MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 64803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003552	ATA	2	6	44591	44596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_003552	ATT	3	9	44603	44611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_003552	ATT	2	6	44662	44667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_003552	TAT	3	9	44680	44688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_003552	TCA	2	6	44798	44803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088934
506	NC_003552	AAG	2	6	44934	44939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088934
507	NC_003552	TGC	2	6	45051	45056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088934
508	NC_003552	CCT	2	6	45287	45292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088934
509	NC_003552	GAG	2	6	45297	45302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088934
510	NC_003552	ATT	2	6	45352	45357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088934
511	NC_003552	GAG	2	6	45381	45386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088934
512	NC_003552	CTT	2	6	45464	45469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088934
513	NC_003552	CAA	2	6	45470	45475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088934
514	NC_003552	TAA	2	6	45560	45565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20088934
515	NC_003552	ATC	2	6	45604	45609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088934
516	NC_003552	AAG	3	9	45687	45695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088934
517	NC_003552	AAG	2	6	45829	45834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_003552	TCC	2	6	45879	45884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_003552	GAA	2	6	45887	45892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_003552	ATA	2	6	46040	46045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_003552	ATC	2	6	46070	46075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_003552	TAT	2	6	46186	46191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088935
523	NC_003552	TTG	2	6	46247	46252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088935
524	NC_003552	GTA	2	6	46253	46258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088935
525	NC_003552	GCA	2	6	46295	46300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088935
526	NC_003552	TAT	2	6	46354	46359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088935
527	NC_003552	CTT	2	6	46443	46448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088935
528	NC_003552	TCT	2	6	46646	46651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088935
529	NC_003552	CAG	2	6	46911	46916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_003552	CTC	2	6	46962	46967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_003552	AAT	2	6	46975	46980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_003552	GAA	2	6	47030	47035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_003552	TCT	2	6	47449	47454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088936
534	NC_003552	TGA	2	6	47476	47481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088936
535	NC_003552	GTT	2	6	47699	47704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088936
536	NC_003552	CAG	2	6	47706	47711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088936
537	NC_003552	TGC	2	6	47815	47820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088936
538	NC_003552	CTT	2	6	47910	47915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088936
539	NC_003552	TTC	2	6	47974	47979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088936
540	NC_003552	AGG	2	6	48170	48175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088936
541	NC_003552	CCG	2	6	48181	48186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20088936
542	NC_003552	ACC	3	9	48245	48253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20088936
543	NC_003552	CTC	2	6	48422	48427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088936
544	NC_003552	GTC	2	6	48479	48484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088936
545	NC_003552	GAA	2	6	48575	48580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088936
546	NC_003552	GTT	2	6	48614	48619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20088936
547	NC_003552	TGG	2	6	48630	48635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088936
548	NC_003552	ACG	2	6	48768	48773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088936
549	NC_003552	TGG	2	6	48921	48926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088936
550	NC_003552	ACT	2	6	49044	49049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088936
551	NC_003552	CTG	2	6	49127	49132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088936
552	NC_003552	AAC	2	6	49429	49434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_003552	AGT	2	6	49494	49499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_003552	TCA	2	6	49555	49560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_003552	AGG	2	6	49617	49622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_003552	ATT	2	6	49772	49777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088937
557	NC_003552	ACC	2	6	49874	49879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20088937
558	NC_003552	GAA	2	6	49924	49929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088937
559	NC_003552	CAA	2	6	50051	50056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088937
560	NC_003552	AAT	2	6	50088	50093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20088938
561	NC_003552	GTA	2	6	50110	50115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088938
562	NC_003552	GAA	2	6	50206	50211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088938
563	NC_003552	ACT	2	6	50271	50276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088938
564	NC_003552	ATG	2	6	50317	50322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088938
565	NC_003552	GGC	2	6	50419	50424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20088938
566	NC_003552	TGG	2	6	50487	50492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088938
567	NC_003552	CTG	2	6	50585	50590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088938
568	NC_003552	CAA	2	6	50594	50599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088938
569	NC_003552	GAA	2	6	50683	50688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088938
570	NC_003552	AGC	2	6	50775	50780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088938
571	NC_003552	ATT	2	6	50790	50795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088938
572	NC_003552	TTA	2	6	50822	50827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088938
573	NC_003552	AAC	2	6	50865	50870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088938
574	NC_003552	AGT	2	6	50883	50888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088938
575	NC_003552	AAC	2	6	50900	50905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088938
576	NC_003552	ATT	2	6	50982	50987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_003552	ATT	2	6	51098	51103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_003552	GAA	2	6	51155	51160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088939
579	NC_003552	GAA	2	6	51167	51172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088939
580	NC_003552	GAA	2	6	51209	51214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088939
581	NC_003552	GAA	2	6	51224	51229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088939
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583	NC_003552	GCC	2	6	51300	51305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20088939
584	NC_003552	CGG	2	6	51309	51314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20088939
585	NC_003552	ACG	2	6	51348	51353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088939
586	NC_003552	CTG	2	6	51448	51453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088939
587	NC_003552	ACC	2	6	51695	51700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20088939
588	NC_003552	CAT	2	6	51856	51861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088939
589	NC_003552	ATC	2	6	52504	52509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_003552	GCA	2	6	52628	52633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088940
591	NC_003552	TTC	2	6	52698	52703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088940
592	NC_003552	TCC	2	6	52776	52781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088940
593	NC_003552	AAC	2	6	52847	52852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_003552	TAT	2	6	52859	52864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_003552	ATC	2	6	52895	52900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_003552	ATC	2	6	52914	52919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_003552	TAC	2	6	53312	53317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_003552	CTT	2	6	53343	53348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_003552	AAG	2	6	53410	53415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088941
600	NC_003552	CTG	2	6	53474	53479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088941
601	NC_003552	CAA	2	6	53667	53672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088941
602	NC_003552	TCC	2	6	53700	53705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088941
603	NC_003552	CTT	2	6	53797	53802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088941
604	NC_003552	GGT	2	6	53902	53907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088941
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606	NC_003552	TGC	2	6	53976	53981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088941
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608	NC_003552	CGG	2	6	54066	54071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20088941
609	NC_003552	AGA	2	6	54095	54100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088941
610	NC_003552	CGA	2	6	54132	54137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088941
611	NC_003552	AGA	2	6	54203	54208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088941
612	NC_003552	TTC	2	6	54447	54452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088941
613	NC_003552	CGT	2	6	54477	54482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088941
614	NC_003552	TGC	2	6	54585	54590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088941
615	NC_003552	AAG	2	6	54843	54848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088942
616	NC_003552	GAA	2	6	55106	55111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088942
617	NC_003552	TCC	2	6	55149	55154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088942
618	NC_003552	ATG	2	6	55257	55262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20088942
619	NC_003552	GGT	2	6	55306	55311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088942
620	NC_003552	TGC	2	6	55360	55365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088942
621	NC_003552	CTC	2	6	55529	55534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088942
622	NC_003552	CGC	2	6	55916	55921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20088942
623	NC_003552	GCC	2	6	55967	55972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20088942
624	NC_003552	CGC	2	6	55991	55996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20088942
625	NC_003552	AAG	2	6	56109	56114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088942
626	NC_003552	GCA	2	6	56172	56177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088942
627	NC_003552	AGC	2	6	56200	56205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088942
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