	AAC	2	6	3661	3666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088901
39	NC_003552	ACA	2	6	3729	3734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088901
40	NC_003552	TAT	2	6	3825	3830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088902
41	NC_003552	TAT	2	6	3880	3885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088902
42	NC_003552	AGG	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088902
43	NC_003552	TTG	2	6	4082	4087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088902
44	NC_003552	CTT	2	6	4219	4224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088902
45	NC_003552	CAA	2	6	4288	4293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088902
46	NC_003552	CTT	2	6	4297	4302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088902
47	NC_003552	ATC	2	6	4318	4323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088902
48	NC_003552	CTG	2	6	4356	4361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088902
49	NC_003552	GGT	2	6	4510	4515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088902
50	NC_003552	ATT	2	6	4627	4632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088902
51	NC_003552	ATC	2	6	4681	4686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088902
52	NC_003552	AAC	2	6	4756	4761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088902
53	NC_003552	TAT	2	6	4812	4817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088902
54	NC_003552	CTG	2	6	4823	4828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088902
55	NC_003552	CTT	2	6	4837	4842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088902
56	NC_003552	GCT	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088902
57	NC_003552	CGG	2	6	5094	5099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20088902
58	NC_003552	ATC	2	6	5125	5130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088902
59	NC_003552	AGC	2	6	5135	5140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088902
60	NC_003552	AAG	2	6	5228	5233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088902
61	NC_003552	AGA	2	6	5241	5246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088902
62	NC_003552	AGA	2	6	5307	5312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088902
63	NC_003552	ATA	2	6	5356	5361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003552	CTT	2	6	5394	5399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_003552	CTT	2	6	5486	5491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_003552	ATG	2	6	5672	5677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003552	AAT	2	6	5774	5779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003552	AAT	2	6	5793	5798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003552	TTA	2	6	5945	5950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003552	AAG	2	6	6060	6065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003552	TTA	2	6	6091	6096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003552	TTA	2	6	6106	6111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003552	TTC	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_003552	AAT	2	6	6280	6285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003552	TGT	2	6	6440	6445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003552	TTA	2	6	6564	6569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003552	AAT	2	6	6691	6696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003552	CTA	2	6	6769	6774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_003552	TAT	2	6	7008	7013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003552	CTG	2	6	7018	7023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_003552	TAA	2	6	7079	7084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003552	TTC	2	6	7131	7136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_003552	ATT	2	6	7216	7221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003552	TGG	2	6	7449	7454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088903
85	NC_003552	CAG	2	6	7471	7476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088903
86	NC_003552	CTT	2	6	7594	7599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088903
87	NC_003552	TCA	2	6	7648	7653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088903
88	NC_003552	GGA	2	6	7803	7808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088903
89	NC_003552	TTG	2	6	8017	8022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088903
90	NC_003552	TTG	2	6	8025	8030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088903
91	NC_003552	GCA	2	6	8037	8042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088903
92	NC_003552	GTT	2	6	8126	8131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088903
93	NC_003552	ACC	2	6	8140	8145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20088904
94	NC_003552	AGG	2	6	8488	8493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088904
95	NC_003552	TCC	2	6	8519	8524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088904
96	NC_003552	GTT	2	6	8552	8557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088904
97	NC_003552	ACC	2	6	8586	8591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20088904
98	NC_003552	CTT	2	6	8630	8635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088904
99	NC_003552	GAA	2	6	8641	8646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088904
100	NC_003552	GAA	2	6	8740	8745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088904
101	NC_003552	CTC	2	6	8746	8751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088904
102	NC_003552	TGA	2	6	8776	8781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088904
103	NC_003552	AAC	2	6	8800	8805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088904
104	NC_003552	TCC	2	6	8842	8847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088904
105	NC_003552	CAG	2	6	9051	9056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088904
106	NC_003552	TCC	2	6	9109	9114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088904
107	NC_003552	CAG	2	6	9153	9158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088904
108	NC_003552	CTT	2	6	9168	9173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088904
109	NC_003552	TTC	2	6	9297	9302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088904
110	NC_003552	TCC	2	6	9359	9364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088904
111	NC_003552	CCG	2	6	9428	9433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_003552	TTC	2	6	9474	9479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_003552	GAG	2	6	9504	9509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003552	AGA	2	6	9630	9635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088905
115	NC_003552	ATT	2	6	9641	9646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088905
116	NC_003552	AGG	2	6	9767	9772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088905
117	NC_003552	TAC	2	6	9861	9866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088905
118	NC_003552	AGG	2	6	9867	9872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088905
119	NC_003552	ATG	2	6	10003	10008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088905
120	NC_003552	AAG	2	6	10416	10421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088905
121	NC_003552	ATA	2	6	10694	10699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20088905
122	NC_003552	AAG	2	6	10736	10741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088905
123	NC_003552	AAT	2	6	10814	10819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003552	GAT	3	9	10823	10831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003552	AAT	2	6	10881	10886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003552	ATG	2	6	10926	10931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003552	TAA	2	6	10968	10973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003552	ATA	2	6	11003	11008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003552	TCA	2	6	11314	11319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_003552	TAT	2	6	11328	11333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003552	GGA	2	6	11632	11637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088906
132	NC_003552	TTC	2	6	11640	11645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088906
133	NC_003552	CTG	2	6	11845	11850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088906
134	NC_003552	AGA	2	6	11899	11904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088906
135	NC_003552	CTG	2	6	11962	11967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088906
136	NC_003552	TGA	2	6	12141	12146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088906
137	NC_003552	GTA	2	6	12190	12195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088906
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