MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 chromosome linear

Total Repeats: 1510

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003063	ACTCC	2	10	39	48	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_003063	CCCTC	2	10	312	321	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3	NC_003063	GAAAT	2	10	894	903	60 %	20 %	20 %	0 %	17936712
4	NC_003063	AGCCT	2	10	1248	1257	20 %	20 %	20 %	40 %	15891922
5	NC_003063	ATCTT	2	10	1484	1493	20 %	60 %	0 %	20 %	15891922
6	NC_003063	TCGCC	2	10	2987	2996	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_003063	AAAAC	2	10	3127	3136	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_003063	CGAAG	2	10	4202	4211	40 %	0 %	40 %	20 %	15891919
9	NC_003063	AGCAA	2	10	4393	4402	60 %	0 %	20 %	20 %	15891919
10	NC_003063	ATTAC	2	10	4642	4651	40 %	40 %	0 %	20 %	15891919
11	NC_003063	GCCTC	2	10	4901	4910	0 %	20 %	20 %	60 %	15891918
12	NC_003063	TCTTT	2	10	5839	5848	0 %	80 %	0 %	20 %	15891917
13	NC_003063	TTTGC	2	10	5933	5942	0 %	60 %	20 %	20 %	15891917
14	NC_003063	ATCGG	2	10	8625	8634	20 %	20 %	40 %	20 %	159185565
15	NC_003063	AACGC	2	10	8638	8647	40 %	0 %	20 %	40 %	159185565
16	NC_003063	CTCGT	2	10	9633	9642	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_003063	GTACA	2	10	10805	10814	40 %	20 %	20 %	20 %	159185566
18	NC_003063	GCGAC	2	10	11445	11454	20 %	0 %	40 %	40 %	159185567
19	NC_003063	TTCTC	2	10	12239	12248	0 %	60 %	0 %	40 %	159185568
20	NC_003063	GCACT	2	10	12483	12492	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_003063	CCGTC	2	10	15030	15039	0 %	20 %	20 %	60 %	15891904
22	NC_003063	CCCTG	2	10	15179	15188	0 %	20 %	20 %	60 %	15891904
23	NC_003063	CCGGA	2	10	16804	16813	20 %	0 %	40 %	40 %	159185570
24	NC_003063	CGAGC	2	10	18085	18094	20 %	0 %	40 %	40 %	15891901
25	NC_003063	CCGGC	2	10	21819	21828	0 %	0 %	40 %	60 %	159186368
26	NC_003063	CCCCT	2	10	22150	22159	0 %	20 %	0 %	80 %	159186368
27	NC_003063	ACGGT	2	10	24232	24241	20 %	20 %	40 %	20 %	159185572
28	NC_003063	CTTGC	2	10	25200	25209	0 %	40 %	20 %	40 %	159185572
29	NC_003063	CCCGG	2	10	26738	26747	0 %	0 %	40 %	60 %	159185573
30	NC_003063	CCGAG	2	10	28927	28936	20 %	0 %	40 %	40 %	159185575
31	NC_003063	TGCGC	2	10	30196	30205	0 %	20 %	40 %	40 %	159185576
32	NC_003063	GCTTC	2	10	30906	30915	0 %	40 %	20 %	40 %	159185576
33	NC_003063	CGGCG	2	10	34925	34934	0 %	0 %	60 %	40 %	15891886
34	NC_003063	CGGCA	2	10	36403	36412	20 %	0 %	40 %	40 %	15891884
35	NC_003063	ACGGC	2	10	36675	36684	20 %	0 %	40 %	40 %	15891884
36	NC_003063	TCGCT	2	10	37470	37479	0 %	40 %	20 %	40 %	15891884
37	NC_003063	CGATG	2	10	38447	38456	20 %	20 %	40 %	20 %	15891883
38	NC_003063	CGGCG	2	10	39292	39301	0 %	0 %	60 %	40 %	15891882
39	NC_003063	TGCGC	2	10	39787	39796	0 %	20 %	40 %	40 %	15891882
40	NC_003063	GCTTC	2	10	39885	39894	0 %	40 %	20 %	40 %	15891882
41	NC_003063	CGATG	2	10	39943	39952	20 %	20 %	40 %	20 %	15891882
42	NC_003063	GCGGA	2	10	40568	40577	20 %	0 %	60 %	20 %	15891882
43	NC_003063	GCACA	2	10	48070	48079	40 %	0 %	20 %	40 %	159185582
44	NC_003063	TTGAA	2	10	51522	51531	40 %	40 %	20 %	0 %	159185584
45	NC_003063	ATGGC	2	10	53071	53080	20 %	20 %	40 %	20 %	159185585
46	NC_003063	CGGCT	2	10	53258	53267	0 %	20 %	40 %	40 %	159185585
47	NC_003063	CAGAT	2	10	55248	55257	40 %	20 %	20 %	20 %	15891869
48	NC_003063	GTCCG	2	10	55738	55747	0 %	20 %	40 %	40 %	15891869
49	NC_003063	CGCGG	2	10	55943	55952	0 %	0 %	60 %	40 %	15891869
50	NC_003063	GTATC	2	10	57861	57870	20 %	40 %	20 %	20 %	159185587
51	NC_003063	CTGTC	2	10	59483	59492	0 %	40 %	20 %	40 %	159185588
52	NC_003063	AGCGC	2	10	61082	61091	20 %	0 %	40 %	40 %	15891866
53	NC_003063	CCCCA	2	10	61221	61230	20 %	0 %	0 %	80 %	15891866
54	NC_003063	GCCGT	2	10	61343	61352	0 %	20 %	40 %	40 %	15891866
55	NC_003063	TGACC	2	10	61584	61593	20 %	20 %	20 %	40 %	15891866
56	NC_003063	TGGCA	2	10	64179	64188	20 %	20 %	40 %	20 %	15891865
57	NC_003063	CTGGT	2	10	66047	66056	0 %	40 %	40 %	20 %	15891863
58	NC_003063	TTCCG	2	10	68179	68188	0 %	40 %	20 %	40 %	15891861
59	NC_003063	CCCTG	2	10	68248	68257	0 %	20 %	20 %	60 %	15891861
60	NC_003063	ATGGG	2	10	70535	70544	20 %	20 %	60 %	0 %	15891859
61	NC_003063	CCCTT	2	10	72976	72985	0 %	40 %	0 %	60 %	159185590
62	NC_003063	AAAAT	2	10	73290	73299	80 %	20 %	0 %	0 %	159185590
63	NC_003063	GCAAC	2	10	73436	73445	40 %	0 %	20 %	40 %	159185590
64	NC_003063	GCTGG	2	10	74524	74533	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_003063	GAACC	2	10	75444	75453	40 %	0 %	20 %	40 %	15891854
66	NC_003063	CGGCA	2	10	78182	78191	20 %	0 %	40 %	40 %	15891854
67	NC_003063	CGATC	2	10	78310	78319	20 %	20 %	20 %	40 %	15891854
68	NC_003063	TGTGC	2	10	79752	79761	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_003063	AAATC	2	10	79781	79790	60 %	20 %	0 %	20 %	15891852
70	NC_003063	CCTGC	2	10	81391	81400	0 %	20 %	20 %	60 %	159185594
71	NC_003063	TGGCA	2	10	84711	84720	20 %	20 %	40 %	20 %	15891848
72	NC_003063	GCAGA	2	10	85179	85188	40 %	0 %	40 %	20 %	159185596
73	NC_003063	CGGGC	2	10	85512	85521	0 %	0 %	60 %	40 %	159185596
74	NC_003063	GCCCT	2	10	86108	86117	0 %	20 %	20 %	60 %	159185596
75	NC_003063	CGGCG	2	10	87653	87662	0 %	0 %	60 %	40 %	15891846
76	NC_003063	GAAAG	2	10	87714	87723	60 %	0 %	40 %	0 %	15891845
77	NC_003063	CGTCA	2	10	88412	88421	20 %	20 %	20 %	40 %	15891845
78	NC_003063	AAGGC	2	10	92126	92135	40 %	0 %	40 %	20 %	15891840
79	NC_003063	CGCAC	2	10	93674	93683	20 %	0 %	20 %	60 %	15891838
80	NC_003063	GCCGC	2	10	95734	95743	0 %	0 %	40 %	60 %	159185599
81	NC_003063	TCGCC	2	10	97934	97943	0 %	20 %	20 %	60 %	159185600
82	NC_003063	CATTT	2	10	98713	98722	20 %	60 %	0 %	20 %	159185601
83	NC_003063	CCCGC	2	10	99012	99021	0 %	0 %	20 %	80 %	159185602
84	NC_003063	ACCAA	2	10	99911	99920	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_003063	ATCGC	2	10	100859	100868	20 %	20 %	20 %	40 %	15891832
86	NC_003063	CACGC	2	10	102572	102581	20 %	0 %	20 %	60 %	159185603
87	NC_003063	CCACG	2	10	105113	105122	20 %	0 %	20 %	60 %	15891829
88	NC_003063	CCGCT	2	10	105685	105694	0 %	20 %	20 %	60 %	15891828
89	NC_003063	TGGAA	2	10	105728	105737	40 %	20 %	40 %	0 %	15891828
90	NC_003063	CTCGT	2	10	106144	106153	0 %	40 %	20 %	40 %	15891828
91	NC_003063	CATTC	2	10	112228	112237	20 %	40 %	0 %	40 %	15891822
92	NC_003063	TGCCC	2	10	114206	114215	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_003063	GCCGA	2	10	115294	115303	20 %	0 %	40 %	40 %	159185606
94	NC_003063	TGCGC	2	10	117196	117205	0 %	20 %	40 %	40 %	15891818
95	NC_003063	GCCTT	2	10	117660	117669	0 %	40 %	20 %	40 %	15891818
96	NC_003063	ACCGA	2	10	122362	122371	40 %	0 %	20 %	40 %	15891814
97	NC_003063	ATTTC	2	10	125529	125538	20 %	60 %	0 %	20 %	15891811
98	NC_003063	CTGGC	2	10	127433	127442	0 %	20 %	40 %	40 %	15891809
99	NC_003063	CGTCA	2	10	129649	129658	20 %	20 %	20 %	40 %	15891807
100	NC_003063	TGTGG	2	10	130358	130367	0 %	40 %	60 %	0 %	15891807
101	NC_003063	TTGCC	2	10	132789	132798	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_003063	ACGCA	2	10	135617	135626	40 %	0 %	20 %	40 %	159185616
103	NC_003063	ATATT	2	10	135867	135876	40 %	60 %	0 %	0 %	159185616
104	NC_003063	CCGCG	2	10	136532	136541	0 %	0 %	40 %	60 %	15891800
105	NC_003063	ATGCC	2	10	137545	137554	20 %	20 %	20 %	40 %	15891800
106	NC_003063	GGCAA	2	10	137590	137599	40 %	0 %	40 %	20 %	15891800
107	NC_003063	CCGAA	2	10	141446	141455	40 %	0 %	20 %	40 %	15891796
108	NC_003063	CGGCA	2	10	143003	143012	20 %	0 %	40 %	40 %	159185618
109	NC_003063	ACTGC	2	10	146538	146547	20 %	20 %	20 %	40 %	15891791
110	NC_003063	CTCCC	2	10	148121	148130	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
111	NC_003063	ACCGG	2	10	148226	148235	20 %	0 %	40 %	40 %	159185621
112	NC_003063	CGGCG	2	10	149633	149642	0 %	0 %	60 %	40 %	15891788
113	NC_003063	TTTCA	2	10	149907	149916	20 %	60 %	0 %	20 %	15891788
114	NC_003063	GCACC	2	10	150571	150580	20 %	0 %	20 %	60 %	159185622
115	NC_003063	CGGAA	2	10	150628	150637	40 %	0 %	40 %	20 %	159185622
116	NC_003063	GCGCC	2	10	153483	153492	0 %	0 %	40 %	60 %	15891783
117	NC_003063	GCCCC	2	10	153939	153948	0 %	0 %	20 %	80 %	15891783
118	NC_003063	ACGGC	2	10	155924	155933	20 %	0 %	40 %	40 %	15891782
119	NC_003063	TGATG	2	10	158774	158783	20 %	40 %	40 %	0 %	159185625
120	NC_003063	CGGCG	2	10	159270	159279	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
121	NC_003063	GCTGC	2	10	161922	161931	0 %	20 %	40 %	40 %	159185626
122	NC_003063	TCGGC	2	10	163215	163224	0 %	20 %	40 %	40 %	15891775
123	NC_003063	CGCCT	2	10	163256	163265	0 %	20 %	20 %	60 %	15891775
124	NC_003063	TGGAT	2	10	165284	165293	20 %	40 %	40 %	0 %	15891773
125	NC_003063	ACCAG	2	10	165824	165833	40 %	0 %	20 %	40 %	15891773
126	NC_003063	GGAAC	2	10	168260	168269	40 %	0 %	40 %	20 %	159185629
127	NC_003063	TGCGC	2	10	170645	170654	0 %	20 %	40 %	40 %	15891768
128	NC_003063	GTTTA	2	10	170997	171006	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003063	CGTGT	2	10	171074	171083	0 %	40 %	40 %	20 %	159185631
130	NC_003063	GAGCG	2	10	171670	171679	20 %	0 %	60 %	20 %	159185631
131	NC_003063	ACGGC	2	10	175121	175130	20 %	0 %	40 %	40 %	159185634
132	NC_003063	GATCG	2	10	175164	175173	20 %	20 %	40 %	20 %	159185634
133	NC_003063	CGACC	2	10	176625	176634	20 %	0 %	20 %	60 %	159185635
134	NC_003063	GCGCC	2	10	176855	176864	0 %	0 %	40 %	60 %	15891762
135	NC_003063	CCGCG	2	10	177263	177272	0 %	0 %	40 %	60 %	15891762
136	NC_003063	GCTCG	2	10	179339	179348	0 %	20 %	40 %	40 %	15891760
137	NC_003063	CGAGG	2	10	183971	183980	20 %	0 %	60 %	20 %	15891755
138	NC_003063	CATCA	2	10	184979	184988	40 %	20 %	0 %	40 %	15891755
139	NC_003063	GCCGG	2	10	189154	189163	0 %	0 %	60 %	40 %	159185637
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151	NC_003063	CGGGC	2	10	203528	203537	0 %	0 %	60 %	40 %	15891735
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185	NC_003063	GCTCA	2	10	247631	247640	20 %	20 %	20 %	40 %	15891702
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211	NC_003063	TGCGA	2	10	283423	283432	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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235	NC_003063	GGAAC	2	10	312856	312865	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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256	NC_003063	CCGGT	2	10	336561	336570	0 %	20 %	40 %	40 %	159185686
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258	NC_003063	TGCCC	2	10	341945	341954	0 %	20 %	20 %	60 %	15891624
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261	NC_003063	TCGCA	2	10	345834	345843	20 %	20 %	20 %	40 %	15891621
262	NC_003063	CCGAG	2	10	346754	346763	20 %	0 %	40 %	40 %	159185688
263	NC_003063	GATCA	2	10	347821	347830	40 %	20 %	20 %	20 %	15891619
264	NC_003063	TCGAT	2	10	348663	348672	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
265	NC_003063	CGGTT	2	10	352508	352517	0 %	40 %	40 %	20 %	159185691
266	NC_003063	TGACG	2	10	353792	353801	20 %	20 %	40 %	20 %	159185691
267	NC_003063	CGTTG	2	10	359596	359605	0 %	40 %	40 %	20 %	15891610
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369	NC_003063	CGGTG	2	10	529266	529275	0 %	20 %	60 %	20 %	159185759
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373	NC_003063	GGCAG	2	10	538583	538592	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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